Plus de 600 espèces d'ignames appartiennent au genre Dioscorea mais environ 10 espèces sont cultivées. L'igname est une culture tropicale très importante, principalement cultivée en Afrique, en Asie, dans le Pacifique et en Amérique du Sud. Sur 8.7 millions d'hectares, la production globale d'igname était de 72.6 millions de tonnes en 2018. La grande ou igname d'eau, Dioscorea alata est l'espèce la plus cultivée.
Une grande équipe internationale, dirigée par Dr Hana Chair at Le Cirad et des collègues de France, d'Autriche, de Suède, du Vietnam, de Vanuatu, de Madagascar, du Sri Lanka, de Papouasie-Nouvelle-Guinée, du Nigeria et du Japon séquencé 643 accessions de grandes ignames pour étudier l'histoire de la dispersion des ignames. Les scientifiques ont découvert que les grandes ignames avaient deux origines de domestication indépendantes, l'Asie du Sud-Est continentale et le Pacifique, et que le pool génétique de la péninsule indienne a conduit au pool génétique africain qui a ensuite été introduit dans les Caraïbes. Le Dr Chaïr a précédemment montré que la conservation de l'igname sauvage est cruciale pour l'avenir de cette culture et a constaté que La culture de l'igname africaine est originaire du bassin du fleuve Niger.
En 1886, De Candolle a d'abord suggéré que les ignames étaient originaires de la région indo-malaise et au fil des ans et même aujourd'hui, la domestication des ignames n'est toujours pas résolue. Les ignames sont cultivées à travers propagation clonale et la plupart des nouvelles variétés sont des somaclones produits par culture tissulaire. L'identification des centres de domestication de l'igname et des pools de gènes diversifiés est indispensable pour trouver des variétés plus résistantes et à plus haut rendement à l'avenir.
En 1886, De Candolle a d'abord suggéré que les ignames étaient originaires de la région indo-malaise et au fil des ans et même aujourd'hui, la domestication des ignames n'est toujours pas résolue. Les ignames sont cultivées à travers propagation clonale et la plupart des nouvelles variétés sont des somaclones produits par culture tissulaire. L'identification des centres de domestication de l'igname et des pools de gènes diversifiés est indispensable pour trouver des variétés plus résistantes et à plus haut rendement à l'avenir.
Les scientifiques ont identifié 352 accessions diploïdes regroupées selon leur origine géographique, tandis que 100 triploïdes provenaient principalement d'Asie et 34 accessions tétraploïdes étaient proches des groupes triploïdes. Une analyse plus approfondie n'a trouvé que 92 génotypes diploïdes indépendants parmi les 352 accessions diploïdes, ce qui suggère une clonalité élevée au sein de cette espèce. Il y avait une faible richesse génétique et des coefficients de consanguinité négatifs au sein des continents, signes de forts goulots d'étranglement de la domestication.
Lors de l'étude de la structure génétique et de l'ascendance de ces échantillons, "[N]otre analyse génétique et inférence démographique ont soutenu une divergence précoce de la grande igname entre l'Asie du Sud-Est continentale et le Pacifique, suivie très probablement de deux événements de domestication indépendants. Ensuite, l'espèce aurait atteint la péninsule indienne, puis l'Afrique et de là les Caraïbes », expliquent les scientifiques.
"Nous avons également révélé une clonalité élevée et une faible diversité nucléotidique, qui sont des indicateurs d'un fort goulot d'étranglement de la domestication et d'un processus de diversification réalisé principalement via l'accumulation somaclonale", ont-ils ajouté. "La faible diversité soulève des inquiétudes quant à la portée de l'amélioration génétique des caractères d'intérêt".
Cet effort de recherche mondial a non seulement révélé les principaux événements de domestication, mais a également produit un important ensemble de données sur la diversité génétique de l'igname. Voir plus à https://yambase.org/.
