Je n'ai pas eu tout le week-end de libre, mais presque. J'ai passé une partie de mon temps à ajouter des noms gallois d'espèces sur iNaturalist pour un projet en cours. Comme je n'ai plus quatorze ans, je me suis assurée que les noms soient authentiques plutôt que d'en inventer.
Je travaille aussi sur des outils pour ici. Je n'ai pas encore eu l'occasion de rendre public tout ce sur quoi je travaille. Mais vous pouvez voir une partie de ce que j'ai fait sur le Outils page. Ce sont des outils que nous utilisons pour faciliter la création de blogs ; si vous avez votre propre site, ils pourraient vous être utiles. Par exemple, si vous souhaitez formater des citations de temps en temps, nous avons un outil que vous pouvez utiliser.
Je vois dans le système que tout le monde a été occupé, donc nous devrions avoir des publications quotidiennes pendant les deux prochaines semaines. Vous recevrez certainement un autre courriel contenant les journaux et les articles que vous partagez. Mastodonte et Bluesky À la semaine prochaine, comme d'habitude. D'ici là, prenez soin de vous.
Alun (webmaster@botany.one)
Sur Botany One
Bogotá vue par un papillon
En suivant les papillons dans les parcs urbains, les scientifiques découvrent comment les décisions d'aménagement urbain influencent non seulement les espèces qui survivent, mais aussi leur mode de vie.
Jerónimo Vázquez-Ramírez : De la consommation de capulines à la recherche sur les graines arctiques
Botany One interviewe le Dr Jerónimo Vázquez-Ramírez, un écologiste mexicain qui a voyagé à travers le monde pour étudier comment les plantes se régénèrent par les graines et comment cela peut contribuer à une meilleure conservation et restauration de la biodiversité.
Terres anciennes sous les pieds des Néandertaliens
De nouvelles peintures de paysages donnent vie avec précision à la flore de l'époque néandertalienne.
Sarah Covshoff
Lumières, caméra, floraison !
Les fleurs peuvent sembler immobiles, mais les vidéos en accéléré révèlent leurs mouvements cachés, offrant un moyen efficace de documenter les plantes et de susciter l'intérêt du public pour la botanique.
Les deux énigmes de cette semaine sont Jardin Sudoku et Rootle.
Et il y a eu celui de la semaine dernière Semaine en botanique, avec la botanique que vous ne pouvez pas voir et la botanique qui n'est pas vue...
Actualités et Opinions
L'Eucalyptus de l'année célèbre la beauté et l'importance des eucalyptus emblématiques d'Australie. Cet événement annuel met en lumière l'incroyable diversité de ces arbres et leur rôle essentiel dans nos paysages, notre biodiversité et notre patrimoine.
Eucalyptus AustralieL’entomologiste Art Borkent a décrit et nommé plus de 300 espèces de moucherons, mais il craint que son domaine scientifique ne soit en train de disparaître, malgré des millions d’insectes, de champignons et d’autres organismes qui attendent d’être découverts.
Concernant les taxonomistes d'insectes, j'imagine que les taxonomistes de plantes reconnaîtront bon nombre des mêmes problèmes..
Concernant les taxonomistes d'insectes, j'imagine que les taxonomistes de plantes reconnaîtront bon nombre des mêmes problèmes..
The GuardianUn faible taux de potassium et un taux élevé d'azote déséquilibrent les sols.
Université de VienneDes recherches montrent qu'un phénomène appelé feu de Saint-Elme, qui se produit pendant les orages, pourrait être beaucoup plus fréquent qu'on ne le pensait auparavant.
The New York TimesLa rainette arboricole, friande de nectar, transporte probablement le pollen d'une fleur à l'autre.
Êtes-vous chercheur postdoctoral en biologie végétale et envisagez-vous une carrière dans le milieu universitaire ou industriel ? Inspiré par l’excellent groupe Slack Future PI, le groupe Slack Plant Postdoc est un espace d’échange pour les postdoctorants en biologie végétale. Ils peuvent y discuter, explorer différentes pistes et s’entraider pour préparer leur avenir professionnel, que ce soit dans le milieu universitaire ou industriel.
