Biochimie et biologie moléculaire des plantes, 2e édition. Édité par Bob B. Buchanan, Guillaume Gruissem et Russell L.Jones. Wiley, 2015.

Buchanan et al.'s 2^nd édition de Biochimie et biologie moléculaire des plantes [ci-après dénommé BMBP2] est en effet une "bête" : il a 3 éditeurs, 75 auteurs, >1,000 500 images en quadrichromie, 1280 photographies, 2.5 pages et pèse >XNUMX kg (en livre de poche). Mais c'est un gentil géant d'une bête. Publié conjointement avec le Société américaine des biologistes végétaux – « cultiver un avenir meilleur grâce à la recherche en biologie végétale » – BMBP2 vient avec une approbation appropriée / appropriée des poids lourds et est un phénomène de publication qui doit être pris au sérieux. Bien que je ne sois pas familier avec ce livre (donc toute comparaison que je pourrais faire devra être faite avec d'autres textes plutôt qu'avec BMBP2's 1^st édition), sa quatrième de couverture m'indique la 1^st édition a été publiée en 2000 et que BMBP2 est entièrement révisé et largement réécrit, y compris beaucoup de nouveau matériel et des chapitres qui sont réorganisés pour une meilleure présentation. Tout cela semble impressionnant. Est-ce? Dans l'ensemble, oui. Mais, pour une évaluation plus réfléchie, lisez la suite…

BMBP2Les 1206 pages de contenu sont divisées en 5 parties :

I : Compartiments (environ 238 pages en 5 chapitres) : Structures membranaires et organites membranaires (documentant bien les membranes et les organites comme les sites à l'intérieur ou sur lesquels une grande partie de la biochimie considérée dans BMBP2 a lieu), la paroi cellulaire, le transport membranaire, le tri des protéines et le trafic des vésicules, et le cytosquelette).

II : Reproduction cellulaire (c. 266 pages en 6 chapitres de compagnons de lit apparemment improbables tels que les acides nucléiques, les acides aminés, les lipides, la structure et l'organisation du génome, la synthèse, le repliement et la dégradation des protéines et la division cellulaire.

III : Flux d'énergie (environ 147 pages en 3 chapitres substantiels intitulés Photosynthèse, Métabolisme des glucides et Respiration et photorespiration).

IV : Intégration métabolique et développementale (environ 324 pages en 6 chapitres – Transport longue distance, Azote et soufre (l'orthographe anglaise (US) est à l'ordre du jour), Biosynthèse des hormones (tellement rafraîchissant de voir ce mot démodé utilisé dans un 21^st texte du siècle), transduction du signal, régulation moléculaire du développement reproductif, et sénescence et mort cellulaire).

V : Environnement végétal et agriculture (environ 222 pages en 4 chapitres sur les réponses aux agents pathogènes des plantes, les réponses au stress abiotique, l'acquisition, le transport et l'utilisation des nutriments minéraux et les produits naturels (qui se termine BMBP2 (avec un rappel d'une ressource majeure du règne végétal). Une touche d'harmonie subtile : chaque chapitre commence par une introduction et se termine par un résumé. À titre indicatif, seuls quatre chapitres sont rédigés par un seul auteur ; les vingt autres sont le fruit de collaborations multi-auteurs, souvent internationales.

Chose inhabituelle pour un manuel [je pense que c'est BMBP2's catégorisation principale, mais plus à ce sujet plus tard], il s'agit d'un tome édité. Ses 24 chapitres sont rédigés par 75 biologistes végétaux de renommée mondiale, dont Howard Thomas et Helen Ougham, qui sont deux des co-auteurs d'un autre manuel de l'écurie Wiley - "La vie moléculaire des plantes”. De plus, Russell Jones [co-rédacteur en chef de BMBP2] est 1^st nommé sur ce manuel de biologie végétale à plusieurs auteurs (Jones et al., 2013). On ne peut s'empêcher de se demander si cela provoque un conflit marketing/ventes pour Wiley, qui publie également BMBP2. Ou si cela pose des conflits d'intérêts pour l'implication de haut niveau du Dr Jones dans l'une ou l'autre des publications ? Ou est-ce un stratagème marketing, deux livres sur des sujets similaires destinés à des marchés différents, BMBP2 plus pour le marché du reste du monde influencé par les États-Unis et les États-Unis, et La vie moléculaire des plantes pour le Royaume-Uni et les pays qui lui sont affiliés en matière d’éducation ?

