Est-ce que quelqu'un a du beau temps en ce moment ? Les tempêtes arctiques font la une des journaux dans mon hémisphère, mais… températures en Australie La situation est épouvantable en ce moment. Toutes mes pensées vont à ceux qui souffrent du froid, de la chaleur, de la pluie et de la sécheresse.

Il n'y a qu'un seul article sur le site cette semaine. Cela est dû à une migraine qui affecte ma capacité de travail, et au passage prochain à Ghost comme plateforme. Ce changement représente beaucoup de travail, il est donc possible que nous n'ayons pas beaucoup de contenu en ligne en février. J'ai une liste croissante de projets de botanique sur lesquels je souhaite travailler une fois que la majeure partie du codage et de la gestion des données sera terminée. L'effet secondaire inattendu de cette transition cette semaine est que je pourrais améliorer notre utilisation d'ORCID avec le nouveau système. ORCID est un système d'identification pour les chercheurs. J'ai écrit quelque chose à ce sujet Cela fait plus de dix ans, il est donc probablement temps de s'y remettre. Mais pas cette semaine.

Cependant, même si ma charge de travail m'empêche d'écrire quoi que ce soit cette semaine, vous recevrez tout de même un autre courriel contenant les articles et les nouvelles que vous partagez sur Mastodonte et Bluesky À la même heure la semaine prochaine. À la prochaine, prenez soin de vous.

Alun (webmaster@botany.one)

Sur Botany One

Plus de cœur que de logique : qu'est-ce qui pousse un scientifique à se consacrer à la botanique ?
Une étude du parcours des botanistes montre que si nous voulons des experts capables de relever les défis de demain, nous devons commencer par cultiver leur curiosité et leur émerveillement.

…et celui de la semaine dernière Semaine en botanique Avec des esprits protecteurs, des jungles urbaines, des contacts étroits et bien plus encore.

Actualités et Opinions

Les yuccas de Joshua sont en fleurs dans le désert californien. C'est une mauvaise nouvelle.
Les yuccas de Joshua commencent normalement à fleurir en février. Cette année, la floraison a commencé fin octobre.

Des milliers de scientifiques gonflent leur CV avec des études auto-publiées qui coûtent des millions de dollars d'argent public.
Une analyse portant sur 100 000 numéros spéciaux de revues académiques révèle qu’un sur huit est rempli d’articles rédigés par le rédacteur en chef, notamment chez l’éditeur MDPI.

Les coléoptères prédateurs d'abeilles sont les premiers animaux connus pour imiter l'odeur des fleurs.
L’étude des coléoptères vésicants parasites révèle une nouvelle forme de tromperie chimique.

Le gouvernement américain a perdu plus de 10 000 docteurs en sciences, technologies, ingénierie et mathématiques (STEM) depuis l’entrée en fonction de Trump.
A Science L'analyse révèle le nombre de personnes qui ont été licenciées, ont pris leur retraite ou ont démissionné dans 14 agences.

La reproduction sexuée sans croisement imite la reproduction clonale chez la plante holocentrique Rhynchospora tenuis (GRATUIT)
La recombinaison méiotique assure une ségrégation chromosomique précise et favorise la diversité génétique en générant des enjambements entre chromosomes homologues. Bien qu'essentielle chez la plupart des organismes à reproduction sexuée, la recombinaison est régulée de façon variable et peut être absente dans certaines lignées, une condition appelée achiasmie. Cependant, l'achiasmie obligatoire chez les deux sexes d'une espèce à reproduction sexuée n'a jamais été documentée. Zhang et al. étudient le carex à bec. Rhynchospora tenuis, une plante holocentrique possédant le plus faible nombre de chromosomes connu parmi les plantes à fleurs (n = 2) et méiose inversée.

Le dernier produit d'OpenAI vous permet de ressentir la science du code
Prism est un éditeur de texte basé sur ChatGPT qui automatise une grande partie du travail lié à la rédaction d'articles scientifiques.
L'accueil réservé à cette initiative a été sceptique, un peu comme si la Grande Muraille de Chine n'était qu'une promenade de santé.

Ce que les Américains perdent si leur Centre national de recherche atmosphérique est démantelé
Cinq façons dont le démantèlement du NCAR coûtera cher aux Américains, et deux façons de le sauver.

L'innovation en matière de sélection végétale franchit une nouvelle étape dans le cadre de l'UE pour la nouvelle génération de technologies végétales.
La commission de l'environnement du Parlement européen (ENVI) a approuvé à une large majorité le texte de compromis relatif au règlement NGT, adopté en trilogue avec le Conseil et la Commission début décembre. Ce vote constitue une étape importante vers son adoption formelle.