Postdoctorants en sciences végétalesUne nouvelle publication de chercheurs de l'ENSA et de collaborateurs internationaux a mis en lumière le rôle de la protéine SYFO2 qui aide les plantes à nouer des partenariats avec des microbes bénéfiques du sol.
ENSAUne étude portant sur plus de 275 violons suggère qu'Antonio Stradivari a utilisé du bois provenant des forêts de haute altitude du nord de l'Italie pour fabriquer certains de ses instruments les plus renommés.
The New York TimesLe Kopi Luwak est un café de spécialité au goût unique, élaboré à partir de « grains » ingérés et excrétés par la civette palmiste asiatique. Les recherches de Mitra et al. (2025) suggèrent la possibilité de produire du Kopi Luwak en réduisant la cruauté envers les animaux.
Boutures de plantesPlus de 1 600 espèces végétales et animales sont protégées par la loi américaine sur les espèces menacées, mais parmi elles, une seule est une mousse. Une nouvelle initiative vise à protéger ces plantes souvent négligées.
Médias publics du NebraskaLes botanistes affirment que la plante est « un peu bizarre ».
Popular ScienceCette semaine en botanique
Il y a 5 ans : Angle historique important dans les approches centre-périphérie de la performance des espèces
Il y a 10 ans : Un nouveau regard sur les parois des cellules de garde
Il y a 15 ans : Phylogéographie des pins des Caraïbes
Articles scientifiques
"Les micro-organismes de la rhizosphère, souvent considérés comme le « second génome des plantes », interagissent avec ces dernières par des mécanismes complexes et multifactoriels, influençant significativement leur santé et leur productivité. Les exsudats racinaires jouent un rôle clé dans la transformation chimique de ce compartiment du sol, créant un écosystème dynamique qui façonne la structure et les processus fonctionnels de la communauté microbienne au sein de la zone adjacente aux racines. Il en résulte une communauté microbienne réactive au stress, capable d'améliorer la résilience des plantes. Nous nous concentrons sur trois fonctions interconnectées – la promotion de la croissance, l'acquisition des nutriments et la suppression des maladies – que nous envisageons comme des composantes intégrées d'un système de réponse au stress chez les plantes. »
"Les bases de données à grande échelle sur la biodiversité comprennent trois principaux types de données pour les plantes : les occurrences ponctuelles d’espèces isolées, les co-occurrences dans les relevés de végétation et les listes d’espèces pour des zones spécifiques. Il est démontré que ces types de données présentent des biais spécifiques, révélant des assemblages d’espèces différents à l’échelle locale. Nous avons utilisé le bassin méditerranéen, un haut lieu de la biodiversité mondiale comptant plus de 2 2200 îles de plus de 0.01 km², pour comparer les modèles de diversité des plantes vasculaires insulaires issus des données d’occurrence (Global Biodiversity Information Facility ; GBIF), des relevés de végétation (European Vegetation Archive ; EVA) et des listes d’espèces (Global Inventory of Flora and Traits ; GIFT). »
"La fonction des protéines est intimement liée à leur localisation subcellulaire, et la détermination expérimentale de cette localisation est essentielle à la compréhension de leurs rôles biologiques. Cependant, même chez les plantes modèles les mieux étudiées, comme Arabidopsis thaliana, seule une minorité de protéines possède une localisation subcellulaire définie expérimentalement. Nous présentons une stratégie expérimentale permettant de cartographier globalement les protéomes subcellulaires végétaux par spectrométrie de masse. Nous avons annoté la localisation subcellulaire de 7 815 protéines dans les racines d’Arabidopsis, de 4 672 dans les plantules d’Arabidopsis et de 2 782 dans la marchantie polymorphe (Marchantia polymorpha). Une validation indépendante a démontré que ces annotations sont hautement prédictives et peuvent être intégrées à d’autres jeux de données protéomiques. Des comparaisons interspécifiques révèlent une importante conservation globale de la localisation subcellulaire. De plus, nous démontrons que cette même approche peut être utilisée pour identifier les protéines subissant une translocation dynamique suite à un traitement ou chez un mutant. Ce travail met en évidence la puissance de la cartographie spatiale globale du protéome chez les plantes et offre une ressource précieuse pour l’étude de la localisation subcellulaire des protéines végétales. »