Une liste aussi longue de contributeurs témoigne de l'importance que la botanique a prise : nul ne peut à lui seul en appréhender toutes les sous-disciplines, les détails et les nuances. Et cela ne concerne que le domaine relativement restreint de la biochimie et de la biologie moléculaire des plantes, un sous-ensemble du domaine beaucoup plus vaste de la botanique. Ce phénomène n'est cependant pas nouveau ; même le très réputé «Lehrbuch der Botanik für Hochschulen de Strasbourg » publié pour la première fois en 1894 contenait dès le départ des contributions d'experts autres qu'Eduard Strasburger [(1844-1912): fondateur de la biologie cellulaire végétale moderne - Volkmann et al., 2012] lui-même [Bresinsky et al., 2013]. Pourtant, cela s'écarte un peu des textes avec lesquels on pourrait être plus familier et qui couvrent un territoire similaire, par exemple Smith et al. (2010) ou Jones et al. (2013), qui sont co-écrits par une équipe beaucoup plus petite.

La majeure partie de Buchanan est axée sur le contenu et alLe mastodonte de . est suivi de c. 13 pages de lectures complémentaires. De manière satisfaisante, l'écrasante majorité des éléments ici concernaient des articles scientifiques datant d'après 2002 (le 1^st date de publication de l'édition par le site Wiley), ce qui indique la «révision» substantielle proclamée et l'actualité du texte de la présente édition. Curieusement, cependant, au moins 7 références datent de 2015. Pourquoi intrigant ? La préface du livre - dont vous pourriez vous attendre à ce qu'elle soit la dernière contribution écrite du livre - est datée de … novembre 2014. les chloroplastes, le repliement des protéines et les modifications post-traductionnelles, la dégradation des protéines (pour le chapitre 10) et les glycosides cyanogènes, les glucosinolates, les alcaloïdes et les composés phénoliques (pour le chapitre 24). Et il y a même mention de sites Web utiles – dans le cas du chapitre 8 (lipides). Tout cela a une valeur pédagogique pour les étudiants désireux. Cependant, si utiles que soient sans aucun doute ces listes de lectures complémentaires, BMBP2 Il serait bénéfique – notamment d’un point de vue pédagogique – que les affirmations soient étayées par des citations de références appropriées dans le texte (ce qui contribuerait également à encourager les étudiants à citer des sources pour étayer les affirmations – souvent factuellement exactes – qu’ils peuvent faire dans leurs propres devoirs).

Le reste des 1264 40 pages est consacré à plus de 3 pages d'index sur trois colonnes, avec une entrée pour chaque lettre de l'alphabet (je ne sais pas pourquoi, mais cela m'impressionne toujours !). Cependant, et l'analyse de l'index peut en dire long sur un texte, il n'y avait aucune entrée pour les éléments suivants :

PAR - ni sa version longue main Rayonnement photosynthétiquement actif ("la gamme spectrale (bande d'onde) du rayonnement solaire de 400 à 700 nm que les organismes photosynthétiques sont capables d'utiliser dans le processus de photosynthèse") cité ;

Chlorophylle f – qui étend le PAR à dans tous 700 nm (Chen et al., 2010). S'il est vrai que cela provient d'une cyanobactérie, c'est sûrement recevable puisque la bactériochlorophylle est mentionnée dans le texte, et ce qui justifierait également la mention de chlorophylle d (pas dans l'index). Isolé de Acaryochloris marina (un procaryote photosynthétique oxygéné) Chl d a un in vivo maximum d'absorption de 714-718 nm (Miyashita et al., 1997), et on en déduit qu'il s'agit de la principale chlorophylle absorbant la lumière chez ce microbe (Larkum et Kühl, 2005). Bien que ces deux chlorophylles `` décalées vers le rouge lointain '' n'aient jusqu'à présent été identifiées que chez les procaryotes, si elles pouvaient être transformées en autotrophes eucaryotes - telles que les plantes cultivées - il est possible d'étendre la gamme de longueurs d'onde utilisées par la photosynthèse (par exemple Chen et Blankenship, 2011), avec des augmentations concomitantes des efficacités photosynthétiques. Sûrement, assez intéressant sur le plan de la biochimie et de la biologie moléculaire pour être inclus dans BMBP2?;

forisomes (Protéines contractiles indépendantes de l'ATP dans les éléments de tamis de certaines plantes (Knoblauch et al., 2003);

