Dans ce nouvel article concernant notre nouveau projet Numéro spécial Botanique numériqueNous avons suivi des spécimens botaniques, de leur collecte sur le terrain jusqu'à leur rôle dans la prise de décision. Nous avons constaté comment la numérisation met les données des spécimens à la disposition des chercheurs, des artistes et du public du monde entier, enrichissant ainsi nos connaissances collectives et révélant des histoires inédites. Nous avons également rencontré de nombreuses personnes passionnées dont les efforts rendent possible ce travail remarquable.

Pour conclure cette série, nous rassemblerons ces différents points et nous rendrons dans un herbier d'Aotearoa Nouvelle-Zélande, un exemple de la manière dont des collections de taille modeste peuvent servir de référence en botanique numérique. Nous y rencontrerons des personnes impliquées dans la collecte, la conservation et la numérisation des spécimens, ainsi que celles qui les étudient et les partagent avec le monde entier.

Le Musée de Nouvelle-Zélande Te Papa Tongarewa, Wellington. Photo par Inconnu, Te Papa (47407) (CC BY 4.0).

Numérisation de l'herbier

Fondé en 1865 dans le cadre du Musée colonial de Wellington, le Herbier WELT est le plus ancien herbier public de Nouvelle-Zélande. Aujourd'hui, il est abrité dans le Musée de Nouvelle-Zélande Te Papa Tongarewa.

Te Papa abrite environ 350 000 spécimens botaniques. Ses archives remontent à… Joseph Banks et Daniel Solander Lors du premier voyage de Cook, les collections comprennent également plus de spécimens types que celles de toute autre institution néo-zélandaise. Bien qu'il reste encore beaucoup de matériel étranger et un important retard à traiter, l'ensemble du matériel néo-zélandais de Te Papa est entièrement numérisé et 70 % est numérisé.

« Conservateurs, gestionnaires de collections, techniciens, stagiaires et bénévoles, tous contribuent à la base de données », explique-t-il. Bridget Hatton, responsable de la collection Kaitiaki Taonga Botanique, qui supervise la numérisation.

Heidi Meudt (à gauche), conservatrice de botanique, et Bridget Hatton (à droite), responsable de la collection Kaitiaki Taonga de botanique, au département de botanique de Te Papa. Photo de Carlos Lehnebach.

Une fois les spécimens intégrés à la base de données, ils sont photographiés en interne. Ces images sont essentielles pour impliquer d'autres chercheurs et ainsi améliorer la qualité des données. Par exemple, une étiquette de collection peut être initialement illisible. « Nous intégrons le maximum d'informations possible à la base de données », explique Hatton. « Ensuite, en téléchargeant une image, d'autres chercheurs peuvent tenter de déchiffrer l'étiquette eux-mêmes […] Nous pouvons alors ajouter ces informations à notre base de données. »

L'herbier principal de Te Papa. Photo de Jean-Claude Stahl, (244917) (CC BY 4.0.).

« Nous utilisons la base de données EMu dans tout le musée, et pas seulement en botanique ou en histoire naturelle », explique Hatton. Au musée Te Papa Système de gestion de la collection EMu (Également utilisé par la Smithsonian Institution et le Muséum d'histoire naturelle de Londres), le système de numérisation confirme l'identité des collectionneurs grâce à un identifiant unique, « identifiant d'agent ». Celui-ci les relie à tous les autres objets leur appartenant au sein de Te Papa, même ceux appartenant aux collections de Taonga Māori, d'histoire ou d'art. Tous ces objets sont facilement accessibles sur le site Collections Online de Te Papa. Allez voir par vous-même!

Le processus de numérisation de Te Papa reconnaît que les spécimens ne sont pas des objets statiques ; ils constituent au contraire le fondement de réseaux dynamiques de personnes ayant interagi, collecté des spécimens dans différents lieux et contribué à notre savoir collectif. Ce dispositif permet de rassembler les archives et, comme nous le verrons bientôt, de faire des découvertes remarquables.

