La conférence Flora in Focus à laquelle j'ai assisté cette semaine était intéressante. Elle m'a donné des pistes de recherche. J'y ai également rencontré des personnes intéressantes. Owen Morton, de la Royal Microscopical Society, m'a indiqué qu'InFocus, leur magazine, est désormais accessible aux non-membres après un certain délai. matière végétale dans ce Cela vaut la peine d'y réfléchir.

Une histoire que j'ai beaucoup appréciée cette semaine, bien que peu partagée, s'intitule « Si un arbre tombe : le procès des meurtriers de Sycamore Gap ». Elle relate l'histoire de deux personnes accusées d'avoir abattu l'arbre sur le mur d'Hadrien, et Rosa Lyster a su saisir l'absurdité de ce procès. On s'est même demandé si la police avait arrêté les bonnes personnes. L'un des accusés…Il a nié avoir jamais abattu un arbre et a déclaré qu'il considérait les tronçonneuses comme des « engins répugnants ».De son côté, l'accusation a produit une vidéo le montrant sur une nacelle élévatrice en train de couper un arbre, une photo de lui tenant des hiboux avec sa collection de tronçonneuses en arrière-plan, et ses messages sur le forum « Tout sur les tronçonneuses ». Je ne dévoilerai pas le verdict, à vous de le découvrir. Lisez-le vous-même.

Il y aura un autre e-mail contenant les articles et les nouvelles que vous partagez. Mastodonte et Bluesky À la même heure la semaine prochaine. À la prochaine, prenez soin de vous.

Alun (webmaster@botany.one)

Sur Botany One

Trois mots pour forêt : quand la foresterie rencontre la scène
Un projet théâtral transforme les véritables paroles des forestiers en une exploration puissante de la manière dont l'incertitude climatique façonne les forêts — et les décisions — de demain.

Nous possédons 3 500 collections de plantes, mais l'isolement les freine.
Derrière chaque étiquette de plante dans un jardin botanique se cache une crise des données, qui pourrait déterminer quelles espèces survivront au XXIe siècle.

Lorsqu'un envahisseur disparaît, les défenses hivernales d'un écosystème disparaissent également.
Une jolie plante envahissante des berges cause le plus de dégâts après sa mort, déstabilisant les rives au moment où les crues sont les plus violentes.

…et celui de la semaine dernière Semaine en botanique avec les histoires que vous avez partagées sur les réseaux sociaux la semaine dernière.

Actualités et Opinions

Résister aux erreurs de l'IA
ScienceLes politiques les plus récentes de [nom de l'entreprise] autorisent l'utilisation de grands modèles de langage pour certains processus sans obligation de déclaration, comme la révision de textes dans des articles de recherche afin d'en améliorer la clarté et la lisibilité ou l'aide à la recherche de références. Cependant, toute utilisation de l'IA au-delà de ce cadre – par exemple, pour la rédaction de manuscrits – doit être déclarée.

Quand l'IA vous rend moyen : Leçons tirées de notre recherche d'emploi de data scientist
Nous avons récemment mené trois campagnes de recrutement distinctes pour des postes de data scientist. Chacune a reçu plus de 500 candidatures, une augmentation considérable par rapport aux 30 à 70 candidatures que nous recevons habituellement pour des postes similaires. Cette forte hausse du nombre de candidatures a rendu le processus de sélection extrêmement difficile. Mais le problème ne résidait pas seulement dans la quantité ; c’était surtout leur grande similitude.

Oui, les arbres des forêts meurent de vieillesse. Mais le réchauffement climatique les tue plus rapidement.
Partout en Australie, les forêts se transforment silencieusement. Des arbres qui vivaient autrefois pendant des décennies, voire des siècles, meurent désormais à un rythme accéléré. Et ce n'est ni à cause des incendies, ni des tempêtes, ni de l'exploitation forestière. C'est le stress chronique lié au réchauffement climatique qui les tue.

Comment un champignon provoque la prolifération de tissus chez le maïs
Une étude de l'Université de Bonn a démontré comment un ravageur du maïs détourne la fonction de développement racinaire de la plante.

Kasey Barton : « Les semis ne sont pas simplement des plantes adultes plus petites. »
Botany One interviewe le Dr Kasey Barton, l'une des rédactrices d'un numéro spécial à paraître. Annals of Botany.

Les traitements de semences biostimulants augmentent-ils les rendements du soja ? Une nouvelle étude menée sur 103 sites dans 22 États américains conclut par la négative.
Les biostimulants, notamment les produits biologiques appliqués aux semences, suscitent un intérêt croissant dans les régions productrices de soja. Leur promesse est séduisante : une vigueur précoce accrue, une meilleure tolérance au stress ou un rendement supérieur, souvent en complément des traitements de semences existants. Mais ces produits sont-ils réellement efficaces dans les conditions réelles d’exploitation ?

