Le solstice d'été/d'hiver aura lieu le week-end prochain, selon l'hémisphère dans lequel vous vivez. Le Globe and Mail du Canada a un titre joyeux : Comment le solstice d'été peut être le signal pour les plantes de se préparer à l'automneMalheureusement, cette histoire est payante, mais il existe une version gratuite sur Phys Org avec un titre plus prosaïque : Le solstice d’été est un jour optimal pour les plantes, mais le changement climatique pourrait perturber ce calendrier.
Cette semaine, je retravaille les flux Bluesky. Ce sont des algorithmes optionnels que vous pouvez suivre sur Bluesky. impulsion collecte les publications les plus appréciées de la journée passée et un peu plus, afin que vous puissiez voir ce qui est populaire en ce moment. Botanique 7 Il rassemble les publications les plus populaires de la semaine passée, ou du moins le fera-t-il une fois actualisé correctement. C'est une façon d'avoir un autre avis sur ce qui est partagé sur les réseaux sociaux.
Il y aura un autre e-mail contenant les articles et les nouvelles que vous partagez. Mastodonte et Bluesky À la semaine prochaine. À bientôt, prenez soin de vous.
Alun (webmaster@botany.one)
Sur Botany One
Comment les terrains de golf contribuent à sauver la primevère
Les terrains de golf bien gérés contribuent à sauver les fleurs de primevère en voie de disparition, leur permettant de croître en nombre et de rester génétiquement saines alors que les fermes deviennent moins respectueuses des fleurs sauvages.
Karolina Heyduk : une carrière façonnée par les plantes du désert et la photosynthèse nocturne
Botany One interviewe le Dr Karolina Heyduk, une biologiste évolutionniste des plantes intéressée par les origines d'un type unique de photosynthèse.
Une voie vers des cultures tolérantes au sel dans un climat changeant
Un nouveau modèle métabolique identifie la base génétique de la résilience au stress salin chez les plantes.
La prison génétique qui piège une plante fantôme
Pourquoi créer des feuilles qui ne coûtent rien ? Une énigme de plante fantôme est résolue.
…et celui de la semaine dernière Semaine en botanique qui comportait des jardins complexes, des extinctions manquantes, un appel à davantage d’experts pour relever les défis environnementaux et plus encore…
Actualités et Opinions
24 heures de flower power…
Nigel Chaffey critique Flower Day : Une histoire de 24 heures et 24 vies florales, écrit par Sandra Knapp, illustré par Katie Scott.
Un biologiste végétal de Lancaster réfléchit aux arbres de Josué et au financement fédéral de la science
J'hésite un peu à l'inclure, car il n'est pas légalement disponible dans l'UE et au Royaume-Uni, Lancaster Online n'étant pas très attaché à la confidentialité des lecteurs. Cependant, si vous avez un moyen d'y accéder, par exemple en laissant votre VPN activé par inadvertance, alors cela vaut vraiment la peine d'être lu. C'est une défense solide de la science motivée par la curiosité.
Spinger Nature découvre MDPI
Is Plantes une revue MDPI, une revue Springer Discover ou les deux ?
Inclusion LGBTQ+ dans la science et la société : la résilience en période d'incertitude et l'importance de la communauté
Célébrer Mois de la fierté 2025, Nous sommes ravis de partager une série de blogs et de podcasts présentant des articles et des ressources utiles aux écologistes et chercheurs LGBTQIA+. Dans chaque article, les auteurs de ces ressources expliquent leur nature, leur origine et leur importance.
Vous êtes probablement la raison pour laquelle il faut autant de temps pour que votre article soit examiné et vos excuses sont mauvaises.
Un phénomène étrange s'est produit dans l'édition scientifique pendant la COVID. Et il perdure. Les publications ont augmenté de 30 à 50 %. Et les réponses aux demandes de révision ont diminué de 30 à 50 %.
iNaturalist reçoit une subvention pour améliorer les suggestions d'espèces
iNaturalist explique sa décision d'accepter une subvention pour utiliser l'IA générative afin d'expliquer ses identifications. Cette décision suscite la controverse.
