Lundi, 17 Juillet 2017

Rubriques : à partir de AoBBlog | Actualités | Articles scientifiques

Bienvenue dans « La Semaine en Botanique », le premier numéro que nous prévoyons de publier. Si vous vous demandez pourquoi ce premier numéro est intitulé « édition spéciale », c'est parce que… sixIl s'avère alors qu'il existe plusieurs façons d'envoyer incorrectement un courriel hebdomadaire. Ce courriel est divisé en trois parties : AoBBlog couvre les articles du blog. À mesure que la production augmente, nous pourrions tweeter un peu moins d'histoires du blog, il sera donc plus facile de manquer des articles. Le Actualités couvre également tous les liens que les botanistes de Twitter ont trouvés intéressants. Une partie de cela pourrait être un commentaire sur la vie en science. Enfin, Articles scientifiques est une sélection des articles les plus populaires partagés sur Twitter ainsi que quelques versions préliminaires des revues AoB. Il n'y a pas de prix pour la lecture tous donc je ne serai pas offensé si vous lisez simplement la partie qui vous intéresse - c'est pourquoi nous avons les liens vers les différentes sections en haut.

De AoBBlog

Cartographie des gènes du blé pour la longueur des poils racinaires dans les lignées aneuploïdes de blé panifiable
Les longs poils absorbants permettent l'absorption efficace des nutriments peu mobiles tels que le phosphore. La cartographie des emplacements chromosomiques des gènes qui contrôlent la longueur des poils absorbants peut aider à exploiter la variation naturelle au sein des cultures pour développer des cultivars améliorés. Liu et al. souches génétiques utilisées du blé (Triticum aestivum) cultivar 'Chinese Spring' pour cartographier les gènes contrôlant la longueur des poils racinaires.

Le garde-manger secret de l'Amérique ancienne
La prochaine grande chose dans votre assiette pourrait être des plantes qui ont d'abord été domestiquées il y a cinq mille ans, puis oubliées pendant des siècles.

La botanique est vraiment géniale !
Car une vie végétale en bordure, comme à flanc de falaise, doit être paisible. Mais Nigel Chaffey découvre qu'une espèce a un réel talent pour ennuyer les autres.

Différents types de réponses des talles de riz à l'azote
Le tallage est un trait agronomique important pour la qualité de la population de riz et la production céréalière. Dans une étude récente publiée dans AoB PLANTS, Wang et al. ont constaté que l'application d'engrais azotés augmentait le nombre de talles de riz, mais que toutes les talles ne contribuaient pas de la même manière au rendement global.

Variation intra-spécifique des stratégies fonctionnelles d'Arabidopsis
A l'aide d'une gamme d'Arabidopsis (Arabidopsis thaliana) accessions d'origines géographiques différentes, mai et al.tester si la théorie du concurrent, de la tolérance au stress et de la rudérale (CSR) peut être appliquée pour caractériser la variation intra-spécifique.

3 façons de lutter contre la cécité des plantes
La conservation des plantes reçoit une fraction du financement que la conservation des animaux reçoit. Un article récent dans Conservation Biology blâme la cécité des plantes. Existe-t-il une solution ?

Ouvrage éclairant sur la domestication du haricot
Que pouvez-vous faire avec une lumière 10 milliards de fois plus brillante que le soleil ? Une chose que vous pouvez faire est d'examiner des enrobages de semences vieux de 4000 ans.

Les réserves de carbone favorisent une utilisation efficace des nitrates lors de la repousse du ray-grass vivace
La repousse des plantes en réponse à la défoliation repose sur une utilisation efficace de l'azote. Roche et al. trouvent que la remobilisation des réserves de glucides solubles dans l'eau dans les feuilles de ray-grass vivace (Lolium Perenne) est coordonné avec la disponibilité de l'azote pour favoriser une assimilation efficace de l'azote en acides aminés dans les tissus des feuilles et de la gaine.

Présentation de la semaine en botanique
Apparemment, il existe une liste de diffusion appelée The Week in Botany d'AoBBlog.

Développement de cultures bioénergétiques durables pour les climats futurs 24-27 septembre 2017

Vous êtes invités à nous rejoindre à Bioénergie 2017. Cette réunion réunira des chercheurs, des sélectionneurs, des producteurs et des décideurs politiques concernés par le développement de nouvelles cultures bioénergétiques pour les climats futurs.

