J'essaie de me tenir au courant de l'actualité, mais il m'arrive d'être très lent à repérer certaines choses. Un exemple en est l'excellent Plantes en bocaux Chaîne YouTube. Je crois que j'avais vu une miniature et que j'avais cru que c'était une autre chaîne sur les plantes d'intérieur. C'en est une en quelque sorte, mais ce n'est pas l'approche « plantes comme élément de décoration » à laquelle je pensais par erreur, comme le montre la dernière vidéo. J'ai accidentellement fait planter le marché des plantes rares Ces émissions valent bien 12 minutes de votre temps.
Cette semaine, et jusqu'à la fin de l'année, je travaille à la refonte du site. L'objectif est de conserver le même design, ou presque, avec des modifications techniques pour optimiser son fonctionnement. Par exemple, j'ajouterai une feuille de style d'impression fonctionnelle, ce qui vous permettra d'imprimer les articles sans problème de qualité. Je m'efforcerai également d'accélérer considérablement le chargement du site. Enfin, je tenterai de nouveau de centraliser la liste de diffusion et le blog sur une même plateforme afin de réduire ma charge de travail.
Une idée qui est ressortie de la réunion stratégique est la création de dossiers thématiques destinés aux professeurs de lycée. Le changement climatique est un vaste sujet en soi, mais nous pourrions envisager de compiler des dossiers sur la phénologie et les migrations d'espèces. Si vous êtes enseignant et que vous avez des suggestions pour vous faciliter la tâche, n'hésitez pas à m'écrire ; je verrai ce que je peux faire.
Tout ce travail supplémentaire risque de me priver de publications jusqu'à la nouvelle année. Cependant, je vous enverrai prochainement un autre courriel contenant les articles et les actualités que vous partagez sur Mastodon et Bluesky. À bientôt !
Alun (webmaster@botany.one)
Sur Botany One
La crise de la dispersion des semences
On entend souvent parler du déclin des populations d'espèces. Mais qu'en est-il des services écosystémiques qu'elles rendent ? La dissémination des graines est l'un des plus remarquables. L'année dernière, Mendes et ses collègues ont publié un article dans la revue Science qui met en lumière l'état de conservation de la dissémination des graines en Europe.
Le blé moderne pousse en profondeur
Le blé moderne a des racines plus profondes que les blés anciens : est-ce une adaptation à une productivité accrue ?
Des fleurs qui rusent pour survivre
Comment les orchidées soleil trompent les abeilles avec de fausses promesses de pollen.
…et celui de la semaine dernière Semaine en botanique avec la vie après le feu, comment l'histoire contribue à l'écologie et une course aux armements entre les plantes et les insectes.
Actualités et Opinions
Un ancien fossile révèle comment les plantes et les champignons se sont d'abord développés sur terre.
Plantes et champignons cohabitent depuis des centaines de millions d'années, tantôt alliés, tantôt ennemis. Un nouveau champignon fossile découvert en Écosse a révélé des preuves anciennes de cette relation, les plantes et les champignons partageant des nutriments pour survivre sur terre.
L'équipe scientifique révèle une protéine importante dans le peuplier
Des scientifiques du Laboratoire national de Brookhaven (BNL) ont dirigé une équipe qui identifié une protéine, PtrbHLH011, chez le peuplier impliqué dans la croissance de la plante, la production de lignine et la résistance aux maladies.
Moments marquants dans la vie et la carrière du jeune scientifique Miguel
Ces derniers mois ont été particulièrement marquants dans la vie et la carrière du Dr Miguel Montez. Ce chercheur du John Innes Centre a connu un double succès : ses travaux de recherche ont été publiés dans deux articles scientifiques à quelques semaines d’intervalle.
Banque de graines du millénaire
Alors que nous célébrons 25 ans de conservation de semences, découvrez comment nous utilisons nos collections pour lutter contre la perte de biodiversité et le changement climatique grâce à la recherche scientifique, tout en restaurant les habitats avec nos partenaires internationaux.
L'extrême droite à la rescousse face à la révolution européenne du génie génétique
Jusqu'ici ignorés, deux élus d'extrême droite pourraient débloquer la situation concernant les plantes génétiquement modifiées.
L'apprentissage avec l'IA est moins performant que la recherche Web traditionnelle.
À pratiquement tous les égards importants, obtenir des informations résumées à partir de modèles d'IA s'est avéré moins instructif que d'effectuer soi-même la recherche.
Adeline Harant : Garder l'esprit ouvert est essentiel pour une carrière scientifique épanouissante.
