lundi 31 juillet 2017
Avez-vous essayé de vous désinscrire ? Je vous pose la question car j'ai reçu deux notifications de désinscription. Ma propre copie de l'e-mail a été partagée lors du Congrès international de botanique et je pense avoir cliqué sur le lien de désinscription par curiosité. Si je me trompe et que vous avez déjà essayé de vous désinscrire sans succès, écrivez-moi à alun.m.salt@gmail.com et je vous désinscrirai manuellement. Je n'ai aucune envie d'importuner qui que ce soit avec des e-mails. J'espère néanmoins que vous trouvez cela agaçant, car il y a des choses passionnantes à dire, même en dehors du Congrès international de botanique.
De AoBBlog
Hybridation spontanée chez les roses sauvages
Une propension à former des hybrides polyploïdes est une caractéristique particulière des roses. Herklotz et Ritz étudier la génétique des populations de quarante-cinq peuplements mixtes d'églantiers en Europe centrale et du sud-est à l'aide de marqueurs microsatellites et de la cytométrie en flux.
La biodiversité cachée sous l'aulne
Certain Alnus les arbres se sont retirés à Colchis au cours de la dernière période glaciaire avant d'étendre leur aire de répartition dans le réchauffement climatique. Leurs partenaires symbiotiques ont-ils fait de même ?
7000 botanistes réunis au congrès semestriel
Sept mille botanistes ne se sont jamais réunis au même endroit auparavant. Mais nous nous réunissons tous au Congrès international de botanique à Shenzhen, #IBC2017, cette semaine, dans une présentation étonnante non seulement de la diversité des plantes, mais aussi de la diversité des chercheurs et de la recherche. Avec 27 (oui, vingt-sept) sessions parallèles la plupart du temps, chacun de nous ramènera quelque chose de très différent de la conférence.
Les individus de tourbe unique comprennent la majeure partie de la diversité allélique dans Sphaigne
En utilisant des marqueurs SSR ancestraux indicatifs, Karlin et Smouse explorer la diversité allélique de la tourbe de sphaigne, un allopolyploïde avec des génomes composants de trois espèces ancestrales différentes.
Structure génétique de Tamarix taklamakanensis
Dans une nouvelle étude publiée dans AoB PLANTS Xiao et coll. évalué la diversité génétique et la structure de 15 T. taklamakanensis populations du bassin du Tarim, en Chine.
Les escargots vivent la grande vie
Nigel Chaffey trouve un épiphyte saisonnier avec un vertige.
Congrès Botanique International #IBC2017 et la vue d'ensemble de Shenzhen
Parfois déroutant & contradictoire, mais aussi énergique & innovant. Pat Heslop-Harrison recherche les thèmes clés du Congrès international de botanique.
Changement de gamme écologique et polyploïdie Fosterelle
La distribution de la polyploïdie le long d'un gradient d'élévation andin relativement raide est étudiée à l'aide du genre Fosterelle (Bromeliaceae) comme système modèle. Paule et al. ont observé une différenciation écologique des cytotypes avec des polyploïdes occupant préférentiellement des habitats plus froids avec une forte variabilité annuelle de température (saisonnalité).
De l'IBC 2017 à Shenzhen
Je craignais que le Grand Pare-feu ne rende l'IBC 2017 très silencieux sur Twitter. Heureusement, je me suis trompé. Nous avons organisé les tweets par session du mieux que nous pouvions. Voici les publications quotidiennes.
Lundi / Mardi / Mercredi / Jeudi / Vendredi / Samedi
Développement de cultures bioénergétiques durables pour les climats futurs 24-27 septembre 2017
Vous êtes invités à nous rejoindre à Bioénergie 2017. Cette réunion réunira des chercheurs, des sélectionneurs, des producteurs et des décideurs politiques concernés par le développement de nouvelles cultures bioénergétiques pour les climats futurs.
