Merci à tous pour votre patience si vous avez reçu plus d'e-mails que prévu cette semaine. Le serveur de messagerie continue d'affirmer que l'importation des adresses e-mail s'est parfaitement déroulée et que vous ne recevez des e-mails que lorsque les articles sont classés dans la catégorie « La Semaine en Botanique ». Le système de comptage des e-mails envoyés est tout autre. Je travaille toujours avec WordPress.com pour essayer de résoudre le problème, même si, pour l'instant, c'est principalement eux qui s'en chargent. Cela signifie que nous avons publié beaucoup moins d'e-mails cette semaine que d'habitude, car je ne veux pas encombrer votre boîte de réception avec des e-mails auxquels vous n'êtes pas abonné. Pour la même raison, cette semaine pourrait également être plus légère.

Ce sera le dernier courriel d'Oxford. Bien que la majeure partie du travail soit effectuée depuis nos bureaux à domicile, partout dans le monde, nous avons, ou avions, un bureau au département de biologie d'Oxford. À partir de début septembre, le bureau où je ne me rendrai généralement pas sera celui de UCL J'espère que le prochain courriel que vous recevrez de ma part sera après le déménagement, avec un nouveau recueil des articles et des articles scientifiques que vous partagez sur les réseaux sociaux. D'ici là, prenez soin de vous.

Alun (webmaster@botany.one)

Sur Botany One

Un patchwork de verdure dans la ville
Les plantes sauvages des jardins urbains défient les attentes et maintiennent la biodiversité urbaine vivante et surprenante.

Grace Gachara : « Démêler les subtilités des couloirs du Wood Wide Web »
Botany One interviewe le Dr Grace Gachara, une écologiste microbienne kenyane, qui cherche à dévoiler les communautés microbiennes associées aux arbres endémiques.

…et celui de la semaine dernière Semaine en botanique avec Liedson Carneiro sur le réseautage, comment les coups de feu n'arrêtent pas la botanique, et plus encore.

Actualités et Opinions

Webinaire AAB de septembre 2025 : Édition génétique des plantes
Premier webinaire de la nouvelle série mensuelle de l'AAB. Le 23 septembre, Karam Mostafa discutera de CRISPR vs nématodes : une nouvelle ère pour la protection des cultures de pommes de terre.

Le laboratoire de recherche sur les plantes du MSU-DOE nomme Federica Brandizzi comme prochaine directrice
Professeur de la Fondation de recherche de l'Université d'État du Michigan Federica Brandizzi a été nommé prochain directeur de la MSU-Laboratoire de recherche sur les plantes énergétiques, ou PRL. Brandizzi est une chercheuse prolifique au sein de la communauté des sciences végétales. Son laboratoire a contribué de manière significative à la recherche végétale en biologie des organites, en recherche sur les biocarburants et en biologie spatiale.

Plantae présente : Le rôle de la science ouverte et du partage des données dans l'avancement de la recherche sur les plantes
L'accessibilité des données scientifiques facilite la reproductibilité et le développement de la recherche. L'évolution rapide des technologies favorise la prédominance de la recherche multi-omique, qui mobilise une quantité massive de données. Le dépôt, l'accès et l'intégration des données influencent leur utilisabilité. Ce webinaire aborde la science ouverte et le partage de données dans le contexte des sciences végétales sous différents angles, notamment la recherche, l'enseignement, la gestion des données et l'entrepreneuriat.

De nouvelles cartes aident les décideurs à prendre en compte l'albédo dans les stratégies de plantation d'arbres
L’albédo peut entraîner une réduction importante des bénéfices climatiques de la plantation d’arbres, mais de nouvelles données scientifiques aident à identifier les emplacements présentant le plus grand potentiel de refroidissement.

« Twitter est nul maintenant et tous les jeunes cools déménagent sur Bluesky » : Notre nouvelle enquête montre que les scientifiques ne trouvent plus Twitter utile ou agréable sur le plan professionnel
Mon collègue Dr Julia Wester et j'ai un nouvel article publié dans la revue Integrative and Comparative Biology Je présente les résultats d'une enquête menée auprès de plus de 800 scientifiques, enseignants et communicateurs scientifiques. J'ai présenté ces résultats lors de la réunion conjointe des ichtyologistes et herpétologistes de 2025. Notre étude confirme une tendance relayée par les journalistes scientifiques et éducatifs depuis un an ou plus : si Twitter était autrefois la référence absolue pour les communicateurs scientifiques en ligne, il n'est plus adapté et est massivement abandonné par les scientifiques.

