Lundi, 24 Juillet 2017
Rubriques : à partir de AoBBlog | Actualités | Articles scientifiques
Bonjour à tous. Je rassemble ça un dimanche après-midi pour sortir le lundi matin. Le seul lien urgent et urgent que nous ayons est le kickstarter Improbable Botany à la fin du Nouvelles et liens section. Si vous aimez votre science-fiction basée sur la botanique, vous voudrez peut-être y jeter un coup d'œil avant la date limite. Un nouveau numéro spécial de Annals of Botany est sorti aussi. C'est sur Polyploïdie en écologie et évolution. C'est actuellement un accès gratuit, mais il passera derrière le paywall après trois mois, vous voudrez peut-être télécharger tous les documents qui vous intéressent à partir de cela. Nous publierons des extraits des articles du numéro au cours des prochaines semaines. La dernière information urgente est que si vous êtes à l'IBC de Shenzhen, vous pouvez rencontrer certains d'entre nous au stand E33, les mardi et jeudi à 12.15hXNUMX.
De AoBBlog
Plasticité photosynthétique et survie à travers la limite Trias-Jurassique
Étudier le rôle évolutif souvent négligé de la plasticité photosynthétique sous [O2]:[CO2], Yotis et al. évaluer les plantes matures de deux angiospermes, deux monilophytes et Ginkgo biloba acclimatés à une atmosphère limite Trias-Jurassique (TJB) et leur plasticité photosynthétique en utilisant des méthodes d'échange de gaz et de fluorescence de chlorophylle.
Comment un malentendu sur l'alimentation a créé un écocide
Pendant des années, l'histoire de la façon dont les habitants de l'île de Pâques ont épuisé leurs sols et détruit leur écosystème a été un récit édifiant pour la civilisation occidentale. Il n'y a qu'un seul problème avec cela en tant qu'avertissement historique - il semble que cela ne s'est jamais produit.
Les réserves de carbone favorisent une utilisation efficace des nitrates lors de la repousse du ray-grass vivace
La repousse des plantes en réponse à la défoliation repose sur une utilisation efficace de l'azote. Roche et al. trouvent que la remobilisation des réserves de glucides solubles dans l'eau dans les feuilles de ray-grass vivace (Lolium Perenne) est coordonné avec la disponibilité de l'azote pour favoriser une assimilation efficace de l'azote en acides aminés dans les tissus des feuilles et de la gaine.
Patinage sur glace mince ..?
Nigel Chaffey a une suite à une histoire de 2012. Les algues fleurissent dans des endroits inattendus et cela pourrait avoir des conséquences sur le reste de la chaîne alimentaire.
Polyploïdie et hybridation interspécifique adaptation de forme, spéciation et évolution
Ce Annals of Botany Numéro spécial sur la polyploïdie en écologie et évolution présente les conséquences évolutives des polyploïdies nouvelles, récentes et anciennes. Alix et al. recense les études expérimentales, génomiques, écologiques et théoriques démontrant que la polyploïdisation intervient souvent lors des périodes de transitions évolutives majeures et de rayonnement adaptatif des espèces. La polyploïdie, pierre angulaire des bouffées de spéciation adaptative, apporte de la nouveauté génétique. L'émergence de nouvelles fonctions géniques permet la diversification, la spéciation et donc l'évolution des plantes.
Traits fonctionnels spécifiques au sexe chez les cycas
Une étude publiée dans AoB PLANTS by Krieg et coll. est le premier du genre à examiner l'écophysiologie liée au sexe chez les cycas. Leurs résultats montrent des différences inutilisées dans la physiologie photosynthétique et mettent en évidence le rôle que les bactéries du sol fixatrices d'azote peuvent jouer dans la reproduction et l'écologie des cycas. Ils ont découvert que les espèces peuvent varier considérablement dans leurs relations avec l'azote et que le sexe des plantes peut entraîner une physiologie foliaire unique.
Ressource : Le guide de Chicago sur la vérification des faits
Comment pouvez-vous faciliter le processus de vérification des faits, afin que vous sachiez que ce que vous dites est exact ? Ian Street trouve une ressource utile.
