La semaine s'annonce chargée. Mardi et mercredi, je serai au Jardin botanique national du Pays de Galles pour la réunion de Plant Science Wales. Vendredi, c'est Black in Plant Science à Leeds. L'idée était d'organiser une réunion par mois, mais le report de Plant Science Wales a changé la donne ce mois-ci. Je privilégierai l'écoute et les échanges plutôt que la publication de blogs sur les événements, car certains éléments seront des travaux en cours ou confidentiels.

Malgré mon air naturellement grincheux, je serai ravi de vous parler de votre travail, de votre vulgarisation scientifique ou de la façon dont Mark est probablement secrètement un traître, malgré ce que disent les légendes, car la façon dont il s'en est pris Tameka était vicieux.

Il y aura également un autre e-mail contenant les articles et les actualités que vous partagez sur Mastodonte et Bluesky À la même heure la semaine prochaine, si vous êtes au Royaume-Uni ou en Europe, ou une heure plus tard ailleurs, car le changement d'heure prend fin le week-end prochain. À bientôt ! Prenez soin de vous.

Alun (webmaster@botany.one)

Sur Botany One

Partenaires pollinisateurs excentriques pour une plante à fleurs excentrique
La science vient de prouver que les insectes les plus méprisés de l’histoire de l’humanité sont les pollinisateurs clés de certaines des plantes les plus étranges et fascinantes de la Terre.

Patricia Silva-Flores : « Tout un monde caché qui attend d’être découvert et admiré ! »
Botany One interviewe le Dr Patricia Silva-Flores, une biologiste chilienne dont le travail attire l'attention sur le rôle vital et négligé des champignons dans les écosystèmes et la société.

Les bibliothèques silencieuses de la vie végétale du Nigeria
Des milliers de spécimens de plantes négligés de ce pays pourraient combler des lacunes critiques dans les connaissances sur la biodiversité mondiale.

…et celui de la semaine dernière Semaine en botanique avec un bouclier insolite, des perles pour sauver les écosystèmes, ce qui fait d'une plante un phénix, et bien plus encore…

Actualités et Opinions

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Avant de vous plaindre, essayez-le.

Webinaires sur les compétences botaniques
Vous pouvez dès maintenant réserver un webinaire gratuit sur les compétences botaniques, ou consulter les webinaires précédents sur la chaîne YouTube du BSBI. À titre d'exemple, voici une vidéo sur Premiers pas avec Plant Keys.

Les célèbres orchidées à tête de singe « Dracula » disparaissent dans la nature
On dirait de minuscules singes qui surgissent de la brume. Connus des scientifiques sous le nom Dracula, les soi-disant « orchidées à face de singe » sont devenues des célébrités en ligne.

Leçons tirées de 138 génomes de bryophytes
Une étude portant sur 138 génomes de bryophytes, dont 123 nouvellement séquencés, révèle une plus grande diversité de familles de gènes et une proportion plus élevée de gènes provenant de procaryotes, de virus, de champignons ou d'animaux par rapport aux trachéophytes.

Les forêts tropicales humides australiennes pourraient passer de l’absorption du carbone à son émission
La biomasse ligneuse des arbres des forêts tropicales humides du Queensland est passée du statut de puits de carbone à celui de source de carbone. Une nouvelle étude analysant 49 années de données provenant de 20 sites indique que le carbone est émis parce que les arbres meurent et se décomposent plus vite qu'ils ne peuvent être remplacés.

Briser la cécité des plantes, une chanson de Taylor Swift à la fois
L’utilisation de clips musicaux de Taylor Swift dans les cours de botanique peut intéresser davantage les élèves aux plantes, les aidant à mieux apprendre et à remarquer le rôle important que jouent les plantes dans notre monde.

Identifier les racines fines
L'identification morphologique des racines fines est une frontière de l'écologie souterraine, susceptible de répondre à des questions sur la dynamique et la stratégie intraspécifiques des nutriments. Quelles niches de profondeur les espèces occupent-elles sous terre ? Comment les caractéristiques racinaires (par exemple, le diamètre des racines) évoluent-elles selon les espèces, les écosystèmes, les conditions pédologiques et la profondeur ?

Le laboratoire qui crée vos plantes d'intérieur
Comment la culture tissulaire crée des plantes d’intérieur aux caractéristiques cohérentes destinées à la vente au public.

Interdit de Mobot #2 – Étiquettes d'herbier et fougères chéilanthoïdes
Joey Santore du Missouri Botanical Garden va passer du temps avec Peter Bernhardt dans l'herbier et pinailler sur les étiquettes d'herbier.