Comment les cernes des arbres aident les scientifiques à comprendre les tempêtes solaires extrêmes perturbatrices
Les scientifiques s'appuient depuis longtemps sur les cernes des arbres pour étudier les anciennes tempêtes solaires – de rares éruptions de particules de haute énergie provenant du soleil, capables de perturber les satellites, les réseaux électriques et les systèmes de communication à travers la planète. Lorsque ces particules pénètrent dans l'atmosphère terrestre, elles créent une forme radioactive de carbone que les arbres absorbent et stockent dans leur bois. Une étude publiée cette semaine dans New PhytologistCela montre que tous les arbres n'enregistrent pas ce carbone de la même manière.

Le pollen peut-il sauver les récifs coralliens ?
La sporopollénine, une substance résistante présente dans le pollen, a inspiré la création d'une nouvelle crème solaire. Cette crème solaire, à base de microgel de pollen de thé, bloque efficacement les rayons UV-B et prévient le blanchiment des coraux, contrairement aux crèmes solaires traditionnelles.

Que sont les « arbres explosifs » ? Ce phénomène hivernal est peut-être différent de ce que vous imaginez.
Jeudi matin, John Seiler se promenait avec ses étudiants sur le campus de Virginia Tech lorsque quelque chose les a interpellés : un cerisier odorant avec une cicatrice irrégulière inhabituelle courant le long de son tronc.

Cette semaine en botanique

Il y a 5 ans : Coffee and the Leaf Economics Spectrum : la taille compte

Il y a 10 ans : Brûler des arbres ? Laisse-moi tranquille…

Il y a 15 ans : Une agriculture hors de ce monde

Articles scientifiques

Lien entre le déséquilibre climatique et communautaire et le fonctionnement des écosystèmes ($)
Stemkovski et al. développent un modèle théorique simple pour aborder ces deux problèmes en reliant le déséquilibre entre les communautés et le climat au fonctionnement des écosystèmes. Ils montrent comment ce déséquilibre peut nuire au fonctionnement à court terme, même si le changement climatique est censé l'améliorer à long terme.

Voies contrastées vers la longévité des arbres chez les gymnospermes et les angiospermes (GRATUIT)
Brienen et al. ont constitué une base de données mondiale sur la longévité maximale de 739 espèces d'arbres et analysé les liens entre la longévité et le climat, le sol et les traits fonctionnels des espèces. Leurs résultats mettent en évidence deux voies principales menant à une longue durée de vie. La première est une croissance lente dans des environnements aux ressources limitées, conformément au paradigme selon lequel « l'adversité engendre la longévité ». La seconde voie passe par l'atténuation des contraintes abiotiques dans des environnements productifs.

Les interactions antagonistes entre les récepteurs CLAVATA façonnent le développement de l'épi de maïs ($)
L'activité méristématique est contrôlée par la voie de signalisation CLAVATA (CLV), qui implique un ensemble de récepteurs riches en leucine (LRR), de protéines de type récepteur et de ligands peptidiques CLV-EMBRYO SURROUNDING REGION (CLE). FASCIATED EAR 3 (FEA3) est une protéine de type récepteur riche en leucine (LRR) importante pour le maintien du méristème chez le maïs et agit indépendamment des récepteurs CLV canoniques. Afin d'identifier le réseau d'interaction de FEA3, Lindsay et al. ont utilisé le marquage de proximité basé sur TurboID. Zea mays méristèmes et ont identifié un co-récepteur putatif, BARELY ANY MERISTEM 1D (BAM1D).

Décodage des signaux de défense des plantes à l'aide de sans défense mutant (GRATUIT)
Les plantes peuvent-elles vivre sans défenses ? Analyse de mutants chez Arabidopsis thaliana De nombreux régulateurs des défenses biotiques, abiotiques et hormonales ont été identifiés, mais la redondance entre les différentes voies de défense reste à explorer. Baral et Brosché ont construit un mutant d'Arabidopsis. sans défense, dépourvues de six voies de défense canoniques utilisant abi1-1(acide abscissique), coi1 (acide jasmonique), sid2 (acide salicylique), un2(éthylène), eds1 (signalisation de défense biotique), et rbohD(production d'espèces réactives de l'oxygène apoplastiques), permettant l'analyse de la résilience du réseau de défense.

