Je sais que je devrais mettre en avant l'interview de Santiago Ramírez-Barahona pour ses écrits, mais il prend aussi des photos extraordinaires, comme celle-ci du sous-bois d'une forêt de nuages ​​mexicaine. J'avoue sans détour envier quiconque est capable de capturer la lumière de cette façon.

La semaine prochaine, nous aborderons le vieillissement des fleurs, l'influence du porte-greffe sur la forme de la vigne et le rôle des oiseaux aquatiques dans la dissémination des graines. Vous recevrez également un autre courriel contenant les articles et les reportages que vous partagez. Mastodonte et Bluesky À la même heure la semaine prochaine. À la prochaine, prenez soin de vous.

Alun (webmaster@botany.one)


Sur Botany One

Refuges à papillons dans les terrains oubliés
Les plantes communes et les terrains vagues transforment les espaces urbains en zones d'alimentation vitales pour les papillons.

Santiago Ramírez-Barahona : « Il y a toujours quelque chose de nouveau avec les plantes »
Botany One interviewe le Dr Santiago Ramírez-Barahona, un scientifique mexicain fasciné par les fougères arborescentes, les forêts de nuages ​​et l'évolution des plantes.

Miniatures mais résistantes au feu : que peuvent nous apprendre les mousses sur une planète qui se réchauffe ?
Dans les Cangas, où la terre bout sous le soleil et où le feu transforme tout en cendres, de minuscules mousses ont trouvé le moyen de survivre.

Ce glaïeul d'Afrique du Sud pourrait en réalité appartenir à sept espèces différentes.
Les glaïeuls séparés par l'espace et le temps pourraient évoluer en espèces distinctes.

Mettre de côté des semences pour demain
Les banques de semences offrent une bouée de sauvetage aux espèces menacées d'extinction.

…et celui de la semaine dernière Semaine en botanique avec l'importance des microscopes et des actualités provenant du web.


Actualités et Opinions

La disparition d'une revue scientifique prolifique met en lumière les profits colossaux de l'édition scientifique.
L'une des quinze revues scientifiques les plus prolifiques au monde a été exclue du système d'indexation pour irrégularités. Son éditeur, Elsevier, affiche une marge bénéficiaire de 38 % qui a atteint 15 milliard de dollars en 2024.

La modification des pores des plantes peut-elle protéger les cultures contre la sécheresse ?
La question n'est pas simple. Mais les chercheurs apprennent beaucoup en modifiant génétiquement le nombre de ces ouvertures, en simulant des atmosphères futures, et bien plus encore.

Disparition des experts, disparition des espèces : la crise de la taxonomie
La taxonomie végétale est le fondement de la science de la biodiversité, mais une pénurie mondiale de compétences menace son avenir. Former une nouvelle génération de taxonomistes est urgent, et de nouvelles recherches cartographient les zones où l'aide est la plus nécessaire pour combler ce déficit.

L'IA détruit l'université et apprend par elle-même
Les étudiants utilisent l'IA pour rédiger leurs dissertations, les professeurs l'utilisent pour les noter, les diplômes perdent toute valeur et les entreprises technologiques s'enrichissent. Bienvenue dans l'ère de la mort de l'enseignement supérieur.

Ce que votre section Introduction n'est pas
Aujourd'hui, voici le quatrième et dernier volet d'une courte série inspirée par de mauvais articles que j'ai lus (dont certains, je l'admets encore une fois, étaient les miens). Je me suis permis de râler sur Ce que ne devrait pas être une section Méthodes et Ce que ne devrait pas être une section Résultats et Ce qu'une section Discussion ne devrait pas être. Cela laisse une lacune évidente : que ne doit pas contenir votre section Introduction ?

ERC-Plus : une science lucrative ou une occasion manquée de réformer le monde universitaire ?
Réflexions de Sophien Kamoun sur ERC-Plus, la toute nouvelle bourse de recherche ultra-compétitive d'Europe, et ce qu'elle nous révèle sur la culture académique que nous sommes en train de construire.

Nouvelles techniques génomiques : un accord pour soutenir la transition écologique dans l’agriculture
Les nouvelles règles rendront le système alimentaire de l'UE plus sûr et plus durable, grâce à des plantes résistantes au climat et aux ravageurs qui offrent des rendements plus élevés et nécessitent moins d'engrais et de pesticides.