La docteure Adeline Harant, assistante de recherche principale au sein du groupe Kamoun, nous explique ce que c'est que de faire partie du personnel de soutien à la recherche de TSL.
Le monde a perdu le pari climatique. Il est désormais confronté à une nouvelle réalité dangereuse.
Il y a dix ans, les dirigeants du monde ont fait un pari historique. L'accord de Paris de 2015 visait à engager l'humanité sur la voie d'un changement climatique dangereux. Dix ans plus tard, alors que la dernière conférence sur le climat s'est achevée à Belém, au Brésil, sans action décisive, force est de constater que l'humanité a perdu ce pari.
Une énigme botanique : AU SECOURS !
Nigel Chaffey s'attaque à une énigme concernant le mucilage.
Des scientifiques stupéfaits après avoir découvert des espèces que l'on croyait disparues : « Irremplaçables »
« Chaque année, la science révèle de nouvelles espèces rares et endémiques qui prospèrent ici. »
Moss survit dans l'espace, les médias perdent le fil de l'histoire
« J'ai lu des titres et des articles vraiment exagérés à ce sujet ces derniers jours. Soyons clairs : la mousse ne poussait pas dans l'espace. Elle survivait, tout simplement. » prospèreCette expérience en particulier ne nous apprend rien sur la nature de cette mousse (comme algues lichensOn ignore si des spores de mousse pourraient survivre sur Mars et si elles constitueraient un bon complément à un système de survie biologique. L'étude nous indique seulement que ces spores pourraient survivre à un voyage vers Mars à l'extérieur d'un vaisseau spatial.
Cette semaine en botanique
Il y a 5 ans : Les voleurs de nectar préfèrent le vol de jour
Il y a 10 ans : Un Martien sauvera-t-il la Terre ?
Il y a 15 ans : PHYLIP et inférence phylogénique
Articles scientifiques
L'analyse des échanges de promoteurs et de domaines met en évidence les déterminants spécifiques de la mémoire du facteur de choc thermique HSFA2 en réponse au stress thermique (GRATUIT)
L'exposition à un stress thermique modéré (ST) prépare les plantes à mieux résister à une exposition future à des conditions de ST plus sévères. Chez Arabidopsis (Arabidopsis thalianaL'état sensibilisé est maintenu pendant plusieurs jours, un phénomène appelé mémoire du choc thermique (HS). Les facteurs de transcription HSFA2 et HSFA3 favorisent cette mémoire en régulant conjointement la mémoire transcriptionnelle d'un sous-ensemble de gènes inductibles par le choc thermique. On ignore pourquoi seulement deux des 21 facteurs de transcription du choc thermique (HSF) chez Arabidopsis interviennent spécifiquement dans la mémoire du choc thermique. Oberkofler et al. ont étudié cette question par une analyse d'échange de promoteurs et de domaines entre HSFA2 et HSFA1D, un régulateur de la réponse aiguë au choc thermique (HSR), afin de déterminer les mécanismes impliqués dans la mémoire du choc thermique.
Sur la croissance et le flux : aspects hydrauliques des méristèmes aériens (GRATUIT)
L'eau est essentielle à la croissance des plantes, influençant l'activité des méristèmes par le biais de fluctuations hydrauliques. Comprendre comment les méristèmes perçoivent ces changements et y réagissent est crucial pour étudier la plasticité méristématique.
Compromis évolutif entre la défense stomatique et les échanges gazeux chez les Brassicacées ($)
L'ouverture des stomates est essentielle aux échanges gazeux, mais elle favorise inévitablement l'invasion par des pathogènes. En réponse, les plantes ferment leurs stomates pour empêcher l'entrée des pathogènes, tandis que la bactérie pathogène Pseudomonas syringae pv. tomato DC3000 (Pto) produit de la coronatine (COR), un analogue du jasmonate (JA), pour contrer cette réponse végétale. Kang et al. démontrent que, grâce à la COR, Pto exploite l'activation du gène CYP707A1 chez Arabidopsis thaliana, gène codant pour une enzyme qui dégrade l'acide abscissique, indispensable à la fermeture des stomates.
Rôle de l'AMPc dans la signalisation auxinique TIR1/AFB : questions ouvertes (GRATUIT)
Le mécanisme canonique par lequel l'auxine, une phytohormone, régule la transcription a longtemps constitué l'un des fondements de la signalisation végétale. La découverte récente et inattendue de l'AMP cyclique (AMPc) comme second messager dans cette voie a remis en question ses principes fondamentaux, tout en laissant de nombreuses questions et lacunes dans notre compréhension.