Les forêts de sorbiers de Victoria pourraient perdre un quart de leurs arbres géants à mesure que les températures augmentent
Les eucalyptus regnans, qui atteignent régulièrement 60 à 80 m de haut, perdent environ 9 % de leurs arbres pour chaque degré de réchauffement, selon les recherches.

Comment les acides aminés sont transportés dans les plantes
Les plantes produisent tous les acides aminés essentiels à la vie humaine. Cette production se fait généralement dans des organites cellulaires spécialisés, appelés plastes. Une équipe de recherche dirigée par l'Université Heinrich Heine de Düsseldorf (HHU) a décrypté le mécanisme par lequel les plantes distribuent ces acides aminés au sein de leur organisme.

Les scientifiques sont pris dans un piège politique
En luttant contre l’administration Trump, ils commencent à ressembler davantage à des activistes.

Quelle(s) plante(s) devrions-nous étudier ?
Arabidopsis, une petite plante à fleurs, est un modèle précieux pour la recherche en biologie végétale depuis plus de 150 ans, ayant donné lieu à des découvertes et des applications majeures. Cependant, ses limites, telles que sa pertinence écologique et sa complexité, nécessitent l'exploration de plantes modèles supplémentaires. Les chercheurs étudient actuellement diverses plantes, notamment les hépatiques, les roseaux et les plantes parasites, afin de mieux comprendre la diversité végétale et de relever des défis spécifiques comme la tolérance au sel et le parasitisme.

Cette semaine en botanique

Il y a 5 ans : Les traits microanatomiques des feuilles varient selon les gradients climatiques dans une herbe des Grandes Plaines

Il y a 10 ans : Sport et drogue…

Il y a 15 ans : La génétique derrière l'évolution

Articles scientifiques

♻ Détection incohérente des dettes d'extinction selon les différentes méthodes (GRATUIT)
La dette d'extinction, c'est-à-dire l'extinction retardée des espèces suite à la dégradation des paysages, est un concept largement débattu. Cependant, la multiplicité des méthodes et le manque de comparaisons entre les habitats empêchent de parvenir à un consensus sur leur prévalence. Nous avons appliqué trois méthodes contrastées de relations espèce-surface pour tester la dette d'extinction des communautés végétales dans trois habitats ayant connu des historiques de dégradation différents au cours du siècle dernier : les prairies calcaires, les landes et les forêts.

Considérations évolutives et méthodologiques lors de l'interprétation de la variation de présence ou d'absence de gènes dans les pangénomes (GRATUIT)
Français Bien que les pangénomes basés sur des graphes soient devenus une base standard et interopérable pour les comparaisons entre plusieurs génomes de référence, l'intégration des annotations de gènes codant pour des protéines entre les pangénomes dans un seul « ensemble de pangènes » reste difficile, à la fois en raison de l'incohérence méthodologique et de la variation biologique de présence-absence (PAV). Brůna et al. examinent et évaluent expérimentalement la racine de l'annotation du génome et de l'incohérence de l'ensemble de pangènes en utilisant deux pangénomes de plantes polyploïdes : le coton et le soja, qui ont été choisis en raison de leurs ressources génomiques diverses et de haute qualité et de l'importance connue de la variation de présence-absence de gènes dans leurs programmes de sélection respectifs.

CRISPR vs. nématodes : une nouvelle ère de solutions génétiques pour la protection des cultures de pommes de terre (GRATUIT)
Pomme de terre (Solanum tuberosum L.), pierre angulaire de la sécurité alimentaire mondiale, est appréciée pour sa valeur nutritionnelle et ses diverses utilisations, mais elle est confrontée à d'importants problèmes de production causés par les nématodes parasites des plantes, en particulier les nématodes à kystes de la pomme de terre (Globodera rostochiensiset G. pallida) et les nématodes à galles (Méloidogyne spp.). Ces ravageurs causent d'importantes pertes de rendement et des pertes économiques dans le monde entier, aggravées par la persistance de kystes de nématodes dans le sol et l'utilisation limitée de nématicides chimiques en raison de préoccupations environnementales. Cette revue se concentre sur la biologie des nématodes, leur impact sur la production de pommes de terre et diverses stratégies de lutte.

