La région inférieure de l'Amérique centrale est largement connue pour son incroyable biodiversité en raison de son histoire topographique et climatique complexe. L'une des espèces de plantes les plus répandues et les plus abondantes de la région est Chamaedorea tepejilote, un petit palmier de sous-bois. Malgré son abondance, très peu d'études ont été menées sur la phylogéographie de cette espèce dans la basse Amérique centrale. Dans une nouvelle étude publiée dans la revue Open Access AoB PLANTS, Fuchs et ses collègues tacle Chamaedorea tepejilote, un petit palmier de sous-étage, en examinant les marqueurs de répétition de séquence simple (SSR) et d'ADN chloroplastique (ADNcp). Leurs résultats révèlent quelle géographie permet aux gènes de circuler et ce qui isole les plantes.
La région inférieure de l'Amérique centrale est un point chaud de la biodiversité car elle contient un grand nombre d'espèces endémiques, c'est-à-dire des espèces que l'on ne trouve nulle part ailleurs dans le monde. Il abrite un large éventail d'habitats, notamment des forêts tropicales humides, des forêts de feuillus, des savanes et des zones humides. Ces habitats abritent une grande variété de plantes et d'animaux, dont certains sont considérés comme menacés ou en voie de disparition. La région est également importante pour l'écotourisme et fournit des moyens de subsistance à de nombreuses populations locales. Les efforts de conservation seraient aidés en comprenant comment l'écosystème est connecté.
Chamaedorea tepejilote, communément appelé palmier Pacaya, est un palmier tropical originaire d'Amérique centrale. Il a un tronc haut et mince avec de longues feuilles fines qui poussent du haut. Il est pollinisé par le vent ou les thrips, mais ses fruits sont mangés et propagés par les oiseaux et les mammifères, y compris les humains. De plus, ses feuilles et son écorce sont utilisées à diverses fins médicinales. Mais la déforestation et l'urbanisation récentes ont probablement réduit la taille des populations de palmiers. Donc Chamaedorea tepejilote est une espèce importante à conserver et à protéger.
Fuchs et ses collègues ont utilisé des microsatellites nucléaires à la recherche de régions appelées marqueurs de répétition de séquence simple (SSR) pour évaluer la diversité génétique et la phylogéographie de Chamaedorea tepejilote. Les microsatellites nucléaires sont des fragments d'ADN dont la longueur varie d'un individu à l'autre et sont utiles pour estimer la diversité génétique, la structure de la population et le flux génétique. Ils sont souvent utilisés chez les plantes et les animaux pour comparer la variation génétique entre les populations. De plus, ils ont également utilisé des marqueurs d'ADN chloroplastique (ADNcp). Les marqueurs d'ADNcp sont hérités de la mère et peuvent être utilisés pour déterminer l'histoire évolutive et la phylogéographie d'une espèce.
Les botanistes ont découvert que Chamaedorea tepejilote les populations ont une diversité génétique SSR nucléaire modérée à élevée. Cette diversité vient probablement de la façon dont Chamaedorea tepejilote reproduit. Chamaedorea tepejilote aime le croisement, ce qui signifie que le pool génétique continue d'être agité par les plantes partageant leur ADN entre elles. Cependant, la perte d'habitat signifie qu'une certaine structure génétique dans les pentes peut encore exister. L'équipe a découvert que les montagnes d'Amérique centrale agissaient comme une barrière très efficace au flux de gènes. Pourtant, les résultats ont indiqué que les palmiers de chaque côte n'étaient pas entièrement isolés les uns des autres.
À l'aide d'une analyse statistique, Fuchs et ses collègues ont découvert qu'ils pouvaient relier les populations des Caraïbes et de la côte sud du Pacifique. Ils ont trouvé la connexion à l'extrême sud de la chaîne de montagnes de Talamanca au Panama. Ce n'est pas un endroit que les gens avaient précédemment suggéré comme voie de colonisation pour les plantes d'Amérique centrale inférieure.
Les résultats montrent que la topographie complexe de la région inférieure de l'Amérique centrale a joué un rôle majeur dans la formation des modèles de flux de gènes de Chamaedorea tepejilote au Costa Rica. Cet article est la première étude de ce genre pour le genre. Les résultats de l'étude permettent de mieux comprendre la diversité génétique et la structure des Chamaedorea tepejilote populations et démontrer l'importance des chaînes de montagnes pour le flux génétique efficace des plantes néotropicales. Par conséquent, cette étude pourrait éclairer les stratégies de conservation de l'espèce.
LIRE L'ARTICLE
Fuchs, EJ, Cascante-Marin, A., Madrigal-Brenes, R. et Quesada, M. (2023) "Diversité génétique et patrons phylogéographiques du palmier dioïque Chamaedorea tepejilote (Arecaceae) au Costa Rica : rôle des chaînes de montagnes et refuges possibles, " AoB PLANTS, 15(1), p. lac060. Disponible à: https://doi.org/10.1093/aobpla/plac060.