L'empreinte familiale révèle des schémas à l'échelle du bassin amazonien de résistance à l'embolie. 🆓
"Les forêts tropicales amazoniennes sont confrontées à un stress hydrique croissant dû à l'augmentation du déficit de pression de vapeur et à la modification des régimes hydrologiques. Résistance à l'embolie (Ψ 50 Le Ψ est un indicateur crucial de la survie des arbres en conditions de sécheresse ; il est défini comme la capacité d’une plante à résister à la perturbation du flux d’eau dans le xylème due à la formation de bulles d’air causée par le stress hydrique. Cependant, les mesures de Ψ 50 ne sont disponibles que pour un nombre limité de sites et d'espèces en Amazonie. En revanche, les données sur la composition taxonomique des forêts sont abondantes dans toute l'Amazonie, et si Ψ 50 Étant donné que ce gène est conservé phylogénétiquement, ces données pourraient permettre d'étendre les modèles de résistance à la sécheresse. Nous évaluons ici Ψ 50 Des mesures effectuées sur des taxons d'arbres amazoniens non inondés révèlent un signal phylogénétique modéré, avec un conservatisme phylogénétique évident au niveau familial. Notamment, les Fabacées figurent parmi les familles d'arbres les plus résistantes à l'embolie en Amazonie. En exploitant ce signal phylogénétique, nous avons utilisé les données de composition spécifique et de taille des arbres de 448 parcelles forestières réparties à travers l'Amazonie pour réaliser une évaluation macroécologique de la vulnérabilité de l'Amazonie à l'embolie. L'estimation de la répartition spatiale qui en résulte révèle que les forêts des régions brésilienne et guyanaise, où les Fabacées sont abondantes, présentent une forte résistance à l'embolie. En revanche, les communautés d'arbres de l'Amazonie occidentale semblent plus vulnérables à l'embolie, ce qui suggère une capacité réduite à résister aux futures sécheresses. »
"Les protéines DELLA jouent divers rôles dans le développement, les interactions plantes-microbes et les réponses au stress, et sont régulées par l'hormone acide gibbérellique (GA) chez les plantes à fleurs. Dans cette étude, nous avons examiné la conservation évolutive des fonctions de l'unique orthologue de DELLA chez l'hépatique, un modèle non vasculaire. Marchantia paleacea, qui est dépourvu de gènes impliqués dans la perception et la biosynthèse des GA bioactifs. Nous avons constaté que les phénotypes de développement indépendants des GA sont conservés chez M. paleacea, tandis que ni DELLA, ni son proche paralogue GRAS13 ne sont impliqués dans l'établissement de la symbiose mycorhizienne arbusculaire. »
"Chez la grande majorité des eucaryotes, les mitochondries sont transmises par la mère. La transmission occasionnelle de mitochondries paternelles (fuite paternelle) peut conduire à une hétérochondriomie et à une recombinaison entre les génomes mitochondriaux maternel et paternel. Malgré ses conséquences physiologiques et évolutives potentielles, l'étendue de la fuite paternelle et les processus cellulaires régissant l'hérédité mitochondriale restent largement inconnus. Nous avons mis au point un test génétique robuste pour détecter l'hérédité mitochondriale paternelle chez le tabac ( Nicotiana tabacum ). »
Empreintes moléculaires et phénotypiques du climat chez les espèces indigènes Arabidopsis thaliana 🆓
"Le changement climatique constitue une menace majeure pour l'humanité, car il entraîne une perte de biodiversité et une réduction des rendements agricoles. Afin de comprendre les impacts moléculaires et développementaux de la hausse des températures, la biologie végétale s'appuie fortement sur l'organisme modèle [nom de l'organisme modèle]. Arabidopsis thaliana Malgré des décennies de recherche, le développement des plantes en conditions naturelles reste mal compris, et seulement ~30 % des gènes possèdent des annotations fonctionnelles expérimentales, principalement parce que de nombreuses fonctions sont subtiles ou ne se manifestent que dans des contextes spécifiques de laboratoire ou écologiques. Nous comblons ici cette lacune grâce à une approche transcriptomique du paysage qui intègre un phénotypage intensif et un profilage transcriptomique de plantes sauvages dans leurs habitats naturels. »
