Malheureusement, il y a de mauvaises nouvelles cette semaine. in silico Rédacteur en chef des plantes, Stephen Long, est mort. Une brève nécrologie a été publié sur le site Web de l'Illinois, et je suis sûr que plus nécrologies plus longues apparaîtra lorsque la nouvelle sera assimilée.

Bien que les rédacteurs en chef de revues scientifiques soient idéalement des chercheurs actifs, lui et son équipe sont parmi les meilleurs dans leur domaine. Je pourrais citer ici quelques articles récents, mais sa page Google Scholar en montre dix depuis 2025. Si vous deviez le décrire en un mot, prolifique C'est peut-être vrai. Mais il ne publiait pas seulement des articles, il produisait des revues.

Je l'ai rencontré plusieurs fois pendant qu'il montait in silico Plantes, une revue qu'il a fondée pour offrir un espace de publication aux articles sur la modélisation végétale. Il a également été le fondateur de Global Change Biology et GCB Bioénergie et a annoncé le mois dernier une nouvelle revue GCB Communications. Ensemble, les revues ont accumulé près d’un million de citations, ce qui montre qu’il savait de quoi les scientifiques voulaient parler.

Mais l'impact ne se résume pas aux chiffres. On se perd facilement dans le nombre de publications et de revues, et chacune d'entre elles reposait sur des interactions humaines. Sa capacité à tisser des liens avec autant de personnes et à les encourager à collaborer avec lui en dit long sur lui. J'attendais avec impatience les réunions où je savais qu'il serait là, car je savais qu'il y aurait toujours quelque chose d'enthousiasmant. Cela me manquera, et je suis certain que je ne serai pas le seul.

C'est un autre courriel plus court, car j'étais encore en déplacement professionnel cette semaine. La semaine prochaine, pour changer, j'ai une visite à l'hôpital qui prendra un peu de temps. Cependant, je veillerai à avoir le temps de vous envoyer un autre courriel contenant les articles et les actualités que vous partagez. Mastodonte et Bluesky À la même heure la semaine prochaine. À la prochaine, prenez soin de vous.

Alun (webmaster@botany.one)

Sur Botany One

Comment les Tlahuica-Pjiekakjoo préservent leur patrimoine mycologique
Une collaboration d'une décennie révèle comment un groupe autochtone en voie de disparition détient des connaissances inégalées sur les champignons sauvages et comment il les transmet aux générations futures.

Ramiro Aguilar : « Les plantes sont les organismes les plus incroyables »
Botany One interviewe le Dr Ramiro Aguilar, parrainé par Annals of Botany pour parler à l'ATBC 2025.

Prospérité chez Allchar : tolérance à l'arsenic et au thallium chez les espèces de Viola
Les métallophytes de Viola ont développé la rare capacité de tolérer les métaux toxiques, leur permettant de prospérer dans les sols difficiles d'Allchar, en Macédoine du Nord.

Les espèces envahissantes surpassent les espèces indigènes en fleurissant hors saison
Une nouvelle étude révèle comment la floraison hors saison aide les plantes envahissantes à surpasser les espèces indigènes.

…et celui de la semaine dernière Semaine en botanique avec une perte d’immunité, un gain de parasites et des histoires inédites sur l’évolution des plantes.

Actualités et Opinions

L'héritage perdu lors de la fermeture des bureaux du Service forestier
Après 117 ans d'activité, le bureau régional du Sud-Ouest du Service des forêts des États-Unis à Albuquerque ferme ses portes sur ordre du secrétaire à l'Agriculture. Depuis 1908, ce bureau a supervisé la gestion de plus de 20 millions d'hectares de forêts nationales en Arizona et au Nouveau-Mexique. La haute direction a déjà quitté ses fonctions et de nombreux employés ont pris leur retraite, ont été mutés ou licenciés.

Pourquoi quelqu’un voudrait-il devenir scientifique ?
Il est difficile de comprendre pourquoi une personne suffisamment intelligente pour être scientifique choisirait de le devenir. Faire de la bonne science exige un effort physique et mental extrême, et pourtant, elle est constamment semée d'échecs et de rejets. Mais, chose étrange même pour moi, non seulement je ne remets pas en question le rapport risque/récompense défavorable, mais je m'estime incroyablement chanceux d'être scientifique. Trois plaisirs fondamentaux m'ont soutenu pendant cinquante ans de cette folie.