Les données d'un herbier mènent un chercheur de Bucknell à la découverte de nouvelles espèces végétales dans l'arrière-pays australien.
A étude dirigé par un professeur de l'université Bucknell Chris Martin, biologieLe professeur Burpee en génétique et recherche végétale a identifié une nouvelle espèce de tomate arbustive dans le Territoire du Nord australien, une découverte déclenchée par des spécimens inhabituels conservés pendant des décennies dans des collections d'herbiers.

Les 5 étapes de l’« enshittification » de l’édition universitaire
Lorsque l'écrivain Cory Doctorow a introduit le terme « enshittification » en 2023, il a mis le doigt sur un phénomène que de nombreux utilisateurs avaient déjà observé dans leur vie personnelle. Nos recherches récentes, publié dans Organization, montre que enshittification Ce phénomène ne se limite pas au monde en ligne. Il est désormais visible dans l'édition universitaire et se déroule en cinq étapes.

Indignation suite au retrait de Trump d'un traité clé de l'ONU sur le climat, ainsi que de dizaines d'organisations internationales.
Des experts dénoncent une décision de quitter la CCNUCC, la qualifiant d'« embarrassante », alors que le président ordonne le retrait de 66 organisations internationales.
Voir aussi : la déclaration de l'IPBES

« Je sors rarement » : les scientifiques délaissent le travail de terrain à l'ère de l'IA
Dans la course à l'adoption des nouvelles technologies, certains écologistes craignent que leur discipline ne perde le contact avec la nature.

Une orchidée qui attire les mouches et un champignon zombie figurent parmi les découvertes botaniques et fongiques de 2025.
Les scientifiques ont également mentionné une perce-neige méconnue qui pousse au Royaume-Uni et un fruit au goût de banane et de goyave.

Cette semaine en botanique

Il y a 5 ans : Un guide indispensable pour être bien

Il y a 10 ans : Tout est sapin dans l'amour et la guerre

Il y a 15 ans : La vie dans un lieu de mort ? Les sarracénies comme habitat

Articles scientifiques

Les caractéristiques de germination des graines révèlent le potentiel de naturalisation : enseignements tirés des espèces herbacées tempérées d’Europe (GRATUIT)
En utilisant des données sur la germination des graines de 1146 espèces herbacées tempérées européennes indigènes, Gioria et al. ont testé si les espèces qui se sont naturalisées en dehors de leur aire de répartition naturelle diffèrent des espèces non naturalisées en termes de capacité germinative globale (proportion finale de germination) et de réponses de germination à six signaux environnementaux dans les zones macroclimatiques de naturalisation tempérées, tropicales sèches et tropicales humides.

Contrôle translationnel chez les plantes : des mécanismes de base aux réponses environnementales et développementales (GRATUIT)
La synthèse protéique est un processus essentiel à tous les organismes vivants et est étroitement régulée afin d'assurer la production adéquate des protéines nécessaires à la croissance, au développement et aux réponses au stress. Organismes sessiles, les plantes ont développé des mécanismes spécifiques de régulation de la traduction, leur permettant de s'adapter à leur environnement. Dans cette revue, Lyons et al. présentent le processus général de traduction, décrivent la machinerie de traduction chez les plantes et examinent Cis-éléments régulateurs qui influencent la traduction.

Forêts minuscules, affirmations grandioses : Le manque de preuves concernant la méthode Miyawaki de restauration forestière (GRATUIT)
Morales et al. ont réalisé une revue systématique de la littérature scientifique sur la méthode Miyawaki. Sur 51 documents examinés, seulement 41 % (n = 21) ont fourni des évaluations quantitatives, et parmi celles-ci, seulement 33.3 % (n = 7) comprenait un groupe témoin et 14.3 % (n = 3) comprenait la réplication.

Aveuglés par la lumière ? Réexamen du rôle adaptatif des éléments transposables chez les plantes grâce à la génomique des populations (GRATUIT)
Les éléments transposables (ET) sont des composants omniprésents du génome dont la mobilité peut être déclenchée par le stress environnemental et influencée par les interactions génotype-environnement. Chez les plantes, les ET constituent une part importante du génome et provoquent fréquemment des mutations à fort impact qui affectent la régulation des gènes, la méthylation et l'expression phénotypique. Ces caractéristiques ont récemment conduit à considérer les ET comme des moteurs potentiels d'adaptation locale rapide. Roulin soutient que toute généralisation concernant l'importance des ET dans l'adaptation locale chez les plantes est complexe et risque d'aboutir à une simplification excessive.