Kōwhai (Sophora tétraptère) est l'un des arbres les plus emblématiques de Nouvelle-Zélande. Spécimen de Banks et Solander rapporté du premier voyage de Cook - kōwhai (Sophora tétraptère), collecté le 8 octobre 1769, Nouvelle-Zélande (à gauche). Gravure de ST Edwards, 1792 (au centre). Kōwhai en fleur (à droite). Sources : Te Papa, SP063797/A, (CC BY 4.0); Graines de jardin pour papillons machaon/Flickr (Domaine public); Matt Ward via iNaturalist (CC BY-NC).

Environ un quart de l'herbier, y compris les spécimens en attente et les spécimens étrangers, n'a pas encore été numérisé ni photographié. La numérisation d'une grande partie de ce matériel prendrait des années, et son déchiffrement nécessite souvent l'expertise de spécialistes. « La clé pour numériser et rendre accessible ce matériel réside dans le financement du personnel nécessaire », explique Hatton. Qui sait quelles histoires pourraient alors être révélées ?

De Te Papa au monde

L'un des défis posés par les données botaniques est que les spécimens, les images et les enregistrements sont souvent conservés dans des systèmes différents – alors comment Te Papa s'y prend-il pour partager ses connaissances avec le monde ? Lucy Schrader, comme le Kaitūhono Hora Raraunga (responsable de la communication sur les canaux numériques) de Te Papa, trouve de nouvelles façons d'y parvenir.

« Les gens n’ont pas besoin de venir à Te Papa ou sur ses sites web pour profiter de ce que nous proposons », explique-t-elle, « ils y ont simplement accès en utilisant… » GBIF [Global Biodiversity Information Facility], Wikipédia, UnsplashPour toucher un public plus large, Te Papa publie sur les plateformes de biodiversité qui hébergent des données provenant de nombreuses institutions du monde entier. « Il est beaucoup plus simple pour quiconque de récupérer des informations sur nos collections, de les combiner avec d'autres sources et de procéder à son analyse », explique Schrader. « Cela facilite des domaines tels que la recherche sur le changement climatique, la restauration des habitats, la gestion des terres, les révisions taxonomiques et bien d'autres encore. »

Lucy Schrader, Kaitūhono Hora Raraunga (responsable de la sensibilisation des chaînes numériques) chez Te Papa. Photo de Lucy Schrader.

Wikidata (exploré dans un Article précédent sur la botanique numérique) est également un outil important. Schrader et ses collègues a organisé une série d'ateliers Wikipédia et d'« édit-athlons » ouvert au personnel, aux participants de la conférence et au public. Docteur Heidi Meudt, conservatrice de botanique, travaille également à impliquer botanistes et professionnels de musées avec Wikidata.

« Wikidata a été important à bien des égards », déclare Schrader. « Il valorise les images que nous partageons en les reliant aux données relatives aux espèces représentées, ainsi qu'aux personnes qui collectent et identifient ces spécimens. » Nous pouvons également l'utiliser comme extension de notre propre système de gestion des collections. en reliant nos enregistrements et les éléments équivalents dans Wikidata, chacun pointant vers l'autre.

Les données botaniques de Te Papa sont désormais accessibles à un vaste réseau d'utilisateurs, allant des simples curieux désireux d'en savoir plus sur la nature aux scientifiques, historiens et chercheurs du monde entier. « Il existe de nombreux exemples concrets d'utilisation des données de Te Papa : les fiches botaniques ont été téléchargées plus de 120 000 fois depuis le GBIF », explique Schrader. « Mais ce que je trouve vraiment formidable, c'est le système plus vaste auquel nous appartenons désormais. » (Voir les fiches d'espèces sur [nom du site web]). INaturalist extraire les articles Wikipédia pertinents, y compris nos images et informations. Bionomie Ce système utilise les données partagées par GBIF et Wikidata pour relier les spécimens aux personnes qui les ont collectés. La mise en commun des informations provenant d'un si grand nombre de personnes et d'organisations transforme nos possibilités d'action et d'apprentissage, et renforce notre capacité à collaborer pour comprendre et préserver notre planète.

Un croisement des disciplines pour révéler de nouvelles histoires : algues, œuvres d’art et Nancy Adams

Les stratégies numériques de Te Papa leur permettent d'explorer et de partager les histoires cachées de expéditions de recherche, les gens et espèce« Ces actions accroissent l’accessibilité et la visibilité des contributions scientifiques de tous les collectionneurs de notre base de données », explique Heidi Meudt, « mais surtout de nombreuses femmes, de botanistes amateurs et d’autres collectionneurs sous-représentés. »

Meudt travaille actuellement avec des conservateurs d'art. Lizzie Bisley et Rebecca Rice pour comprendre les résultats et l'héritage de Nancy Adams (1926-2007).