Joyeux 2ème anniversaire (à nous) !
Nigel Chaffey fête les deux ans de son blog.

Les photos Instagram aident les scientifiques à suivre les schémas de floraison des plantes envahissantes
Ce tapis vibrant de fleurs roses et jaunes qui recouvre les falaises méditerranéennes pourrait être magnifique sur les photos de vacances publiées sur les réseaux sociaux. Mais des scientifiques ont découvert que ces mêmes clichés Instagram révèlent comment l'une des plantes côtières les plus destructrices au monde envahit de nouveaux environnements en prolongeant sa floraison et en menaçant la biodiversité indigène.

Cette semaine en botanique

Il y a 5 ans : Brûlez tout : les caractéristiques des feuilles changent plus que la composition des espèces

Il y a 10 ans : Phytoastrologie

Il y a 15 ans : Le blogueur devient fou (dans le bon sens)

Articles scientifiques

La kinase KEY1 contrôle la taille du condensat pyrénoïde tout au long du cycle cellulaire en perturbant les interactions de séparation de phase (FREE)
He et al. ont identifié une kinase, KEY1, dans l'algue modèle Chlamydomonas reinhardtii qui régule la taille et le nombre des condensats pyrénoïdes tout au long du cycle cellulaire et est nécessaire au fonctionnement et à la croissance normaux des pyrénoïdes. Contrairement au type sauvage, key1 les cellules mutantes présentent plusieurs condensats plus petits tout au long du cycle cellulaire qui ne se dissolvent pas pendant la division cellulaire.

Le peptide CAPE1 confère une résistance au flétrissement bactérien de la tomate (GRATUIT)
Zhang et al. décrivent le protéome du xylème chez ces mêmes cultivars et le comparent au protéome apoplastique, révélant des modifications dépendantes de la variété et de l'infection. Cette analyse protéomique a permis d'identifier les protéines PR1 (protéines liées à la pathogenèse 1) comme étant fortement induites lors de l'infection.

Exploration des pathosystèmes et des récepteurs immunitaires des fougères pour combler les lacunes de l'immunité des plantes (GRATUIT)
Castel et al. révèlent que les fougères présentent diverses réponses aux pathogènes, notamment une résistance potentielle non liée à l'hôte et des mécanismes de résistance plus spécifiques. Parmi les dix fougères testées, Pteris vittata présente le spectre le plus large de compatibilité avec les agents pathogènes.

Les analyses d'expression spatiale et unicellulaire révèlent des domaines d'expression complexes dans le développement précoce des épis de blé (GRATUIT)
Xu et al. ont combiné l'hybridation in situ par fluorescence à molécule unique (smFISH) et le séquençage d'ARN à cellule unique (scRNA-seq) pour générer un atlas des clusters cellulaires et des domaines d'expression au cours des premiers stades du développement de l'épi de blé. Ils ont caractérisé l'expression spatio-temporelle de 99 gènes par smFISH dans 48 225 cellules aux stades de transition précoce (W1.5), de double crête tardive (W2.5) et d'ébauche des fleurons (W3.5).

Contributions différentielles d'un effecteur antimicrobien de Dahlia verticillium à la virulence et à l'assemblage du microbiote de la tomate dans le sol naturel (GRATUIT)
Punt et al. ont constitué une collection d'échantillons de sols naturels présentant des propriétés physico-chimiques et des compositions microbiennes diverses. À partir de cette collection, ils démontrent, pour trois espèces végétales (orge, tomate et coton), que les communautés bactériennes et fongiques associées aux racines sont principalement déterminées par le type de sol, tandis que le microbiote de la phyllosphère est essentiellement déterminé par l'espèce végétale.

Modifications des caractéristiques d'inflammabilité des plantes liées aux caractéristiques du régime des incendies et aux conditions de biomasse dans le Cerrado (GRATUIT)
Dans les savanes ouvertes du Cerrado, Zanzarini et al. ont sélectionné des zones à fréquence d'incendie élevée ou faible, ainsi que des zones récemment brûlées ou à l'abri des incendies au cours des 21 dernières années. Pour les graminées, les plantes herbacées non graminoïdes et les arbustes, ils ont mesuré les caractéristiques suivantes liées à l'inflammabilité : teneur en eau, biomasse morte, taux de combustion, température maximale d'incendie et biomasse brûlée.