Acide phytique/phytate (ni mention des phosphates organiques (cf. phosphate inorganique, qui est indexé)) qui n'est pas seulement important comme réserve de phosphore dans les graines (par exemple Raboy, 2009) - et mérite d'être inclus, il est également abondant dans l'environnement (Richardson et al., 2007), et donc une forme majeure de phosphate biodisponible qui mérite d'être mentionnée. Il n'est pas non plus indexé comme son nom plus formel de hexakisphosphate d'inositol (IP6);

Tannosome (un « organelle formant des tanins condensés dans les organes chlorophylliens de Tracheophyta » – Brillouet et al., 2013) – qui pourrait être intégré dans le graphique indiquant les interrelations développementales des plastes (Fig. 1.47 à la p. 33) ?;

Plasmatubules (« évaginations tubulaires du plasmalemme associées à des sites où un flux élevé de soluté se produit entre l’apoplaste et le symplaste » – Chaffey et Harris, 1985).

Maintenant, je suppose que ces sujets – qui sont pertinents pour BMBP2's title - ne sont pas couverts dans le texte car ils ne sont pas indexés. Non, je n'ai pas eu le temps de lire chaque page du texte détaillé pour voir si elles étaient couvertes à l'intérieur. Mais le fait est que ces termes doivent être indexés s'ils sont inclus. Notant que l'index a été compilé par Indexing Specialists (UK) Ltd, on ne peut que croire qu'ils ont fait un travail complet et complet qui donne dûment crédit au travail des éditeurs, auteurs et éditeurs. Bien que je reconnaisse qu'il appartient aux auteurs/éditeurs de décider ce qu'il faut inclure (ou omettre), en tant que botanique généraliste ce sont là des termes qui me paraissent dignes d'être mentionnés par rapport au sujet du livre – et que je m'attendais à voir dans un texte d'aujourd'hui – et dont l'apparente absence m'a surpris. Comment bien BMBP2 sert les plus exigeants spécialiste en biochimie végétale ou en biologie moléculaire je ne peux pas savoir.

Avec plus de 1,000 500 images en quatre couleurs (et XNUMX photographies) dans tout le texte, BMBP2 est abondamment illustré. Et lorsque les sens sont agressés par tant de graphismes, il est trop facile d'être séduit pour croire que ce que vous voyez est la vérité. Mais les lecteurs doivent garder à l'esprit que, aussi persuasive qu'une image couleur puisse être, c'est juste notre actuel C'est la meilleure hypothèse (bien qu'instruite, sans doute) sur le fonctionnement de ces phénomènes, sur la manière dont une chaîne d'événements s'organise ou sur la coordination de processus. Malgré tout, ils embellissent le texte ! Mais est-ce trop demander que d'y ajouter des barres d'échelle ou d'autres indications de taille, en particulier sur les micrographies ?

Étant donné la multitude de sigles, abréviations et acronymes qui encombrent la botanique moderne, je me demande si un glossaire distinct serait utile aux lecteurs. Peut-être. Ou peut-être a-t-on décidé que leur inclusion dans l'index et l'orientation vers les pages de texte appropriées qui les traitent constituent une solution économique. Mais ajouter une douzaine de pages (si ce n'est moins) aux près de 1300 XNUMX pages de l'ouvrage existant est un prix modique (à condition de ne pas avoir à payer beaucoup – voire rien !) de plus pour… Étiquette de prix de 90 £ de la version brochée de BMBP2).