Les chercheurs peuvent-ils empêcher l’IA d’inventer des citations ?
Le GPT-5 d'OpenAI hallucine moins que les modèles précédents, mais supprimer complètement les hallucinations pourrait s'avérer impossible.

Éloge funèbre pour Teakettle
Le juge William O. Douglas, dans son opinion dissidente sur la décision de la Cour suprême dans l'affaire Sierra Club c. Morton, a déclaré : « La préoccupation publique contemporaine pour la protection de l'équilibre écologique de la nature devrait conduire à conférer aux organismes environnementaux le droit d'agir en justice pour leur propre préservation. » Son opinion poursuit en affirmant que les entreprises ont acquis la personnalité juridique, tout comme les systèmes naturels. Aujourd'hui, je souhaite donner la parole à la forêt expérimentale de Teakettle, un lieu qui a brûlé dans les premiers jours de septembre 2025.

Un jeune chercheur talentueux reçoit un financement important du Wellcome Trust
Le projet de recherche innovant d'un jeune chercheur en botanique du Centre John Innes a reçu un prestigieux financement d'une association caritative internationale œuvrant dans le domaine de la santé. Le Dr Miguel Montez, chercheur postdoctoral au sein du groupe de la professeure Caroline Dean, FRS, a reçu le prix Early-Career du Wellcome Trust.

Un feu de grenat brûle dans un bosquet de séquoias géants ; plusieurs mastodontes sont en flammes
Un incendie qui fait rage dans la forêt nationale de Sierra, dans le comté de Fresno, a ravagé une partie d'un grand bosquet de séquoias géants, mettant le feu à au moins quelques-uns de ces arbres rares et imposants.

Les scientifiques s'attaquent à Trump : ces chercheurs ripostent
Au travers de poursuites judiciaires, de suivi des subventions, de dénonciations et bien d’autres mesures, la résistance à la guerre des États-Unis contre la science s’accroît.

Livrer votre dose quotidienne de champignons
Nigel Chaffey critique Mushroom day : Une histoire de 24 heures et 24 vies fongiques, d'Alison Pouliot.

Une nouvelle voie conçue dans les plantes leur permet d'absorber plus de CO₂
La voie conçue permet au carbone d’être directement intégré dans les voies métaboliques clés.

Cette semaine en botanique

Il y a 5 ans : Deux voies d'évolution ont agi sur les "fossiles génomiques" du genre théier Camillia

Il y a 10 ans : Plantes vs téléphones portables

Il y a 15 ans : Chanceux bruyère? Non, trèfle !

Articles scientifiques

L'inactivation d'un gène lié à SPX pour la polyphosphate synthétase accélère les réponses à la privation de phosphate dans la microalgue oléagineuse Nannochloropsis océanique ($)
Les protéines contenant le domaine SPX sont importantes pour la signalisation du phosphate (Pi) et l'homéostasie chez divers eucaryotes. Analyses génomiques et transcriptomiques de la microalgue oléagineuse Nannochloropsis océanique identifié quatre gènes codant pour des membres de la famille SPX avec des architectures de domaine distinctes : SPX (NonSPX1), SPX-VTC(NonSPX2), SPX-EXS(NonSPX3), Et SPX-MFS (NonSPX4). Celles-ci Pas de SPX les gènes ont répondu différemment à la privation de Pi, avec NonSPX1 et NonSPX2 l'expression étant considérablement régulée à la hausse.

Ingénierie de l'horloge circadienne des plantes pour l'adaptation latitudinale comme stratégie pour garantir la productivité agricole sur une planète en mutation (GRATUIT)
Gerhardt et Mehta soutiennent qu'une adaptation latitudinale rapide des cultures à l'avenir est possible grâce à l'ingénierie ciblée de régulateurs circadiens exprimés le matin, l'après-midi et le soir dans des plantes cultivées ayant des phénologies distinctes.