Des scientifiques font de nouveaux progrès dans la compréhension de la construction des fleurs.
Une équipe de biologistes végétaux a fait une découverte passionnante sur la façon dont les fleurs poussent et s'organisent, et l'un des principaux auteurs était professeur adjoint en biologie végétale. Ya Min (Minya) Des chercheurs de l'Université de l'Illinois ont publié une nouvelle étude dans la revue Current Biology, qui explore le rôle d'un gène appelé CYCLOIDEA (CYC) dans le développement précoce d'une fleur sauvage, le Mimulus parishii (communément appelé mimule des paroisses). Ce gène est important car il permet à la fleur de déterminer quelle face deviendra la partie supérieure, déterminant ainsi sa forme finale.

La linaigrette rare est revenue sur le front de mer
Une espèce végétale menacée est réintroduite sur un espace commun en bord de mer où elle a été observée pour la première fois il y a plus de 400 ans.

Autour d'une pinte à Oxford, nous avons peut-être découvert le Saint Graal de l'agriculture.
Je savais qu'une révolution dans notre compréhension des sols pouvait changer le monde. Puis vint une illumination – et la naissance du programme Earth Rover.

Une plante carnivore rarissime, surnommée « plante tueuse », découverte aux portes de la ville.
Un vieux dicton affirme qu'en Australie, tout veut vous manger – et cela inclut apparemment les plantes, l'île étant un véritable foyer mondial d'espèces carnivores. Or, des scientifiques ont fait une découverte particulièrement étonnante : des milliers de carnivores rarissimes se sont regroupés aux abords des villes.


Cette semaine en botanique

Il y a 5 ans : La diversité des cultures et l'habitat semi-naturel sont une aubaine pour les rendements ainsi que pour les pollinisateurs

Il y a 10 ans : Des plantes altruistes ?

Il y a 15 ans : La banane soutient … pour la nutrition, pour les moyens de subsistance et pour l'environnement


Articles scientifiques

L'enrichissement des souches de Streptomyces associées aux racines en réponse à la sécheresse est déterminé par divers traits fonctionnels et ne prédit pas les effets bénéfiques sur la croissance des plantes (GRATUIT).
En utilisant deux méthodes de séquençage de l'ARNr 16S avec différents niveaux de résolution taxonomique, Fonseca-Garcia et al. ont confirmé l'enrichissement associé à la sécheresse (DE) de Streptomyces dans les racines de sorgho cultivées en plein champ et ont identifié cinq variantes de séquences d'amplicons (ASV) étroitement apparentées mais distinctes appartenant au genre avec des modèles d'enrichissement en sécheresse variables.

Productivité inattendue et résistance à l'invasion dans les communautés végétales assemblées à partir de populations allopatriques ($)
En utilisant quatre espèces végétales indigènes provenant de 15 sites écologiquement similaires répartis sur une vaste région, Agneray et al. ont comparé le fonctionnement des écosystèmes au sein de communautés issues de sources allopatriques ou sympatriques. Conformément aux prédictions de différenciation des niches écologiques chez les plantes indigènes co-occurrentes, ils ont observé davantage d'interactions négatives entre les plantes indigènes dans les communautés d'origine allopatrique et davantage d'interactions positives dans les communautés d'origine sympatrique.

L'analyse de l'interactome inter-espèces révèle un mécanisme d'autophagie sélective conservé pour le contrôle de la qualité des protéines chez les plantes (GRATUIT)
L'autophagie sélective est une voie fondamentale de contrôle qualité des protéines qui préserve l'homéostasie protéique en dégradant les composants cellulaires endommagés ou excédentaires, notamment en situation de stress. Ce processus est orchestré par des récepteurs d'autophagie sélective (RAS) qui recrutent des protéines spécifiques pour leur dégradation. Malgré les progrès considérables réalisés dans la compréhension du mécanisme moléculaire de l'autophagie sélective, la diversité des répertoires de RAS selon les espèces reste largement inexplorée. Grâce à une analyse comparative de l'interactome chez cinq organismes modèles, Sánchez de Medina Hernández et al. ont identifié un ensemble de candidats RAS conservés et spécifiques à certaines lignées.

La mécanique et la coordination de la croissance définissent les champs de polarité basés sur SOSEKI (GRATUIT)
La formation des organes nécessite la croissance coordonnée des cellules et des tissus par rapport aux axes principaux du corps. La croissance des plantes est généralement anisotrope et mécaniquement couplée par des parois cellulaires contiguës ; cependant, la manière dont ces structures physiques sont liées à la polarité cellulaire et tissulaire reste floue. Piepers et al. utilisent les protéines SOSEKI (SOK) — que l’on pensait auparavant capables de refléter les champs de polarité globaux — comme marqueurs pour analyser comment la polarité se met en place lors de l’organogenèse des racines latérales.