Nancy Adams – Première excursion sur le terrain pour l'étude des algues à Island Bay, janvier 1943, Wellington, auteur inconnu. Acquis en 2007. Te Papa (CA000903/001/0003/0001).

Adams était une botaniste et une artiste exceptionnelle dont les écrits et les illustrations ont popularisé la flore néo-zélandaise. Passionnée par les algues, elle a passé une grande partie de sa carrière au Dominion Museum – l’ancêtre de Te Papa – où elle est devenue conservatrice adjointe, a enrichi la collection de référence et a identifié 6 874 spécimens. « L’étendue et la profondeur de ses connaissances et de son œuvre – tant botaniques qu’artistiques – sont tout simplement époustouflantes », déclare Meudt.

Les aquarelles exquises de Nancy Adams représentent une grande variété de plantes, des renoncules alpines aux conifères indigènes en passant par les fleurs sauvages exotiques ; ses dessins et aquarelles ont contribué à faire connaître la flore d’Aotearoa Nouvelle-Zélande. Sources, de gauche à droite : Ranunculus insignis, par Nancy Adams CBE. Acquis en 2007. © Te Papa, CC BY 4.0. Te Papa (CA000888/006/0039); Podocarpus nivalis, 26 avril 1951, Ruapehu, Mont, par Nancy Adams CBE. Acquis en 2007. © Te Papa, CC BY 4.0. Te Papa (CA000888/043/0027Fleurs de la famille des Brassicacées (Cruciferae) et de la menthe (Lamiacées), planche 13 de « Wild Flowers in New Zealand », années 1970, Wellington, par Nancy Adams CBE. Acquis en 2007. © Te Papa. CC BY 4.0. Te Papa (CA000888/022/0001).

La numérisation est essentielle au projet interdisciplinaire de Te Papa. Stagiaires et chercheurs ont catalogué et numérisé les 3 300 collections botaniques d’Adams (qu’elle aurait elle-même données au musée), ainsi que ses œuvres, diapositives et autres documents conservés par Te Papa. « Ces ressources permettent d’avoir une vision plus complète de son héritage et de son œuvre », explique Meudt.

« Nous avons appris de nouvelles choses sur Adams au fil du temps, par exemple qu'elle a contribué à de nombreux dessins… » Une encyclopédie de la Nouvelle-Zélande et qu'elle aussi ont contribué à l'organisation de la collection textile du musée et à la conception de ses aménagements paysagers.! "

La numérisation des collections a permis aux chercheurs de faire correspondre les illustrations à l'aquarelle d'Adams avec ses spécimens – en l'occurrence, un Melanothamnus strictissimus Des algues ! À gauche : Melanothamnus strictissimus, recueilli par Nancy Adams CBE, 1973. © Te Papa (A009426); À droite : Illustration à l'aquarelle de spécimens d'algues Polysiphonia, planche 109 de « Seaweeds of New Zealand », Wellington, par Nancy Adams CBE. Acheté en 2007. CC BY 4.0. © Te Papa (CA000892/001/0078)

Meudt explique comment la numérisation a également permis Les illustrations d'Adams doivent être associées à ses spécimens botaniques., à la fois dans la base de données de Te Papa et dans Collections Online. Cela a révélé à quel point ses illustrations étaient précises. « Nous nous sommes aussi bien amusés pendant visites des coulisses « Nous avons placé ses aquarelles originales à côté de ses spécimens et nous avons observé comment certains devaient s'approcher de très près pour déterminer lequel était lequel ! »

Le projet a également impliqué des stagiaires issus de différents horizons, couvrant les sciences, les arts et les sciences humaines. Lucie Adams (Sans aucun lien de parenté avec Nancy !) J’ai recensé, numérisé et étudié les collections de Nancy au cours de deux stages. « Ce travail est important car il met en lumière la contribution des femmes dans des domaines scientifiques à prédominance masculine, à une époque où l’égalité des sexes est faible. C’est une collection qui célèbre la créativité en science […] l’art visuel rend les idées complexes plus accessibles. »

« J’ai beaucoup appris sur les systèmes d’archivage, sur la manière dont l’information est conservée de génération en génération, et sur la façon dont cela façonne nos récits sur les peuples et le monde. »

Explorez Te Papa Centre Nancy Adams pour découvrir leur travail et en savoir plus

Tout cela est rendu possible grâce aux bénévoles.

