Les plantes clonales produisent une progéniture génétiquement identique grâce à la croissance végétative. Lorsqu'il fait référence à une progéniture clonale, un «ramet» fait référence à un seul individu physiologique produit par propagation clonale, tandis qu'un «genet» fait référence à un groupe de ramets issus d'une seule graine. Certaines espèces végétales clonales produisent de nouveaux ramets à l'extrémité des rhizomes souterrains, ce qui entraîne des difficultés à déterminer les distributions des ramets individuels et à les attribuer aux genettes. Non seulement ce processus nécessite l'excavation d'organes végétaux souterrains, mais il peut être incroyablement difficile dans des situations où les rhizomes allongés de ramets de plusieurs genettes sont entremêlés. Le génotypage offre une solution à ce problème, en utilisant des marqueurs génétiques pour attribuer des ramets aux genettes correspondantes.
Dans une étude récente publiée dans AoBP, Tsujimoto et al. ont étudié comment les ramets appartenant à différentes genettes étaient répartis dans une population naturelle de Cardamine leucantha à Hokkaido, au Japon. Cette espèce se caractérise par des rhizomes stolonifères exceptionnellement longs, atteignant jusqu'à 1.2 m de long. Les rhizomes entre les ramets mère et fille se déconnectent en 1 à 2 ans, ce qui signifie qu'une seule genette peut rapidement se développer en un groupe de ramets déconnectés répandus. À l'aide de marqueurs SNP à l'échelle du génome, les auteurs ont identifié 61 genets dans la population, bien qu'il y ait des inégalités à la fois en termes de taille de ces genets et de leur distribution. On pense que ces variations ont probablement été causées par l'âge des genettes. Les auteurs ont conclu que RAD-seq peut fournir des données permettant une attribution robuste de gènes pour des espèces telles que C. leucantha. Ils espèrent que les travaux futurs dans ce domaine aideront à comprendre exactement comment les grosses genettes deviennent dominantes.