Ne pas être naturaliste, mais l'être quand même
Il est trois heures du matin, dans une tourbière de sarracénies pourpres à Terre-Neuve en septembre. Je frissonne un peu et je vois mon souffle. Les étoiles sont étonnamment brillantes ici, loin des lumières de la ville, et la Voie lactée s'étale dans le ciel comme du sucre renversé. En baissant les yeux, j'aperçois la végétation de la tourbière dans la flaque de lumière de ma lampe frontale : des sarracénies pourpres (un thermomètre posé dans la feuille en forme de coupe remplie d'eau d'une sarracénie explique ma présence à trois heures du matin), du kalmia, du romarin des marais, du california california, de la sphaigne, de la camarine noire, et bien d'autres encore.
Plantes voyageuses : un projet collaboratif
En 2020, l'équipe des Archives des Jardins botaniques royaux de Kew a collaboré avec d'autres organismes pour créer un modèle pour le secteur des archives. Ce modèle repose sur des méthodes de transcription et de recherche à distance, menées par des bénévoles, afin de rendre les collections facilement partageables et accessibles grâce à l'encodage TEI-XML. Dans le cadre de la création de ce modèle, nous avons également numérisé, transcrit, encodé et rendu accessible dans la BHL l'un des volumes les plus importants, mais jusqu'alors inaccessibles, de Kew : le Livre des records de Kew.
Mise à jour du président de l'ASPB : Plaidoyer : il n'a jamais été aussi important de continuer à partager ce que signifie faire de la phytologie
Défenseur : une personne qui soutient ou recommande publiquement une cause ou une politique particulière.
Couleurs souterraines
Bien que moins voyantes que les parties aériennes des plantes, les parties souterraines peuvent également présenter une variété de couleurs. Vous trouverez ci-dessous quelques exemples récemment coloriés, tirés des coloriages actuellement disponibles en téléchargement. Il s'agit de différentes plantes d'Afrique australe. Oxalis espèces, colorées pour montrer davantage la variété et le contraste présents dans les différentes couches de tuniques (feuilles adaptées à la protection du bulbe).
Articles scientifiques
Plastes en difficulté : coordination des réponses au stress et au développement grâce à la signalisation rétrograde (GRATUIT)
Cette revue met en évidence la compréhension des réponses des plastes à l'environnement, ainsi que l'impact généré en aval des signaux rétrogrades, pour mieux comprendre le rôle des plastes dans la résilience au stress abiotique des plantes à fleurs.
MYB68 régule la différenciation endodermique radiale et la formation de la subérine (GRATUIT)
Kraska et al. ont identifié un régulateur génétique de la subérisation spécifique du fichier cellulaire et de la différenciation des cellules de passage, lié au xylème. Cela fournit des informations spatiotemporelles sur le(s) mécanisme(s) sous-jacent(s) à la subérisation, établissant un cadre pour l'organisation radiale de l'endoderme et mettant en évidence la ou les fonctions putatives des cellules de passage.
Bonnes pratiques pour passer de la corrélation à la causalité dans la recherche écologique (GRATUIT)
En écologie, les questions causales sont omniprésentes, mais la littérature décrivant les approches systématiques pour y répondre est vaste et fragmentée selon les traditions (par exemple, la randomisation, la modélisation par équations structurelles, la cartographie croisée convergente). Correia et al. relient les hypothèses, les tâches, les cadres et les méthodes causales de ces traditions, fournissant ainsi une synthèse des concepts et des avancées méthodologiques permettant de détecter et de quantifier les relations causales dans les systèmes écologiques.
Les parallèles entre les invasions biologiques et les migrations humaines sont erronés et compromettent les deux disciplines. Réponse à Ahmed et al. ($)
Un article récent d'Ahmed et de ses collègues (2025) tentent d'établir des parallèles et d'évaluer les distinctions entre les invasions biologiques et les migrations humaines. Cette comparaison confond deux phénomènes mondiaux de manière scientifiquement erronée et risque de détourner des concepts scientifiques à des fins idéologiques et politiques.