Actualités

Chaude et sèche, Madrid vise un avenir plus frais et plus vert
Les touristes inondent la zone du "Museum Mile" de Madrid - un tronçon de l'immense artère Paseo del Prado à huit voies qui abrite les musées d'art les plus renommés d'Espagne. C'est smog et bondé avec tout le trafic. Au CaixaForum, une fondation artistique, les gens s'arrêtent. C'est ce qu'il y a à l'extérieur de ce musée, plutôt que ce qu'il y a à l'intérieur, qui les a arrêtés : un jardin vertical géant avec plus de 15,000 300 plantes de XNUMX espèces indigènes - bégonias, plantes de yucca, fougères - recouvrant tout un mur extérieur s'étendant sur toute la longueur d'une ville bloc.

Scientifiquement parlant, votre PowerPoint craint
Une étude du Decision Science Laboratory de Harvard utilise la science du cerveau pour expliquer pourquoi nous préférons certains types de présentations à d'autres.

Pourquoi débat-on encore des OGM ?
Un nouveau film a relancé la polémique sur ce que nous mangeons.

L'Espagne craint pour l'huile d'olive «or liquide» alors qu'une bactérie destructrice frappe durement les bosquets
Après avoir ravagé des oliveraies entières en Italie et être apparue l'an dernier aux îles Baléares, le premier cas de la bactérie destructrice Xylella fastidiosa a été confirmé en Espagne continentale, ce qui inquiète les agriculteurs du pays où l'huile d'olive est un véritable or liquide.

Une base de données massive de 182,000 XNUMX feuilles aide à prédire les arbres généalogiques des plantes
L'histoire d'une plante est gravée dans ses feuilles. Un arbre poussant dans un environnement froid avec beaucoup d'eau est plus susceptible d'avoir de grandes feuilles avec de nombreuses dents dentelées sur les bords. Mais si la même espèce vit dans une région chaude et sèche, ses feuilles sont susceptibles d'être plus petites et plus lissesUn atlas recensant les formes de 182 000 feuilles appartenant à 141 familles de plantes et provenant de 75 régions du monde entier s’avère prometteur pour affiner la capacité des scientifiques à interpréter cette histoire.

Le débat bouillonnant de la biologie sur la publication précoce de la recherche
Il y a cinq ans, Daniel MacArthur s'est lancé dans la construction d'une immense bibliothèque d'humains séquences de gènes-un le plus grand de tous les temps. Les 60,706 XNUMX séquences brutes, collectées auprès de collègues du monde entier, ont occupé un pétaoctet de mémoire. C'était le genre de projet flashy et à succès qui assurerait à MacArthur une place convoitée dans l'une des trois meilleures revues scientifiques, lançant son nouveau laboratoire au Broad Institute sous les projecteurs scientifiques. Mais avant que tout cela n'arrive, il a fait quelque chose qui a compté comme un acte de radicalisme dans le monde de la biologie : Il l'a mis sur Internet.

Le jour où j'ai cassé quelques flux Twitter : aperçu du sexisme dans le milieu universitaire, partie 2
Cet article fait suite à la tribune libre publiée la semaine dernière par Gina Baucom, dans laquelle elle relatait son expérience sur Twitter concernant les commentaires sexistes visant les femmes dans le milieu universitaire. Dans ce post, elle a résumé (et catégorisé) la variété des commentaires sexistes qui se produisent régulièrement dans le milieu universitaire. Les réponses à son tweet initial ont été écrasantes et son message d'origine a généré pas mal de discussions (dont certaines, malheureusement, sexistes). Dans cet article, Gina a des réflexions sur la façon d'aller de l'avant (avec quelques ajouts de ma part à la fin).

Sommes-nous aussi condamnés que ça Paris Article de magazine dit?
Pourquoi il est si difficile de parler du pire problème au monde

Errant dans le désert, à la recherche de plantes rares
Questions-réponses avec Janel Johnson, botaniste du Nevada Natural Heritage Program à Carson City, Nevada.

La mère de toutes les pommes disparaît
Dans la nature sauvage du Kazakhstan, il y a un arbre sans prétention qui porte un fruit sans prétention. Comme de nombreuses espèces végétales, le développement empiète sur son territoire habituel tandis que le changement climatique rend plus difficile la croissance de l'arbre et la production de fruits sains.

Les plantes transforment les chenilles en cannibales
Les produits chimiques produits par les plants de tomates en réponse aux attaques de ravageurs peuvent modifier le comportement des insectes.