Vers une vision quantitative de l'évolution de la famille de gènes NLR dans l'espace génomique (GRATUIT)
À la lumière des dernières découvertes sur les caractéristiques génomiques associées à la diversité des gènes NLR, Wingen et al. visent ici à évaluer la contribution des forces impliquées dans l'évolution de la famille des gènes NLR et la variation de présence/absence : mutation, recombinaison, duplication et suppression de gènes, et sélection naturelle.

La diversité nucléotidique est un mauvais indicateur du potentiel adaptatif à court terme (GRATUIT)
Le paradigme actuel en génétique de la conservation suggère que les espèces présentant la plus faible diversité génétique moléculaire ont la plus faible capacité d'adaptation. Malgré les inquiétudes antérieures quant à la pertinence des mesures traditionnelles de la variation génétique moléculaire pour prédire le potentiel d'adaptation, la confusion entre diversité génétique et potentiel d'adaptation demeure fréquente dans la littérature scientifique et les politiques internationales. En combinant une nouvelle théorie à un vaste ensemble de données sur la variation génétique de centaines d'espèces, Abson et al. démontrent que la variation des séquences moléculaires est faiblement corrélée au niveau de variation héréditaire des caractères entre les espèces.

La transcriptomique évolutive révèle des changements rapides dans les profils d'expression génique chez les plantes à fleurs (GRATUIT)
Schuster et al. ont analysé les transcriptomes développementaux de sept espèces d'angiospermes sur une période de 160 millions d'années d'évolution. Ils démontrent que les profils d'expression des gènes codant pour les protéines chez les angiospermes ont divergé rapidement.

L'imputation intègre les données d'expression génétique unicellulaire et spatiale pour résoudre les réseaux transcriptionnels dans le développement du méristème des pousses d'orge (GRATUIT)
Demesa-Arevalo et al étudient les changements transcriptionnels au cours du développement de l'orge, de la spécification des cellules fondatrices du méristème et des organes à l'initiation d'organes floraux distincts, sur la base d'une approche d'imputation intégrant le séquençage profond de l'ARN unicellulaire avec des données d'expression génique spatiale.

Évolution et classification des anthocérotes : nouvelles perspectives issues de la première phylogénie basée sur le plastome ($)
Xu et al. ont réalisé des analyses génomiques comparatives de 106 génomes de plastes d'anthocérotes, dont 91 nouvellement générés. Les sites d'édition d'ARN ont été identifiés par l'intégration de données transcriptomiques et de prédictions in silico. De plus, une nouvelle méthode, inspirée des stratégies de capture de marqueurs, a été proposée pour estimer le nombre total de sites d'édition U-à-C.

Contrôle spécifique du type cellulaire des modules de régulation génique comme caractéristique des réponses immunitaires précoces dans les feuilles d'Arabidopsis (GRATUIT)
Chez les plantes, plusieurs types cellulaires contribuent à l'immunité, mais quelle est la répartition des tâches entre ces types cellulaires lors de l'activation du système immunitaire ? Wang et al. ont comparé, à l'échelle de la cellule unique, la réponse des cellules foliaires d'Arabidopsis thaliana lors de l'immunité déclenchée par des motifs moléculaires associés aux pathogènes (PTI) et par des effecteurs (ETI), échantillonnées 3 et 5 h après l'infection par Pseudomonas syringae DC3000. Les modules de défense essentiels étaient largement partagés par les différents groupes cellulaires, mais leur activation variait en termes de chronologie et d'intensité, les principaux récepteurs immunitaires présentant également une dynamique d'expression spécifique à chaque type cellulaire.

Analyse des stomates : intégration de la microscopie confocale en temps réel avec les échanges gazeux foliaires et le contrôle environnemental (GRATUIT)
Crawford et al décrivent un outil qui combine la microscopie confocale à balayage laser, les instruments d'échange gazeux et l'analyse d'images par apprentissage automatique pour observer simultanément les caractéristiques anatomiques de nombreux (>40) stomates ainsi que les caractéristiques au niveau de la feuille comme la photosynthèse, la transpiration et la conductance stomatique.

Dans les publications de l'AoBC

Carrières

Remarque : il s’agit d’articles qui ont été annoncés sur le Web. Ce ne sont pas des articles que je propose personnellement, et je ne peux pas non plus vous obtenir de visa pour travailler à l'étranger.

Stage prédoctoral – Laboratoire Nobori, Norwich
Recherche sur l'immunité végétale à l'échelle unicellulaire et spatiale. Vous êtes étudiant(e) ou jeune diplômé(e) motivé(e) et souhaitez poursuivre un doctorat ou développer vos compétences en recherche en sciences végétales et microbiennes ? Rejoignez-nous ! Groupe Nobori au Sainsbury Laboratory (TSL) à Norwich, au Royaume-Uni, et faites partie d'une équipe de recherche de pointe étudiant les interactions plantes-microbes à résolution moléculaire et cellulaire.