AGO5 limite la transmission verticale des virus dans les gamétophytes des plantes (GRATUIT)
Hoffmann et al. montrent que l'AGO5, un facteur d'interférence ARN exprimé spécifiquement dans les cellules souches du méristème apical de la tige et dans la lignée germinale d'Arabidopsis thaliana, réduit considérablement la transmission verticale du virus de la mosaïque jaune du navet (TYMV).

La paire Pik NLR s'accumule au niveau de la membrane plasmique sous forme d'un complexe protéique immunitaire hétéro-oligomérique capteur-auxiliaire avant l'activation (FREE).
Pai et al. ont étudié l'état oligomérique du riz génétiquement lié (Oryza sativa) le capteur Pik-1 et l'auxiliaire Pik-2 NLR paire avant l'activation de l'effecteur lorsqu'ils sont exprimés transitoirement dans Nicotiana benthamiana feuilles. Nous montrons que les deux Pikm-1 de type sauvage et les Pikm-1 modifiésEnhancer Les capteurs s'associent à Pikm-2 et forment des hétéro-complexes d'environ 1 MDa à l'état de repos qui s'accumulent au niveau de la membrane plasmique.

Formation forestière fantôme méconnue et étendue le long de la côte atlantique américaine ($)
Yeung et al. ont cartographié plus de 10 millions d'arbres morts dans la région atlantique américaine, une zone particulièrement touchée par la montée du niveau de la mer, grâce à l'apprentissage profond et à l'imagerie aérienne à résolution inférieure au mètre. Leur analyse révèle une mortalité des arbres disproportionnée et généralisée dans de nombreuses zones de forêts fantômes jusqu'alors méconnues, avec plus de 6 millions d'arbres morts concentrés dans les forêts de basse altitude (moins de 5 m), principalement en raison de la salinisation plutôt que des seules inondations.
Lire gratuitement via ReadCube : https://rdcu.be/eTyQb

L'alcalinisation de l'apoplaste induite par l'acide salicylique nécessite la TRANSMEMBRANE KINASE 1 et entraîne une atténuation de la croissance (FREE)
Müller et al. montrent que l'activité de l'acide salicylique dépend de KINASE TRANSMEMBRANAIRE 1 (TMK1) entraînant une alcalinisation de l'apoplaste et une restriction de la croissance. Le traitement à l'acide salicylique (SA) empêche la phosphorylation et l'activation de l'H de la membrane plasmique (MP).+-ATPases à la surface de la cellule et ne dépend pas du récepteur d'auxine Auxin Binding Protein 1 (ABP1).

La structuration de la paroi cellulaire régule la dynamique des cellules souches végétales ($)
Les cellules végétales sont enveloppées d'une paroi semi-rigide qui se remodèle au fur et à mesure de leur expansion. Les propriétés chimiques et matérielles de la pectine, un composant essentiel des parois cellulaires, peuvent influencer la division cellulaire. Zhu et alNous avons constaté des propriétés différentes de la pectine dans les parois cellulaires nouvelles et matures, qui sont contrôlées par des enzymes modifiant la pectine telles que la PME5.

Le facteur de réponse à l'auxine de classe B MpARF2 est essentiel à l'organisation du méristème dans les gamétophytes des plantes libres ($)
Flores-Sandoval et al. rapportent que chez l'hépatique Marchantia polymorpheLes cellules souches pluripotentes sont protégées de la différenciation induite par l'auxine par le facteur de réponse à l'auxine de classe B unique (MpFRA2), un gène spécifique aux embryophytes qui antagonise les réponses à l'auxine. Ils décrivent le rôle crucial de MpFRA2 dans l'établissement et le maintien du méristème à l'aide de lignées rapportrices, d'allèles de perte et de gain de fonction et d'expériences d'interaction génique.

Un endophyte fongique racinaire complète fonctionnellement l'immunité de l'hôte et atténue la variation immunitaire naturelle chez Arabidopsis (GRATUIT)
Les micro-organismes bénéfiques associés aux racines peuvent renforcer la résilience des plantes en complétant certains aspects de leur système immunitaire. L'endophyte fongique racinaire Serendipita indica (Si) est connu pour favoriser la croissance des plantes et leur conférer une large tolérance au stress. Afin d'évaluer l'influence de la variation génétique naturelle de l'hôte sur la protection conférée par Si, Peltz et al. ont analysé la sensibilité de 47 accessions d'Arabidopsis thaliana au champignon pathogène Bipolaris sorokiniana (Bs), avec et sans colonisation par Si.


Dans les publications de l'AoBC


Carrières

Remarque : il s’agit d’articles qui ont été annoncés sur le Web. Ce ne sont pas des articles que je propose personnellement, et je ne peux pas non plus vous obtenir de visa pour travailler à l'étranger.

