Pistes d'amélioration

Dans mon le chargement après, j'ai discuté de l'état des collections de plantes et de champignons dans le monde, comme indiqué par l'état des plantes et des champignons dans le monde rapport et conférence, mis en place par les Royal Botanic Gardens, Kew cette semaine. Au cours de cette seconde moitié, je décrirai certaines des solutions proposées aux lacunes de nos recouvrements présentées dans ce rapport et les documents qui l'accompagnent. Plantes, Gens, Planète article par Paton et ses collègues.

Image: canva.

L'une des principales faiblesses de nos collections telles qu'elles se présentent actuellement est le biais géographique dans la couverture des collections. Cela s'explique en partie par le fait que la collecte a tendance à être motivée par des questions et des problèmes scientifiques spécifiques plutôt que par des tentatives pour combler des lacunes. La coordination des efforts des institutions individuelles pourrait être assurée par « des initiatives régionales telles que le Réseau Botanique d'Amérique Latine, ou l'Association pour l'Etude Taxonomique de la Flore d'Afrique Tropicale, le Système Distribué de Collections Systématiques en Europe ou des organismes internationaux tels que en tant qu'Association mycologique internationale », écrivent les auteurs.

Les tentatives de collecte coordonnée dans des zones ciblées nécessiteront une infrastructure de financement stable qui fournira à la fois des installations et le renforcement de l'expertise. «Souvent, le financement est basé sur des projets et axé sur une livraison à court terme. Il est crucial de développer une infrastructure nationale à long terme qui, à son tour, puisse soutenir des projets à plus court terme. La création et le soutien d'une expertise dans la collecte, la gestion et l'utilisation des collections sont également importants.

À titre d'exemple, un effort coordonné dans la région biodiversifiée mais sous-étudiée du Karoo en Afrique du Sud a réuni plus de 20 ONG, universités, institutions de collecte et autres pour collecter des spécimens et décrire de nouvelles espèces végétales et fongiques. Ces nouvelles informations ont ensuite été utilisées pour éclairer les évaluations d'impact environnemental et les choix de développement dans la région. Le projet a été initié et dirigé par le South African National Biodiversity Institute.

Parallèlement à des efforts de collecte ciblés et coordonnés, le rapport a appelé à un effort pour élargir et démontrer la base d'utilisateurs de spécimens, comme moyen d'éviter les fermetures et les pertes de collections. Deux façons d'y parvenir sont la création de spécimens étendus et l'utilisation d'identificateurs persistants.

Les spécimens étendus sont des bons qui ont des données liées telles que des photos, des échantillons d'ADN, des graines, des champignons associés, etc., qui permettent une utilisation plus large du spécimen. Cette approche peut également être utilisée de concert avec des applications de science citoyenne, notent les auteurs : INaturalist contribuera également à une conservation plus large au niveau communautaire. Plus les données associées au spécimen sont complètes, plus il aura d'utilisations potentielles. Une méthode standard pour identifier l'étendue des informations numériques disponibles à partir des spécimens d'une collection est en cours d'élaboration.

Des identifiants persistants pour les spécimens individuels permettront de relier de manière fiable les bons d'herbier à d'autres types de données, les rendant plus visibles et disponibles pour les utilisateurs potentiels. De plus, les identifiants uniques peuvent être plus facilement référencés lorsque des spécimens sont utilisés dans des recherches publiées, ce qui facilite le suivi de l'utilisation et des citations lors de la prise de décisions de financement.

La prochaine étape à la fois dans l'expansion de l'utilisation des échantillons et dans l'ajout d'une couche de protection face à des événements tels qu'un incendie ou une autre perte de collection est la numérisation. En raison des coûts associés, la numérisation s'est concentrée sur des collections plus grandes et mieux dotées, mais bon nombre des plus petites, en particulier dans les régions riches en biodiversité, ont des spécimens uniques et/ou rares de grande valeur à risque de perte. Le rapport recommande d'intensifier les activités de numérisation dans la mesure du possible et d'affecter des fonds aux herbiers plus petits pour pouvoir le faire. Comme pour la collecte, le ciblage des espèces les plus importantes peut être nécessaire : « La connaissance de la grande proportion de collections qui ne sont pas numérisées pourrait être améliorée par une approche normalisée de collecte de métadonnées sur les collections, facilitant la numérisation ciblée des collections non numérisées », écrivent les auteurs.

Une fois les spécimens numérisés, ils devraient être mis à la disposition des utilisateurs mondiaux via des agrégateurs tels que GBIF, où à l'heure actuelle, seule une collection sur cinq est indexée. Cela augmentera non seulement l'utilisation des collections, mais permettra une meilleure compréhension de la couverture taxonomique des collections mondiales de spécimens.

Un exemple d'effort réussi pour accroître la numérisation est le GBIF Information sur la biodiversité pour le développement (DIS). Ce programme de financement ciblait plusieurs régions sous-représentées au GBIF : l'Afrique subsaharienne, les Caraïbes, l'Asie du Sud-Est et les îles du Pacifique. À ce jour, il a abouti à "67 nouveaux éditeurs de données mobilisant plus de 1.3 million de nouvelles occurrences, dont 39,000 2,400 noms taxonomiques dont près de 120 1,500 étaient nouveaux sur le réseau GBIF", écrivent les auteurs. "En plus de mobiliser des données sur la biodiversité, les programmes BID ont directement formé 66 personnes aux compétences de mobilisation et d'utilisation des données et cet impact a été multiplié à près de XNUMX XNUMX personnes grâce à XNUMX ateliers de réplication".

Le thème des solutions proposées par le rapport sur l'état des plantes et des champignons dans le monde, vis-à-vis des collections, est celui de l'expansion : expansion de la base d'utilisateurs, des usages des spécimens et des collections elles-mêmes. Comme pour les espèces dans le monde en général, une plus grande diversité conduit à une plus grande valeur et à plus de stabilité.