Impact des éléments transposables sur les génomes végétaux polyploïdes
Les éléments transposables (ET), ainsi que la polyploïdisation, ont un rôle clé dans l'évolution des plantes, générant des changements dans la taille du génome, ainsi qu'agissant comme source de nouvelles séquences génétiques codantes et régulatrices. Vicient et Casacuberta passent en revue les principales conséquences de l'activité TE dans les génomes des plantes et l'évolution des gènes, en particulier après des événements de polyploïdisation.
Développement de cultures bioénergétiques durables pour les climats futurs 24-27 septembre 2017
Vous êtes invités à nous rejoindre à Bioénergie 2017. Cette réunion réunira des chercheurs, des sélectionneurs, des producteurs et des décideurs politiques concernés par le développement de nouvelles cultures bioénergétiques pour les climats futurs.
Nouvelles et liens
Maïs, riz, blé : alarme face à la montée du risque climatique pour les cultures vitales
Des échecs de récolte simultanés dans des régions clés entraîneraient une famine mondiale, selon le Met Office The Guardian
Comment les pins se protègent-ils de la sécheresse ?
Les jeunes pins accumulent-ils des réserves alimentaires au détriment de la croissance pour leur permettre de survivre plus longtemps en cas de sécheresse ? Cette hypothèse controversée est réfutée par une nouvelle étude réalisée par le Institut fédéral de recherches sur la forêt, la neige et le paysage (WSL). Dans l'expérience, les arbres se sont rapidement adaptés à une sécheresse artificielle et ont été équipés pour la combattre l'année suivante. Journal de l'écologie Blog
Nous appartenons au désert
Parker J Palmer demande si nous pouvons posséder la nature sauvage. On Being
Bain de forêt : une retraite dans la nature peut renforcer l'immunité et l'humeur
Le bain de forêt n'est pas un bain. Nous nous sommes assis au bord de la rivière, mais nous ne sommes pas entrés dans l'eau. Ce n'est pas non plus une randonnée. Nous avons parcouru les sentiers forestiers, mais nous nous sommes promenés sans destination particulière en tête. Radio NPR
Les orties piquantes
Qu'est-ce qui fait piquer les orties ? In Defence of Plants jette un œil. À la défense des plantes
Combien y a-t-il de banques de gènes dans le monde ?
Il s'avère que les compter n'est pas si simple. Le blog de la biodiversité agricole
Une belle excursion pour voir Drosera rotundifolia en Belgique
Fin juin, je suis allé avec notre société française des plantes carnivores visiter un site intéressant en Belgique, pas très loin de ma ville natale. L'habitat y était censé abriter une petite population de Drosera rotundifolia. Chronique d'un jardin
Drosera intermedia survivant à la sécheresse dans le sud de la Belgique
Juste avant d'aller observer une population belge de Drosera rotundifolia, nous avons prospecté un autre site où l'on aurait pu trouver du Drosera intermedia, le drosera à feuilles oblongues. Chronique d'un jardin
Monstre fromagerie suisse à la recherche de trous noirs
La feuille de la plante à fromage suisse, Monstera deliciosa, n'a rien à voir avec un fromage quel qu'il soit lorsqu'il est jeune. En vieillissant, des perforations pénètrent profondément dans la feuille et des trous apparaissent vers son centre. Il devient fougère (penné), mais avec des trous… Plantes parlantes
Pivot Épisode 1, Saison 1 : La science ouverte extrême et le sens de l'impact scientifique avec Sophien Kamoun
The Taproot est le podcast qui creuse sous la surface pour comprendre comment se créent les publications scientifiques en biologie végétale. Dans chaque épisode, les co-animateurs Liz Haswell et Ivan Baxter prennent un article de la littérature et parlent de l'histoire derrière la science avec l'un de ses auteurs. Plantae
Stratégies adaptatives de recherche de nourriture racinaire le long d'un gradient forêt boréale-tempérée
Dans cet article, nous avons analysé les mécanismes adaptatifs de recherche de nourriture des racines ectomycorhiziennes et fines de Picea abies, Pinus sylvestris et Betula pendula Le long d'un gradient allant de la forêt boréale tempérée à la forêt boréale subarctique (38 sites entre les latitudes 48°N et 69°N) en Europe, cette étude a été menée en collaboration avec des collègues et des équipes de recherche de Finlande, d'Allemagne, du Royaume-Uni et de Lituanie. Ivika Ostonen présente son article dans New Phytologist. EcolChange
Summer of Weeds : manger du pourpier