Édition de précision de l'épigénome des plantes : quoi, comment et pourquoi ($)
Les progrès de l'ingénierie des génomes ont ouvert la voie à l'ingénierie ciblée de l'épigénome, apportant des éclairages fondamentaux sur le rôle des modifications épigénétiques dans l'hérédité des caractères. Les épiallèles modifiés ont déjà induit des modifications stables et héréditaires des caractères agronomiques. Malgré ces capacités, les progrès dans ce domaine n'ont pas encore atteint leur plein potentiel, laissant de nombreuses pistes de recherche inexplorées. Leech et al. examinent les facteurs qui influencent ces progrès, notamment les avancées des techniques actuelles d'édition de l'épigénome, les principaux objectifs de recherche et les applications translationnelles, ainsi que les défis liés à la sélection des loci cibles idéaux.

Conséquences évolutives des événements climatiques extrêmes ($)
Baeckens et Donihue examinent les conséquences évolutives des événements climatiques extrêmes et montrent comment elles dépendent des caractéristiques des événements eux-mêmes, des traits soumis à la sélection, de la capacité d'adaptation des populations touchées et du contexte écologique de la sélection.

Ce que les grands modèles linguistiques savent de la biologie moléculaire végétale (GRATUIT)
Les grands modèles de langage (GML) se répandent rapidement dans la recherche scientifique, mais leurs capacités en biologie moléculaire végétale restent largement méconnues. Fernandez Burda et al. présentent MoBiPlant, le premier banc d'essai complet pour l'évaluation des GML dans ce domaine, développé par un consortium de 112 chercheurs en biologie végétale issus de 19 pays.

Une grande diversité d'arbres exposés à des conditions macroclimatiques sans précédent, même dans des conditions de changement climatique anthropique minimes ($)
Les arbres jouent un rôle essentiel dans les écosystèmes terrestres, mais sont sensibles aux grands changements climatiques. Boonman et al. quantifient l'exposition au changement climatique de fin de siècle (déplacements vers les zones climatiques actuellement inoccupées des espèces) pour 32,089 XNUMX espèces d'arbres à l'échelle mondiale.

Reprogrammation transcriptionnelle conservée dans les cellules racinaires infectées par des nématodes (GRATUIT)
Saura-Sanchez et al. ont développé un cadre comparatif hôte-pathogène pour étudier le processus d'infection par les nématodes chez Arabidopsis et le riz. Grâce à une approche transcriptomique unicellulaire inter-espèces, ils ont identifié une signature moléculaire unique dans les cellules racinaires infectées et ont démontré que la reprogrammation cellulaire durant ces premiers stades est hautement conservée dans les deux interactions hôte-pathogène.

Un locus de caractère quantitatif multigénique sous-tend la variation naturelle Arabidopsis thaliana architecture du système racinaire et réponses transcriptionnelles aux dérivés du microbiote Pseudomonas (GRATUIT)
Les plantes interagissent avec des communautés microbiennes structurées appelées microbiotes, ce qui peut avoir un impact profond sur leur croissance et leur santé. Cependant, la manière dont les plantes perçoivent et réagissent à des membres spécifiques du microbiote au niveau moléculaire reste encore mal connue. Copeland et al. ont identifié des variations naturelles dans Arabidopsis thaliana réponses racinaires aux souches bactériennes du genre Pseudomonas, un genre essentiel du microbiote végétal.

Racines : architectes métaboliques de l'assemblage bénéfique du microbiome (GRATUIT)
Uribe-Acosta et al. soulignent le rôle multiforme des métabolites végétaux dans l'assemblage du microbiome racinaire, en se concentrant sur leur régulation dynamique par le génotype végétal, les conditions environnementales et les réponses immunitaires. Ils abordent le concept émergent des racines comme architectes métaboliques des microbiomes qui leur sont associés, où les interactions plante-métabolite-microbiome coévoluent parallèlement à des systèmes vitaux essentiels tels que l'immunité et l'acquisition de nutriments.

