Il est facile de se perdre dans un océan d'histoires négatives. Nous en aurons peut-être une plus tard dans la journée, avec la publication d'un article d'Andrés Pereira-Guaqueta sur les dangers du changement climatique pour le cacao. Cependant, il existe des solutions, mais aussi des pessimismes. C'était un plaisir de le lire. À tel point que les fautes de frappe qui ont survécu aux corrections sont de ma faute, car j'ai passé trop de temps à me concentrer sur le sens des paragraphes plutôt que sur la forme des mots.

Il y a aussi un article sur le Hanami, la tradition japonaise qui consiste à admirer les fleurs, par Mareike Jezek. Elle examine la génétique des cerisiers en fleurs et son importance dans un monde en réchauffement climatique. Cet article paraîtra vendredi.

À cause des vacances, il pourrait y avoir des perturbations dans l'envoi des e-mails la semaine prochaine. Je prévois de le rédiger et de le programmer avant le week-end. Mais cette semaine, j'avais prévu de le rédiger avant dimanche, afin d'avoir mon jour de congé. Il est 7 h dimanche au moment où j'écris ces lignes, au lieu de 10 h habituellement. Ce n'est donc pas un échec total, mais je pourrais faire mieux.

Dès qu'il arrivera, il y aura un autre e-mail contenant les documents que vous partagez. Mastodonte, Bluesky, et Twitter la semaine prochaine. À bientôt, prenez soin de vous.

Alun (webmaster@botany.one)

Sur Botany One

Pourquoi le pedigree est important pour la survie des plantes menacées comme l'arum Titan
Des scientifiques ont établi un pedigree de l'Arum Titan, une plante rare et menacée, et ont découvert que les jardins botaniques pourraient réduire involontairement sa diversité génétique.

Marcelo A. Aizen : « La pollinisation ne se résume pas à la simple visite des animaux aux fleurs »
Botany One interviewe le Dr Marcelo A. Aizen, un chercheur argentin fasciné par les interactions entre les plantes et les pollinisateurs.

Pourquoi un arbre se moquerait-il de Thor ?
Certains arbres tropicaux non seulement survivent aux coups de foudre, mais les utilisent également comme armes contre leurs concurrents.

La sagesse des foules à la main verte apporte son expertise à l'Australie occidentale

Actualités et Opinions

RILAB / déclarations
Toutes les demandes d’emploi et de subvention présentées ici sont acceptées, ce qui, nous l’espérons, offre une perspective diversifiée sur ce qui a fonctionné en matière d’emploi et de financement.

Gardiens des clairières : protéger les forêts européennes contre le changement climatique
Des chercheurs financés par l’UE combinent des recherches de pointe avec des pratiques forestières durables pour protéger nos forêts et préserver les nombreux avantages environnementaux qu’elles offrent.

Les microbes, acteurs cachés ou importants de la vie végétale
Rejoignez-nous pour un symposium de trois jours organisé par la nouvelle rédactrice en chef de New Phytologist, Maarja Öpik. Université de Tartu, du 8 au 10 juillet 2025.

Visas d'étudiants internationaux révoqués
Au 12 avril, plus de 170 collèges et universités ont identifié plus de 950 étudiants internationaux et jeunes diplômés dont le statut juridique a été modifié par le Département d'État américain.

9e atelier annuel de biologie computationnelle
Le Laboratoire Sainsbury de l'Université de Cambridge (SLCU) et le Laboratoire de Reproduction et Développement des Plantes de l'ENS Lyon organisent conjointement l'Atelier International de Biologie Computationnelle des Plantes. Organisé par des membres du groupe Morphodynamique Computationnelle, cet atelier annuel vise à réunir des scientifiques intéressés par la modélisation du développement des plantes. Il accueillera des intervenants de diverses disciplines et des chercheurs travaillant sur d'autres systèmes modèles des sciences de la vie. L'atelier propose des séminaires autour d'un thème différent chaque jour et un temps important pour des discussions de groupe sur les défis actuels et futurs du développement de la modélisation et de la morphogenèse. Des discussions plus techniques et des hackathons sont également prévus, au cours desquels les développeurs de modèles s'efforcent d'intégrer des logiciels de différents groupes de traitement d'images, de maillage et de modélisation.