"Marchantia polymorphe Les corps lipidiques (CL) sont des structures cellulaires spécialisées abritant une grande variété de terpènes en C15, appelés sesquiterpènes. Ces composés agissent comme répulsifs contre les herbivores, mais les enzymes responsables de la biosynthèse de leurs précurseurs restent mal caractérisées. Nous avons étudié la localisation des enzymes de biosynthèse des isoprénoïdes à l'aide de gènes rapporteurs de traduction et de transcription, couplés à la microscopie confocale. »
"Monarda mexicana, un taxon originaire de la Sierra Madre Occidentale de haute altitude, dans l'État de Durango au Mexique, a été redécouvert grâce à une observation récente sur la plateforme de sciences participatives iNaturalist. Cette observation a conduit à des travaux de terrain ciblés, à l'étude d'échantillons d'herbier et à la mise en culture de l'espèce. Deux populations actuelles, géographiquement isolées et vivant en haute altitude, ont été documentées, incluant un nouveau spécimen et deux collections historiques jusqu'alors inconnues. »
"Nous montrons ici que les anthocérotes, seules plantes terrestres possédant des pyrénoïdes, présentent une petite sous-unité de Rubisco inhabituelle, RbcS-STAR, dont le domaine enroulé C-terminal s'oligomérise pour permettre la condensation de la Rubisco. RbcS-STAR est incorporée à l'holoenzyme Rubisco et agit ainsi comme un lien « inné » avec la Rubisco. L'expression de RbcS-STAR chez des espèces dépourvues de pyrénoïdes, comme Arabidopsis, suffit à induire la formation de condensats de type pyrénoïde. Nos résultats révèlent un mécanisme de condensation de la Rubisco et une voie potentielle pour l'introduction de pyrénoïdes dans les plantes cultivées. »
"Dans cette revue systématique de la littérature, nous synthétisons les données issues de 107 études empiriques portant sur 226 espèces de plantes vasculaires présentes au-delà des limites altitudinales et latitudinales des arbres. Nous constatons une attention soutenue portée à la limite supérieure de répartition altitudinale (73 % des études) et au rôle des facteurs abiotiques (54 % des études), notamment la température (36 % des études). En revanche, les recherches sur les facteurs inter- et intraspécifiques (40 % et 25 % respectivement), tels que l'herbivorie ou la phénologie, demeurent relativement rares. Si la température est clairement identifiée comme un facteur majeur influençant la limite supérieure de répartition (29 % des études), la disponibilité en eau (15 % des études) est le facteur le plus fréquemment étudié à la limite inférieure. Bien qu'un large éventail de facteurs ait été exploré, de nombreux facteurs potentiellement importants restent peu étudiés, comme l'influence des flux génétiques et de la connectivité entre les populations, la phénologie et la lumière (chacun de ces facteurs n'ayant fait l'objet que d'une ou deux études). »
Dans les publications de l'AoBC
- Au-delà de la référence unique : perspective pangénomique sur la diversité structurale de WRKY et son rôle dans l’adaptation des caractères chez les Oleaceae 🆓
- Régulation par inhibiteurs de protéases des protéines impliquées dans la sénescence foliaire induite par la chaleur chez l'agrostide stolonifère. ????
- Accumulation de ferritine dans les fruits de deux Tristérix Plantes épiphytes : importance écologique en tant que source nutritionnelle pour les frugivores ????
- Un cadre pour identifier le complexe polyploïde dans Rorippa (Brassicaceae) : combinaison de l'évolution des caractères, des données d'herbier et de l'apprentissage automatique ????
- Compréhension des bases génétiques de la taille différentielle des organes chez les fleurs de cactus : une étude de cas chez deux espèces contrastées 🆓
Carrières
Il s'agit d'une formidable opportunité de contribuer à la création du laboratoire de la professeure Gail Taylor, aux côtés d'un autre chercheur postdoctoral et d'un doctorant, suite à son départ de l'Université de Californie et sa nomination au poste de doyenne de la Faculté des sciences de la vie et de professeure Quain de botanique. La personne retenue intégrera le département de génétique, d'évolution et d'environnement et rejoindra à la fois le Centre de recherche sur la biodiversité et l'environnement de Bloomsbury et le laboratoire « People and Nature » d'UCL East. Son temps sera principalement consacré à l'analyse de données de génétique moléculaire, de phénotypage et de microbiote liées aux recherches en cours sur la laitue, le cresson et le peuplier.