Des analyses comparatives de quatre génomes de référence révèlent une diversité exceptionnelle et une sélection faiblement liée dans le complexe Mimulus guttatus (FREE)
Les Mimulus guttatus (complexe Mimulus guttatus, Phrymacées) constituent un système performant pour l'étude de l'adaptation écologique, de la variation reproductive et de l'évolution du génome. Afin d'initier la pangénomique au sein de ce groupe, Lovell et al. présentent quatre assemblages à l'échelle chromosomique et des annotations d'accessions couvrant un large spectre évolutif : deux provenant d'une seule population de M. guttatus, un de l'espèce autofécondée étroitement apparentée M. nasutus, et un d'une espèce plus divergente M. tilingii.
Un flux de travail pour l'évaluation du pH apoplasique absolu lors de l'imagerie de cellules vivantes dans les racines des plantes (GRATUIT)
Rößling et al. présentent un nouveau flux de travail basé sur l'étalonnage pour la quantification in vivo du pH apoplasique absolu à l'aide de l'indicateur de pH fluorescent HPTS. Alors que l'HPTS était auparavant principalement utilisé pour suivre les variations de pH relatif, leur nouvelle méthodologie permet une mesure précise du pH absolu grâce à une stratégie d'étalonnage simplifiée et à un plugin Fiji sur mesure.
La découverte des gènes FoTO1 et Taxol permet la biosynthèse de la baccatine III (FREE)
Des gènes « manquants » nécessaires à la biosynthèse d'un médicament anticancéreux naturel ont été découverts en perturbant et en analysant des cellules individuelles d'ifs. « …permettant une biosynthèse de novo de 17 gènes et l'isolement de la baccatine III, le précurseur industriel du Taxol, en Nicotiana benthamiana feuilles, à des niveaux comparables à l'abondance naturelle dans Taxus aiguilles.
Le début de la réponse phénologique des plantes au réchauffement climatique (GRATUIT)
Pausas utilise des données phénologiques à long terme pour le cerisier de montagne japonais (Prunus jamasakura ; Rosaceae) à Kyoto afin d'identifier le point de départ d'un changement phénologique constant et durable. La date de pleine floraison de ce cerisier est enregistrée depuis le IXe siècle, ce qui permet de distinguer les changements phénologiques causés par le changement climatique anthropique de la variabilité naturelle du climat et de la phénologie.
Une kinase de type récepteur de motif de lysine végétale joue une fonction ancestrale dans les mycorhizes (GRATUIT)
Les plantes terrestres s'associent à des champignons symbiotiques pour acquérir des nutriments. Chez les plantes à fleurs, cette symbiose dépendrait de la perception de molécules fongiques spécifiques par des récepteurs végétaux appelés kinases de type récepteur à motif de lysine (LysM-RLK). Teyssier et al. montrent que la perception de ces molécules chez la plante non vasculaire Marchantia paleacea nécessite également deux LysM-RLK, démontrant ainsi le caractère ancestral de ce dialogue symbiotique.
kÉchelles de diversité basées sur les -mers avec des indicateurs de taille de population supérieurs à la diversité des nucléotides dans une méta-analyse de 98 espèces végétales (GRATUIT)
Une prédiction clé de la théorie neutre est que le niveau de diversité génétique d'une population devrait être proportionnel à sa taille. Cependant, comme l'a noté Richard Lewontin en 1974 et confirmé par des études ultérieures, la pente de la relation taille-diversité de la population dans la nature est bien plus faible que prévu par la théorie neutre. Roberts et Josephs émettent l'hypothèse que l'un des facteurs contribuant à ce paradoxe est que les méthodes actuelles, qui reposent sur des polymorphismes mononucléotidiques (SNP), obtenus par l'alignement de courtes lectures sur un génome de référence, sous-estiment le niveau de diversité génétique de nombreuses espèces.
