Le courriel de cette semaine devrait être légèrement différent. Cela s'explique en partie par la création de nouveaux outils pour faciliter la mise en forme des liens. De plus, si vous l'avez reçu par courriel, sachez que nous sommes enfin passés à Ghost. Un article à ce sujet est disponible. que signifient ces changementsmais j'espère que la plupart passeront inaperçues.
Malheureusement, vous remarquerez peut-être mon léger retard cette semaine. J'ai importé la liste de diffusion à la dernière minute afin d'éviter de relancer les personnes souhaitant se désinscrire. Cette opération a déclenché une alerte de sécurité, car l'importation d'un grand nombre d'adresses pourrait indiquer un risque d'utilisation abusive du système à des fins de spam. Le retard est dû à la résolution de cette alerte.
Je suis content que la migration soit terminée car le premier élément sur le nouveau serveur est urgent, et je voulais le mettre en ligne au plus vite. Déborah Narh, Jason Hoeksema Mes collègues et moi-même souhaitons savoir qui a accès aux technologies omiques et qui n'y a pas accès. Nous nous intéressons particulièrement aux personnes qui n'y ont pas accès, afin d'identifier les opportunités de recherche manquées. Nous cartographions le problème en demandant des réponses à un sondage, mais nous avons besoin des réponses avant début mars. plus de détails ici.
Je ne sais pas encore ce que je prévois pour cette semaine. Je me suis concentré sur la finalisation de ce projet. Quoi qu'il arrive, je vous enverrai un autre courriel contenant les articles et les reportages que vous partagez. Mastodonte et Bluesky À la semaine prochaine, j'espère à l'heure habituelle. D'ici là, prenez soin de vous.
Alun (webmaster@botany.one)
Sur Botany One
Qui aura la chance de faire de l'analyse 'omique' ?
Quel est le principal obstacle à la participation aux sciences : le talent ou votre compte en banque ?
Alun Salt
Le fantôme de l'avenir de la botanique
Nous avons changé de plateforme de blog et nous corrigeons les bugs tout en explorant les nouvelles opportunités.
Alun Salt
Deux puzzles également Jardin Sudoku et Plant Hunt : Tueurs.
Et la semaine dernière Semaine en botanique, qui n'était pas très fourni, en raison du travail investi dans le déménagement.
Actualités et Opinions
Un nouveau composant de la voie de détection de la gravité, SLQ1, a été identifié. SLQ1, ainsi que son homologue SETH6, est essentiel à la bonne distribution de l'auxine et au gravitropisme des pousses.
La Société botanique de Géorgie accepte les candidatures pour le prix Marie Mellinger de recherche en botanique de terrain. Depuis plus de 20 ans, ce programme octroie de modestes bourses pour soutenir les étudiants, les enseignants, les botanistes de terrain, les gestionnaires de terres protégées et les défenseurs de l'environnement qui mènent des recherches sur le terrain, des projets de conservation et des programmes éducatifs axés sur la flore indigène de Géorgie.
Le géranium des bois (Geranium sylvaticum) a inspiré des recherches en écologie de la pollinisation et en systèmes de reproduction végétale. Du fait de la présence de fleurs mâles et femelles, les scientifiques se sont particulièrement intéressés à l'évolution de ce mode de reproduction unique.
Journal de l'écologie BlogLes paysages sont en perpétuelle évolution, mais une véritable compréhension de la restauration de la nature, des tendances de la biodiversité et des résultats des efforts de conservation exige souvent des données écologiques à long terme. Dans cette conférence, intitulée « La réponse aux questions de demain se trouve peut-être dans le passé », le Dr Keith Kirby explore l'importance des données à long terme dans la recherche environnementale, en s'appuyant sur les études à long terme de Wytham Woods, mondialement reconnues, comme exemple éloquent.
Réseau de la nature d'OxfordLa nouvelle souche, identifiée en 2025, a surmonté un gène de résistance clé qui protégeait de nombreuses variétés de blé britanniques importantes contre l'infection par la rouille jaune.