L'étendue mondiale du biome des prairies et ses implications pour le puits de carbone terrestre ($)
Les données de couverture terrestre sont couramment utilisées pour modéliser le puits de carbone terrestre (C), mais ces données présentent d'importantes marges d'erreur qui modifient considérablement les estimations du stockage global de C. MacDougall et al. démontrent cette vulnérabilité des données dans les prairies, qui sont essentielles au cycle du C mais dont la distribution estimée a varié de plus de 50 millions de km².2 (3.5 à 42 % de la surface terrestre de la Terre).
Lire gratuitement via ReadCube : https://rdcu.be/e1KLa

Changements fonctionnels globaux chez les arbres, induits par la naturalisation d'espèces exotiques et l'extinction d'espèces indigènes ($)
Guo et al. ont analysé les caractéristiques fonctionnelles et les niches environnementales de 31 001 espèces d'arbres dans le monde entier, en comparant les espèces naturalisées, menacées et non menacées afin d'évaluer les tendances actuelles et de projeter les changements futurs dans un contexte d'extinction et de naturalisation accrues.
Lire gratuitement via ReadCube : https://rdcu.be/e1KXA

Du potentiel de croissance à la survie en période de sécheresse : un cadre basé sur les caractéristiques et le temps pour l’économie de l’eau chez les plantes vasculaires (GRATUIT)
Volaire et al. ont construit un modèle physiologique en trois phases intégrant à la fois les caractéristiques des plantes et le temps sous forme de gradient de disponibilité en eau décroissante, ce qui a permis d'identifier les caractéristiques impliquées dans la maximisation du potentiel de croissance (Phase I), le maintien de la croissance/turgescence pendant la sécheresse (Phase II – résistance à la sécheresse) ou la survie après l'arrêt de la croissance (Phase III – survie à la sécheresse).

Le vieillissement induit un programme de dégradation de la méthylation de l'ADN dans les organes végétaux ($)
La méthylation de l'ADN réprime généralement l'expression des éléments transposables. En étudiant ce processus chez une plante à courte durée de vie, Dai et alDes études ont montré que le silençage épigénétique des éléments transposables diminuait avec l'âge des organes. Cependant, ce vieillissement épigénétique n'était pas observé dans les réserves de cellules souches auto-renouvelables des méristèmes apicaux caulinaires, réinitialisant ainsi l'horloge biologique du vieillissement dans les organes nouvellement formés.

GLADE : Inférence précise des gains, des pertes, des génomes ancestraux et des événements de duplication pour la génomique comparative (GRATUIT)
Belcher et Kelly présentent GLADE, un outil qui reconstitue avec précision les gains, pertes et duplications de gènes pour un ensemble d'espèces donné et utilise ces informations pour inférer le contenu génique ancestral de chaque événement de spéciation dans l'arbre phylogénétique. GLADE ne requiert en entrée qu'un répertoire de résultats OrthoFinder standard et fournit en sortie l'histoire évolutive complète de chaque orthogroupe, incluant les changements spécifiques à chaque branche et les génomes ancestraux reconstitués.

Dynamique parallèle de l'exsudation racinaire et de l'assemblage de SynCom chez Arabidopsis dans un environnement contrôlé (GRATUIT)
Joller et al. ont comparé deux systèmes de microcosmes couramment utilisés dans les études du microbiome racinaire (à base de particules d'argile) ou des exsudats racinaires (à base de billes de verre) afin d'évaluer leur capacité à suivre simultanément ces deux aspects. Ils ont évalué ces systèmes en fonction de la performance des plantes, de la croissance bactérienne et du profilage temporel des communautés microbiennes et des exsudats.

Détermination du devenir de la lignée germinale par un seul ARGONAUTE protéines dans Ectocarpe (GRATUIT)
Les protéines ARGONAUTE (AGO) sont des régulateurs essentiels de l'expression génique chez les eucaryotes multicellulaires, intervenant dans les processus de développement par le biais d'interactions avec de petits ARN. Bien qu'elles aient été largement étudiées chez les plantes et les animaux, la diversité de la fonction des protéines AGO au sein de lignées multicellulaires ayant évolué indépendamment reste mal comprise. En utilisant les algues brunes comme modèle comparatif, Bukhanets et al. démontrent qu'une seule protéine AGO peut diriger des transitions développementales clés et la spécification de la lignée germinale, probablement par une régulation post-transcriptionnelle.