Chercheur postdoctoral en édition du génome végétal, Gand
Nous recherchons un chercheur postdoctoral pour développer et utiliser des criblages CRISPR cellulaires afin d'étudier les gènes de réparation de l'ADN. Ce projet, à la croisée de la recherche fondamentale et de ses applications immédiates en biotechnologie, est financé par le Fonds de la Recherche Scientifique – Flandre (FWO).

Scénaristes et conteurs (tous genres), international
Kurzgesagt recherche un conteur accompli, expérimenté dans la création de récits qui captivent les spectateurs sur des formats longs (idéalement adaptés au format YouTube de 10 à 20 minutes).

Vérificateur de faits et chercheur (senior) (tous genres), Munich
Kurzgesagt recherche une personne titulaire d'un diplôme, de préférence en physique, en sciences naturelles ou sociales ou en journalisme scientifique ; une solide expérience en statistiques ou en traitement des données serait un atout.
disponible pour travailler au moins 32 heures par semaine.

Professeur adjoint en écologie de la faune et restauration de la nature, Utrecht
Notre candidat idéal est un écologue confirmé, possédant une expérience en écologie de la faune sauvage et en restauration de la nature, de préférence dans le domaine des réseaux écologiques et du réensauvagement. Votre travail repose sur un profond engagement envers la restauration de la nature et une forte volonté d'avoir un impact durable. La recherche collaborative et l'enseignement sont des composantes essentielles de votre pratique académique. Vous valorisez un mode de travail collégial et solidaire et êtes un véritable membre d'équipe, contribuant activement à un environnement où les personnes et les idées peuvent s'épanouir et où les réussites sont célébrées. Votre enthousiasme et votre passion pour l'écologie, la conservation et la restauration de la nature inspirent étudiants et collègues.

Professeur adjoint (titularisation possible) de nutrition végétale durable, Zurich
Ce poste de professeur est axé sur la nutrition des plantes dans le contexte de l'agriculture durable et des changements environnementaux globaux. Le candidat idéal utilise des approches intégratives, incluant des expériences moléculaires, en serre et en plein champ, la modélisation des systèmes plante-sol et des outils de pointe (isotopes, phénomique ou génomique, par exemple), afin de générer de nouvelles connaissances sur les interactions environnement-culture (dans la rhizosphère et à différentes échelles). Il collabore avec les parties prenantes pour proposer des solutions visant à améliorer l'efficacité de l'utilisation des nutriments et la durabilité de la production alimentaire et fourragère à l'échelle mondiale. Les candidats doivent avoir constitué un dossier de recherche stimulant, posséder une expérience en enseignement et en mentorat, et être motivés par le dialogue avec la société.

Poste de doctorat : Réponses physiologiques des arbres à la sécheresse atmosphérique, Lausanne
Nous lançons un appel à candidatures pour un poste de doctorant entièrement financé, d'une durée de quatre ans, à l'École Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL), en Suisse, avec une prise de fonction prévue en juin 2026. Les recherches doctorales combineront des expériences dose-réponse à court terme en chambres climatiques avec des expériences de manipulation sur plusieurs années. Les travaux porteront sur la quantification des seuils physiologiques et l'établissement de liens entre les échanges gazeux, les défaillances hydrauliques, le stress thermique et les dommages cellulaires, tout en évaluant les interactions avec l'humidité du sol et les conditions atmosphériques à long terme.

Chargé de cours en botanique environnementale, Melbourne
L'Université Deakin recherche une personne titulaire d'un doctorat dans une discipline pertinente et possédant une expertise avérée en recherche végétale, notamment dans les domaines de l'écologie et de la biologie fondamentale, appuyée par des partenariats dans l'enseignement, la recherche et l'engagement communautaire.

Programme des chaires de recherche Impact+ Canada, Montréal
L’Université McGill sollicite des candidatures pour le Programme des chaires de recherche Impact+ du Canada (Impact+), ouvert aux professeurs agrégés et titulaires. Ce programme, mis en place ponctuellement, vise à aider les établissements à attirer des chercheurs de renommée internationale dont les travaux contribuent à relever des défis nationaux et mondiaux cruciaux. Il met l’accent sur l’excellence en recherche et sur un impact concret. Les titulaires de chaires de recherche Impact+ bénéficieront d’un financement à long terme et d’un soutien institutionnel pour mener à bien des projets ambitieux et transformateurs dans les domaines stratégiques prioritaires du Canada, constituer et maintenir des équipes de recherche exceptionnelles et collaborer avec des partenaires de différents secteurs et au-delà des frontières.