UCLUn poste de chercheur postdoctoral est à pourvoir au sein de l'équipe récemment constituée du Dr Hassan Salem, au Centre John Innes, dans le département de microbiologie moléculaire. L'équipe Salem étudie l'évolution, la fonction et les conséquences adaptatives des symbioses entre herbivores et microbes. Nos recherches portent sur la manière dont les symbiotes bactériens extracellulaires optimisent la physiologie digestive de l'hôte, permettent une spécialisation alimentaire et facilitent ainsi l'herbivorie.
Centre John InnesLe département de biochimie recrute un professeur agrégé (APTF) travaillant dans le vaste domaine de la biologie cellulaire moléculaire, dont les recherches portent sur la dissection des mécanismes moléculaires impliqués dans les processus cellulaires fondamentaux chez les procaryotes ou les eucaryotes.
Université d'OxfordNous recherchons une personne très motivée pour piloter les activités de recherche et d'enseignement en sciences végétales fondamentales et/ou translationnelles, contribuant ainsi au développement de nos points forts en recherche dans les domaines suivants au sein de l'École de biologie : agronomie, génétique végétale, développement des plantes, phytopathologie, symbioses végétales et interactions plantes-sol. Vous jouerez un rôle clé dans la réalisation de notre vision de l'agronomie à Leeds, en travaillant à l'interface entre la recherche fondamentale et la recherche appliquée afin de soutenir l'intensification durable de l'agriculture.
Université de LeedsAu jardin RHS de Wisley, nous recherchons un horticulteur dynamique pour rejoindre l'équipe de la serre. Ce poste, basé dans la section tempérée de la serre, consiste à assurer l'entretien des massifs et des collections de plantes en coulisses, notamment les fougères arborescentes, les palmiers et autres plantes fragiles. Une passion pour les plantes de serre est essentielle, ainsi qu'un sens aigu du détail et une créativité certain, afin de contribuer à la création d'aménagements horticoles inspirants. Une bonne connaissance de la culture sous abri, des pratiques de pépinière, des techniques de multiplication et de la lutte intégrée contre les ravageurs est également souhaitable.
RHSVIP3 est un programme de bourses postdoctorales au Vienna BioCenter offrant des bourses de trois ans ouvertes aux candidats ayant une formation en sciences de la vie, chimie, physique, médecine, ingénierie, informatique et bioinformatique.
Biocentre de VienneLe technicien sera chargé de la préparation d'échantillons de sédiments lacustres en vue d'analyses géochimiques, palynologiques et de détection de traces d'incendie. Il participera également au comptage des micro-charbons sous la supervision de spécialistes. Basé au laboratoire du CEPAM à Nice (France), il travaillera en étroite collaboration avec le chercheur postdoctoral recruté pour le projet, l'équipe CEPAM « FORÊTS » et nos partenaires du Laboratoire des sciences du climat et de l'environnement (LSCE), de Chrono-Environnement, d'Edytem et de l'Université des sciences et technologies du Missouri.
CNRSNotre groupe de recherche, récemment créé, étudie la coopération des récepteurs immunitaires végétaux pour déclencher une réponse immunitaire et comment exploiter ces connaissances afin de développer des stratégies de résistance durable aux maladies chez les cultures. Vos missions : analyses phylogénétiques ; travaux de biologie moléculaire courants ; biochimie des protéines ; tests de réponse immunitaire sur les plantes et les protoplastes ; documentation et présentation des résultats, rédaction de publications ; encadrement d’étudiants en laboratoire, soutien aux chercheurs invités.
Institut Leibniz de biochimie végétaleRejoignez le groupe d'écologie théorique de l'Université de Ratisbonne ! Nous recherchons actuellement des candidats pour un poste de doctorant (1 an + 2.5 ans, 75 % E13) en apprentissage automatique écologique, dans le cadre du projet BaySenseAI. Ce projet vise à développer un système d'IA multimodal intégrant un large éventail de données et de capteurs de biodiversité, traditionnels et innovants (par exemple, inventaires, ADN environnemental, capteurs acoustiques), afin de prédire la composition des espèces à tout moment et dans tout l'espace, avec une couverture taxonomique aussi large que possible.