De distal à proximal : un continuum de facteurs qui façonnent la croissance des arbres et la répartition du carbone (GRATUIT)
La relation entre l'assimilation du carbone (C) des arbres et leur croissance est essentielle à la compréhension de leur fonctionnement et à la prévision de la séquestration du carbone forestier, mais elle reste non résolue. Le débat de longue date sur le C source vs lavabo L'étude des limites de la croissance a apporté des éclairages précieux, mais repose sur une fausse dichotomie. Recadrer cette question en termes de Distal-à-proximal Les processus qui pilotent l'activité du puits et les placent dans une compréhension plus large du partitionnement C offrent de nouvelles perspectives.

Dans les publications de l'AoBC

Carrières

Remarque : il s’agit d’articles qui ont été annoncés sur le Web. Ce ne sont pas des articles que je propose personnellement, et je ne peux pas non plus vous obtenir de visa pour travailler à l'étranger.

Stages éditoriaux JXB – Appel à candidatures
Nous sommes ravis d'annoncer l'ouverture d'un appel à candidatures pour la quatrième édition des stages éditoriaux JXB. Ces stages ont pour objectif de permettre aux chercheurs en début de carrière d'acquérir une expérience éditoriale de l'édition scientifique, de développer leur carrière de chercheur ou de se lancer dans l'édition scientifique.

Chargé de recherche principal (associé de recherche postdoctorale), Essex
PlantPlug est une initiative ambitieuse financée par l'ARIA et dirigée par le Dr Pallavi Singh. Elle redéfinit le rôle des plantes parasites en tant que biointerfaces vivantes programmables. Il s'agit d'une occasion rare de travailler à la pointe de la biologie synthétique, de la science du développement des plantes et de la communication interspécifique, en utilisant le gui comme un support entièrement nouveau pour le transfert de caractères entre plantes. Le/la candidat(e) retenu(e) jouera un rôle essentiel dans la construction et la mise en œuvre des bases expérimentales et techniques de cette subvention pionnière, de la germination et de la propagation in vitro du gui à la transformation génétique et aux tests d'intégration chez l'hôte.

Professeur titulaire de biochimie végétale, Tübingen
Le/La candidat(e) retenu(e) devra développer et mener un programme de recherche indépendant au Centre de biologie moléculaire végétale (ZMBP) sur la biochimie végétale. Ce programme de recherche devra se concentrer sur les aspects biochimiques de la composition, de la structure, de la dynamique et de la régulation des complexes protéiques végétaux et des molécules associées.

Chaire de génétique végétale, Kiel
Nous recherchons un scientifique possédant une excellente expérience internationale et menant des recherches pionnières dans les domaines de la génétique végétale, notamment sur la régulation des réponses au stress en milieu naturel et le rôle des facteurs épigénétiques dans l'adaptation au stress. Nous recherchons un scientifique spécialisé dans les aspects fondamentaux de la génétique végétale, à travers des travaux de recherche sur les plantes en relation avec leur habitat naturel. Son expertise en recherche est étayée par des publications exceptionnelles et l'obtention réussie de projets financés par des tiers.

Professeur universitaire (in) (m/w/d) pour Pflanzengenetik, Würzburg
Nous recherchons un chercheur d'excellence, doté d'un profil international, en génétique végétale, dans le contexte de l'évolution, du développement et de l'adaptation des plantes. Le/la candidat(e) devra travailler de manière expérimentale et bioinformatique, et collaborer de manière interdisciplinaire.

Chercheur postdoctoral en surveillance forestière, Sydney
Rejoignez un projet pionnier financé par l'Australian Forest & Wood Innovation Centre for Climate-Smart Forestry, où votre expertise contribuera à façonner l'avenir de la surveillance forestière en Australie. Ce poste nouvellement créé joue un rôle central dans le développement d'un prototype de plateforme de données ouvertes pour surveiller la structure, l'état et les stocks de carbone des forêts australiennes. Vous travaillerez avec des données terrestres et de télédétection et contribuerez à une feuille de route nationale pour la surveillance forestière.

Professeur adjoint de biologie des changements globaux, Montréal
Le/La candidat(e) retenu(e) contribuera à l'excellence du corps professoral par l'enseignement, la recherche et le service. Il/Elle élaborera un programme de recherche, enseignera et encadrera des étudiants, et participera aux activités du département et de l'université.

Image de couverture: Amanite basilaire au Mexique par Alan Rockefeller / iNaturalist. CC-BY