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Rubriques : à partir de Botanique Un | Actualités | Articles scientifiques

Comme toujours, nous avons ci-dessous les histoires et articles botaniques les plus populaires partagés par nos abonnés sur Twitter @botanyone. Si vous souhaitez que votre article soit répertorié ci-dessous, ce serait peut-être une bonne idée de demander à vos amis de vous aider. Ou vous pouvez contacter notre rédactrice Anne Osterrieder (@anneosterrieder ou editor@botany.one).

De Botany One

Analyse des modèles biogéographiques à l'aide de l'extraction de SNP du génome des chloroplastes
Non seulement la méthode pool-seq est remarquablement précise dans la mesure des fréquences SNP, mais elle peut également révéler de nouvelles informations que les études biogéographiques de la distribution des plantes ne peuvent pas, à savoir des données sur la quantité relative de dispersion efficace à travers les barrières géographiques.

Halloween et la plante monstre
Cette semaine, la plus grande fleur de la planète, également connue sous le nom de "Reine de toutes les plantes parasites", est venue à Oxford - mais pas de la manière à laquelle on pourrait s'attendre.

Un nouvel angle sur l'amélioration du rendement des cultures
Pour les tournesols, un ami n'est pas quelqu'un sur qui on peut s'appuyer, comme le découvre Nigel Chaffey.

Suppression des pathogènes fongiques Brassica par Bacillus amyloliquefaciens
De nouvelles formes de fengycines linéaires potentiellement antifongiques pourraient servir de base au développement d'agents phytosanitaires plus puissants.

Évolution des systèmes de pollinisation impliquant des trichomes comestibles chez les orchidées
Des trichomes comestibles ont été enregistrés dans plusieurs familles de plantes. Cependant, les poils alimentaires n'ont pas été enregistrés parmi les Catasetinae, une sous-tribu des Orchidaceae.

Un modèle basé sur le transcriptome pour le changement de couleur chez Lotus et l'émergence de la pollinisation des oiseaux
Le changement de couleur post-anthèse (PACC) est très répandu chez les angiospermes. Pourtant, nous savons peu de choses sur la façon dont ce trait fonctionne au niveau moléculaire.

Appel à contributions : Numéro spécial sur l'écologie et l'évolution de la reproduction des plantes

Les botanistes sont depuis longtemps fascinés par l'extraordinaire diversité des modes de reproduction des plantes à fleurs et cherchent à comprendre les processus écologiques et les mécanismes génétiques qui influencent leur reproduction. Ces cinq dernières années, la recherche dans ce domaine a connu une accélération fulgurante. Les avancées majeures dans ce domaine associent souvent des modèles théoriques élégants à des expériences innovantes menées sur le terrain et en laboratoire. Annals of Botany publiera un numéro spécial sur l'écologie et l'évolution de la reproduction des plantes en janvier 2019, et il mettra en lumière les articles de 3 symposiums au XIXe Congrès international de botanique à Shenzhen, en Chine. Voir l'appel à communications complet pour plus d'informations.

La mort subite du chêne ravage les sapins du nord-ouest du Pacifique
Les scientifiques ont récemment découvert une maladie mortelle des plantes qui infecte les sapins du nord-ouest du Pacifique. Cette souche «européenne» de la mort subite du chêne (Phytophthora ramorum) est apparue dans le sud-ouest de l'Oregon il y a quelques années, et on savait qu'elle se propageait aux sapins en Europe. Cette maladie a tué des millions de tanoaks et plusieurs espèces de chênes (coast live oak, California black oak, Shreve oak et canyon live oak). Entretien total du paysage

Des génomes de citrouille séquencés révélant une histoire évolutive peu commune
Pour certains, les citrouilles évoquent des décorations d'Halloween sculptées, mais pour de nombreuses personnes dans le monde, ces gourdes fournissent de la nutrition. Des scientifiques du Boyce Thompson Institute (BTI) et du National Engineering Research Center for Vegetables de Pékin ont séquencé les génomes de deux espèces importantes de citrouilles, Cucurbita maxima et Cucurbita moschata.Institut Boyce Thompson

Un agriculteur italien mène une bataille solitaire contre une vague continentale de superstition
Près de la ville italienne du nord-est de Pordenone, où la plaine fertile s'étend entre Venise sur la côte Adriatique et les contreforts des Alpes, un homme a mené une bataille solitaire contre la superstition.Cornell Alliance pour la science

De nombreux universitaires sont impatients de publier dans des revues sans valeur
La concurrence est féroce pour être publié dans des revues de premier plan. Mais qu'en est-il des professeurs surmenés dans des écoles et des collèges communautaires moins prestigieux, sans grandes subventions et sans laboratoires à la pointe de la technologie ? Comment avancent-ils ?NY Times

Un petit groupe s'empare d'un effort international pour séquencer un énorme génome de blé
Seulement six scientifiques conquièrent l'un des génomes les plus compliqués jamais lus.Nature