Ces loups redoutables ne représentent pas une avancée scientifique extraordinaire. Ils sont un symbole inquiétant de la direction que nous prenons.
Nous ne devrions pas célébrer la « dé-extinction ». Nous devrions plutôt nous concentrer sur les espèces actuellement en danger.

J'ai vu les gommiers bien-aimés d'Australie mourir et cela me fait me demander : s'ils ne peuvent pas survivre, comment pouvons-nous le faire ?
Même les eucalyptus robustes trouvent leurs limites alors que nous sommes confrontés à des feux de brousse, des vagues de chaleur et des sécheresses plus fréquents.

Une découverte surprenante sur la plante la plus étudiée au monde peut rendre les graines plus grosses
Une « porte » négligée régit le transport des nutriments vers les graines et pourrait un jour stimuler les récoltes.

Un botaniste du Kent a sauvé une fleur japonaise de l'extinction
L'histoire de la façon dont un botaniste du Kent a sauvé une variété de cerisiers japonais de l'extinction dans les années 1920 sera racontée à travers une série de promenades.

Le paradoxe phytoplanctonique
Quel est le lien entre le phytoplancton flottant librement dans l’océan et les plants de riz terrestres ?

Articles scientifiques

Le cycle cellulaire suit le mécanisme de « pause et de lecture » dans la récupération du stress environnemental chez diverses espèces végétales (GRATUIT)
Hazelwood et al. ont testé la régulation du cycle cellulaire pendant les périodes de contrôle, de stress et de récupération pour les stress salins, osmotiques, froids et thermiques en utilisant l'eudicot Arabidopsis thaliana et les monocotylédones Distachyon de Brachypodium et Lolium multiflore(ray-grass annuel). Ils ont identifié un mécanisme conservé de « pause et de reprise » du cycle cellulaire pendant le stress environnemental et la récupération.
Aussi voir le fil de discussion d'Arif Ashraf.

Une synthèse mondiale sur la façon dont les plantes réagissent au climat
Réchauffement des traits à la forme physique ($)

Malgré des recherches intensives, notre compréhension de la façon dont les plantes réagissent au réchauffement en coordonnant l'ensemble de leurs traits pour ajuster leur fitness est insuffisante. Pour combler cette lacune, Jia et al. ont appliqué un cadre basé sur les traits avec trois groupes (deux groupes fonctionnels : « taux de fixation du carbone » et « surface de fixation du carbone » ; un troisième groupe : « fixation totale du carbone ») à un ensemble de données mondiales compilé à partir de 572 études d'expériences de réchauffement menées auprès de 677 espèces et d'une liste exhaustive de traits et de composantes de fitness.
Accès éventuellement gratuit via le lien ci-dessus.

Extrait du Indicatif de Shenzhen à la Indicatif de Madrid:Nouvelles règles et recommandations pour nommer les algues, les champignons et les plantes (GRATUIT)
Ce commentaire complète les rapports techniques déjà publiés et donne un aperçu de certaines des règles et recommandations nouvelles ou modifiées dans les années à venir. Indicatif de Madrid.

Étude de la précision du CO des tiges ligneuses tropicales2 estimations d'efflux : méthodes de mise à l'échelle et variation verticale et journalière (GRATUIT)
Tige CO2 L'efflux (EA) contribue significativement à la respiration autotrophe et écosystémique dans les forêts tropicales, mais les méthodologies de terrain introduisent souvent des biais et des incertitudes. Cette étude évalue ces biais et leur impact sur la mise à l'échelle de l'EA à l'échelle du peuplement.

