Féverole (Vicia faba), souvent appelée fève, est l'une des plus importantes cultures de légumineuses alimentaires et fourragères au monde. Les fèves contiennent des niveaux très élevés de protéines et de fibres alimentaires. D'un point de vue agronomique, elles sont plus durables que les cultures céréalières en raison de leur capacité à fixer l'azote atmosphérique, réduisant ainsi l'utilisation d'engrais. Il peut pousser dans des conditions d'irrigation limitée, de salinité modérée et de basse température.
Avec la demande de protéines végétales et d'alternatives plus saines à la viande qui poussent d'année en année, il est nécessaire de se concentrer sur la sélection de nouvelles variétés de fèves à rendement plus élevé et plus résistantes. Cependant, l'utilisation de la sélection assistée par marqueurs pour l'amélioration de la fève est actuellement limitée par la disponibilité des données de séquence d'ADN génomique.
Dans leur nouvel article publié dans AoBP, Mokhtar et al. présenter le Vicia faba Base de données omiques (VfODB) en tant que centre complet d'accès libre d'informations sur le germoplasme, d'étiquettes de séquence exprimées (EST), d'étiquettes de séquence exprimées - répétitions de séquences simples (EST-SSR) et de répétitions de séquences simples mitochondriales (mtSSR), marqueurs de microARN cibles et cartes génétiques dans la fève. Le VfODB intègre 31536 EST, 9071 EST-SSR et 3023 marqueurs cibles de microARN développés sur la base de V. faba Minage RefTrans-V2.
Mokhtar et al. espérer que VfODB servira de base de données puissante pour la communauté de recherche sur la fève et les sélectionneurs intéressés par la sélection assistée par la génomique. Le VfLa base de données ODB sera régulièrement mise à jour avec les ressources génomiques, transcriptomiques et bibliographiques nouvellement publiées. De plus, la conception et les outils du hub seront régulièrement améliorés, affinés et soutenus.