NiabLa décision de l'Agence américaine de protection de l'environnement (EPA) d'abroger la conclusion de mise en danger limitera la capacité du gouvernement à réglementer les émissions de dioxyde de carbone et d'autres gaz à effet de serre en vertu de la loi sur la qualité de l'air (Clean Air Act).
The Nature ConservancyLes étudiants qui sollicitent des bourses de recherche de troisième cycle pensent que la biologie est délaissée.
Des spécimens rares aux plantes les plus appréciées, découvrez pourquoi ces collections sont essentielles pour les jardiniers, les scientifiques et les amoureux des plantes.
L'Australie compte de nombreux botanistes talentueux, dont beaucoup sont des femmes. Voici quelques-unes de leurs histoires.
Géographique australienne
Pendant près d'un demi-millénaire, les botanistes ont cherché la « véritable » identité de Lignum nephriticum, une merveille mystérieuse qui a déconcerté la science du début de l'ère moderne.
JSTOR DailyUne nouvelle étude menée au Japon montre que les gens valorisent la nature de trois manières distinctes : intrinsèque, relationnelle et instrumentale.
Terre.comCette semaine en botanique
Il y a 5 ans : Les tendances historiques des spécimens d'herbier pourraient entraîner des observations trompeuses
Il y a 10 ans : Retracer les racines – tiges, feuilles, fruits… – de la botanique moderne
Il y a 15 ans : Induction d'une barrière de perte d'O2 radiale et formation d'un enchyme
Articles scientifiques
"Au cours de la dernière décennie, la démocratisation des séquenceurs a considérablement accru la taille de la communauté génomique en permettant aux équipes de recherche de séquencer les génomes d'espèces végétales d'intérêt. On a également assisté à un développement rapide de nouveaux outils d'analyse des données de séquençage. Nous partageons ici notre expérience des méthodes de séquençage long-read pour les plantes, réalisées avec la plateforme Oxford Nanopore Technologies (ONT), et proposons un guide pratique pour accompagner les nouveaux chercheurs en génomique végétale. »
"De manière générale, le mycobiome racinaire est dominé par des champignons endophytes et mycorhiziens présentant un potentiel mutualiste pour améliorer la vigueur des plantes. Cependant, dans certains cas, la distinction entre ces deux groupes biotrophes est remise en question par la capacité de plusieurs champignons endophytes à coloniser les racines et à transférer des nutriments aux plantes. Grâce à des recherches plus approfondies sur l'exploitation des combinaisons plante-endophyte au sein d'un système gnotobiotique, davantage d'endophytes dotés de caractéristiques similaires à celles des mycorhizes ont été identifiés. »
"L'interprétation des résultats évolutifs est limitée sans l'intégration de l'écologie physiologique, et les interprétations écophysiologiques gagneraient à intégrer des perspectives évolutives. Bien que les études à l'intersection de ces deux domaines se soient multipliées ces vingt dernières années, les études évolutives intégrant la physiologie végétale se sont largement concentrées sur les mêmes caractéristiques (par exemple, la période de floraison, la surface foliaire spécifique), négligeant les caractéristiques cellulaires et développementales. Cette négligence est principalement due aux exigences élevées en matière de débit de données dans les études évolutives et au manque d'avancées technologiques en écophysiologie. Or, ce biais dans les caractéristiques mesurées limite notre compréhension de l'évolution de la forme et de la fonction des plantes. L'objectif de cette synthèse est d'offrir une ressource complète, s'appuyant sur des travaux antérieurs, permettant aux chercheurs de combler le fossé entre l'écophysiologie et l'écologie évolutive. »
"Des études montrent une corrélation entre la résolution créative de problèmes et une plus grande diversité, et la biologie végétale ne peut se permettre de perdre ses talents. Nous présentons ici des stratégies pour promouvoir la diversité, l'inclusion et un sentiment d'appartenance pour tous au sein de la biologie végétale. Nous abordons les façons dont les institutions, les organisations, les communautés, les éducateurs et les individus peuvent contribuer à ce changement culturel nécessaire. »