L'immunité à l'eau l'emporte sur l'immunité stomatique dans la résistance des plantes à Pseudomonas syringae (GRATUIT)
Le pathogène bactérien Pseudomonas syringae (chut) exploite les stomates ouverts pour pénétrer dans son hôte. Cependant, il peut également induire la fermeture des stomates aux stades post-invasifs pour favoriser l'hydratation apoplasique, créant ainsi un environnement favorable à chut prolifération, se manifestant par des lésions aqueuses sur les feuilles. Durant les stades post-invasifs de chutLors d'une infection, les plantes rouvrent leurs stomates pour favoriser la déshydratation apoplasique, établissant ainsi la deuxième couche de défense stomatique, appelée immunité hydrique. Pour évaluer l'importance relative de l'immunité stomatique et de l'immunité hydrique, Kemppinen et al. ont utilisé un ensemble diversifié d'Arabidopsis (Arabidopsis thaliana) mutants présentant une fonction stomatique altérée et une croissance bactérienne surveillée, un comportement stomatique et une capacité d'absorption d'eau après chut PV tomate Infection par DC3000.

L'excision des feuilles et la durée d'exposition modifient les estimations des seuils thermiques photosynthétiques irréversibles ($)
Didion-Gency et al. ont déterminé la température critique (Tcrit), la température provoquant une réduction de 50 % (T50) et la température maximale tolérable (Tmax) du photosystème II chez les jeunes arbres de cyprès méditerranéen, de pin d'Alep et de pin sylvestre en utilisant des courbes d'exposition à la chaleur de 15 ou 30 minutes réalisées sur des plantes vivantes (in vivo), des aiguilles excisées (ex vivo) et des aiguilles excisées exposées en continu à chaque augmentation de température (ex vivo continu).

Une méthylation extensive de la cytosine N4 est essentielle à la fonction des spermatozoïdes de Marchantia (GRATUIT)
La N4-méthylcytosine (4mC) est une modification importante de l'ADN chez les procaryotes, mais sa pertinence, voire sa présence, chez les eucaryotes demeurent mystérieuses. Walker et al. montrent que la spermatogenèse chez l'hépatique Marchantia polymorpha implique deux vagues de reprogrammation extensive de la méthylation de l'ADN.

L'auxine et le tryptophane déclenchent des réponses communes chez l'algue streptophyte Penium margaritaceum (GRATUIT)
Carrillo-Carrasco et al. étudient les réponses auxines chez l'algue streptophyte unicellulaire Penium margaritaceum. En évaluant les réponses physiologiques, transcriptomiques et cellulaires, ils ont découvert que l'auxine déclenche la prolifération cellulaire, la régulation génétique et l'accélération du flux cytoplasmique.

MetaFlowTrain : un système fluidique hautement parallélisé et modulaire pour l'étude des interactions inter-organismes médiées par les exométabolites (GRATUIT)
Chesneau et al présentent MetaFlowTrain, un système fluidique modulaire, facile à assembler, bon marché et à débit semi-élevé, dans lequel plusieurs milieux peuvent être rincés à des débits réglables dans des microchambres gnotobiotiques accueillant divers micro-organismes, allant des bactéries aux petits eucaryotes.

IQ-TREE 3 : Logiciel d'inférence phylogénomique utilisant des modèles évolutifs complexes (GRATUIT)
ARBRE IQ (http://www.iqtree.org) est un outil logiciel open source largement utilisé pour déduire efficacement des arbres phylogénétiques sous maximum de vraisemblance. Nous présentons ici IQ-TREE version 3, la troisième version majeure du logiciel.

Dans les publications de l'AoBC

Carrières

Remarque : il s’agit d’articles qui ont été annoncés sur le Web. Ce ne sont pas des articles que je propose personnellement, et je ne peux pas non plus vous obtenir de visa pour travailler à l'étranger.

