Cette semaine a été épuisante, avec deux conférences et beaucoup de travaux à prévoir entre elles. Je pense que mon projet d'assister à une conférence d'une journée par mois pourrait être viable, mais les quatre jours de congé cette semaine ont été très chargés. Je suis content d'avoir eu cette heure de plus au lit ce week-end.

L'un des moments forts de la semaine a été une visite guidée du Jardin botanique national du Pays de Galles, où nous avons pu observer des champignons inhabituels. La visite s'est déroulée en trois phases. D'abord, je n'ai vu aucun champignon. Puis, une fois qu'on me les a montrés, j'en ai vu beaucoup. Enfin, j'ai commencé à avoir une certaine paranoïa, car ils pouvaient être partout, et j'avais l'impression de mettre le pied dans le champ et d'endommager quelque chose de rare.

Parce que je n'ai pas été beaucoup présent la semaine dernière, je ne sais pas ce qui va sortir ensuite. Cependant, il y aura également un autre e-mail contenant les journaux et les articles d'actualité que vous partagez sur Mastodonte et Bluesky À la même heure la semaine prochaine. À la prochaine, prenez soin de vous.

Alun (webmaster@botany.one)

Sur Botany One

Vos yeux et vos oreilles sont plus aptes à détecter la biodiversité que vous ne le pensez
Les impressions que les gens ont sur les forêts correspondent souvent aux mesures scientifiques de la biodiversité, avec de grandes implications pour la conservation et le bien-être.

Les botanistes traquent où se cache un voleur de plantes
L’imagerie avancée capture la croissance d’un parasite à l’intérieur de son hôte.

Paul M. Kirika : La botanique comme héritage et vocation
Botany One interviewe le Dr Paul M. Kirika, conservateur du plus grand herbier d'Afrique tropicale.

Ils pensaient cultiver des fruits. Ils ont accidentellement créé un quartier.
Les jardins forestiers urbains suédois, créés pour une alimentation durable, sont devenus, de manière surprenante, davantage appréciés pour favoriser les liens communautaires et la cohésion sociale que pour produire des cultures.

Les plantes carnivores manquent de gènes pour héberger des champignons mycorhiziens arbusculaires
Lorsque leurs amis les abandonnent, certaines plantes se lancent dans une tuerie.

…et celui de la semaine dernière Semaine en botanique avec le pollinisateur le plus effrayant, des herbiers fantômes, le monde caché des champignons et bien plus encore…

Actualités et Opinions

Dominique Bergmann
Le profil du botaniste de Stanford, New Phytologist, a été beaucoup partagé lundi.

Événement : Living Data 2025
Living Data 2025 est une conférence majeure dans le domaine de l'informatique de la biodiversité à Bogotá, en Colombie, du 21 au 24 octobre 2025, et comporte une session consacrée aux projets Wikimedia.

Christine Faulkner
Mardi, la botaniste du John Innes Centre a partagé son récent profil de New Phytologist.

Les vagues de chaleur mettent en danger les zones préservées de l'Amazonie, selon une étude
En septembre 2024, le biologiste Cássio Alencar Nunes a été surpris alors qu'il partait pour des recherches sur le terrain dans le parc national de Jaú, une zone de conservation de l'État d'Amazonas, au nord du Brésil. Cependant, au lieu d'entendre le bruit habituel de la forêt à l'aube, les chercheurs n'ont découvert que le silence. Ni oiseaux, ni insectes. Tout était calme.

La Harvard FAS réduit de plus de moitié le nombre de places de doctorat lors des deux prochains cycles d'admission.
La Faculté des arts et des sciences a réduit le nombre de places d'admission pour les étudiants au doctorat dans la division des sciences de plus de 75 pour cent et dans la division des arts et des sciences humaines d'environ 60 pour cent pour les deux prochaines années.

Avis de décès de David Edwards
David Edwards, décédé à l'âge de 77 ans, était botaniste, professeur puis administrateur principal à l'Université de Brunei Darussalam à Brunei, où il a grandement contribué aux efforts de préservation de la forêt tropicale.

Pour comprendre la résilience des plantes au feu, regardez sous terre
Lorsque les plantes ont colonisé la terre il y a environ 500 millions d'années, elles ont découvert un monde où le feu était absent. Cette période « sans feu » a pris fin avec l'augmentation de l'oxygène atmosphérique (permettant l'inflammation), et les plantes elles-mêmes ont fourni une quantité abondante de combustible.