"La pigmentation bicolore des fleurs chez certains cultivars de pétunia et de dahlia est due à une interférence ARN (ARNi) naturelle. Chez les deux espèces, le gène de la chalcone synthase est fortement exprimé uniquement dans les régions pigmentées des pétales bicolores. Cependant, le mécanisme par lequel l'ARNi est induite spécifiquement dans les régions non pigmentées demeure inconnu. Afin d'élucider le mécanisme sous-jacent à la formation de ce motif bicolore, nous avons analysé l'activité de clivage de Dicer-like 4 (DCL4), une enzyme essentielle de la voie de l'ARNi. »
"Les protéines kinases dépendantes du calcium (CDPK) décodent les variations transitoires du calcium cellulaire et jouent divers rôles dans la croissance des plantes et leurs réponses au stress, notamment l'immunité. Chez Arabidopsis thaliana (At, Arabidopsis par la suite), AtCPK28 contribue à l'homéostasie immunitaire en phosphorylant les protéines U-box végétales du sous-groupe IV AtPUB22/24/25/26, qui ciblent la kinase cytoplasmique de type récepteur immunitaire (RLCK) AtBIK1 pour leur dégradation. Bien que ce module soit conservé chez de nombreuses angiospermes, on ignore si le rôle de CPK28 dans l'homéostasie immunitaire est conservé plus largement chez les plantes terrestres. Dans cette étude, nous avons adopté une approche comparative évolutive pour comprendre le rôle de CPK28. »
"Les forêts tropicales jouent un rôle crucial dans le cycle global du carbone, mais notre compréhension limitée de la sensibilité physiologique des arbres de ces forêts aux facteurs environnementaux complique les prévisions des flux de carbone tropicaux dans un contexte de changement climatique. Nous avons déterminé la réponse à court terme de la photosynthèse et de la respiration foliaires de jeunes plants de trois espèces d'arbres tropicaux du Panama à la température. »
"Le compromis entre croissance et défense est une stratégie de survie essentielle pour les plantes soumises à un stress environnemental. Cependant, la manière dont cet équilibre est maintenu au niveau méristématique reste mal comprise. Nous montrons ici que la blessure des feuilles en rosette inhibe de façon systémique la croissance de la tige de l'inflorescence, associée à une réduction de la prolifération cellulaire dans les couches cellulaires internes du méristème apical caulinaire (MAC), mais pas dans le domaine des cellules apicales de la tige. »
"Plus d'un siècle après que deux agents pathogènes introduits ont décimé des milliards de châtaigniers américains, l'introgression d'allèles de résistance provenant du châtaignier chinois a contribué au rétablissement de populations autonomes. Cependant, les progrès ont été lents en raison de la complexité de l'architecture génétique de la résistance. Afin de mieux comprendre la résistance au chancre, nous avons comparé les génomes de référence, les réponses d'expression génique et les profils métaboliques des tiges des espèces de châtaignier chinoise résistante et américaine sensible. »
"Phtheirospermum japonicum est un modèle génétique pour les Orobanchaceae parasites, une famille de plantes qui comprend des plantes parasites nuisibles des genres Striga, Orobanche et Phelipanche (Ishida et al., 2011)... Ici, nous avons adapté un système de délivrance par virus pour les nucléases TnpB ultracompactes, permettant l'édition du génome indépendamment de la régénération des tissus ou de la transformation par trempage floral dans la plante parasite P. japonicum (Nagalakshmi et al., 2025 ; Weiss et al., 2025). »
"Ces dernières années, la nouvelle direction de Twitter a opéré des changements importants qui ont entraîné une augmentation de la prévalence de la pseudoscience, des théories du complot et du harcèlement sur la plateforme, poussant de nombreux scientifiques à chercher des alternatives. Bluesky a été proposé comme une bonne alternative à Twitter, mais le phénomène de changement de plateforme de médias sociaux chez les universitaires n'avait pas encore été étudié. Nous présentons ici les résultats d'une enquête menée auprès de scientifiques inscrits sur Twitter et Bluesky (n = 813). Les résultats confirment largement que les changements apportés à Twitter ont rendu la plateforme inutilisable et peu agréable sur le plan professionnel, et que de nombreux scientifiques l'ont abandonnée au profit de Bluesky. »
Dans les publications de l'AoBC
- Caractéristiques fonctionnelles et absorption d'éléments chez les plantes des zones humides côtières urbaines sous des conditions hydrologiques et édaphiques variables 🆓
- Validation de l'extrapolation à l'échelle des poils absorbants dans les modèles de transport de solutés dans la rhizosphère 🆓
- Diversité fine des plantes à fleurs du Cerrado et de leurs abeilles pollinisatrices, induite par le feu, dans l'espace et le temps ????
