La taille du génome varie considérablement selon la diversité de la vie végétale. Bien que la taille du génome soit, par définition, affectée par les variantes génétiques de présence/absence, qui sont omniprésentes dans les études de séquençage des populations, la taille du génome est souvent traitée comme une propriété intrinsèque d'une espèce. Becher et al. étude de la variation intra- et interspécifique de la taille du génome chez des euphraises britanniques taxonomiquement complexes (Euphrasie, Orobanchacées). Leur objectif était de documenter la diversité de la taille du génome et d'étudier les processus évolutifs sous-jacents qui façonnent la variation entre les individus, les populations et les espèces.

Euphraises. Image: canva.

L'équipe a trouvé une variation considérable de la taille du génome intraspécifique et a observé l'isolement par la distance pour la taille du génome chez les diploïdes croisés. Tétraploïde Euphrasie ont montré des schémas contrastés, la taille du génome augmentant avec la latitude lors de l'exogamie Euphrasie arctique, mais avec peu de variation de la taille du génome chez les Euphrasie micrantha. Les différences interspécifiques dans la taille du génome et les proportions génomiques de séquences répétées étaient faibles.

Becher et al. montrent l'utilité de traiter la taille du génome comme le résultat d'une variation polygénique. Comme d'autres types de variation génétique, tels que les polymorphismes d'un seul nucléotide, la variation de la taille du génome peut être affectée par l'hybridation en cours et l'étendue de la subdivision de la population. En plus de la sélection sur les traits associés, la taille du génome devrait être affectée indirectement par la sélection en raison de la pléiotropie des variantes de présence/absence sous-jacentes.

ARTICLE DE RECHERCHE

Becher, H., Powell, RF, Brown, MR, Metherell, C., Pellicer, J., Leitch, IJ, Twyford, AD, 2021. La nature de la variation intraspécifique et interspécifique de la taille du génome dans les euphraises taxonomiquement complexes. Annals of Botany. https://doi.org/10.1093/aob/mcab102