Collecte de plantes et expérience vécue de la botanique : la collection malaisienne de Bill Burtt
Brian Lawrence 'Bill' Burtt (1913-2008) a commencé sa carrière en tant que taxonomiste à Kew Gardens, avant de venir au Royal Botanic Garden Edinburgh (RBGE) en 1951. Tout au long de sa carrière, il a joué un rôle important dans le développement de RBGE comme une institution, supervisant de nouveaux programmes de recherche et des publications académiques.Histoires botaniques

Les mousses anciennes suggèrent que l'île de Baffin au Canada est la plus chaude depuis 45,000 XNUMX ans
Bonjour Soleil! Les mousses enfouies dans la glace de l'île de Baffin au Canada dégèlent pour la première fois depuis au moins 45,000 45,000 ans, ont rapporté des chercheurs la semaine dernière lors de la réunion annuelle de la Geological Society of America. Les scientifiques ont utilisé la datation au radiocarbone pour déterminer quand les mousses enfermées dans les glaciers étaient pour la dernière fois capables de photosynthèse – et donc, pour la dernière fois exposées à la lumière du soleil. Ils ont découvert que certaines plantes étaient si vieilles qu'elles n'avaient plus de radiocarbone, leur âge se situant entre au moins 50,000 XNUMX et XNUMX XNUMX ans, rapporte Science News.Science

À la ferme, les investisseurs se salissent les mains
Jesse Fink était co-fondateur et directeur de l'exploitation du site Internet de voyages Priceline lorsqu'il est devenu public en 1999. L'offre l'a rendu instantanément riche et il a pris sa retraite presque immédiatement. Lui et sa femme, Betsy, qui s'étaient rencontrés à l'école forestière, ont pris leur aubaine et ont commencé à investir non pas dans d'autres entreprises technologiques de haut vol, mais dans la terre : d'abord un vignoble à Long Island, puis un verger de pêchers au Colorado et finalement atterrir dans Wilton, Conn., qui est devenu Millstone Farm.NY Times

Les animaux de la forêt vivent à la lisière
Une nouvelle étude mondiale révèle les conséquences de la fragmentation des forêts du monde.The Atlantic

Les couleurs végétales ne sont pas que des pigments
La scientifique de Kew, Paula Rudall, réfléchit à une collaboration à long terme entre Cambridge et Kew et explique pourquoi la couleur structurelle des plantes est si importante dans le monde naturel, notamment en aidant les oiseaux et les abeilles à trouver de la nourriture et à polliniser les fleurs.Sciences de Kew

Rencontrez le Dr Maribeth Latvis, une botaniste qui étudie les modèles de biodiversité végétale !
Maribeth a obtenu son baccalauréat de l'Université du Michigan en 2005. Elle a travaillé comme assistante de recherche à l'Oregon State University et comme responsable de laboratoire à l'Université de Harvard, avant de retourner aux études supérieures à l'Université de Floride, où elle a obtenu son doctorat. . en biologie en 2013. Depuis lors, elle a travaillé comme chercheuse postdoctorale à l'Université de l'Idaho et commencera un poste de professeur menant à la permanence à la South Dakota State University en 2017.La femme scientifique

La police allemande découvre que la "bombe WW2" était une grosse courgette
Un Allemand craignait qu'une courgette monstre qu'il avait trouvée dans son jardin soit une bombe non explosée de la Seconde Guerre mondiale et a appelé la police.BBC

Appel à contributions : Développer des cultures bioénergétiques durables pour les climats futurs

Des progrès rapides ont été réalisés au cours des cinq dernières années en ce qui concerne les nouvelles technologies génomiques émergentes pour l'amélioration des cultures et cela Annals of Botany Spécial Le numéro sera consacré à mettre en évidence les dernières découvertes et à considérer le potentiel de ces technologies pour le déploiement futur des cultures bioénergétiques face au changement climatique. Dans le même temps, des recherches de pointe permettant de mieux comprendre les caractéristiques complexes des plantes qui sous-tendent la tolérance à la sécheresse et la réponse à d'autres stress abiotiques et biotiques sont nécessaires pour ces cultures relativement nouvelles. Les connaissances dans ce domaine seront rassemblées dans ce numéro spécial, et l'accent sera mis sur les progrès récents du phénotypage à haut débit pour démêler ces réponses complexes. Voir l'appel à communications complet pour plus d'informations.

Articles scientifiques

Cellules de chaussée et énigme de la topologie
Les cellules de la chaussée épidermique des feuilles se développent en formes de pièces de puzzle, s'écartant fortement de ces formes classiques. Nous étudions la topologie des feuilles d'Arabidopsis en développement composées uniquement de cellules de pavage. Développement

Les effecteurs impliqués dans l'interaction champignon-champignon conduisent à un phénomène rare d'hyperbiotrophie dans le système tritrophique agent de lutte biologique-oïdium-plante
Notre étude a mis au jour un phénomène complexe et complexe, décrit ici comme une hyperbiotrophie, uniquement réalisable grâce à l'action conjuguée des trois protagonistes.
New Phytologist

Biais d'échantillonnage généralisés dans les herbiers révélés par la numérisation à grande échelle
Les études utilisant des collections d'herbier devraient tenir compte des biais d'échantillonnage, et les futurs efforts de collecte devraient éviter d'aggraver ces biais dans la mesure du possible. New Phytologist