- Sélection phénotypique chez le radis adventice et ses hybrides bidirectionnels culture-adventice dans deux environnements contrastés 🆓
- Démêler la contribution de la plasticité des caractères à l'amélioration de la productivité d'un système de culture intercalaire maïs-soja dans le Midwest américain 🆓
Carrières
Vous créerez et dirigerez un groupe de recherche indépendant afin de poursuivre des objectifs de recherche ambitieux et novateurs. Pour soutenir vos recherches, l'EMBL-EBI vous offrira un soutien financier important, incluant des financements pour les doctorants, les bioinformaticiens, les ingénieurs et les chercheurs postdoctoraux. Vous aurez également accès à une infrastructure de calcul de pointe, comprenant des clusters haute performance et des capacités de calcul GPU, et bénéficierez d'une totale liberté académique, sans aucune obligation d'enseignement.
LEBML'étudiant participera à un projet multidisciplinaire visant à étudier les facteurs anatomiques, physiques et cellulaires qui façonnent l'environnement interne des racines. Ce projet explorera comment l'organisation racinaire et les conditions environnementales interagissent pour influencer la disponibilité en oxygène, et comment ces conditions internes varient dans l'espace et le temps.
Université de NottinghamLe/la titulaire du poste étudiera comment l'environnement interne des racines influence les décisions de développement et la différenciation tissulaire, en s'intéressant particulièrement à la façon dont les voies de signalisation réagissent aux variations prolongées de la disponibilité en oxygène. Ce poste contribuera à définir comment les caractéristiques physiques et biologiques des racines interagissent pour moduler les conditions internes et coordonner la croissance.
Université de NottinghamAu sein d'une équipe dirigée par la professeure Myriam Charpentier, vous explorerez les mécanismes moléculaires sous-jacents au décodage des oscillations calciques nucléaires et à l'amélioration de l'endosymbiose des racines des légumineuses. Le/la candidat(e) retenu(e) étudiera de manière novatrice la dynamique des réseaux de régulation à l'interface de la symbiose mycorhizienne arbusculaire et de la colonisation par les bactéries fixatrices d'azote, en utilisant des approches de biologie moléculaire, de protéomique et de bio-ingénierie. Il/elle bénéficiera d'un environnement hautement interdisciplinaire et international, ainsi que d'un soutien institutionnel exceptionnel.
Centre John InnesNous souhaitons recruter trois nouveaux enseignants-chercheurs au sein de l'École des sciences biologiques (équivalent à un poste de professeur assistant dans d'autres universités). Nous recherchons des candidats capables de développer des programmes de recherche d'excellence internationale qui contribueront aux priorités stratégiques de recherche de notre École. Les domaines de recherche concernés sont : la biologie évolutive et la compréhension de l'évolution du vivant ; l'écologie comportementale et sensorielle et les réponses aux changements anthropiques ; l'écologie et la lutte contre la crise de la biodiversité ; et les sciences végétales et la transformation de la production alimentaire durable.
Université de BristolLe/la titulaire du poste planifiera et mènera un projet triennal comprenant la planification des inventaires, la formation des botanistes aux méthodologies d'inventaire, l'organisation de formations et d'événements d'inventaire, la coordination, le soutien et la réalisation des inventaires, ainsi que la gestion quotidienne du projet et la production de rapports pour les financeurs. Il/elle apportera également son soutien aux bénévoles au Pays de Galles en facilitant d'autres formations (par exemple, en identification des plantes et en gestion des données) et en encourageant la planification de la relève des bénévoles, le développement de leurs compétences et le renforcement de leurs capacités.