Un atlas transcriptomique spatial unicellulaire du cycle de vie d'Arabidopsis (GRATUIT)
Arabidopsis La biologie végétale a joué un rôle crucial dans la découverte des principes fondamentaux de la biologie végétale. Pourtant, une compréhension complète et précise de ses identités cellulaires tout au long de son cycle de vie reste incomplète. Nous présentons ici un atlas transcriptomique mononucléaire et spatial couvrant dix stades de développement, englobant plus de 400,000 75 noyaux provenant de tous les systèmes organiques et tissus, des graines aux siliques en développement. En exploitant des ensembles de données transcriptomiques mononucléaires et spatiales appariées, Lee et al. annotent XNUMX % des groupes cellulaires identifiés, révélant une diversité moléculaire frappante des types et des états cellulaires tout au long du développement.

Photosynthèse CAM cryptique dans l'arbre de Josué (Yucca brevifolia, Y. jaegeriana) (GRATUIT)
Une combinaison de données physiologiques et transcriptomiques a montré de faibles niveaux de CAM, variables selon les populations, mais sans lien avec les conditions environnementales du foyer. L'expression génétique a confirmé l'activité de la CAM et a suggéré des différences dans le métabolisme du carbone et de l'azote entre les individus. Y. brevifolia et Y. jaegeriana.

Les scientifiques ne trouvent plus Twitter utile professionnellement et sont passés à Bluesky ($)
Shiffman & Wester rapportent les résultats d'une enquête distribuée aux scientifiques sur Twitter et Bluesky (n = 813). Les résultats confirment largement que les modifications apportées à Twitter ont rendu cette plateforme de médias sociaux inutilisable et peu agréable sur le plan professionnel, et que de nombreux scientifiques l'ont abandonnée au profit de Bluesky. Les résultats montrent que pour chaque avantage professionnel que les scientifiques tiraient autrefois de Twitter, ils peuvent désormais l'obtenir plus efficacement sur Bluesky.

L'intensification de l'aridité pendant la saison des incendies laisse présager une expansion continue des graves incendies de forêt dans les forêts de l'ouest des États-Unis (GRATUIT)
La superficie brûlée par les feux de forêt a augmenté dans les forêts de l'ouest des États-Unis et ailleurs au cours des dernières décennies, coïncidant avec des saisons des incendies plus chaudes et plus sèches. Cependant, les incendies de forte intensité – qui détruisent la totalité ou la plupart des arbres – constituent sans doute un indicateur plus important de l'activité des incendies, compte tenu de leur influence déstabilisatrice sur les écosystèmes forestiers et de leurs impacts directs et indirects sur les communautés humaines. Parks et al. ont quantifié les superficies brûlées et les superficies gravement brûlées dans les forêts de l'ouest des États-Unis de 1985 à 2022 et ont évalué les tendances au fil du temps.

La coopération entre un endophyte fongique racinaire et la coumarine scopolétine dérivée de l'hôte assure la nutrition en fer d'Arabidopsis (GRATUIT)
Les interactions fongiques-coumarines ont été évaluées en profilant les métabolites et en mesurant la mobilisation du fer dans les cultures F80 supplémentées avec des coumarines spécifiques, tout en quantifiant les performances de croissance et la teneur en fer dans Arabidopsis mutants de biosynthèse de la coumarine inoculés avec F80.

Le début de la réponse phénologique des plantes au réchauffement climatique (GRATUIT)
L'étude utilise des données phénologiques à long terme sur le cerisier de montagne japonais de Kyoto afin d'identifier le début de changements phénologiques durables dus au réchauffement climatique. La date de pleine floraison du cerisier, enregistrée depuis le IXe siècle, permet de distinguer le changement climatique anthropique de la variabilité naturelle.

Le recrutement de la cycline de type A TAM pour stresser les granules est crucial pour la fidélité méiotique sous la chaleur (GRATUIT)
Les granules de stress (GS) sont des condensats biomoléculaires qui représentent une réponse adaptative des cellules à divers stress, notamment thermiques. Cependant, la fonction spécifique au type cellulaire et la pertinence de la formation des GS, notamment au cours du développement reproductif, restent largement méconnues. De Jaeger-Braet et al. montrent que la cycline méiotique de type A, la MÉIOSE ASYNCHRONE TARDIVE (TAM), est recrutée dans les GS des méiocytes mâles. Arabidopsis après exposition à la chaleur.

Dans les publications de l'AoBC

Carrières

Remarque : il s’agit d’articles qui ont été annoncés sur le Web. Ce ne sont pas des articles que je propose personnellement, et je ne peux pas non plus vous obtenir de visa pour travailler à l'étranger.