Doctorat Comment les plantes et les microbes synchronisent leurs rythmes quotidiens pour rester en forme, Norwich
Saviez-vous que presque toute vie sur Terre, des plantes aux humains, possède une horloge biologique de 24 heures ? Jusqu'à récemment, nous pensions que la plupart des bactéries, bien que représentant 12 % de la biomasse mondiale, n'en avaient pas. Nous avons fait une découverte révolutionnaire : une véritable horloge circadienne chez Bacillus subtilis, une bactérie non photosynthétique. Cela remet en question tout ce que nous pensions savoir sur la vie bactérienne et ses relations avec les autres organismes. Dans cette thèse, vous approfondirez cette découverte. Les bactéries et les plantes pourraient-elles synchroniser leurs horloges pour se bénéficier mutuellement ?

Maître de conférences en écologie de terrain, Reading
La Division d'écologie et de biologie évolutive recherche un scientifique ou un praticien hautement motivé et performant, travaillant sur des aspects de l'écologie de terrain, notamment l'identification des animaux et des plantes. Ses fonctions comprendront : la contribution à la recherche, y compris les demandes de financement, l'enseignement aux niveaux licence et master, et les tâches administratives normalement attendues en milieu universitaire.

Chercheur associé (durée déterminée), Cambridge
Nous recherchons un poste d'associé de recherche postdoctoral au sein du groupe du Dr Sarah Robinson au Laboratoire Sainsbury de l'Université de Cambridge (SLCU). L'objectif du laboratoire Robinson est d'étudier le développement des plantes, notamment d'un point de vue mécanique. Nous recherchons une personne passionnée par le développement des plantes et intéressée par le développement de méthodes biomécaniques pour leurs applications.

Bourse de doctorat : Revitaliser le houblon britannique : exploiter les fleurs sauvages pour un avenir plus vert, Cirencester
Il s'agit d'un projet de doctorat collaboratif entre la Royal Agricultural University et l'Université de Warwick. Les candidatures sont ouvertes pour cette bourse de doctorat à temps plein. Pour les étudiants britanniques, elle est entièrement financée par la Brewers' Company, Asahi et la Royal Agricultural University. Les étudiants internationaux sont les bienvenus, mais la différence entre les frais de scolarité nationaux et internationaux reste à leur charge.

Chercheur postdoctoral, Édimbourg
Mener des recherches en chronobiologie cellulaire et moléculaire, contribuant au développement de nouvelles idées, approches, concepts ou techniques.

Chercheur (H/F) en génomique et épigénomique des organismes photosynthétiques (H/F), Paris
La personne recrutée développera des analyses expérimentales et bioinformatiques en génomique fonctionnelle. Elle appliquera des approches de génétique moléculaire, d'épigénomique et de microscopie confocale, ainsi que leurs analyses bioinformatiques complètes. Elle proposera et développera également des stratégies originales d'analyses bioinformatiques ciblées, adaptées aux questions biologiques posées par le projet ChromatinPhotoDynamics, coordonné par Fredy Barneche et financé par l'Agence nationale de la recherche (ANR).

Post-Doc Chercheur (H/F) en écologie microbienne et métabolomique des interactions bactéries-plantes (H/F), Lyon
Le/La jeune chercheur(euse) (H/F) sera intégré(e) à l'équipe Rhizo du laboratoire d'Écologie Microbienne de Lyon. Il/Elle travaillera en étroite collaboration avec C. Prigent-Combaret, DR CNRS, coordinateur(trice) du projet innovant « SensOrCol », soutenu par le programme « Prématuration » du CNRS, et avec les membres du Centre d'Étude des Substances Naturelles (CESN). Il/Elle devra (i) développer une méthode de criblage à haut débit de la sensibilité des cultivars de colza à Phelipanche ramosa, et (ii) identifier les mécanismes moléculaires impliqués dans l'interaction entre différents cultivars de colza cultivés en France et une bactérie bénéfique pour les plantes.

Poste de doctorat en génomique végétale, Bonn
L'objectif de ce projet financé par le DFG est de comprendre les bases génétiques et moléculaires de la modulation systémique de l'architecture du système racinaire du maïs (Zea mays L.) par les racines séminales pour mieux s'adapter à la sécheresse.