Stocker et restaurer un maïs inestimable
Les catastrophes naturelles peuvent avoir un impact dramatique sur la diversité génétique des cultures, menaçant la sécurité alimentaire locale et mondiale. Lorsque l'ouragan Stan a balayé le Guatemala en 2005, faisant 1,500 XNUMX morts, de nombreux agriculteurs ont perdu des récoltes entières. Certaines communautés autochtones n'ont pas pu récolter les semences de leurs variétés traditionnelles de maïs, connues sous le nom de variétés locales.

Se connecter avec les arbres
Réflexions sur Les chants des arbres, un nouveau livre de David George Haskell

Rencontrez la mousse de pistolet à poudre
Une mousse qui ne s'attend pas au vent pour disperser sa progéniture.

Nouvellement créé, un parc national en Australie dévoile une nouvelle espèce végétale
Une équipe de botanistes des États-Unis a nommé une nouvelle espèce de tomate de brousse, basée sur des collections réalisées par leurs collègues australiens, lors d'enquêtes financées par le gouvernement dans un tout nouveau parc national.

Archives, Herbier et Arctique : Préservation de la Biodiversité au RBGE
Le lundi 26 juin, Emily et moi avons fait équipe à nouveau et sommes retournés au RBGE, cette fois pour rencontrer l'un des membres du personnel responsable de la numérisation. Nous lui avions précédemment envoyé une liste de ces documents d'archives que nous avons identifiés pour notre projet afin de déterminer quel équipement de numérisation nous aurions besoin d'utiliser.

Pressage de plantes bricolage
Comment un spécimen de plante devient-il une feuille d'herbier, prête pour une collection du Musée ? Pour que les plantes soient soigneusement cataloguées et conservées afin qu'elles puissent être étudiées longtemps dans le futur, elles doivent d'abord être séchées et pressées. Vous pouvez faire quelque chose de similaire à la maison - ce projet de bricolage est un peu comme faire un gâteau en couches (ou des lasagnes, selon vos goûts)

Le travail de terrain, l'horreur de devoir faire de la science dehors !
Je ne sors pas beaucoup – à la fois socialement et du point de vue de la recherche. Le premier est surtout dû aux heures ridicules requises par le second. Mais de toute façon, je passe plus de temps à l'intérieur à me prélasser dans la lueur des tubes fluorescents (ou des tubes de LED à économie d'énergie fantaisistes et coûteuses) qu'avec l'étrange truc vert sur le sol et la grande lumière dans le ciel que tu ne peux pas allumer désactivé.

Présentation de l'apprenant
Nous sommes heureux de vous présenter le apprenant package, désormais disponible sur CRAN. Le package learnr permet de transformer facilement n'importe quel document R Markdown en un didacticiel interactif. Les didacticiels consistent en un contenu ainsi que des composants interactifs pour vérifier et renforcer la compréhension.

Des chercheurs de Brisbane découvrent qu'une plante indigène australienne peut tuer le virus Zika
Les chercheurs de QUT, en collaboration avec Health Focus Products Australia (HFPA), ont découvert un groupe de composés naturels dans une plante indigène australienne qui tue efficacement le virus Zika.

Les défenseurs de l'environnement sont tués en nombre record dans le monde, selon une nouvelle étude
Des militants, des gardes forestiers et des dirigeants autochtones meurent violemment au rythme d'environ quatre par semaine, avec un sentiment croissant dans le monde que "n'importe qui peut tuer des défenseurs de l'environnement sans répercussions"

Edward Bulkley et l'herbier Du Bois
À l'approche (ou est-ce un ralentissement ?) de la retraite, je dois vider mon bureau, y compris quatre armoires d'herbier remplies de spécimens mis de côté de temps en temps en attendant de nouvelles recherches. L'un d'eux est un groupe de 52 feuilles indiennes principalement collectées à Fort St George, l'actuelle Chennai dans le sud de l'Inde, entre 1700 et 1712, qui sont parmi les plus anciens spécimens de l'herbier RBGE.

Organiser une tige de plante
La microscopie et les techniques informatiques révèlent comment les cellules sont disposées dans les tiges de certaines plantes.

Les mesures individuelles les plus efficaces pour lutter contre le changement climatique ne sont pas discutées
Selon de nouvelles recherches, les gouvernements et les écoles ne communiquent pas les moyens les plus efficaces pour les individus de réduire leur empreinte carbone.