Dans les publications de l'AoBC
- Développement des jeunes pommiers en conditions radiatives agroforestières : un ensemble de données morphologiques et architecturales multi-échelles (GRATUIT)
- Murbeckiella est mort, vive Oréophyton – Origine et systématique de la tribu Oreophytoneae (Brassicaceae) (GRATUIT)
- Révélation des événements de mort cellulaire programmée pendant la sénescence des fleurs (pétales) (GRATUIT)
- Sur l'origine des racines euphyllophytes – hypothèses à partir d'un Psilophyton du Dévonien précoce (GRATUIT)
- Caractérisation et distinction des premiers euphyllophytes ligneux en fonction de l'anatomie du xylème secondaire : développement et application de méthodes (GRATUIT)
Carrières
Remarque : il s’agit d’articles qui ont été annoncés sur le Web. Ce ne sont pas des articles que je propose personnellement, et je ne peux pas non plus vous obtenir de visa pour travailler à l'étranger.
Chercheur postdoctoral en résilience forestière, changement climatique et santé humaine en Amazonie, Oxford
Rattaché(e) au chercheur principal, le Dr Jesús Aguirre Gutiérrez, le/la titulaire du poste est membre du groupe de recherche BioEO : Biodiversité et observation de la Terre au sein de l’Institut des changements environnementaux de l’École de géographie et d’environnement de l’Université d’Oxford. Il/Elle sera chargé(e) de développer des recherches sur l’écologie, le changement climatique et la télédétection des forêts tropicales amazoniennes, ainsi que sur leur lien avec la répartition des maladies à vecteurs dans la forêt amazonienne.
Chercheur postdoctoral, Oxford
Nous recherchons un·e associé·e de recherche postdoctoral·e en conception de génomes. Ce poste s'inscrit dans le cadre d'un projet financé par l'ARIA visant à améliorer la photosynthèse et la résilience climatique de la pomme de terre et du blé. Le·la titulaire du poste sera membre d'un consortium de recherche collaborative impliquant des partenaires universitaires et industriels. Des opportunités de développement personnel, un mentorat auprès d'experts universitaires et industriels de premier plan, ainsi qu'un programme d'échanges universitaires-industriels dynamiques visant à accélérer le développement de carrière du·de la titulaire du poste, employé·e sur le projet, seront proposés.
Chercheur postdoctoral, Oxford
Le laboratoire Kelly est heureux d'annoncer un nouveau poste de postdoctorant en biologie computationnelle. Ce poste est financé dans le cadre d'un consortium international de scientifiques cherchant à améliorer les performances et la résilience des plantes fourragères.https://www.nsf.gov/awardsearch/showAward?AWD_ID=2435360).
Chercheur associé en dynamique des forêts tropicales américaines, Leeds
Vous travaillerez sur un projet financé par le Conseil britannique de recherche sur l'environnement naturel : « AMSINK – La fin du puits de carbone amazonien ? ». Vous serez chargé(e) d'effectuer des analyses statistiques de la dynamique forestière (indicateurs de renouvellement, de productivité et de changement) dans le temps et l'espace, et de produire des documents de qualité.
Écologiste principal, Leeds
Futures Ecology est un petit cabinet de conseil convivial, créé en 2019 et disposant de bureaux à Leeds et Bolsover. Nous recherchons un écologue senior pour notre bureau de Leeds. Idéalement, le candidat devra être spécialisé dans au moins l'un des domaines suivants : blaireaux, chauves-souris (y compris l'arboriculture), botanique ou ornithologie. Il devra également être titulaire d'une licence/d'un titre d'écologiste pour les études ou les travaux d'atténuation, ou justifier d'au moins quatre ans d'expérience en conseil.