La méthylation de l'ADN à l'adénine associée à une chromatine transcriptionnellement permissive est répandue chez les eucaryotes (GRATUIT).
La méthylation de l'ADN est un régulateur clé des génomes eucaryotes, principalement via la 5-méthylcytosine (5mC). En revanche, l'existence et la fonction de la N6-méthyladénine (6mA) chez les eucaryotes ont fait l'objet de controverses, des résultats contradictoires étant parfois dus à des artefacts méthodologiques. Néanmoins, certains organismes unicellulaires, comme les ciliés, les champignons basaux et l'algue Chlamydomonas, présentent des signaux 6mA robustes, soulevant des questions quant à leur origine et leur rôle évolutif. Charria et al. ont utilisé le séquençage Oxford Nanopore pour analyser le profil 6mA à la résolution de la paire de bases chez 18 eucaryotes unicellulaires représentant tous les principaux supergroupes. Leurs résultats montrent que des profils 6mA robustes n'apparaissent que chez les espèces codant pour l'adénine méthyltransférase AMT1.
Épigénomique par phases et hérédité de la méthylation chez un hybride historique de Vitis vinifera (GRATUIT)
Cochetal et al. ont assemblé les génomes phasés du Cabernet Sauvignon et de ses lignées parentales, le Cabernet Franc et le Sauvignon Blanc, grâce au séquençage à haute résolution (HiFi) et à une carte génétique dix fois plus dense que les cartes existantes. À partir de trois clones par cépage, ils ont quantifié la méthylation par un séquençage à lectures courtes et longues très homogène, garantissant ainsi la représentativité variétale et l'évaluation de la variabilité clonale.
Le climat et l'hybridation façonnent l'évolution des caractéristiques stomatiques chez Populus (GRATUIT)
Exploiter six zones de contact réparties en latitude et couvrant la zone hybride naturelle entre Populus trichocarpa × Populus balsamiferaZavala-Paez et al. ont utilisé le reséquençage du génome entier et des expériences de jardin commun répliquées pour tester le rôle que jouent le flux de gènes interspécifiques et la sélection dans l'évolution des caractéristiques stomatiques.
La culture à grande échelle du microbiome de l'arbre permet une suppression ciblée des maladies (GRATUIT)
Ordonez et al. ont constitué une collection de cultures de microbiote de chêne comprenant plus de 30 000 isolats provenant de 150 chênes répartis sur l’ensemble du territoire britannique. Ces isolats appartenaient à des taxons bactériens et fongiques clés, représentant respectivement 61 % et 87 % du total des séquences bactériennes et fongiques, comme déterminé par séquençage indépendant de la culture. Plus de 22 000 isolats ont été analysés afin d’identifier leur capacité à supprimer les espèces bactériennes associées à la dégradation des tissus vivants du tronc chez les arbres atteints du dépérissement aigu du chêne (DAO). Cette analyse a permis d’identifier 341 isolats bactériens capables de supprimer les pathogènes du chêne.
Un phosphoswitch de l'AINTEGUMENTA contrôle l'activité bilatérale des cellules souches pendant la croissance secondaire ($)
Cette étude révèle un mécanisme de régulation essentiel qui contrôle l'activité des cellules souches bilatérales lors de la croissance radiale des plantes. Les cellules souches du cambium prolifèrent et se différencient en tissus spécialisés comme le bois et le liège, sites clés d'accumulation de biomasse. En explorant l'interaction entre le récepteur ERECTA (ER) et la signalisation auxinique, Xiao et al. montrent comment ces voies modulent la différenciation des cellules souches et l'épaississement radial par la phosphorylation du facteur de transcription AINTEGUMENTA (ANT).
Surmonter les obstacles qui limitent l'impact de la recherche écologique (GRATUIT)
Cano-Barbacil et al. décrivent les contraintes fréquemment rencontrées dans les institutions de recherche écologique et, en s'appuyant sur de nombreuses pratiques utilisées à l'échelle internationale, ils identifient des mesures d'atténuation possibles et mettent en évidence des exemples de conséquences négatives qui peuvent survenir en l'absence de stratégies d'atténuation efficaces.