Concernant le prix, c'est une somme importante, mais, s'il n'y a qu'une nouvelle édition tous les 13 ans environ, c'est probablement un prix raisonnable à exiger pour un texte aussi complet (un intervalle de publication entre les éditions/révisions que les éditeurs de manuels de biologie végétale et générale de premier cycle aimeraient imiter ?). J'hésite à appeler BMBP2 un manuel parce que c'est probablement beaucoup plus que cela. Certes, c'est un texte très impressionnant traitant des sujets qu'il aborde - biochimie et biologie moléculaire des plantes - mais il vous faudra tout de même d'autres textes comme Taiz et al. (2015) (pour la physiologie végétale) et Evert et Eichhorn (2012) ou Mauseth (2014) (pour la biologie végétale plus générale comme la biodiversité et la structure). Mais, BMBP2 a un grand rôle à jouer dans l'apport d'alphabétisation et de connaissances botaniques à la génération actuelle d'étudiants. De plus, en raison de la couverture, qui pour un botaniste généraliste semble à la limite de l'encyclopédie, des sujets qu'il comprend, BMBP2 sera également utile au chercheur confirmé qui souhaite/a besoin d'avoir une idée de l'état actuel des choses en matière de biologie biochimique et moléculaire spécialisée des angiospermes.

Bien que l’on comprenne que le livre se concentre sur la biochimie et la biologie moléculaire, que signifie-t-il par plantes dans le contexte de BMBP2? Eh bien, malheureusement, ce n'est pas explicitement défini au début du livre - où des questions aussi importantes doivent être abordées. Cependant, quand on lit le texte, il semble assez clair que le livre est axé sur les angiospermes - c'est-à-dire qu'il traite principalement (exclusivement ?) des plantes à fleurs. En effet, vous auriez du mal à trouver la mention d'un membre du règne végétal en dehors de ces représentants ; bien que le tableau 15.1 (p. 666) se démarque en comparant l'ultrastructure des éléments tamis des mousses (ont-elles vraiment des « éléments tamis » ?), des cryptogames vasculaires (même question), des conifères (qui ont des éléments tamis cellules pas d'éléments de tamis…), et les angiospermes (qui ont des tubes de tamis composés de nombreux éléments de tamis bout à bout…). Et pourquoi ne pas se concentrer sur les angiospermes ? Il y en a plus de 350,000 XNUMX espèces (Paton et al., 2008 – ou env. 400,000 XNUMX, par Toni Kutchan et al. p. 1206), ce qui devrait représenter un défi plus que suffisant pour les chercheurs les plus intrépides. De plus, l'importance de l'étude de ce groupe végétal est soulignée par le fait que ses membres représentent une question de vie ou de mort pour une grande partie de la population humaine en tant que sources de calories et d'autres composants alimentaires.

En complément de ce qui se trouve dans l’entité papier – et comme c’est de plus en plus courant de nos jours, BMBP2 possède de site Web compagnon, qui, bien qu'il soit protégé par un mot de passe dans une certaine mesure, est librement accessible aux propriétaires de l'édition imprimée du livre (ou uniquement aux utilisateurs de celle-ci (!)). Avec des figures téléchargeables (des 24 chapitres) et des tableaux (des 17 chapitres qui les contiennent), ceux-ci sont utiles pour être incorporés dans des cours ou peuvent même être incorporés de manière appropriée dans les devoirs des étudiants. Étant «gratuit», c'est une excellente ressource à avoir, d'autant plus qu'elle ne dépend pas de l'envoi aux adoptants enregistrés d'un code à usage unique pour accéder et télécharger toutes les ressources pédagogiques nécessaires à son enseignement en une seule séance. le cas de plusieurs autres sites Web liés aux manuels scolaires.

Dans l'ensemble:

Biochimie et biologie moléculaire des plantes2.^nd L'édition est une bête, mais c'est une version conviviale qui devrait être accueillie dans sa vie pour fournir une compagnie très appréciée pour poursuivre ses études en biologie végétale.

Références

Bresinsky A, Körner C, Kadereit JW, Neuhaus G et Sonnewald U (2013) Sciences végétales de Strasburger [y compris les procaryotes et les champignons]. Springer.

Brillouet JM, Romieu C, Schoefs B, Solymosi K, Cheynier V, Fulcrand H, Verdeil JL et Conejero G (2013) Le tannosome est un organite formant des tannins condensés dans les organes chlorophylliens des Tracheophyta. Annals of Botany 112 (6): 1003-1014.

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