Impact différentiel de l'arrosage à l'aube et au crépuscule sur le métabolisme et la répartition de la biomasse de la tomate ($)
Siqueira et al démontrent que l'arrosage des tomates (Solanum lycopersicum) à différents moments de la journée modifie les schémas transcriptionnels des gènes contrôlant l'induction de la floraison. L'arrosage à l'aube (DAW) a déclenché une forte répression de la grappe de fleurs simples (PFTS), entraînant une accumulation de métabolites et un retard de développement. Les plantes arrosées au crépuscule ont montré une production de fruits accrue par rapport aux plantes traitées au DAW.

La biomasse aérienne des forêts tropicales australiennes constitue désormais une source nette de carbone ($)
Carle et al. utilisent des données d'inventaire forestier à long terme (1971-2019) provenant de forêts tropicales humides australiennes et un cadre d'inférence causale pour évaluer le bilan carbone de la biomasse ligneuse aérienne au fil du temps, les processus démographiques qui le sous-tendent et ses facteurs climatiques, notamment les cyclones. Ils constatent une transition d'un état de puits de carbone (0.62 ± 0.04 Mg C ha⁻¹) à un état de transition (0,62 ± 0,04 Mg C ha⁻¹).-1 yr-1: 1971–2000) à la source (−0.93 ± 0.11 Mg C ha-1 yr-1: 2010–2019) s'est produite pour la biomasse ligneuse aérienne de ces forêts, avec une capacité de puits diminuant à un taux de 0.041 ± 0.032 Mg C ha-1 yr-1.

L'intensité et la durée de la sécheresse interagissent pour amplifier les pertes de productivité primaire ($)
Ohlert et al. ont évalué les effets de la sécheresse grâce à une expérience d'exclusion des précipitations répartie sur 74 prairies et zones arbustives réparties sur six continents. En moyenne, la productivité primaire a diminué de 29 % lors des années de sécheresse modérée, mais les effets ne se sont pas amplifiés lors des sécheresses pluriannuelles.

Signatures phylogénomiques des mutations ponctuelles induites par répétition à travers le règne fongique (GRATUIT)
La taille des génomes fongiques varie de plus de 100 fois, principalement en raison de l'expansion de séquences répétitives telles que les éléments transposables (ET). Les mécanismes de silençage ciblant les ET au niveau épigénétique ou transcrit ont évolué indépendamment dans de nombreuses lignées. Chez les champignons, la mutation ponctuelle induite par répétition (RIP) cible les ET en reconnaissant les séquences répétitives et en induisant une mutagenèse. Cependant, la prévalence de la RIP dans le règne fongique et la fidélité des signatures canoniques de mutation C-à-T restent floues. Badet et Croll comblent ces lacunes en suivant les changements d'architecture du génome à travers le règne fongique.

L'exclusion des embruns salés foliaires et la tolérance tissulaire sous-tendent l'adaptation locale aux embruns salés océaniques (FREE)
Plunkert et al. ont étudié les mécanismes d'adaptation aux embruns salés en comparant cinq paires d'accessions de mimules, adaptées localement aux milieux côtiers et continentaux, et provenant de différentes latitudes. Ils ont mesuré les concentrations de sodium dans les feuilles de ces deux types d'écotypes, exposées à des embruns salés expérimentaux en laboratoire, et comparé les caractéristiques de la surface foliaire susceptibles d'expliquer les différences d'absorption de sodium entre les écotypes. Les mimules côtières absorbent moins de sodium par la surface de leurs feuilles sous l'effet des embruns salés expérimentaux, ce qui pourrait contribuer à leur adaptation locale aux embruns océaniques dans les milieux côtiers.

Dans les publications de l'AoBC

Carrières

Remarque : il s’agit d’articles qui ont été annoncés sur le Web. Ce ne sont pas des articles que je propose personnellement, et je ne peux pas non plus vous obtenir de visa pour travailler à l'étranger.

Compatibilité des hôtes dans le système Marchantia-Phytophthora, PhD, Norwich
L'objectif de ce projet est d'explorer l'équilibre délicat entre résistance et sensibilité aux pathogènes filamenteux chez M. polymorpha. À l'aide d'analyses macroévolutives comparatives, de génétique moléculaire et d'approches multi-omiques, le/la candidat(e) étudiera les aspects largement conservés et spécifiques à chaque lignée de l'immunité de l'hépatique, ainsi que les mécanismes de virulence utilisés par les espèces de Phytophthora à large spectre pour favoriser l'infection de plantes hôtes éloignées. Ce projet multidisciplinaire est mené dans le laboratoire du Dr Phil Carella, au sein du Département de biologie cellulaire et du développement du Centre John Innes.