Nouvelles et liens
Un botaniste en Laponie suédoise
Le plan était de retracer une partie d'un voyage que Carl Linnaeus a fait en 1732 quand il avait 25 ans, d'Uppsala, juste au nord de Stockholm, à la région la plus septentrionale de la Suède, connue sous le nom de Laponie suédoise. Linnaeus a tenu un journal détaillé de ses voyages, souvent appelé son "Journal de Laponie", avec des cartes des montagnes, des rivières et des lacs, des dessins et son écriture sinueuse.
Utilisation du métabolisme pour améliorer la sélection du maïs
Cañas et coll. étudier les relations entre le métabolisme des feuilles de maïs et le rendement en grains pour identifier des marqueurs putatifs pour la sélection Plantae
Un outil « anti-CRISPR » nettoie les modifications génétiques
L'ajout de protéines aux cellules humaines rend CRISPR-Cas9 plus spécifique. Nature
La botanique ouvrira la nuit pour laisser les gens sentir la "fleur du cadavre"
L'arum titan (Amorphophallus titanum), aussi appelé « fleur cadavre », est surnommé ainsi en raison de l'odeur nauséabonde de chair en décomposition qu'il dégage lors de sa pleine floraison. Cette plante exotique devrait fleurir d'ici quelques jours, pour la deuxième fois seulement en Écosse. The Scotsman
Riz, papaye, oranges - 3 versions OGM de cultures conventionnelles modifiées pour le bien de l'humanité
Examinons trois exemples de cultures GM qui n'ont pas été créées pour augmenter les bénéfices des entreprises, mais pour le bénéfice de l'humanité. Le projet d'alphabétisation génétique
Annonce d'une nouvelle revue interdisciplinaire en libre accès du New Phytologist Trust
Comment la science végétale peut-elle résoudre les défis mondiaux du 21ème siècle ? Plantes, gens, planète, une nouvelle revue qui sera lancée au Congrès international de botanique (IBC), à Shenzhen, en Chine, cherchera à répondre à cette question. John Wiley & Sons
Les paysages sonores forestiers détiennent la clé de la surveillance de la biodiversité
Matinée dans le village de Musiamunat. De l'autre côté de la rivière et sur un flanc de montagne escarpé, les oiseaux de paradis crient bruyamment à travers la canopée de la forêt tropicale, ajoutant leurs cris au chœur presque assourdissant des insectes. À moins d'un kilomètre de là, de petits oiseaux voltigent à travers un bosquet de bananiers, de taros et de vignes de citrouille qui serpentent à travers la clairière accidentée. Ici aussi, les cigales hurlent. Science verte cool
Les invasions d'espèces exotiques et le réchauffement climatique constituent un "duo mortel", avertissent les scientifiques
Les animaux et les plantes étrangers peuvent causer d'énormes dégâts, avec la marche des fourmis argentines au Royaume-Uni, un nouvel exemple de la façon dont le changement climatique renforce la menace. The Guardian
CRISPR : une nouvelle boîte à outils pour de meilleures cultures
Les phytologues utilisent la méthode d'édition de gènes pour fabriquer des produits agricoles de meilleure qualité et plus durables, mais l'acceptation par les consommateurs n'est pas garantie. Nouvelles en chimie et ingénierie
Restaurer les prairies d'alvar estoniennes pour sauver des espèces uniques
Un vaste projet visant à redonner à l'un des habitats les plus riches en biodiversité d'Europe sa splendeur d'antan porte déjà ses fruits. Reportage de Julianna Photopoulos sur place. New Scientist
10 méga mythes sur l'agriculture à retenir lors de votre prochaine course à l'épicerie
La plupart d'entre nous ne passons pas nos journées à labourer des champs ou à garder du bétail. Nous faisons partie des 99 % d'Américains qui consomment des aliments, mais ne les produisent pas. Compte tenu de notre relation étroite avec l'alimentation, et de son rôle crucial pour notre santé et l'environnement, Il est essentiel de se préoccuper de la manière dont ce produit est fabriqué. Or, nous ne sommes pas toujours irréprochables. La prochaine fois que vous ferez vos courses, pensez à ces 10 idées reçues modernes sur le plus ancien métier du monde. Washington post
