Le deuxième jour de la conférence Botany 2020, j'ai assisté au symposium "La recherche sur la biodiversité La collecte est plus importante que jamais - inaugurant une renaissance de la collecte,» mis en avant par le Société des conservateurs d'herbier (SHC) et iDigBio. Les huit conférences données ont exploré quatre thèmes différents : la collecte intelligente, les nouveaux objectifs de collecte, les nouveaux outils de collecte et la découverte de nouvelles espèces. Ils ont également posé la question : « Comment tirer le meilleur parti des nouvelles avancées dans ce domaine ? » Historiquement, les collections étaient principalement utilisées à des fins floristiques et taxonomiques, mais au cours des dernières décennies, ces utilisations se sont considérablement développées. "Les progrès récents dans les ressources de données, les technologies, les stratégies d'engagement du public, la coordination de la recherche et la recherche d'opportunités positionnent bien la communauté pour une renaissance de la collecte de spécimens de biodiversité afin de relever les grands défis sociétaux et scientifiques", a déclaré Patrick Sweeney, président du SHC, dans son introduction. "Le symposium est conçu pour encourager les communautés de collectionneurs et de collections à de nouvelles ambitions."

La première conférence, donnée par Sweeney, a examiné dans quelle mesure les collections représentent la nature pour une zone bien collectée et longuement étudiée. Sweeney s'est concentré sur la Nouvelle-Angleterre, qui a une longue histoire de collecte, d'exploration et de sociétés scientifiques régionales, ainsi qu'un effort de numérisation récent et robuste. La comparaison des enregistrements d'herbier avec l'imagerie satellite pour une douzaine de classes de végétation différentes a révélé que les deux ne correspondent pas bien, que ce soit pour le type de végétation ou la densité. Les enregistrements d'herbiers ont montré un biais d'échantillonnage vers les collectes effectuées à proximité des routes ou des herbiers eux-mêmes, à des altitudes plus basses, et avec des herbes et des arbres surreprésentés, pour n'en nommer que quelques-uns. Sweeney a recommandé d'orienter la collecte future autour des lacunes connues et de collecter en gardant à l'esprit les biais liés aux traits, tels que la forme de croissance, la coloration (ou son absence), les très petites plantes et les taxons épineux qui sont plus difficiles à collecter.

Thématiquement similaire était Mary-Ann Feist's talk sur les incursions botaniques. Le groupe de Feist à l'herbier de l'Université du Wisconsin organise une expédition annuelle de collecte de week-end, basée sur des bénévoles - une incursion - dans une zone sous-collectée stratégiquement ciblée de l'État. En plus de lutter contre les préjugés dans les collections de l'herbier, les incursions aident à créer une communauté autour de l'installation, à la protéger et à éduquer le public sur ce qu'elle fait. Les incursions attirent un grand nombre de bénévoles et sont complétées par des ateliers hivernaux de traitement des bons tout aussi bien fréquentés. Feist note que le concept s'est maintenant répandu dans au moins quatre États.

Trois conférences, par Barbara Thiers, Caleb Powell et Bonnie Isaac, axée sur l'utilisation de la technologie pour créer des spécimens « nés étendus » et « nés numériques ». Thiers a préconisé de collecter et de relier des types supplémentaires de données qui étendent l'utilité d'un spécimen, comme son ADN, son champignon et ses graines associés. Bien que cela ralentirait probablement les collectes et nécessiterait de nouveaux portails de données et de nouvelles infrastructures, cela permettrait de diversifier les utilisateurs de spécimens d'herbier et de donner aux collections une plus grande visibilité. Powell et Isaac ont discuté de l'utilisation des applications CollNotes et INaturalist, respectivement, tout en travaillant sur le terrain. L'open source CollNotes permet de saisir des données et de les transformer immédiatement en étiquettes sans étape de transcription, ce qui permet d'économiser du temps et des efforts. L'application populaire iNaturalist peut être utilisée pour lier les photos d'un spécimen avant la collecte à son éventuel bon à l'aide de codes QR qui peuvent être joints au bon et scannés. Le fait d'avoir des photos liées aide à préserver les informations sur les caractéristiques éphémères comme la couleur des fleurs qui sont souvent perdues lors du processus de séchage.

Mât d'AustinL'exposé de s'est concentré sur l'idée fascinante que les anomalies dans les spécimens collectés sont une source importante d'informations sur les changements dans la nature. « Les anomalies sont notre pain et notre beurre », a-t-il déclaré aux collectionneurs, car elles ne sont pas exclues des collections comme elles le seraient d'un ensemble de données expérimentales. À l'heure actuelle, la découverte d'anomalies notées dans les carnets de terrain et sur les étiquettes de collecte a tendance à être ponctuelle et désorganisée. Pour lutter contre cela, Mast a identifié des termes d'anomalie et a utilisé une initiative de science citoyenne appelée "How Weird Is That?" pour assembler un ensemble de formation pour l'apprentissage automatique pour détecter automatiquement ces termes. L'algorithme résultant est maintenant capable de le faire avec une grande précision.

Enfin, deux interventions de Lucas Majuré et Kelsey Noël, axé sur les données de terrain et la collecte de spécimens. Majure a évoqué son travail sur la biodiversité des Grandes Antilles et leurs « taxons manquants ». Il a étudié les spécimens d'un certain nombre de collectionneurs antérieurs de la région et a trouvé de nouvelles espèces cachées dans l'herbier, tout en les utilisant pour informer sa propre collection. Majure a souligné l'importance du travail floristique dans le catalogage des espèces en péril avant qu'elles ne soient perdues et de l'utilisation de spécimens d'herbier pour informer le placement taxonomique des nouvelles collections. Kelsey Yule a parlé du biodépôt du National Ecological Observatory Network (NEON) en tant qu'étude de cas sur l'utilisation de la collecte de spécimens pour surveiller les changements environnementaux. NEON est un projet de 30 ans avec 181 types de données collectées sur 81 sites différents à travers les États-Unis. Yule a établi une distinction entre les collections d'histoire naturelle et les collections de biodépôts, expliquant que ces dernières sont axées sur la surveillance des changements, liées à des données environnementales à petite échelle et destinées à être utilisées de manière destructive, au lieu d'être préservées à perpétuité. Les données NEON sont déjà utilisées dans un certain nombre d'études de recherche et des efforts sont déployés pour intégrer de manière significative les données aux collections d'histoire naturelle.

Dans l'ensemble, le symposium a plaidé en faveur de l'utilité continue et sans cesse croissante des collections d'histoire naturelle et a exploré certaines des façons dont les scientifiques de terrain peuvent les rendre encore plus utiles et pertinentes à l'ère numérique.