Virulence disparaissante : étude de la perte de pathogénicité chez un champignon phytopathogène, doctorat, Norwich
Qu'est-ce qui fait perdre son efficacité à un phytocide ? Ce projet étudiera pourquoi les agents pathogènes fongiques perdent leur virulence lorsqu'ils sont cultivés en laboratoire, loin de leur plante hôte. Grâce à des techniques de pointe en biologie moléculaire et en génomique, nous tenterons de résoudre un mystère vieux de plusieurs décennies en phytopathologie.

Comment les cellules communiquent-elles lorsqu'il fait chaud ?, PhD, Norwich
Ce projet permettra de décrire l'évolution des réponses plasmodesmiques selon un gradient de température et d'explorer ainsi la relation entre la fonction plasmodesmique, la température et le succès des réponses immunitaires. L'étudiant(e) exploitera les nombreux outils et ressources disponibles au laboratoire Faulkner pour étudier la fonction plasmodesmique et les réponses immunitaires, et les utilisera pour générer de nouvelles informations et hypothèses à tester. Le projet utilisera des approches de biologie moléculaire, de génétique et d'imagerie quantitative afin de déterminer comment la connectivité intercellulaire via les plasmodesmes sous-tend le succès immunitaire dans différents environnements.

L'identité est importante : comprendre l'architecture des pics pour augmenter le nombre de grains dans le blé, PhD, Norwich
Nous avons récemment identifié un candidat potentiel pour le gène responsable de ce caractère. Notre analyse phénotypique initiale suggère que l'identité des organes des glumes est modifiée pour correspondre à celle des lemmes, suggérant que le mutant transforme les glumes en fleurs stériles. Nous émettons l'hypothèse que cela pourrait être exploité pour augmenter le nombre de grains par épillet, en combinant plusieurs mutations afin de transformer complètement les glumes en fleurs fertiles. Ce projet vise clairement à caractériser un mutant prometteur chez un parent du blé, tout en laissant à l'étudiant toute la latitude nécessaire pour s'approprier le projet et approfondir ses recherches selon ses centres d'intérêt et les résultats obtenus. L'étudiant bénéficiera d'un encadrement et d'une formation de pointe en génétique végétale moderne, génomique, analyse de données et bioinformatique.

Lutte contre la maladie du piétin-échaudage du blé grâce à des communautés microbiennes synthétiques et sur le terrain, PhD, Norwich
Dans ce projet de doctorat, vous allez : développer des compétences en laboratoire moléculaire et en bioinformatique pour analyser la diversité génétique des communautés microbiennes ; analyser les données de terrain existantes de la collection de races locales de blé Watkins pour informer et potentiellement modifier les communautés microbiennes synthétiques de blé existantes ; sélectionner des représentants de la collection Watkins pour la suppression du piétin-échaudage en présence de différentes communautés microbiennes de la rhizosphère ; effectuer un séquençage d'amplicons sur les communautés établies pour analyser la corrélation entre les communautés microbiennes et la gravité du piétin-échaudage.

Professur für Pflanzengenetik, Kiel
Nous recherchons un professeur en génétique végétale, spécialisé dans les réponses au stress et l'adaptation à l'habitat. D'excellents résultats de recherche, une expérience de l'enseignement et de l'autonomie universitaire, ainsi que des connaissances en promotion de la diversité sont requis. En allemand, ma traduction automatique peut être incorrecte.

Professeur associé en écologie végétale, spécialisé dans l'écologie des plantes vasculaires, des bryophytes ou des lichens, Stockholm
Le Département d'écologie, d'environnement et de sciences végétales (DEEP) de l'Université de Stockholm lance un appel à candidatures pour un poste de professeur associé titulaire en écologie végétale. Le/La candidat(e) retenu(e) mènera des recherches de pointe, enseignera des cours de licence et de master en écologie végétale et encadrera des doctorants et des chercheurs postdoctoraux. Le poste est entièrement financé et l'enseignement en licence représente généralement environ 25 % du budget.

Conservateur des plantes et de la durabilité, Toronto
Le ROM recherche un conservateur novateur et collaboratif pour constituer, étudier, interpréter et partager la collection de plantes du Musée et pour défendre avec conviction l'importance des plantes vertes, notamment les plantes vasculaires, les ptéridophytes, les bryophytes et les algues. Le conservateur des plantes initiera et développera des expositions et des programmes publics transdisciplinaires, mettra en place un solide programme de recherche muséal, collaborera avec des établissements universitaires (comme l'Université de Toronto), des groupes communautaires et des intervenants, et fera preuve d'un leadership, d'une écoute et d'une communication exceptionnels.