Tolérance environnementale extrême et capacité de survie spatiale de la mousse Physcomitrium patens (GRATUIT)
Les bryophytes, comme les mousses, présentent une extrémotolérance remarquable, mais malgré les études sur les réponses environnementales chez la mousse modèle Patène PhyscomitriumSa survie dans les conditions extrêmes de l'espace reste incertaine. Maeng et al. ont testé des protonémas, des cellules prolifératives et des spores enfermées dans un sporange dans des environnements spatiaux simulés. Ils ont identifié les spores comme les plus résistantes et les ont ensuite exposées à l'environnement spatial à l'extérieur de la Station spatiale internationale. Après neuf mois dans l'espace, plus de 80 % des spores ont survécu et conservé leur capacité à germer.
Dans les publications de l'AoBC
- L'interaction complexe entre les chromosomes, la niche climatique et les traits morphologiques façonne la diversification de Carex (Cyperaceae) (GRATUIT)
- Morphologie, anatomie et affinités inférées des Brassicalées Scalarifructus coloradensis (Knowlton) gen. et comb. nov. de l'Éocène d'Amérique du Nord et d'Europe (GRATUIT)
- Évaluation de Echinochloa frumentacea en conditions salines-alcalines et comparaison avec cinq espèces fourragères (GRATUIT)
- De la génomique à la domestication : histoire bioculturelle des palmiers néotropicaux acrocomie aculée et Acrocomia totai (GRATUIT)
- Signatures génétiques de l'histoire évolutive à long terme d'une espèce végétale herbacée, hautement polyploïde et clonale d'Europe centrale (GRATUIT)
Carrières
Rédacteur en chef du Journal of Applied Ecology, Monde entier
Nous recherchons un écologue très motivé par la publication d'excellents travaux en écologie appliquée pour rejoindre l'équipe éditoriale de Journal of Applied Ecology. Le rédacteur en chef travaillera avec les autres membres de l'équipe de la revue pour promouvoir les objectifs de celle-ci, commander et évaluer les articles soumis, et planifier et mettre en œuvre des stratégies visant à renforcer son profil, à étendre sa portée et à mieux servir sa communauté d'auteurs et de lecteurs.
Doctorat, Augmentation de la canopée des arbres urbains grâce au gui : amélioration de la qualité de l’air, de la biodiversité et du bien-être dans un contexte de changement climatique, Essex
Ce projet offre une plateforme de formation interdisciplinaire exceptionnelle. Vous acquerrez une expérience pratique des techniques de pointe en écophysiologie végétale, telles que la fluorescence de la chlorophylle, les échanges gazeux (à l'aide de systèmes LICOR) et l'imagerie thermique, afin d'évaluer la performance des plantes en situation de stress environnemental. La formation en analyse géospatiale et en modélisation écologique vous permettra d'anticiper la dynamique des écosystèmes urbains. Vous développerez une expertise en matière de mobilisation des parties prenantes, de sciences participatives et de communication scientifique et politique, en traduisant la recherche en actions concrètes.
Doctorat, EASTBIO : Définition de la boîte à outils génétiques qui sous-tend le développement et l’évolution des feuilles de céréales, Édimbourg
Au sein du Laboratoire de morphologie végétale, nous menons des recherches à l'intersection de la génétique végétale, de la biologie du développement et de la biologie évolutive afin de comprendre le développement des céréales, les gènes qui contrôlent ces processus et leur évolution. Notre objectif final est d'identifier des cibles de sélection potentielles pour améliorer la productivité, la qualité et la résilience de diverses cultures céréalières. Ce projet de doctorat vise à utiliser la génétique du développement comparée pour étudier les réseaux de régulation génique qui contrôlent le développement des feuilles de céréales et comment ils ont pu évoluer au cours du temps pour engendrer des différences de forme distinctes.
EASTBIO – Comment les plantes respirent dans un monde qui se réchauffe : décryptage du contrôle thermique du développement des stomates, Dundee
Ce projet vous formera à un large éventail d'approches expérimentales, notamment la génétique, la biologie moléculaire, la biochimie des protéines, la microscopie confocale avancée et les techniques omiques de pointe. Vous acquerrez une compréhension approfondie de la conception expérimentale, du contrôle qualité et de l'analyse statistique, et développerez votre esprit critique et vos compétences en résolution de problèmes. Vous aurez l'opportunité de présenter vos résultats lors de séminaires départementaux et de conférences scientifiques, de participer à des activités de vulgarisation scientifique et de contribuer à la publication de vos recherches.
Chercheur postdoctoral, Birmingham
Les laboratoires Plackett et Kettles de l'Université de Birmingham cherchent à recruter un chercheur postdoctoral spécialisé en bioinformatique pour entreprendre un projet de 2 ans intitulé « Technologies d'amélioration rapide des arbres à feuilles larges du Royaume-Uni » dans le cadre du Centre pour la protection des forêts (CFP) financé par le Defra.