Poste postdoctoral – dans le domaine de la biologie moléculaire des associations plantes-microbes, Kiel
Nous étudions l'adaptation et l'écologie des micro-organismes associés aux plantes cultivées et sauvages. Nos recherches portent principalement sur les champignons phytopathogènes. Nous avons récemment démontré que l'infection des tissus végétaux par des champignons pathogènes influence fortement la composition du microbiote végétal. Ce projet vise à mieux comprendre l'interaction tripartite des champignons pathogènes avec les micro-organismes associés aux plantes et leur système immunitaire. Ce projet s'intéressera plus particulièrement aux mécanismes moléculaires sous-jacents par lesquels les plantes hébergent ces micro-organismes. La recherche s'appuiera sur des approches moléculaires et expérimentales, ainsi que sur des analyses statistiques de données à haut débit.

Doctorant en modélisation de la végétation arctique-boréale, Oslo
Nous recherchons un(e) candidat(e) motivé(e) pour travailler au sein d'une équipe interdisciplinaire afin d'améliorer le modèle démographique de végétation FATES, couplé au modèle de surface terrestre CLM, intégré au modèle norvégien du système terrestre (NorESM). Le/la candidat(e) retenu(e) collaborera avec des experts de renommée mondiale du cycle du carbone arctique-boréal, de la modélisation de la végétation et de la physiologie végétale. Il/elle améliorera un schéma d'endurcissement au froid et l'hydraulique végétale dans FATES en utilisant des données physiologiques végétales issues d'une expérience en climat contrôlé et d'expériences de terrain, en collaboration avec des partenaires du projet en Norvège, au Groenland et aux États-Unis.

Chef de l'unité de recherche Écologie forestière et des sols 90-100 % (f/m/d), Zurich
Vous dirigerez et animerez une unité de recherche de renommée internationale, composée de sept groupes de recherche solides et reconnus, et d'une centaine de collaborateurs issus d'une vingtaine de pays. En tant qu'écologiste reconnu, vous jouerez un rôle important dans des projets nationaux et internationaux axés sur la science des forêts et des sols. Au sein de l'unité, vous intégrerez divers domaines de recherche, tout en facilitant et en promouvant le développement scientifique et stratégique des groupes de recherche.

Poste de doctorat en paléoécologie et paléogénomique, Berne
En tant que doctorant, vous étudierez les réponses de la végétation au changement climatique et aux perturbations anthropiques à l'aide de méthodes paléoécologiques et paléogénomiques innovantes. Ce poste comprend des travaux de terrain tels que le carottage de glace dans les Pyrénées et les Alpes européennes, des analyses microscopiques de pollen et de macrofossiles végétaux, l'isolement d'ADNa dans un laboratoire d'analyse d'air pur, et l'analyse de données paléoécologiques et paléogénomiques à l'aide d'outils bioinformatiques avancés pour évaluer la variation de la diversité génétique. Ce projet offre l'opportunité de travailler à l'avant-garde de la recherche sur l'ADNa, un domaine en plein essor, et offre un environnement stimulant et interdisciplinaire aux jeunes chercheurs.

Professeure ou professeur en biologie moléculaire et cellulaire, Canada
L'Université de Sherbrooke sollicite des candidatures pour un poste de professeur(e) adjoint(e) en biologie moléculaire et cellulaire menant à la permanence au Département de biologie de la Faculté des sciences.

Scientifique SIG, à distance ; préférence pour les candidats basés dans le nord-est des États-Unis
Avis à tous les passionnés de plein air ! Rejoignez l'Appalachian Mountain Club (AMC) et poursuivez notre mission de protection de la région des Appalaches du Nord-Est et du centre de l'Atlantique, depuis 1876. Nous recherchons un scientifique SIG permanent à temps plein pour offrir une large gamme de services.