Analyse protéomique quantitative de la signalisation de l'auxine pendant le développement des semis
Ces données décrivent de nouveaux protéomes régulés par l'auxine et constituent une excellente ressource pour identifier de nouveaux composants de signalisation en aval liés à la croissance et au développement des plantes médiées par l'auxine. bioRxiv

Un catalogue commun révèle la diversité microbienne multi-échelle de la Terre
Des protocoles coordonnés et de nouvelles méthodes analytiques, en particulier l'utilisation de séquences exactes au lieu d'unités taxonomiques opérationnelles en cluster, permettent de suivre les séquences de gènes d'ARN ribosomal bactérien et archéen dans de multiples études et nous permettent d'explorer des modèles de diversité à une échelle sans précédent. Le résultat est à la fois une base de données de référence donnant un contexte global aux données de séquences d'ADN et un cadre pour incorporer les données des études futures, favorisant une caractérisation de plus en plus complète de la diversité microbienne de la Terre. Nature

Dynamique évolutive de la symbiose mycorhizienne dans la diversification des plantes terrestres
On a longtemps émis l'hypothèse que les Glomeromycotina, les symbiotes mycorhiziens de la majorité des plantes, ont facilité la colonisation des terres par les plantes à l'Ordovicien. Ce point de vue a été récemment remis en question par la découverte d'associations mycorhiziennes avec Mucoromycotina dans plusieurs premières lignées divergentes de plantes terrestres. En utilisant une grande base de données au niveau des espèces des associations mycorhiziennes des plantes et une approche bayésienne de la dynamique de transition d'état, nous montrons ici que le recrutement de Mucoromycotina est la transition la mieux supportée à partir d'un état non mycorhizien. bioRxiv

La diversité du génome de Solanum à tubercules révèle une histoire évolutive complexe et des cibles de domestication dans la pomme de terre cultivée
L'analyse de la pomme de terre cultivée et de ses parents sauvages à l'aide d'approches génomiques modernes peut donner un aperçu de la diversité génomique du matériel génétique existant, révéler des introgressions historiques et des événements d'hybridation, et identifier les gènes ciblés lors de la domestication qui contrôlent la variance des traits agricoles, toutes des informations essentielles pour assurer la sécurité alimentaire dans l'agriculture du XXIe siècle. PNAS

L'architecture et la diversité du génome de l'amidonnier sauvage élucident l'évolution et la domestication du blé
Avni et al. ont utilisé la méthode Hi-C de capture de confirmation du génome pour assembler et annoter le blé sauvage allotétraploïde (Triticum turgidum). Ils ont ensuite identifié les mutations causales putatives dans les gènes contrôlant l'éclatement (un trait clé de domestication chez les céréales). Science

Un nématode phytophage augmente indirectement la condition physique d'un puceron
Nos données suggèrent une interaction positive et asymétrique entre un nématode endoparasite sédentaire et un insecte suceur de sève. La réponse systémique du plant de pomme de terre suite à une infection par G. pallida influence indirectement les performances de M. persicae. Ce travail révèle des avantages secondaires supplémentaires de la lutte contre les ravageurs des cultures individuelles. Frontiers in Plant Science

Recombinaison haute fréquence entre les membres d'une famille de rétrotransposons LTR lors des rafales de transposition
Ici, nous fournissons des preuves chez Arabidopsis que les anciens membres entrent dans des cycles de réplication/transposition grâce à des taux élevés de recombinaison intrafamiliale. La recombinaison se produit par paires, ressemblant à la formation de rétrovirus recombinants. Ainsi, chaque salve de transposition génère une nouvelle population de descendants de rétrotransposons LTR intégrés chromosomiquement constitués de produits de recombinaison par paires produits dans un processus comparable à l'échange sexuel d'informations génétiques. Communications Nature

Revisiter les critères d'annotation des miARN végétaux à l'ère du big data
Les avancées conceptuelles et informatiques ont facilité une classification de plus en plus rigoureuse de ces ARN, en utilisant notre meilleure compréhension de leur biogenèse. Cependant, le nombre de siARN endogènes par rapport aux miARN a été un facteur majeur dans l'annotation erronée des siARN en tant que miARN. Les inexactitudes historiques dans les annotations et les définitions des miARN doivent être reconnues et mises à jour, et des systèmes d'annotation améliorés pour toutes les classes de petits ARN végétaux sont nécessaires. Nous proposons donc des critères mis à jour pour les annotations de miARN végétaux adaptés à l'ère des « big data » en biologie. bioRxiv

Les changements d'accessibilité de la chromatine entre les cellules souches d'Arabidopsis et les cellules du mésophylle éclairent les réseaux de facteurs de transcription spécifiques au type de cellule
Une brève description va icibioRxiv

Et cela met fin à l'e-mail cette semaine. Le temps a tourné ici donc je vais aller chercher un thé chaud et peut-être des toasts. J'espère que partout où tu es, il fait plus chaud. Prenez soin de vous jusqu'à la semaine prochaine.