S'il n'était pas aussi prolifique et persistant, le pourpier serait probablement un invité bienvenu dans nos potagers et paysages comestibles. Parmi les mauvaises herbes comestibles les plus nutritives et les plus polyvalentes, Portulaca oleracea est une annuelle extrêmement abondante qui s'est insérée dans les parterres de jardin et les terres cultivées dans les climats tempérés du monde entier. Botanique maladroit
Le cycle de vie de la chenille légionnaire d'automne
La chenille légionnaire d'automne, Spodoptera frugiperda, est un ravageur envahissant majeur en Afrique. Il a un appétit vorace et se nourrit de plus de 80 espèces végétales, dont le maïs, le riz, le sorgho et la canne à sucre. Une autre caractéristique qui en fait une espèce envahissante incroyablement réussie est sa capacité à se propager et à se reproduire rapidement. CABI a développé une affiche pour montrer le cycle de vie de la chenille légionnaire d'automne, qui comprend l'œuf, 6 stades de croissance du développement de la chenille (stades), la pupe et le papillon adulte. CABI – Le Blog Plantwise
Avec l'approbation de la canne à sucre OGM résistante aux insectes, les agriculteurs brésiliens sont prêts à récolter les bénéfices du pipeline biotechnologique
En juin, le Brésil est devenu le deuxième pays, après l'Indonésie, à approuver la culture commerciale de canne à sucre génétiquement modifiée résistante aux insectes conçue pour éloigner naturellement le foreur de la canne à sucre potentiellement dévastateur. Le foreur cause des pertes estimées à 1.5 milliard de dollars aux agriculteurs brésiliens chaque année. Le projet d'alphabétisation génétique
L'école d'études supérieures est difficile pour la santé mentale. Voici un antidote.
Je savais que les études supérieures seraient difficiles, mais j'ai été surpris de trouver une façon de travailler plus dur : apprendre à parler de science. J'ai grandi en voyant la science déformée ou mal comprise dans les nouvelles et la culture pop. Je pensais que la relation entre la science et la société avait besoin d'être réparée, et je considérais l'isolement des scientifiques comme faisant partie du problème. Je ne pouvais donc pas croire que mon doctorat. programme était prêt à me libérer dans le monde sans m'apprendre à parler à des gens en dehors du milieu universitaire. La chronique de l'enseignement supérieur
Écoutons-le pour les bénévoles du jardin
Une armée de bénévoles maintient l'industrie horticole à flot. Reconnaissons leur contribution, plaide Robbie Blackhall-Miles. The Guardian
Entreprise : jeu sur
Les scientifiques conçoivent des jeux de société, de cartes et numériques pour véhiculer des concepts scientifiques. Nature
Qui ose douter des pouvoirs de décomposition des champignons ?
Il est généralement admis qu'il a fallu 120 millions d'années aux champignons pour découvrir comment décomposer les plantes ligneuses. C'est ainsi que des matériaux riches en lignine se sont accumulés, parallèlement à l'apparition de vastes forêts. Période carbonifère (il y a environ 359 - 299 millions d'années), qui a conduit à d'énormes gisements de charbon jusqu'à champignons de la pourriture blanche finalement pris dans le permien (environ 299 - 252 ma). En tant que chauvin microbien, je ne peux pas imaginer que les champignons soient aussi retardés sur le plan de l'évolution. Si des plantes extraterrestres composées de plastique dégradable devaient envahir la Terre, faudrait-il 120 millions d'années pour développer des voies de biodégradation efficaces ? Petites choses considérées
Botanique improbable
Onze auteurs de science-fiction de renom imaginent des invasions végétales extraterrestres et des futurs botaniques dans ce recueil de nouvelles. Si vous souhaitez soutenir ce projet sur Kickstarter, vous devez soumettre votre contribution avant le mercredi 26 juillet 2017 à 12 h 25 UTC. Kickstarter
Appel à contributions : Numéro spécial sur l'écologie et l'évolution de la reproduction des plantes
Les botanistes sont depuis longtemps fascinés par l'extraordinaire diversité des modes de reproduction des plantes à fleurs et cherchent à comprendre les processus écologiques et les mécanismes génétiques qui influencent leur reproduction. Ces cinq dernières années, la recherche dans ce domaine a connu une accélération fulgurante. Les avancées majeures dans ce domaine associent souvent des modèles théoriques élégants à des expériences innovantes menées sur le terrain et en laboratoire. Annals of Botany publiera un numéro spécial sur l'écologie et l'évolution de la reproduction des plantes en janvier 2019, et il mettra en lumière les articles de 3 symposiums au XIXe Congrès international de botanique à Shenzhen, en Chine. Voir l'appel à communications complet pour plus d'informations.