Rédacteur associé de Biological Flora, Monde
Le BES recherche des écologues possédant des connaissances comparatives approfondies sur un ou plusieurs aspects de diverses espèces de plantes vasculaires, se concentrant soit sur celles trouvées en Grande-Bretagne et en Irlande (BFBI) soit sur une autre flore régionale de notre couverture mondiale (IBF), pour rejoindre l'équipe de rédacteurs de Journal of Ecology.

The Plant Cell accepte les candidatures pour les postes d'assistant rédacteurs en chef, dans le monde entier
Êtes-vous un chercheur en début de carrière passionné par les plantes et la communication scientifique ? La cellule végétale La revue accepte les candidatures pour le poste de rédacteur adjoint d'articles (REA) pour les exercices 2026 et 2027. Les REA rendent un service précieux à la revue, à nos auteurs et à la communauté scientifique. En échange, ils rejoignent notre comité de rédaction et bénéficient d'une formation et d'une expérience en rédaction et communication de résultats scientifiques à un large public. Ils bénéficient également d'opportunités de réseautage et d'une formation de rédacteur en chef en participant à des activités de La cellule végétale comité de rédaction. Nous acceptons les candidatures via Lundi, septembre 15, 2025.

Rédacteur en chef – Journal of Applied Ecology, Monde entier
Nous recherchons un rédacteur en chef pour renforcer et compléter notre équipe éditoriale et contribuer au rayonnement international de la revue. Afin de compléter notre équipe, nous recherchons un chercheur actif ayant un large intérêt pour l'écologie appliquée. Une expertise en sciences de la conservation, en écologie animale et en écologie forestière est particulièrement appréciée, mais non indispensable. Les candidatures de scientifiques de renom, spécialistes de tous les domaines couverts par la revue et susceptibles de contribuer à son développement dans des domaines actuels et émergents, sont les bienvenues.

Ingénieur logiciel de recherche, Norwich
Le/La candidat(e) retenu(e) rejoindra cette équipe hautement qualifiée et motivée, travaillant à l'interface entre la science et l'informatique. Ce poste offre une opportunité passionnante de collaborer avec des chercheurs à la pointe des sciences de la vie, d'explorer de nouvelles approches technologiques et de les appliquer à des problèmes concrets et complexes. Il/Elle contribuera au soutien de la plateforme informatique afin de fournir des outils logiciels, des services web, des formations et des services de gestion de données à l'institut et à la communauté scientifique au sens large. Cela comprendra la gestion des services essentiels et la maintenance des applications web existantes, le développement de solutions logicielles et d'infrastructure, la gestion des données, la documentation et la formation.

Bourse indépendante en interactions microbiennes associées aux plantes, Norwich
Le Centre John Innes (JIC) reconnaît l'importance cruciale de ce domaine en pleine évolution et invite les scientifiques visionnaires à postuler pour une bourse de recherche indépendante axée sur les communautés microbiennes et leurs interactions. Nous accueillons les candidats possédant une expertise et un intérêt pour tout aspect des communautés microbiennes ou fongiques et de leurs interactions avec les organismes hôtes, en particulier lorsque ces interactions contribuent à la santé des plantes et des sols.

Rédacteur associé de PLOS Biology - FTC, Royaume-Uni
PLOS Biology recherche un·e scientifique passionné·e par les sciences de la vie pour rejoindre son équipe éditoriale dédiée en tant que rédacteur·rice associé·e. Le poste est à pourvoir immédiatement et les candidatures seront étudiées dès réception. Ce poste stimulant intellectuellement requiert un vif intérêt pour la pratique et la communication scientifiques. En tant que membre à part entière de l'équipe éditoriale de cette revue de biologie en libre accès de premier plan, vous serez responsable du recrutement et de l'évaluation des manuscrits de recherche, de la collaboration avec le comité de rédaction des rédacteurs académiques, de la gestion de l'évaluation par les pairs et de la commande d'articles pour notre section Magazine. L'interaction avec la communauté scientifique, notamment la participation à des conférences internationales et la visite d'instituts de recherche, est un aspect clé de ce poste. Le·la candidat·e retenu·e devra donc être dynamique et sociable, disposé·e à voyager et posséder d'excellentes qualités relationnelles.

Chaire (niveau W2) en « Amélioration moléculaire des cultures », Münster
Outre son poste de professeur, le/la candidat(e) occupera également un poste de direction au sein de l'antenne de Münster de l'Institut Fraunhofer de biologie moléculaire et d'écologie appliquée (IME). Nous recherchons un/une chercheur(euse) de renommée internationale, expert(e) en recherche fondamentale et appliquée sur les stratégies d'amélioration des caractéristiques des cultures.