Doctorat, MAGIC Crops : Génomique pour la sélection d’amarante à haut rendement, résistante et nutritive (Projet York YBDTP), York
Ce projet de doctorat utilise des techniques génomiques de pointe pour relever les défis de la sécurité alimentaire mondiale, en combinant la génétique, l'édition de gènes et la science végétale expérimentale afin de développer des variétés améliorées d'amarante — une culture résistante au climat, très nutritive, mais sous-utilisée.
Programme de doctorat en sciences végétales, Cologne
En tant que programme à vocation internationale, nous encourageons les étudiants de tous les pays à candidater. Les candidats retenus seront inscrits dans une université allemande, généralement… Université de Cologne (UoC)L’Institut Max Planck de recherche sur l’amélioration des plantes (MPIPZ) et l’Université de Cologne sont des employeurs qui souscrivent au principe de l’égalité des chances. Pour être admissible à la sélection, vous devez posséder un diplôme de premier cycle. Maîtrise ou diplôme équivalent Les candidats doivent avoir suivi quatre à cinq années d'études universitaires dans des disciplines pertinentes à leurs projets respectifs. Bien qu'il ne soit pas nécessaire d'être titulaire du diplôme au moment du dépôt de candidature, celui-ci doit avoir été obtenu avant le début du projet de doctorat.
Professeur en « Production végétale », Munich
Les responsabilités incluent la recherche, l'enseignement et la promotion des jeunes chercheurs. Nous souhaitons recruter un expert en production végétale, spécialisé dans la sécurité alimentaire et l'innovation des systèmes de culture. Cette chaire a pour objectif de développer et de mettre en œuvre les innovations biologiques et techniques nécessaires au développement et à la refonte de la production agricole.
Professeur adjoint en diversité des plantes non à graines (bryophytes, fougères, lycophytes), Vancouver
L’Université de la Colombie-Britannique recherche des candidats pour un poste de professeur adjoint permanent en diversité des plantes non semencières, avec une date d’entrée en fonction prévue le 1er juillet 2026. Il s’agit d’un poste à temps plein offrant un salaire annuel de départ de 120 000 $ à 135 000 $. Les candidats menant des recherches novatrices sur la diversité des bryophytes, des fougères ou des lycophytes sont encouragés à postuler, notamment ceux qui utilisent la systématique, la phylogénétique, l’évolution, la paléobotanique, l’écologie, la biologie cellulaire, la biologie du développement, la physiologie, la biologie moléculaire, la génomique ou des techniques connexes, et dont les recherches incluent idéalement la collecte et l’utilisation d’échantillons de terrain et/ou de collections muséales pour aborder des questions fondamentales sur la biodiversité et la biologie comparée des plantes non semencières.
Professeure ou professeur en biologie moléculaire végétale, Sherbrooke
L’Université de Sherbrooke sollicite des candidatures pour un poste de professeur adjoint menant à la permanence en biologie moléculaire végétale au sein du Département de biologie de la Faculté des sciences. Le poste est à pourvoir, mais une nomination à un poste supérieur est envisageable pour les candidats possédant une expérience pertinente. Les candidatures portant sur les systèmes végétaux dans tous les domaines de la recherche en biologie moléculaire et cellulaire seront prises en considération, notamment en génétique, phénotypage, biologie cellulaire, bioinformatique, biologie structurale et recherche « omique ».
Professeur adjoint ou agrégé (Tenure Track) : Écophysiologie forestière, Vancouver
Le Département des sciences forestières et de la conservation (Faculté de foresterie et de gestion environnementale, campus de Vancouver, Université de la Colombie-Britannique – UBC) sollicite des candidatures pour un poste menant à la permanence en écophysiologie forestière (professeur adjoint ou agrégé), à compter du 1er juillet 2026 ou dès qu’un candidat qualifié sera trouvé. Nous recherchons un chercheur exceptionnel et prometteur pour mener des recherches de calibre international en écophysiologie forestière et ses liens avec la résilience des forêts, en se concentrant sur un ou plusieurs des domaines d’étude suivants : écophysiologie des arbres; physiologie des stress abiotiques et biotiques chez les plantes; mortalité forestière et réponses aux changements climatiques; bilan carbone forestier; relations hydriques des arbres; ou utilisation des nutriments. Les recherches peuvent porter sur les échelles moléculaire, de l’organisme ou du peuplement, et utiliser des approches observationnelles, expérimentales ou de modélisation.