Ce qui rend les doctorants heureux ? Un bon encadrement.
Les superviseurs qui investissent dans des relations de mentorat positives avec leurs candidats au doctorat en récoltent également les bénéfices pour leurs propres recherches.

Une nouvelle découverte sur la diversité du blé pourrait apporter une solution urgente à la sécurité alimentaire mondiale
La diversité récemment découverte dans le génome du blé pourrait offrir de nouvelles opportunités vitales pour améliorer et « rendre résistante au changement climatique » l'une des cultures de base les plus importantes au monde.

Qu'est-ce que la co-création vraiment Que signifient les transitions agroécologiques ?
Explorer la théorie et la pratique lors de la réunion annuelle du forum des membres de l'Agroécologie TPP ?

Le jardin botanique de Bali
« Il existe 800 incarnations de Bali. Il suffit de trouver celles qui vous plaisent. » Ces mots, prononcés par un ancien expatrié australien installé à Bali depuis les années 1970, se sont révélés prophétiques.

Cette semaine en botanique

Il y a 5 ans : L'asymétrie permet une utilisation divergente des pollinisateurs, mais représente souvent une voie évolutive à sens unique

Il y a 10 ans : Contrôle de l'esprit humain par les plantes

Il y a 15 ans : Processus infectieux de Sclérotes sclérotes in Brassica napus

Articles scientifiques

Division cellulaire dynamique et croissance pendant de novoformation de méristèmes dans les gamétophytes de fougères épiphytes ($)
En utilisant l'imagerie confocale en direct avec segmentation et quantification d'images assistées par ordinateur à une résolution de cellule unique, Wu et al. montrent que dans Phlebodium pseudoaureum, une fougère épiphyte représentative, continue de novo La formation de méristèmes favorise la formation de clones gamétophytiques et une longévité accrue. Les schémas de croissance et de division cellulaires sont étroitement associés à l'initiation et à l'expansion de de novo-méristèmes formés dans Phlébodiumgamétophytes, avec une prolifération active dans la couche la plus externe à l'origine de ce processus.

Composition en acides gras des graines et dormance physique dans les écosystèmes exposés aux incendies (GRATUIT)
McInnes et al. ont caractérisé la composition en acides gras (AG) des graines de 26 espèces de Fabacées provenant d'écosystèmes sujets aux incendies et d'écosystèmes non sujets aux incendies par chromatographie en phase gazeuse couplée à la spectrométrie de masse. Ils ont comparé la saturation en AG, la teneur relative totale en AG et l'AG à point de fusion le plus élevé de chaque espèce selon les tissus de la graine (tégument vs tissus internes) et le type d'habitat (sujet aux incendies vs non sujet aux incendies). Pour les espèces sujettes aux incendies, ils ont également recherché une corrélation avec les seuils de levée de dormance spécifiques à chaque espèce.

Une température environnementale élevée nuit à l'accumulation du récepteur de reconnaissance de formes FLS2 (FREE)
L'immunité déclenchée par des motifs (ITP) est initiée lorsque les plantes détectent des motifs moléculaires associés aux pathogènes (PAMP) grâce à des récepteurs de reconnaissance de motifs (PRR). L'impact d'une augmentation modérée de la température sur cette signalisation immunitaire végétale reste incertain. Jacobs et al. ont exploré cette question en utilisant flg22 et la kinase du récepteur à répétition riche en leucine (LRR-RK) FLS2 comme modèle de système récepteur-ligand, ainsi que le Ca2+ signalisation en tant que sortie PTI représentative.

PHLOÈME PRÉCOCE DE LA DURÉE DE VIE les gènes sont induits dans les galles de la hernie du chou en conséquence de la stimulation cambiale et de la reprogrammation vasculaire pendant Plasmodiophora brassicae infection chez Arabidopsis thaliana (GRATUIT)
Les galles de la hernie représentent des structures cellulaires complexes produites par Plasmodiophora brassicae, un protiste du sol, qui infecte les parties souterraines de Brassicacéesplantes, y compris Arabidopsis thalianaCe biotrophe obligatoire détourne la machinerie de l'hôte pour manipuler le développement et la structuration vasculaires. Les galles présentent une reprogrammation cellulaire spectaculaire où la prolifération du phloème est favorisée tandis que la xylogenèse est inhibée. Singh et al. montrent qu'au moins trois PHLOÈME PRÉCOCE DE LA DURÉE DE VIE(Poire) gènes—PEAR1, DOF6 et ACTIVITÉ CAMBIAL ÉLEVÉE2 (HCA2) — sont induites dans le phloème en prolifération pendant le développement des galles.