Professeur junior W1 avec titularisation W2 (h/f/d) en biologie membranaire, Bochum
Nous recherchons des candidats en début de carrière souhaitant répondre à des questions biologiques en utilisant des méthodes innovantes de pointe. Leurs recherches devront aborder des questions clés telles que le métabolisme lipidique, le maintien membranaire ou la modulation dynamique de la membrane en réponse à des conditions environnementales variables chez des organismes modèles, par exemple des microbes, des animaux ou des plantes. Les axes de recherche peuvent être la biogenèse membranaire, l'identité et les sites de contact membranaire, la physiologie cellulaire, la composition et la fluidité membranaires et/ou la compartimentation, par exemple.

Chef de l'unité de service Protéomique, Potsdam
L'Institut Max Planck de physiologie moléculaire des plantes (MPI-MP) situé à Potsdam recherche un expert en protéomique basée sur la spectrométrie de masse pour soutenir l'institut en tant que chef de l'unité de service Protéomique.

Chercheur postdoctoral en écologie de la reproduction des arbres forestiers face au changement climatique, Poznań
Nous invitons les candidats à postuler pour rejoindre notre équipe. Le/la candidat(e) retenu(e) dirigera un projet de recherche indépendant sur la reproduction des arbres dans des conditions climatiques changeantes, collaborera avec les scientifiques du centre et contribuera au transfert de connaissances et aux activités de vulgarisation. Il/elle aura la possibilité de développer ses propres idées de recherche dans le vaste domaine de l'écologie forestière.

Doctorant en écophysiologie végétale (f/m/d), Lausanne
Vous travaillerez au sein de « The Réseau doctoral FutureForests« Une initiative Actions Marie Skłodowska-Curie (MSCA) financée par l'UE, qui vise à former la prochaine génération de scientifiques à l'évaluation des impacts du changement climatique sur les forêts européennes en utilisant un réseau unique d'installations forestières de terrain phares européennes. Basé au WSL à Lausanne, vous vous concentrerez sur l'évaluation des changements dans les relations carbone-eau des arbres, y compris l'allocation du carbone dans l'expérience VPDrought (Valais, Suisse). L'objectif est d'étudier comment les sécheresses atmosphériques et pédologiques affectent les processus écophysiologiques de la feuille à l'arbre entier qui stimulent la croissance, la séquestration du carbone et la mortalité des arbres. Des mesures et analyses complémentaires seront menées dans des installations de manipulation sélectionnées en Estonie (Université de Tartu) et en Allemagne (Université technique de Munich) afin de comparer les impacts des sécheresses récurrentes et des déficits de pression de vapeur sur la croissance des plantes et la dynamique du carbone dans le cadre du changement climatique. »

Décoder les signatures spectrales de la diversité et de la fonction des arbres d'Australie, Sydney
Une bourse de doctorat est disponible dans le cadre d'un projet ARC-DECRA sur la diversité et le fonctionnement des arbres et des forêts d'Australie. Nos recherches combinent des analyses de la réflectance spectrale foliaire avec les caractéristiques fonctionnelles des plantes, de riches plateformes de données de terrain et une modélisation basée sur les processus pour étudier les variations fonctionnelles des arbres et leurs implications pour la résilience et la productivité des forêts, aujourd'hui et demain.

Doctorat : La génomique de l'adaptation locale dans une zone hybride d'épinettes, Calgary
Le laboratoire Yeaman cherche à recruter un doctorant pour étudier les bases génomiques de l'adaptation locale dans la zone hybride de l'épinette blanche et de l'épinette d'Engelmann dans les Rocheuses albertaines (Banff, Kananaskis). Selon l'expérience et les intérêts du candidat, ce projet peut inclure des travaux de terrain dans les Rocheuses ou se concentrer uniquement sur l'analyse bioinformatique/génomique ou l'application d'approches théoriques pour réaliser des prédictions spatialement explicites pour la zone hybride.

Bourse de recherche postdoctorale Killam, Vancouver
Les bourses de recherche postdoctorale Killam de l'UBC sont attribuées chaque année par le Fonds commémoratif Izaak Walton Killam pour les études avancées et sont disponibles pour la plupart des domaines de recherche. Mme Killam souhaitait que les boursiers sélectionnés « soient susceptibles de contribuer à l'avancement du savoir ou de se distinguer dans une profession. Un boursier Killam ne doit pas être unilatéral… Une distinction intellectuelle particulière doit reposer sur une solide personnalité. »