BSBICe projet de doctorat vise à étudier les interventions précoces de gestion lors de la transition de l'agriculture à la restauration de la nature, en mettant l'accent sur la mise à disposition d'habitats et de ressources pour les oiseaux, comme les graines et l'abondance des invertébrés. Le projet s'appuie sur le suivi écologique à long terme déjà réalisé en 2022 à Wild Saltholme, un projet de restauration de la nature de 100 hectares géré par la RSPB dans la vallée de la Tees.
Université de TeessideLe laboratoire Kamoun du Sainsbury Laboratory (TSL) recherche un chercheur postdoctoral ou un assistant de recherche très motivé pour rejoindre son équipe. Ce poste porte sur la biologie des récepteurs immunitaires végétaux et l'application de ces connaissances à la résistance des cultures aux maladies, avec un intérêt particulier pour les protéines NLR (protéines à répétitions riches en leucine et à liaison aux nucléotides) et leurs interactions avec les effecteurs de virulence des pathogènes.
Le laboratoire SainsburyLe Muséum d'histoire naturelle du Danemark souhaite recruter un(e) maître de conférences en bryologie (mousses et plantes apparentées) titulaire, doté(e) d'une vision ambitieuse pour les musées d'histoire naturelle dans un monde en mutation. Les fonctions seront partagées à parts égales entre la recherche sur les collections et d'autres tâches muséales, notamment la conservation et la numérisation des collections de bryophytes, l'enseignement de la recherche et l'encadrement d'étudiants, les activités de médiation culturelle, ainsi que la liaison du musée avec les communautés naturalistes danoises concernées.
Musée d'histoire naturelle du DanemarkL'IE mènera des travaux de génétique moléculaire d'Arabidopsis thaliana, de microscopie à haute résolution, d'interaction protéine-protéine, de suivi d'activité de biocapteur fluorescent, d'expression de protéines recombinantes, et de phénotypage de plantes. Soutien technique, logistique et conceptuel d'une équipe multinationale, l'IE travaillera en étroite collaboration avec les doctorants, postdoctorants et ingénieurs de l'équipe et en soutien de leur projet.
CNRSNous recherchons un(e) scientifique motivé(e) et enthousiaste, possédant d'excellentes connaissances en statistiques écologiques avec le logiciel R (par exemple, analyse de réseaux, modélisation par équations structurelles, GLMM, méta-analyse ou statistiques bayésiennes). Les candidats doivent être titulaires d'un master et d'un doctorat (ou en voie de l'obtenir) en écologie, biologie, agronomie ou disciplines connexes. Une expérience de recherche est requise, notamment en agroécologie, biodiversité, écologie des communautés, analyse de réseaux, écologie du paysage, ainsi qu'une compréhension de base des paysages agricoles en tant que systèmes socio-écologiques.
Université de GöttingenLe pôle d'excellence « Forêts du futur » de l'Université de Fribourg lance un appel à candidatures pour un poste de doctorant en génétique fonctionnelle des arbres et édition du génome. Le projet vise à établir une technique d'édition génique par CRISPR/Cas chez le peuplier afin d'étudier le rôle de la régulation épigénétique dans la résilience et la mémoire du stress face aux changements climatiques. En combinant l'édition du génome, le profilage de l'épigénome et le phénotypage quantitatif du stress, le projet cherche à identifier des marqueurs moléculaires prédictifs de la résilience des arbres.
Université de FribourgNous recherchons un doctorant pour le printemps 2026, avec une prise de fonction prévue autour de septembre 2026 (dates flexibles). Vous travaillerez au sein du réseau doctoral Marie Curie AGILE, un consortium de scientifiques européens dédié à la formation de la prochaine génération de microscopistes spécialisés en biologie cellulaire végétale. Important : seuls les candidats n’ayant pas effectué plus de 12 mois d’études en Allemagne au cours des 36 derniers mois sont éligibles.
Université de HeidelbergLe projet Next Gen, en étroite collaboration avec le nœud La Trobe du Réseau australien de phénotypage végétal (APPN), recherche un spécialiste des données.
La Trobe UniversityCe projet vise à quantifier comment les perturbations anthropiques telles que l'agriculture, la foresterie et la construction de routes affectent le cycle du carbone et l'hydrologie dans les marais et les tourbières boisées du sud du Québec.
Groupe de recherche sur la résilience des zones humides
