Les modèles informatiques sont de plus en plus utilisés dans tous les domaines des sciences de la vie pour imiter et sonder les processus entrepris par les organismes vivants. La phytologie ne fait pas exception à cette règle et les techniques de modélisation informatique sont désormais largement utilisées pour étudier la croissance et le développement des plantes. Pourquoi, les gens peuvent demander, devrions-nous utiliser des modèles informatiques alors que nous pouvons plutôt travailler avec des plantes réelles ? Eh bien, s'ils sont bien faits, les modèles informatiques peuvent passer par une variété de scénarios beaucoup plus rapidement et avec moins de travail que nous ne le pourrions jamais en utilisant des usines réelles. En les développant pour correspondre aux données expérimentales, les modèles informatiques pourraient être un moyen extrêmement puissant de modéliser les réponses des plantes à certains scénarios. Par exemple, nous pourrions vouloir savoir comment une plante commercialement importante à croissance lente réagit à certaines conditions dans le champ. Un modèle de calcul bien informé pourrait donner une indication de cela beaucoup plus rapidement qu'un montage expérimental. Dans leur récent article en Annals of Botany Véronique Letort et ses collègues développent un modèle informatique pour simuler la croissance de Coffea arbres, la source de cette boisson peu connue (* tousse *) le café.

Les auteurs produisent un type de modèle connu sous le nom de modèle de croissance fonctionnelle et structurelle des plantes (FSPM), qui peut être utilisé pour modéliser informatiquement la croissance des plantes et l'appliquer aux jeunes Coffea des arbres. L'une des principales caractéristiques de ce modèle est qu'il intègre la pression trophique interne dans ses simulations de croissance. C'est-à-dire qu'elle rend compte de l'hypothèse selon laquelle un nouvel organe tel qu'une branche en cours de développement par l'usine doit pouvoir être satisfait par les ressources disponibles. Le résultat central de ceci est que le modèle développé par Letort et ses collègues a pu simuler les schémas de croissance des jeunes Coffea arbres de manière globalement réaliste par rapport aux propriétés des arbres réels mesurées par les auteurs.

Bien que l'inclusion de la pression trophique dans ce modèle et les résultats précis qu'il produit soient passionnants, les auteurs admettent qu'il ne prouve pas définitivement que la pression trophique interne de la plante est un paramètre qui devrait définitivement être inclus dans les modèles informatiques de croissance des plantes. Les résultats sont bons pour certains paramètres. Par exemple, la probabilité que la ramification se produise dans les premiers stades de Coffea la croissance des arbres est bien corrélée avec la pression trophique simulée. En revanche, la probabilité d'initiation des organes végétaux était moins bien corrélée avec la pression trophique simulée. Les auteurs soulignent également que la compétition trophique n'est probablement pas quelque chose qui peut être directement mesuré chez les plantes et que des travaux sont nécessaires pour arriver à une manière acceptée de l'estimer expérimentalement afin de valider des modèles comme celui qu'ils créent.

Cependant, plus il y aura de modèles créés comme celui présenté ici et comparés à des données réelles, mieux nous réussirons à les produire pour diverses espèces végétales. Cela aide également à construire, comme le soulignent les auteurs, une imitation de plus en plus complexe des différents défis et conditions environnementales que les plantes réelles rencontrent dans ces modèles. Plus ces modèles deviennent réalistes, plus nous pourrons les utiliser pour comprendre comment les plantes poussent et pour éventuellement répondre à des questions complexes et lentes à approfondir.