À l'intérieur de la chambre forte mondiale des semences, où l'histoire et l'avenir de l'agriculture sont stockés
Graines sur glace L'auteur Cary Fowler décrit le tunnel souterrain près du pôle Nord, qui stocke et protège une collection de 933,000 XNUMX échantillons de variétés de cultures différentes et uniques. Radio Nationale Publique
Il sera beaucoup plus difficile de qualifier de nouvelles découvertes de "significatives" si cette équipe parvient à ses fins
Une méga-équipe de scientifiques soucieux de la reproductibilité renouvelle une proposition controversée visant à élever la norme de signification statistique dans les études de recherche. Ils veulent que les chercheurs abandonnent l'utilisation de longue date d'une valeur de probabilité (valeur p) inférieure à 0.05 comme étalon-or pour des résultats significatifs, et la remplacent par le seuil de valeur p beaucoup plus rigide de 0.005. Science
Arrêtez de négliger les champignons
Les agents pathogènes fongiques sont pratiquement ignorés par la presse, le public et les organismes de financement, alors qu'ils représentent une menace importante pour la santé publique, la biosécurité alimentaire et la biodiversité. Nature de microbiologie
Hiérarchie des hypothèses comme outil d'organisation de la recherche. Reportage sur un atelier
Le rédacteur en chef du Journal of Ecology, David Gibson, la rédactrice associée Lorena Gómez-Aparicio, et le rédacteur en chef de Methods in Ecology and Evolution, Bob O'Hara, ont récemment participé à un atelier intitulé "L'approche de la hiérarchie des hypothèses : Exploration de son potentiel pour structurer et analyser la théorie, la recherche et des preuves dans toutes les disciplines », du 19 au 21 août, à Hanovre, en Allemagne. Journal de l'écologie Blog
Pourquoi personne ne s'intéresse-t-il aux bords des routes urbaines ?
Les responsables des chaînes hôtelières savent qu'une rénovation d'hôtel est importante non seulement pour son esthétique, mais aussi pour le temps nécessaire au nettoyage. Les coûts d'entretien réguliers sont souvent un facteur déterminant de la réussite ou de la faillite d'une entreprise… Nous devrions appliquer ces mêmes principes aux terrains publics gérés par les collectivités locales dans nos zones urbaines et périurbaines. Le pot entremêlé
Des scientifiques modifient génétiquement le premier chrysanthème bleu au monde
Les vraies fleurs bleues sont rares dans la nature - elles ne se produisent que chez certaines espèces comme les gloires du matin et les delphiniums. Maintenant, les chercheurs ont créé un chrysanthème véritablement bleu en ajoutant deux gènes à la fleur normalement rose ou rougeâtre. Science
Les phytotechniciens prévoient un effort massif pour séquencer 10,000 XNUMX génomes
Les espoirs de séquencer l'ADN de chaque être vivant sur Terre font un pas en avant avec l'annonce de plans visant à séquencer au moins 10,000 10 génomes représentant chaque clade majeur de plantes et de microbes eucaryotes. Le géant chinois du séquençage BGI et la China National GeneBank (CNGB) ont organisé hier un atelier en marge du Congrès international de botanique, qui se tient cette semaine dans la ville natale de BGI, à Shenzhen, pour discuter de ce qu'ils appellent le plan XNUMXKP. Science
Nous savons comment réduire la déforestation – alors où est l'argent ?
Payer les gens pour qu'ils n'abattent pas d'arbres fonctionne, les preuves le montrent - alors pouvons-nous vraiment nous permettre de ne pas le faire ? The Guardian
Ce n'est pas votre imagination. Les étés deviennent plus chauds.
Les étés extraordinairement chauds – du genre qui étaient pratiquement inconnus dans les années 1950 – sont devenus monnaie courante.