Dans les publications de l'AoBC

Carrières

Remarque : il s’agit d’articles qui ont été annoncés sur le Web. Ce ne sont pas des articles que je propose personnellement, et je ne peux pas non plus vous obtenir de visa pour travailler à l'étranger.

Doctorat, Arrosage des fleurs : contrôle gène-environnement de la consommation d'eau pendant le développement de l'inflorescence de Brassica napus, Durham
Quand faut-il arroser les fleurs ? Face aux effets du changement climatique, la sécheresse et le réchauffement climatique affectent déjà la productivité agricole. Le colza est une culture majeure, et des hivers plus doux influencent le développement de ses fleurs et sa productivité. La sécheresse peut également réduire le nombre de fleurs produites par la plante, qui cherche à économiser l'eau, ce qui diminue les rendements. Nous avons déjà utilisé des techniques de pointe de photographie en accéléré et de vision par ordinateur pour étudier le développement de la tige florale sous différents régimes climatiques hivernaux, en observant un large éventail de génotypes de colza en serre. Dans le cadre de ce projet, nous souhaitons analyser la consommation d'eau de ces plantes au fil du temps, en utilisant diverses données existantes pour identifier et caractériser les gènes contrôlant ces caractéristiques, grâce à des techniques bioinformatiques telles que les études d'association pangénomiques (GWAS) et la transcriptomique associative (AT).

Chercheur postdoctoral, Oxford
Le laboratoire Mosher recherche un chercheur postdoctoral pour diriger un projet de visualisation des petits ARN (siARN) au cours du développement des graines. Les plantes produisent de nombreux siARN à partir d'un petit nombre de loci lors de la reproduction. Ces siARN sont produits dans les cellules somatiques parentales et influencent le développement des tissus fécondés (10.1073/pnas.2001332117, 10.1093/plcell/koac197). Cependant, le site précis de leur expression et leur mode d'action restent inconnus. Ce projet vise à comprendre l'expression spatio-temporelle de ces siARN au niveau cellulaire grâce à des techniques d'imagerie.

Poste de doctorant (H/F/D, E13 TV-L, 65 %), Tübingen
Notre groupe, récemment créé, étudie les bases structurales des changements qui se produisent dans les complexes moléculaires lors des transitions cellulaires. Plus précisément, ce projet portera sur l'architecture cellulaire de l'appressorium, une cellule spécialisée utilisée par les champignons pathogènes pour envahir l'hôte. Vous appliquerez des technologies d'imagerie de pointe, telles que la microscopie électronique volumétrique, la cryo-tomographie électronique et la segmentation d'images de dernière génération, afin d'étudier les modifications de l'architecture cellulaire de divers champignons pathogènes lors de l'établissement de l'infection.

Poste de postdoctorat (H/F/D, E 13 TV-L, 100 %), Tübingen
Notre groupe, récemment créé, étudie les bases structurales des changements qui se produisent dans les complexes moléculaires lors des transitions cellulaires. Plus précisément, vous étudierez les bases structurales de la formation de l'appressorium, une cellule spécialisée utilisée par les champignons pathogènes pour envahir l'hôte. Vous appliquerez des technologies d'imagerie de pointe, telles que la microscopie électronique volumétrique et la cryo-tomographie électronique, pour étudier les complexes macromoléculaires au sein de ces complexes. magnaporthe oryzae, l'agent causal de la pyriculariose, une maladie dévastatrice qui décime les cultures de riz et de blé dans le monde entier.

Professeur titulaire et directeur du laboratoire de biophysique, Wageningen
Le poste de directeur/directrice du Laboratoire de Biophysique vous offre l'opportunité de concevoir et de développer vos propres axes de recherche en collaboration avec l'équipe, tout en renforçant votre profil de leadership académique. À ce titre, vous serez responsable de la gestion académique et opérationnelle du groupe. Vos responsabilités incluront l'élaboration de la stratégie de recherche avec votre équipe, l'encadrement d'une équipe pluridisciplinaire de scientifiques, d'enseignants-chercheurs et de personnel de soutien, ainsi que le renforcement du rayonnement national et international du groupe. Par ailleurs, vous contribuerez à la qualité de l'enseignement aux niveaux Licence, Master et Doctorat et participerez à la promotion de l'innovation pédagogique.

Professeur adjoint de biologie, Uppsala
Nous vous invitons à postuler si vous êtes chercheur ou enseignant en biologie au sens large. Vous contribuerez au développement de la recherche et de l'enseignement dans l'un des départements suivants : biologie cellulaire et moléculaire, écologie et génétique, ou biologie des organismes.