Université de RatisbonneLes tâches comprennent : la réalisation d’expériences d’indexation combinatoire de cellules uniques (par exemple sci-RNA-seq, sci-ATAC-seq) (aucune expérience préalable requise) ; des travaux de biologie moléculaire (y compris l’extraction d’ARN/ADN/protéines, la PCR, l’électrophorèse) ; la dissociation de tissus et la préparation d’échantillons à partir de différents matériels d’organismes et principalement de matériel végétal ; la programmation et l’utilisation d’appareils automatisés de manipulation de liquides.
Université de HeidelbergNous recherchons deux techniciens de recherche seniors, compétents et innovants, pour soutenir le pôle UQ du Réseau australien de phénotypage végétal (APPN). Vous combinerez une expertise pratique en conditions réelles et en environnement contrôlé avec une maîtrise des technologies de pointe. Vous serez responsable de l'utilisation de machines agricoles et de serres, de drones et de plateformes de phénotypage sur le terrain, en serre et en environnement contrôlé, contribuant ainsi à une recherche d'envergure nationale qui fait progresser l'agriculture australienne. Le candidat idéal possède une formation en agronomie et/ou en horticulture, des connaissances en gestion des adventices et en agriculture de précision, ainsi qu'un vif intérêt pour l'application des technologies émergentes afin d'obtenir des résultats de recherche de haute qualité et à fort impact.
Université du QueenslandDans le cadre de ce poste, vous mènerez des recherches sur les processus éco-évolutifs au sein d'un système drosophile-parasitoïde en laboratoire, ainsi que dans des réseaux hôtes-parasitoïdes et plantes-pathogènes existants. Plus précisément, vous réaliserez des expériences pour identifier les mécanismes en jeu et rechercher des signaux associés dans de vastes ensembles de données existants. Vous êtes titulaire d'un doctorat en écologie, en entomologie ou dans un domaine connexe (le diplôme n'est toutefois pas nécessairement encore obtenu au moment de votre candidature au poste d'attaché de recherche).
Université de CanterburyLe Centre de développement des cultures (CDC) du Département des sciences végétales de l'Université de la Saskatchewan (USask) sollicite des candidatures pour un poste de sélectionneur de légumineuses à grains (pois de grande culture). Ce poste permanent (équivalent à un poste menant à la permanence) sera pourvu au rang de professeur adjoint ou agrégé, selon les qualifications et l'expérience. La personne retenue sera responsable d'un programme de sélection de pois de grande culture bien établi et productif. Elle développera et diffusera des variétés améliorées répondant aux besoins de l'agriculture de l'Ouest canadien, enseignera aux cycles supérieurs et/ou au sein du Département des sciences végétales et supervisera des étudiants à la maîtrise et au doctorat ainsi que des stagiaires postdoctoraux.
Université de la SaskatchewanLe Centre de développement des cultures (CDC) du Département des sciences végétales de l'Université de la Saskatchewan (USask) sollicite des candidatures pour un poste de phytopathologiste spécialisé dans les céréales à paille (blé, orge, avoine, alpiste; 85 % du temps de travail) et le lin (15 % du temps de travail). Ce poste permanent (équivalent à un poste menant à la permanence) sera pourvu au rang de professeur adjoint ou agrégé, selon les qualifications et l'expérience. La personne retenue prendra en charge un programme de recherche en phytopathologie des céréales et du lin bien établi et productif. Elle développera un programme de recherche de calibre international, financé par des fonds externes et axé sur la phytopathologie des céréales et du lin. Le poste intégrera la recherche appliquée (p. ex., identification et déploiement de la résistance des plantes hôtes) à la recherche fondamentale (p. ex., biologie des agents pathogènes fongiques et bactériens et leurs interactions avec les plantes hôtes) afin de faire progresser les stratégies de sélection et de gestion des maladies des cultures de céréales et de lin. La personne nommée devra enseigner au premier cycle et/ou aux cycles supérieurs au Département des sciences végétales et superviser des étudiants à la maîtrise et au doctorat. étudiants et mentors de boursiers post-doctoraux.
Université de la SaskatchewanImage de couverture : Néandertaliens dans une vallée de sauge et d’herbe par Gabriela Amorós.