Appel à contributions : Numéro spécial sur l'écologie et l'évolution de la reproduction des plantes
Les botanistes sont depuis longtemps fascinés par l'extraordinaire diversité des modes de reproduction des plantes à fleurs et cherchent à comprendre les processus écologiques et les mécanismes génétiques qui influencent leur reproduction. Ces cinq dernières années, la recherche dans ce domaine a connu une accélération fulgurante. Les avancées majeures dans ce domaine associent souvent des modèles théoriques élégants à des expériences innovantes menées sur le terrain et en laboratoire. Annals of Botany publiera un numéro spécial sur l'écologie et l'évolution de la reproduction des plantes en janvier 2019, et il mettra en lumière les articles de 3 symposiums au XIXe Congrès international de botanique à Shenzhen, en Chine. Voir l'appel à communications complet pour plus d'informations.
Articles scientifiques
Plasticité du développement au niveau de la fleur à la disponibilité des nutriments chez Datura stramonium : implications pour le système d'accouplement
Étant donné que les facteurs environnementaux et développementaux peuvent produire des changements dans les traits liés au système d'accouplement, cette étude a utilisé la deuxième approche pour déterminer si la variation intra-individuelle des traits liés à l'herkogamie est affectée par l'environnement pendant le développement de la plante dans deux populations de Datura stramonium, un herbacée annuelle avec un système d'accouplement mixte persistant hypothétique, et pour déterminer quels traits morphologiques peuvent favoriser l'autofécondation. Annals of Botany
Les mutations multinucléotidiques provoquent de fausses inférences de sélection positive
Nous avons évalué si les tests phylogénétiques d'évolution adaptative, tels que le test des sites de branchement largement utilisé, pouvaient interpréter à tort les motifs de séquences produits par des mutations multinucléotidiques comme de faux arguments en faveur de la sélection positive. Nous avons exploré deux jeux de données pangénomiques comprenant des milliers d'alignements de séquences codantes — l'un provenant de mammifères et l'autre de drosophiles — et constaté que les codons présentant de multiples différences (CMD) expliquent la quasi-totalité des arguments en faveur de la sélection positive inférés par le test des sites de branchement. bioRxiv
Flux de gènes entre des lignées divergentes spécifiques aux céréales et aux graminées du champignon Magnaporthe oryzae
Ici, nous utilisons des informations sur la séquence du génome entier de 76 isolats de M. oryzae prélevés dans 12 genres de graminées et de céréales pour déduire la structure de la population de M. oryzae et pour réévaluer le statut d'espèce des populations du champignon infectant le blé. bioRxiv
Transport systémique de trans-la zéatine et son précurseur ont des rôles différents dans les pousses d'Arabidopsis
Des études antérieures ont proposé que le trans-zéatine-riboside, un type de précurseur de la cytokinine, est une forme majeure de signalisation à longue distance dans les vaisseaux du xylème et que son action dépend de la conversion métabolique via l'enzyme LONELY GUY à proximité du site d'action. Nous rapportons ici une autre forme de signalisation à longue distance de la cytokinine : trans-la zéatine, une forme active. Nature Plants
Le type d'habitat et le mode de dispersion sous-tendent la capacité de migration des plantes à travers une voie maritime intermittente
L'étude de la distribution des espèces à travers les barrières géographiques est une méthode couramment utilisée en biogéographie pour aider à comprendre les traits fonctionnels qui permettent aux plantes de se disperser avec succès. Ici, l'approche d'analyse des modèles biogéographiques est étendue en utilisant l'exploration du génome entier de l'ADN chloroplastique pour examiner les traits fonctionnels qui ont eu un impact sur la dispersion d'espèces forestières tempérées répandues à travers une voie maritime intermittente, le détroit de Bass de 200 km de large dans le sud-est de l'Australie. Annals of Botany