Articles scientifiques
Génétique végétale, agriculture écologique et avenir de l'alimentation
Ici, je donne des exemples de cultures dérivées de trois approches génétiques modernes de la sélection végétale : le génie génétique, qui permet l'introduction de gènes d'une espèce dans une autre ; la sélection assistée par marqueurs, qui facilite la sélection de précision à l'aide de techniques moléculaires ; et l'édition du génome, qui permet des insertions, des suppressions ou des remplacements ciblés de séquences d'ADN. Au cours des vingt dernières années, les scientifiques et les sélectionneurs ont utilisé ces approches pour créer des variétés de cultures qui prospèrent dans des environnements extrêmes ou peuvent résister aux attaques de ravageurs et de maladies. Examen géographique
"Early Bird" Arabidopsis stimulation de la croissance des poils absorbants par des souches pathogènes de Pseudomonas syringae
Bénéfique sélectionné Pseudomonas spp. souches ont la capacité d'influencer l'architecture des racines dans Arabidopsis thaliana en inhibant l'allongement des racines primaires et en favorisant la formation des racines latérales et des poils absorbants. Un rôle crucial de l'auxine dans cette interaction plante-microbe à long terme (1 semaine) et à longue distance a été démontré. Annals of Botany
Les champignons mycorhiziens sont-ils nos sauveurs durables ? Considérations pour atteindre la sécurité alimentaire
Nous nous appuyons sur les connaissances écologiques des champignons mycorhiziens arbusculaires (AMF) pour éclairer leur rôle dans les agroécosystèmes, en fournissant un regard équilibré sur les symbioses mycorhizes-cultures en termes d'écophysiologie végétale et le rôle plus large de l'AMF dans les agroécosystèmes et posons la question : les AMF sont-ils notre durabilité sauveurs ? Journal of Ecology
La lumière déclenche une réduction dépendante de PILS de la signalisation de l'auxine nucléaire pour la transition de croissance
Dans cette étude, nous avons utilisé le développement de la courbure apicale comme modèle de transition de croissance chez les plantes. Un module de transport intercellulaire d'auxine dépendant de PIN-FORMED (PIN) définit un maximum d'auxine qui induit la répression de la croissance lors de la formation de la courbure apicale. Nos données montrent que la transition de croissance pour l'ouverture de la courbure apicale est largement indépendante de ce module PIN, mais requiert les transporteurs d'auxine putatifs PIN-LIKES (PILS) au niveau du réticulum endoplasmique. Nature Plants
Botanique synthétique
Nous mettons en évidence de nouvelles approches de la manipulation des plantes à base d'ADN et l'utilisation de techniques d'imagerie quantitative avancées dans des modèles de plantes simples tels que Marchantia polymorphe. Ceux-ci offrent la perspective d'une meilleure compréhension de la dynamique des plantes et de nouvelles approches d'ingénierie rationnelle des traits des plantes. Perspectives en biologie de Cold Spring Harbor
Diversité des herbicides et évolution des mauvaises herbes résistantes aux herbicides aux États-Unis
Ici, je montre que l'adoption de variétés de maïs génétiquement modifiées n'a pas réduit la diversité des herbicides et n'a donc probablement pas augmenté la pression de sélection pour les mauvaises herbes résistantes aux herbicides dans cette culture. L'adoption de variétés génétiquement modifiées a réduit la diversité des herbicides dans le coton et le soja, mais le glyphosate a largement remplacé les herbicides qui sont plus susceptibles de sélectionner des mauvaises herbes résistantes aux herbicides. Pré-impression à Une plante hors de propos
Arrêt du cycle cellulaire chez les plantes : qu'est-ce qui distingue quiescence, dormance et G1 différencié ?