Associé de recherche postdoctoral, Tennessee
Le laboratoire de biologie synthétique des plantes Tianhu Sun de l'Université d'État de l'Est du Tennessee recherche un chercheur indépendant et motivé pour un poste postdoctoral. Ce poste s'inscrit dans le cadre du projet financé par la Fondation pour la recherche sur l'alimentation et l'agriculture (FFAR) visant à accroître la valeur nutritionnelle des semences. La durée initiale du poste est d'un an, renouvelable plusieurs fois.

Professeur adjoint/associé, sciences végétales, Louisiane
Le/La candidat(e) retenu(e) enseignera divers cours de premier cycle en phytologie, notamment (liste non exhaustive) : introduction à la phytologie, production végétale, lutte antiparasitaire, aménagement paysager et plantes paysagères. Ses responsabilités comprendront également la recherche appliquée, l'encadrement pédagogique, le recrutement des étudiants, l'élaboration des programmes d'études et, éventuellement, le conseil aux clubs et associations étudiantes.

Poste permanent à temps plein en sciences végétales, Pennsylvanie
Le/La candidat(e) retenu(e) s'occupera principalement des étudiants de nos programmes de biologie, de sciences de l'environnement/biologie et de sciences de l'environnement/agriculture biologique régénératrice. Il/Elle sera chargé(e) d'enseigner des cours d'introduction à la biologie et à la botanique, ainsi que des cours avancés en taxonomie et/ou physiologie végétales. Il/Elle sera également chargé(e) de développer des cours dans son domaine d'expertise.

Chercheur postdoctoral en phytopathologie, Arkansas
Le/La candidat(e) dirigera des recherches sur les nématicides chimiques, la résistance des plantes hôtes et les pratiques culturales visant à atténuer les pertes de rendement dues aux nématodes phytoparasites dans les systèmes de production de coton, de maïs et/ou de soja, répartis sur plusieurs sites de l'État. L'accent sera mis sur la caractérisation de la résistance des plantes hôtes du soja au nématode à galles du Sud. De plus, le/la candidat(e) collectera et analysera des données pluriannuelles afin de valider les options de gestion proposées aux agriculteurs et aux scientifiques.

Professeur adjoint/associé d'enseignement de la génétique et de recherche en éducation disciplinaire (DBER), Nebraska
Le Département d'agronomie et d'horticulture de l'Institut d'agriculture et des ressources naturelles (IANR) de l'Université du Nebraska-Lincoln (UNL) recherche un poste de professeur assistant/associé en enseignement de la génétique et recherche pédagogique disciplinaire (DBER). Ce poste, d'une durée de 12 mois (année civile), permettra de diriger l'enseignement des cours de génétique végétale et animale de premier cycle et des cours de génétique végétale de niveau supérieur, et de mener des recherches en pédagogie des sciences végétales. La répartition est de 60 % pour l'enseignement et de 40 % pour la recherche.

Chercheur postdoctoral, Caroline du Nord
Il s'agit d'un poste de postdoctorant à temps plein qui dirigera un projet de recherche appliquée et de vulgarisation axé sur l'amélioration de la résilience climatique de l'agriculture grâce à l'amélioration de la santé des sols, aux systèmes de cultures de couverture et au développement de la bioéconomie. Le postdoctorant jouera un rôle de premier plan dans la conception, le développement et la mise en œuvre de projets de démonstration et de projets en exploitation agricole promouvant des pratiques durables et respectueuses du climat, notamment les cultures de couverture et les systèmes de bioraffinage innovants, tout en fournissant des formations et des ressources aux petits exploitants agricoles et aux agriculteurs défavorisés.

Chercheur associé – DEPP, Caroline du Nord
L'associé de recherche sera principalement chargé de mener des recherches en laboratoire, en informatique, en serre et sur le terrain sur les maladies de la patate douce et des cucurbitacées. Il générera et analysera de manière autonome des données pour les projets, rédigera des publications et interviendra lors de conférences scientifiques et de réunions de producteurs. Il contribuera également à l'obtention de financements pour le laboratoire par la rédaction de demandes de subvention et la recherche contractuelle.

Chercheur agricole II, Îles Marshall
Recherche sur la patate douce.