Arche de l'Apocalypse
Partout dans le monde, des scientifiques créent des banques de données contenant de tout, des graines à la glace en passant par le lait de mammifères — dans une course contre la montre pour préserver un ordre naturel qui disparaît rapidement.

Appel à contributions : Numéro spécial sur l'écologie et l'évolution de la reproduction des plantes

Les botanistes ont longtemps été fascinés par l'extraordinaire diversité des modèles de reproduction des plantes à fleurs et ont cherché à comprendre les processus écologiques et les mécanismes génétiques influençant l'accouplement des plantes. Au cours des cinq dernières années, les progrès de la recherche dans cette discipline se sont rapidement accélérés. De nouvelles idées importantes dans ce domaine combinent souvent des modèles théoriques élégants avec des expériences innovantes sur le terrain et en laboratoire. Annals of Botany publiera un numéro spécial sur l'écologie et l'évolution de la reproduction des plantes en janvier 2019, et il mettra en lumière les articles de 3 symposiums au XIXe Congrès international de botanique à Shenzhen, en Chine. Voir l'appel à communications complet pour plus d'informations.

Articles scientifiques

Différences morphologiques et physiologiques spécifiques au sexe chez la mousse Ceratodon purpureus (Dicranales)
Dans cette étude, les traits morphologiques des cellules et des feuilles spécifiques au sexe à petite échelle sont corrélés avec la physiologie spécifique au sexe et les sex-ratios de la population ont été évalués pour déterminer comment ils varient entre trois populations au sein d'une espèce de mousse et si les traits morphologiques à petite échelle s'étendent jusqu'à caractéristiques physiologiques et sex-ratio. Annals of Botany

Un marqueur criblable rapide et non destructif, FAST, pour identifier les graines transformées de Arabidopsis thaliana
L'établissement de lignées transgéniques homozygotes prend du temps et est laborieux, et l'utilisation d'antibiotiques ou d'herbicides pour sélectionner des plantes transformées peut nuire à la croissance de certaines plantes transgéniques. Nous décrivons ici une nouvelle technologie, que nous avons nommée FAST (fluorescence-accumulating seed technology), qui surmonte ces difficultés. Bien que cette technologie ait été conçue pour être utilisée sur Arabidopsis thaliana, elle peut être adaptée pour être utilisée sur d'autres plantes. Le journal des plantes

Évolution du champignon de la pyrale du blé par des pertes fonctionnelles dans un déterminant de la spécificité de l'hôte
Dans les années 1980, les cultures de blé ont commencé à céder à l'agent pathogène fongique qui cause la pyriculariose. Observée pour la première fois au Brésil, la pyrale du blé l'an dernier a causé des pertes de récoltes dévastatrices au Bangladesh. Inoué et al. traqué la génétique changeante qui a permis l'émergence de cette menace potentiellement mondiale pour les cultures de blé (voir la perspective de Maekawa et Schulze-Lefert). Les variétés de blé avec un gène de résistance désactivé étaient sensibles aux souches pathogènes qui affectaient les cultures d'avoine et de ray-grass. Des modifications génétiques ultérieures de l'agent pathogène ont amplifié la virulence du blé. Science

Le potentiel de co-évolution des mécanismes de concentration de CO2 et de Rubisco chez les diatomées
Cette revue explore notre compréhension actuelle de la diatomée CO₂-mécanismes de concentration (CCM) et met en évidence la diversité des cinétiques CCM et Rubisco. Nous suggérerons des facteurs environnementaux, physiologiques et évolutifs possibles pour la co-évolution du CCM et de Rubisco chez les diatomées. JXB

L'inhibition de l'ARN polymérase II permet une mobilisation contrôlée des rétrotransposons pour la sélection végétale
Ici, nous montrons que les plantes défectueuses en activité Pol II perdent la méthylation de l'ADN au niveau des séquences répétées et produisent plus d'ADN de rétrotransposon extrachromosomique lors d'un stress dans Arabidopsis et riz. Nous démontrons que l'inhibition combinée de la méthylation de l'ADN et de l'activité Pol II conduit à une forte mobilisation dépendante du stress de la réponse à la chaleur. ONSEN rétrotransposon en Arabidopsis les semis. Biologie du génome