SynProm : rapporteurs transcriptionnels spatio-temporels rapides et modulaires pour les plantes (projet Plant BioDesign Bristol), Bristol
Comprendre quand et où les gènes sont activés est essentiel pour décrypter comment les plantes réagissent au stress et aux changements environnementaux. Cependant, les approches actuelles, telles que le séquençage d'ARN (RNA-seq) ou les lignées rapportrices stables, sont souvent lentes, coûteuses ou peu flexibles. Ce projet de doctorat vise à développer SynProm, une boîte à outils modulaire de biologie synthétique pour une surveillance spatio-temporelle rapide de l'activité génique chez les plantes.

Chercheur postdoctoral (Groupe Salem), Norwich
Au sein d'une équipe dirigée par le Dr Hassan Salem, vous développerez et appliquerez des outils de manipulation génétique pour disséquer les mécanismes moléculaires et fonctionnels sous-jacents aux mutualismes insectes-microbes.

Professeur adjoint ou agrégé (recherche et enseignement) en forêts face aux changements globaux, Birmingham
Nous recherchons un(e) maître(sse) de conférences ou professeur(e) agrégé(e) en Forêts et Changement climatique global pour l'École de géographie, des sciences de la Terre et de l'environnement (GEES) de l'Université de Birmingham, au Royaume-Uni. La personne retenue rejoindra une communauté de recherche dynamique qui étudie la réponse des forêts au changement climatique, aux perturbations et aux contraintes environnementales. Ce poste renforcera notre expertise reconnue internationalement dans le domaine des écosystèmes forestiers, notamment grâce à l'expérience FACE (Free-Air CO₂ Enrichment) de l'Institut de recherche forestière de Birmingham (BIFoR), une plateforme unique et de longue durée permettant de comprendre comment les forêts tempérées matures réagissent à l'augmentation du CO₂ atmosphérique.

Poste de chercheur postdoctoral (H/F/D) sur les approches synthétiques pour promouvoir la symbiose mycorhizienne arbusculaire, Potsdam
Le/la candidat(e) mènera des recherches à fort impact sur les mécanismes moléculaires végétaux favorisant la formation de spores de champignons mycorhiziens arbusculaires. Le/la postdoctorant(e) sera intégré(e) au projet « AMFactory », une collaboration multidisciplinaire visant à combler le fossé entre la production de champignons mycorhiziens arbusculaires sans contaminants dans des cultures d’organes racinaires et leur production à grande échelle et à faible coût dans des bioréacteurs, afin de rendre l’UE compétitive à l’échelle mondiale sur le marché des bioinoculants à base de champignons mycorhiziens arbusculaires.

Responsable de la biologie cellulaire chez KWS Vegetables, Wageningen
Nous recherchons une personne pratique Responsable de la biologie cellulaire (h/f/d), basé au Légumes KWS lieu de recherche à Wageningen, Pays-BasLe/La responsable de la biologie cellulaire participera à l'élaboration de la stratégie de recherche de KWS Vegetables et dirigera l'équipe de biologie cellulaire. Ses domaines d'expertise comprennent la biologie cellulaire (par exemple, la régénération des plantes, la multiplication in vitro et la production d'haploïdes doubles), la sélection accélérée, la reproduction végétale, et plus particulièrement le développement, la mise en œuvre et l'application systématique de méthodologies visant à soutenir le processus de sélection.

Poste de doctorat portant sur le décryptage des bases cellulaires et moléculaires de l'intégration des signaux chez les plantes, Amsterdam
Vous vous demandez comment les plantes traitent, évaluent et interprètent simultanément les innombrables signaux provenant de leur environnement ? Vous souhaitez explorer les mécanismes d’intégration des signaux chez les plantes au niveau cellulaire et vous êtes passionné(e) par la biologie moléculaire et la bio-imagerie ? Alors ce poste est peut-être fait pour vous ! Nous recherchons un(e) doctorant(e) motivé(e) pour rejoindre notre équipe ambitieuse et collaborative.

Bourse postdoctorale EEB, Toronto
Le/la boursier/ère pourra collaborer avec un ou plusieurs directeurs/trices de recherche en écologie et évolution. Nous recherchons des candidats/euses proposant des programmes de recherche novateurs et indépendants. Cette indépendance lui permettra de bénéficier d'un petit financement complémentaire pour soutenir ses travaux. Afin de favoriser les échanges au sein du département, le/la boursier/ère organisera un atelier sur un sujet en lien avec ses intérêts, à destination des doctorants, des postdoctorants et des professeurs/euses. Avant de postuler, nous encourageons les candidats/euses à contacter les professeurs/euses partageant les mêmes intérêts de recherche afin d'explorer d'éventuelles collaborations.

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