Ici, la physiologie et la régulation moléculaire de (1) la quiescence méristématique, (2) la dormance et (3) la différenciation terminale (sortie du cycle cellulaire) sont considérées afin de déterminer si et comment les décisions moléculaires guidant ces états nucléaires sont distinctes. Un bref aperçu des régulateurs canoniques du cycle cellulaire est fourni, et les preuves génétiques et génomiques, ainsi que physiologiques, sont examinées concernant deux questions principales : (1) Les régulateurs canoniques du cycle cellulaire sont-ils supérieurs ou subordonnés dans la régulation de la quiescence ? (2) Ces trois modes de quiescence sont-ils régis par des contrôles moléculaires distincts ? Annals of Botany ACCÈS LIBRE
La base de la résilience des espèces d'arbres forestiers et son utilisation dans la gestion adaptative des forêts en Grande-Bretagne
Il est peu probable que traiter chaque nouvelle menace à mesure qu'elle surgit soit rentable et probablement peu pratique. Une meilleure stratégie pour établir une résilience à long terme serait d'exploiter les processus évolutifs, de maximiser la capacité des espèces d'arbres individuelles à répondre aux nouvelles menaces par la réorganisation des populations via la sélection naturelle ; en d'autres termes, être résilient. Foresterie
Combiner des techniques d'analyse d'images semi-automatisées avec des algorithmes d'apprentissage automatique pour accélérer les études génétiques à grande échelle
Nous avons formé un algorithme de forêt aléatoire pour déduire des traits architecturaux à partir de descripteurs d'images extraits automatiquement. La formation a été effectuée sur un sous-ensemble de l'ensemble de données, puis appliqué à son intégralité. Cette stratégie nous a permis (i) de diminuer le temps d'analyse des images de 73 % et (ii) d'extraire des traits architecturaux significatifs basés sur des descripteurs d'images. bioRxiv
Disséquer le phénotype « bacon et œufs » : transcriptomique du changement de couleur post-anthèse chez Lotus
Le changement de couleur post-anthèse (PACC) est largement considéré comme une adaptation pour signaler l'adéquation florale aux pollinisateurs. Lotus filicaulis et Lotus sessilifolius sont des légumineuses herbacées pollinisées par des insectes dont les fleurs s'ouvrent en jaune, virent à l'orange et enfin au rouge. Cette étude examine la base moléculaire du changement de couleur florale dans ces Lotus espèces. Annals of Botany
Ciblage de précision par les phosphoinositides : comment les IP dirigent le trafic endomembranaire des plantes
Ici, nous passons en revue les mécanismes généraux par lesquels les phosphoinositides et le trafic membranaire se rétroagissent pour réguler la structuration cellulaire. Nous utilisons ensuite les exemples spécifiques du trafic polarisé, du tri endosomique et de la biogenèse vacuolaire pour illustrer ces concepts généraux. Opinion actuelle en biologie végétale
La taille des graines et son taux d'évolution sont en corrélation avec la diversification des espèces à travers les angiospermes
Ici, nous montrons que la taille absolue des graines et le taux de variation de la taille des graines sont tous deux associés à la variation des taux de diversification. Sur la base du plus grand arbre phylogénétique d'angiospermes disponible, nous avons constaté que les plantes à petites graines présentaient des taux de diversification plus élevés, probablement en raison d'un potentiel de colonisation amélioré. PLoS Biology
Transfert de lipides des plantes aux champignons mycorhizes arbusculaires
Dans une approche génétique directe, nous avons identifié deux Lotus du Japon mutants déficients en paralogues spécifiques aux mycorhizes arbusculaires des gènes de biosynthèse des lipides (CASI et GPAT6). Ces mutants perturbent le développement fongique et l'accumulation d'AG fongiques emblématiques 16:1ω5. En utilisant le profilage isotopologique, nous démontrons que 13Les modèles C des AG fongiques récapitulent ceux des hôtes de type sauvage, indiquant un transfert de lipides entre les royaumes des plantes aux champignons. eLife
Exploiter les spectres végétaux pour intégrer les sciences de la biodiversité à travers les échelles biologiques et spatiales
Que pouvez-vous dire de la couleur d'une feuille? L'examen de la lumière réfléchie par les plantes pourrait révéler beaucoup de choses sur la diversité. AmJBot
Cela ferme l'e-mail pour cette semaine. Nous allons regarder le #IBC2017 hashtag pour voir ce qui se passe à Shenzhen. Si vous voulez suivre ce que nous partageons, vous pouvez nous suivre sur Twitter @annbot.