La sélection rapide : un outil puissant pour accélérer la recherche et la sélection des cultures
Nous présentons ici une méthode appelée « élevage rapide », qui raccourcit considérablement le temps de génération et accélère les programmes d'élevage et de recherche. La sélection rapide permet d'atteindre jusqu'à 6 générations par an pour le blé de printemps (Triticum aestivum), blé dur (T.durum), orge (Zea mays), pois chiche (Cicer Arietinum) et pois (Pisum sativum) et 4 générations pour le canola (Brassica napus), au lieu de 2-3 dans des conditions normales de serre. bioRxiv

Le potassium, et non le lépidimoïde, est le principal « allélochimique » de l'exsudat de graines de cresson qui favorise l'allongement de l'hypocotyle de l'amarante (Accès libre)
Cresson imbibé (Lepidium sativum L.) les graines exsudent des « allélochimiques » qui favorisent un allongement excessif de l'hypocotyle et inhibent la croissance des racines chez les compétiteurs voisins, par exemple l'amarante (Amarante caudée L.) semis. Il a récemment été démontré que le principal promoteur de l'hypocotyle n'était pas le disaccharide acide précédemment suggéré, l'acide lépidimoïque (LMA), un fragment du domaine polysaccharidique pectique rhamnogalacturonan-I. La nature du promoteur de l'hypocotyle a maintenant été réévaluée. Annals of Botany

Cellules de chaussée et énigme de la topologie
Nous étudions la topologie des feuilles d'Arabidopsis en développement composées uniquement de cellules de pavage. L'analyse d'images d'environ 50,000 XNUMX cellules révèle une signature topologique claire et unique, déviant des tissus épidermiques précédemment étudiés. bioRxiv

L'analyse du génome entier des gènes candidats associés à la taille et au poids des graines de Sorghum bicolor révèle des signatures de sélection artificielle et des informations sur la domestication parallèle dans les cultures céréalières
Cette étude a identifié des orthologues de gènes de sorgho ayant des effets prouvés sur la taille et le poids des graines chez d'autres espèces végétales et a recherché des preuves de sélection lors de la domestication en utilisant les données de reséquençage d'un panel de diversité. Au total, 114 gènes candidats de taille de graine ont été identifiés dans le sorgho, dont 63 présentaient des signaux de sélection purificatrice lors de la domestication. frontières en sciences végétales

Spécimens d'herbier comme exaptations : nouvelles utilisations pour d'anciennes collections
Les fonctions traditionnelles des herbiers demeurent essentielles à la recherche botanique : de nouvelles espèces continuent d’être décrites, les relations systématiques sont constamment révisées, la nomenclature est régulièrement mise à jour et la documentation et l’étude de la biodiversité revêtent une importance croissante à l’heure où nous entrons dans une ère d’extinctions massives d’origine anthropique. Cependant, de nouvelles recherches utilisent également les spécimens de manière non traditionnelle et inattendue. AmJBot

Point de vue : les scientifiques nomades et ceux qui restent
Pour améliorer la diversité de la main-d'œuvre scientifique, nous ne devons pas pénaliser les chercheurs qui ne peuvent pas se déplacer à l'étranger pendant de longues périodes. eLife

Développement d'une plateforme de phénotypage pour le criblage à haut débit de l'angle nodal des racines chez le sorgho
L'objectif de cette étude était de développer une plateforme de phénotypage pour la mesure rapide, non destructive et numérique de l'angle nodal des racines du sorgho au stade plantule. Méthodes végétales

Rôle de LAX2 dans la régulation du développement du xylème et de la symétrie des nervures latérales dans la feuille
En étudiant des plantes transgéniques Arabidopsis exprimant de manière ectopique le facteur de transcription du tournesol HaHB4, il a été observé qu'il y avait une asymétrie significative des nervures latérales dans les feuilles et dans la formation du xylème par rapport aux plantes de type sauvage. Pour démêler les mécanismes moléculaires à l'origine de ce phénotype, des gènes différentiellement exprimés dans ces plantes et liés à l'influx d'auxine ont été étudiés. Annals of Botany

…et ça ferme La semaine en botanique pour cette semaine. Si vous avez décidé que tout cela est un peu trop et que vous préférez ne pas le voir dans votre boîte de réception, vous pouvez cliquer pour vous désabonner. Sinon, la prochaine édition est prévue pour être avec vous lundi prochain. Si vous êtes arrivé jusqu'ici, merci d'avoir lu.