Chercheur postdoctoral en biologie moléculaire végétale, Durham
Nous sollicitons des candidatures pour un poste de chercheur postdoctoral en biologie moléculaire végétale, plus particulièrement axé sur la biologie de l'ARN et l'épigénétique des éléments transposables chez Arabidopsis. Ce projet de recherche, financé par le BBSRC, étudiera les mécanismes moléculaires à l'origine de l'inactivation épigénétique des éléments transposables végétaux. Pour ce faire, l'étude utilisera un large éventail d'approches expérimentales, couvrant la biologie moléculaire végétale et les technologies de séquençage à haut débit. Le/la candidat(e) retenu(e) devra mener des recherches indépendantes, en accord avec les objectifs du projet financé par le BBSRC, et collaborer étroitement avec le chercheur principal, le Dr Jungnam Cho, et les membres de son équipe.
Assistant de recherche (Durée déterminée), Cambridge
Un poste d'assistant de recherche à court terme est à pourvoir au laboratoire OpenPlant de Cambridge, au sein du département des sciences végétales de l'Université de Cambridge, sous la direction du Dr Facundo Romani et du professeur Jim Haseloff. Le/La candidat(e) devra développer un projet de recherche axé sur l'exploration de la diversité morphologique des hépatiques. Des travaux antérieurs sur Marchantia ont permis d'établir les fondements du développement végétatif.https://haseloff.plantsci.cam.ac.uk).
Doctorant H/F en milieux géo-naturels et anthropisés sur les services écosystémiques rendus par les prairies restaurées, Auzeville Tolosane
Cette thèse s'inscrit dans le projet COMSYSE (COMpromis et Synergies entre Services Ecosystémiques), qui présente la particularité de s'appuyer sur deux thèses : l'une en économie, l'autre en écologie. Dans le projet COMSYSE, nous proposons de mieux comprendre comment des compromis entre performance économique et préservation de l'environnement peuvent être formulés pour maintenir une certaine efficacité économique tout en adoptant une forme d'équité au sein des socio-écosystèmes pour une économie à haute valeur humaine et écologique.
Technicien en production végétale H/F, Strasbourg
Le/la technicien-ne effectuera toutes les opérations de la production végétale et assurera le suivi des plantes. Il/elle planifiera les cultures selon des protocoles définis en interaction avec les expérimentateurs et le responsable du service. Il/elle participera également aux travaux d'entretien et de maintenance de premier niveau des installations.
Postdoctorat en microfluidique des interactions plantes-bactéries, Leiden
Nous recrutons un(e) chercheur(se) postdoctoral(e) pour rejoindre notre équipe financée par l'ERC en chronomicrobiologie, un nouveau domaine qui relie la microbiologie et la chronobiologie. Le programme MicroClock s'appuie sur notre découverte inédite d'une horloge circadienne chez Bacillus subtilis. Ce poste postdoctoral se concentrera sur la compréhension des interactions entre les horloges végétales et bactériennes. Le/la chercheur(se) mettra au point un système microfluidique permettant de suivre l'expression des gènes circadiens chez Bacillus subtilis et Arabidopsis thaliana, en collaboration avec nos partenaires du consortium du Centre John Innes et de la LMU de Munich. Le/la chercheur(se) apprendra les principes et l'expérimentation chronobiologiques et jouera un rôle clé dans la découverte d'un système circadien inter-règnes. Le/la chercheur(se) participera à un projet interdisciplinaire et innovant dans un environnement scientifique productif offrant un bon équilibre entre vie professionnelle et vie privée.
Doctorant sur les détails moléculaires des interactions horloge plantes-bactéries
Nous recrutons un doctorant pour rejoindre notre équipe financée par l'ERC en chronomicrobiologie, un nouveau domaine qui relie la microbiologie et la chronobiologie. Le programme MicroClock fait suite à notre découverte inédite d'une horloge circadienne chez Bacillus subtilis. Cette thèse vise à comprendre les détails moléculaires de l'horloge circadienne bactérienne lors de son interaction avec la plante modèle, Arabidopsis thaliana. Le doctorant utilisera des outils de biologie moléculaire pour suivre l'expression des gènes circadiens chez Bacillus subtilis lors de sa colonisation racinaire. Ce travail sera réalisé en collaboration avec nos partenaires du consortium du Centre John Innes et de l'Université libre de Munich. Le doctorant apprendra les principes et l'expérimentation chronobiologiques et jouera un rôle clé dans la découverte d'un système circadien inter-règnes. Il participera à un projet interdisciplinaire et innovant dans un environnement scientifique productif offrant un bon équilibre entre vie professionnelle et vie privée.