Symbiose foliaire héréditaire chez les plantes tropicales : évolution et fonction des symbiotes bactériens transmis verticalement (GRATUIT)
Jusqu'à récemment, l'impossibilité de cultiver les symbiotes bactériens et la difficulté d'obtenir des plantes exemptes de bactéries de manière fiable ont limité la compréhension des fonctions de ces symbioses et des mécanismes de transmission intergénérationnelle. Le développement de méthodes exemptes de culture a permis d'identifier les endosymbiotes bactériens et de constater que ces symbioses sont hautement spécifiques, chaque plante hôte n'interagissant qu'avec une seule espèce bactérienne. Ninzatti et al. passent en revue les connaissances actuelles sur ces associations symbiotiques foliaires hautement spécifiques, en se concentrant sur des données expérimentales récentes.

Génétique quantitative dans les populations naturelles ($)
Les phénotypes évoluent sous l'effet de la sélection naturelle si, et seulement si, ils sont génétiquement variables. Si les écologistes évolutionnistes étudient la sélection naturelle depuis longtemps, ce n'est que récemment que les méthodes de génétique quantitative ont été appliquées aux populations sauvages. Ce domaine de recherche fertile nous permet d'examiner les bases génétiques de la (co)variation intra- et inter-caractères, améliorant ainsi notre compréhension de l'évolution adaptative dans la nature. Wilson et Poissant passent en revue certains des principes clés, des avancées, des défis et des orientations émergentes de ce domaine de recherche.

Évolution généralisée des fleurs poricides : un exemple frappant de convergence morphologique entre les plantes à fleurs (GRATUIT)
L'évolution des morphologies florales tubulaires contrôlant la libération du pollen par de petites ouvertures (fleurs fonctionnellement poricides) représente un exemple, taxonomiquement et géographiquement répandu, d'évolution répétée et indépendante d'une morphologie fonctionnellement similaire. Les fleurs poricides sont aussi souvent étroitement associées à la pollinisation par bourdonnement des abeilles. Cependant, nous manquons d'une étude actualisée de leur distribution phylogénétique à l'échelle des angiospermes. Leigh Russell et al. ont identifié tous les genres d'angiospermes connus contenant des fleurs poricides grâce à une étude bibliographique.

La chimiodiversité végétale intraspécifique à l'échelle de la parcelle a des effets contrastés sur les groupes fonctionnels d'arthropodes (GRATUIT)
La chimie végétale régule les interactions entre les plantes et leur environnement. Si la chimiodiversité intraspécifique à l'échelle de chaque plante est bien étudiée, ses effets sur les interactions entre les arthropodes à l'échelle de la communauté végétale méritent une attention accrue. Ojeda-Prieto et al. ont mené une expérience de terrain pour tester l'impact de la chimiodiversité intraspécifique sur les interactions plantes-arthropodes.

La glucosylation des facteurs endogènes induisant l'haustorium favorise l'évitement de la parenté chez les plantes parasites ($)
Les plantes parasites peuvent être dévastatrices pour les cultures. Les plantes de la famille des Orobanchacées sont généralement parasites, mais elles parasitent rarement leurs propres espèces ou des espèces proches. Xiang et al. ont identifié une enzyme dans la plante parasite Phtheirospermum japonicum qui conjugue les sucres aux composés phénoliques impliqués dans la stimulation de la formation de l'organe parasitaire appelé haustorium.

Réduction des programmes DEI et perte de talents scientifiques ($)
Aux États-Unis, les programmes soutenant la diversité, l'équité et l'inclusion (DEI) dans le domaine scientifique sont menacés. Les données indiquent que la diversité au sein du personnel scientifique favorise la créativité et la réussite face aux défis. La perte de talents prometteurs soutenus par ces programmes affaiblira considérablement notre capacité de recherche, limitera l'innovation et réduira considérablement les découvertes essentielles au progrès scientifique.
Lire gratuitement via ReadCube : https://rdcu.be/eMLnD

La liaison disulfure sculpte un pli peptidique qui assure la reconnaissance des phytocytokines (GRATUIT)
La reconnaissance précise des ligands par des récepteurs kinases à répétitions riches en leucine (LRR-RK) étroitement apparentés est essentielle à la coordination de l'immunité, du développement et de l'adaptation environnementale des plantes. Jimenez Sandoval et al. montrent comment HAESA-LIKE 3 (HSL3) reconnaît spécifiquement les phytocytokines CTNIP/SCREW repliées et stabilisées par des ponts disulfures chez Arabidopsis.