Dans de nombreux herbiers, les bénévoles contribuent énormément à la botanique numérique, et Te Papa ne fait pas exception ! Quel que soit leur niveau d'expertise initial, les bénévoles peuvent aider à accomplir diverses tâches.

Eleanor Burton et Jane Humble sont bénévoles au musée Te Papa depuis plus de dix ans. Burton a d'abord étudié la botanique et travaillé en arboriculture et en jardinage ; elle gère actuellement la base de données et la bibliothèque du jardin botanique indigène d'Ōtari. Humble a travaillé comme technicienne de laboratoire médical en Nouvelle-Zélande et au Royaume-Uni, mais elle nourrit depuis toujours une passion pour les plantes – elle est également bénévole à Ōtari. artistes botaniques et sont très impliquées dans la Société botanique de Wellington.

Eleanor au travail à Te Papa. Photo de Bridget Hatton.

Burton et Humble fixent toutes deux des spécimens de plantes pressées sur du carton – un véritable travail d'orfèvre – et les classent dans les collections. Burton effectue également des recherches dans les bases de données, prend des photos et vérifie si les spécimens sont des doublons (c'est-à-dire s'ils partagent les mêmes informations de collection et contiennent le même matériel) ; dans le cas contraire, elle les intègre à la collection.

« Le projet le plus amusant auquel j'ai participé a été de parcourir l'ensemble Celmisia « [Les marguerites] sont classées par genre et leur identification est vérifiée », explique Burton. « Leon [Perrie, conservateur de botanique] pense que nous avons modifié l’identification d’environ 10 % d’entre elles. »

La quasi-totalité du montage des œuvres à Te Papa est réalisée par des bénévoles qui contribuent grandement à leur numérisation. Surtout, cette expérience leur apporte également beaucoup.

Burton explique : « Je suis bénévole à Te Papa parce que j'ai du temps libre, que j'aime ça, que c'est une façon de rendre service à la communauté et que c'est une bonne opportunité d'apprentissage pour moi. »

« Je suis très heureuse de faire du bénévolat à l’Herbier de Te Papa et j’apprends constamment, entre autres, à quel point mes connaissances sont limitées ! » déclare Humble. « Lors des pauses-café et des déjeuners festifs, on y trouve certaines des plus grandes réunions de botanistes retraités et actifs de Nouvelle-Zélande ! Les échanges sont passionnants. »

Chercheurs et bénévoles de l'herbier de Te Papa, 2020, dont Jane Humble (à gauche) et Eleanor Burton (deuxième à partir de la droite). © Te Papa. Photo de Jess Calcutt.

Qu'est-ce qu'un herbier peut être ?

En misant sur des méthodes, une portée et un impact réfléchis, Te Papa fait figure de modèle en matière de botanique numérique efficace. En touchant de nouveaux publics grâce à des plateformes internationales, en collaborant avec différents départements, en menant des recherches et en impliquant des stagiaires et des bénévoles, Te Papa enrichit considérablement son écosystème grâce à ses efforts de numérisation – son impact dépasse largement le cadre de ses collections physiques.

Plutôt que de les remplacer ou de les supplanter, la numérisation peut rendre les spécimens botaniques plus accessibles, pertinents et utiles que jamais auparavant.

Cela signifie qu'un herbier de taille moyenne peut illustrer comment les données sur les plantes, les histoires humaines et la recherche pratique peuvent être reliées au monde.

Profil de l'auteur invité

Ben, Né en Nouvelle-Zélande et installé à Londres, est diplômé en écologie et étudie la diversité mycorhizienne au sein de l'équipe des Jardins botaniques royaux de Kew. Passionné par les collections d'histoire naturelle, il est ravi de mettre en lumière leur histoire en tant que contributeur invité de Botany One.