Chercheur doctorant : Taux de repousse des forêts et accumulation de carbone dans les forêts et les réserves forestières en Europe (NextgenCarbon), Wageningen
Vous êtes motivé(e) et curieux(se) et vous vous intéressez vivement aux forêts, à la dynamique forestière et aux sciences du climat ? Vous êtes titulaire d'un master en écologie forestière, sciences du système terrestre, sciences du climat, mathématiques, géo-information ou dans un domaine similaire, et vous maîtrisez la programmation R/Python ? Nous avons l'opportunité idéale pour vous !
Poste de doctorat dans le domaine de l'archéobotanique, Bâle
Votre thèse portera sur l'analyse archéobotanique d'un habitat lacustre néolithique en Suisse. Ce doctorat s'inscrit dans le cadre d'un projet SNF Weave/Lead Agency intitulé « Décryptage des habitats lacustres » (subvention n° 10002949). Le/la candidat(e) retenu(e) analysera le matériel archéobotanique et réalisera une reconstitution interdisciplinaire de l'écologie et du paysage culturel. Il/elle collaborera étroitement avec les autres disciplines impliquées dans le projet, notamment la palynologie, l'archéozoologie/ichtyoarchéologie, les isotopes et la génétique des sédiments. Vous obtiendrez votre doctorat en publiant plusieurs articles dans des revues universitaires à comité de lecture.
Modélisation de la réponse au stress dans IceLab : Doctorat en physique computationnelle pour découvrir les mécanismes de coordination des organites sous stress, Umeå
Le Département de physique recherche un doctorant en physique computationnelle, spécialisé dans la compréhension des mécanismes de coordination entre le noyau, les mitochondries et les chloroplastes des cellules végétales. Ce poste est d'une durée de quatre ans à temps plein. L'embauche débutera dès que possible, conformément à une entente. La date limite de candidature est le 15 août 2025.
Chef de groupe, Institut de biotechnologie, Helsinki
L'Institut de Biotechnologie invite les candidats les plus talentueux à postuler pour le poste de chef d'équipe. Les équipes de recherche de l'institut opèrent à différentes échelles de résolution biologique dans les domaines de la biologie structurale, de la biologie moléculaire et cellulaire, de la biologie du développement, de la génomique et de la biologie évolutive. Nous recherchons un scientifique en début de carrière qui complétera nos compétences de recherche actuelles tout en développant un profil de recherche unique, financé par des fonds externes.
Botaniste en chef, Perth
AECOM recherche une personne titulaire d'un diplôme en sciences de l'environnement, en écologie, en biologie ou similaire. 7 à 10 ans d'expérience professionnelle dans les études botaniques, avec une forte concentration sur le conseil écologique, les évaluations de la végétation ou les travaux de terrain connexes.
Technicien de recherche – Culture de tissus végétaux et édition génétique, Canberra
Le CSIRO offre une opportunité passionnante à un·e technicien·ne de recherche en culture de tissus végétaux et édition génique. Ce·tte technicien·ne de recherche pourra rejoindre notre équipe d'innovation en caractéristiques végétales sur le site de Black Mountain, à Canberra. Il·elle intégrera l'unité de recherche en agriculture et alimentation et contribuera au développement de méthodes d'édition génique et d'administration cellulaire pour diverses espèces de cultures commerciales. Dans ce poste pratique en laboratoire, vous mettrez à profit vos compétences et votre expérience en techniques de culture de tissus végétaux, en biologie moléculaire et en transformation génétique du matériel végétal. Vous réaliserez diverses tâches de culture de tissus végétaux, concevoirez et réaliserez des expériences et des analyses en laboratoire, et contribuerez à la réalisation de recherches scientifiques de pointe dans les domaines de la culture de tissus végétaux et de l'édition génique.