La réduction de la croissance des feuilles de maïs en cas de sécheresse légère affecte la transition entre la division cellulaire et l'expansion cellulaire et ne peut pas être restaurée par des niveaux élevés d'acide gibbérellique
La croissance est caractérisée par l'interaction entre la division cellulaire et l'expansion cellulaire, deux processus séparés le long de la zone de croissance au niveau de la feuille de maïs. Pour mieux comprendre la transition entre la division cellulaire et l'expansion cellulaire, des conditions ont été étudiées dans lesquelles la position de cette zone de transition était affectée positivement ou négativement. Journal de la biotechnologie des plantes
Mécanisme d'acétylation du substrat hôte par un effecteur de la famille YopJ
Ici, nous rapportons les structures cristallines de PopP2, un effecteur YopJ produit par le phytopathogène Ralstonia solanacearum, en complexe avec l'hexaphosphate d'inositol (InsP6), acétyl-coenzyme A (AcCoA) et/ou substrat Résistance à Ralstonia solanacearum 1 (RRS1-R)WRKY. PopP2 reconnaît le motif WRKYGQK de RRS1-RWRKY pour positionner une lysine ciblée dans le site actif d'acétylation. Nature Plants
Formation de racines latérales et rôles multiples de l'auxine
Dans cette revue, nous résumons les progrès récents dans notre compréhension de quatre aspects de la formation de LR : (i) le positionnement de LR, qui détermine la distribution spatiale des ébauches de racines latérales (LRP) et des LR le long des racines primaires ; (ii) l'initiation de la LR, englobant l'activation de la migration nucléaire dans des cellules fondatrices de racines latérales (LRFC) spécifiées jusqu'à la première division cellulaire asymétrique ; (iii) l'excroissance LR, la structuration « primordium-intrinsèque » des tissus d'organes de novo et un méristème ; et (iv) l'émergence de la LR, une interaction entre la LRP et les tissus de recouvrement pour permettre le passage à travers les couches cellulaires. JXB
Plante parasite de la tige Cuscuta australis (cuscute) transfère les signaux induits par l'herbivorie entre les plantes
Ici, nous montrons que l'attaque des herbivores sur l'un des Cuscuta les plantes connectées en pont induisent l'expression des gènes et augmentent l'activité des inhibiteurs de la trypsine protéinase, et élèvent ainsi la résistance aux insectes chez d'autres plantes non endommagées mais Cuscuta-plantes connectées. PNAS
Arbitrages entre taille des graines et des feuilles (théorie graine-phytomère-feuille) : colle fonctionnelle liant les stratégies régénératives aux stratégies d'histoire de vie… et la taxonomie à l'écologie ?
Alors que le « spectre mondial de l'économie des feuilles » (Wright IJ, Reich PB, Westoby M, et al. 2004. Le spectre mondial de l'économie des feuilles. Nature428: 821–827) définit les relations entre les nutriments minéraux dans les plantes, aucun consensus fonctionnel unificateur ne relie les attributs de taille. Ici, l'accent est mis sur la taille des feuilles, un trait de plante très étudié qui évolue positivement avec la qualité de l'habitat et les composants de la taille de la plante. L'objectif est de montrer que ce large éventail de relations est explicable en termes d'un modèle théorique graine-phytomères-feuilles (SPL) définissant la taille des feuilles en termes de compromis impliquant la taille, le taux de croissance et le nombre de blocs de construction (phytomères ) dont est constituée la jeune pousse. Annals of Botany
La semaine a été chargée, ce qui pourrait expliquer pourquoi l'e-mail est un peu léger sur les papiers cette semaine. Cependant, si vous voulez voir de la science de pointe, l'IBC a quelque chose que vous devriez voir. Il y a une application que vous pouvez télécharger – si vous pouvez scanner le code QR. La raison pour laquelle vous souhaitez le faire est que vous pouvez utiliser l'application pour afficher des copies électroniques des affiches présentées lors de la conférence. J'espère qu'il restera en ligne pendant un certain temps, car il y en a quelques-uns que j'aimerais lire correctement et voir si les auteurs veulent écrire des articles de blog. Bien que la semaine prochaine, j'espère que nous aurons quelques papiers de plus pour vous.