Dans les publications de l'AoBC

Carrières

Remarque : il s’agit d’articles qui ont été annoncés sur le Web. Ce ne sont pas des articles que je propose personnellement, et je ne peux pas non plus vous obtenir de visa pour travailler à l'étranger.

Doctorat : Production alimentaire durable grâce à la compréhension des interactions génétiques et hormonales au cours du développement des gousses de pois, Oxford
Oxford mène un projet visant à comprendre les mécanismes moléculaires sous-jacents au développement coordonné des graines et des gousses chez les légumineuses. Si les résultats de cette recherche seront importants pour comprendre l'évolution des plantes à fleurs, les connaissances acquises pourraient jouer un rôle crucial dans l'amélioration de la durabilité de la production alimentaire et de la santé humaine. De fait, des opportunités d'exploiter les résultats du projet pour l'amélioration des cultures devraient se présenter durant la bourse d'études.

Doctorat : Effets de la diversification forestière sur la production de récompenses florales pour les pollinisateurs, Londres
À l'issue de ce projet, le/la candidat(e) possédera une expertise en écologie forestière, en gestion forestière, en techniques de terrain, en écologie des pollinisateurs et en analyses chimiques du pollen et du nectar. Ces compétences lui permettront de poursuivre une carrière universitaire (par exemple, en tant que chercheur postdoctoral sur des projets d'écologie forestière, d'écologie chimique ou d'interactions plantes-pollinisateurs), en gestion forestière, en élaboration de politiques (par exemple, en élaboration d'approches de gestion forestière respectueuses des pollinisateurs) ou en chimie des produits naturels.

Doctorat : Prédire les réseaux fonctionnels plantes-microbiotes pour la remédiation des sols, Manchester
Ce projet combinera des approches multi-omiques (génomique, métatranscriptomique) et une modélisation prédictive pilotée par l'IA afin de démêler les processus écologiques et moléculaires sous-jacents à la mobilisation du zinc. En intégrant des ensembles de données microbiologiques à l'apprentissage automatique, l'étudiant identifiera les fonctions microbiennes clés, modélisera leurs interactions dans des scénarios de stress (y compris les inondations) et concevra, construira et testera des consortiums microbiens en vue d'une application à l'orge cultivée dans des conditions de contamination par le zinc et de capacité hydrique du sol.

Chaire W2 avec possibilité de titularisation (W3) en biologie computationnelle, Göttingen
Nous recherchons un·e collaborateur·rice engagé·e et ayant l'esprit d'équipe pour représenter le domaine de la recherche et de l'enseignement axés sur les données en sciences de la vie. Le/la titulaire du poste effectuera des recherches et enseignera dans le domaine des méthodes Big Data. Cela pourra inclure l'exploration, le développement et l'application, par exemple la numérisation, l'analyse, la visualisation et l'intégration de grandes quantités de données obtenues par des méthodes à haut débit sur les biomolécules (génomique, transcriptomique, protéomique, métabolomique, etc.) et/ou des méthodes d'imagerie ou de phénotypage à haut débit (phénomique).

Poste de doctorat en biologie du développement végétal, Gießen
Nous recherchons un chercheur motivé pour rejoindre notre équipe pour un contrat de quatre ans. Ce poste est idéal pour une personne désireuse de parfaire ses connaissances universitaires tout en contribuant à la recherche fondamentale dans le domaine de l'évolution moléculaire et de la reproduction sexuée des plantes.

Sac de PD en Ecologia de Comunidades Vegetais, Rio Claro
Il est possible qu'il y ait une opportunité de travail dans une équipe transdisciplinaire et internationale, dans le cadre du projet Biota-Cerrado on Fire. Le projet est comme une base d'expérimentation de longue durée de brouillard dans le Cerrado, avec un grand banc de données disponible.