L'Apioideae est le plus grand des quatre sous-familles des Apiacées, ou Ombellifères, ainsi que les plus taxonomiquement complexe. Contenant un peu plus de 400 genres et environ 2900 espèces, les relations évolutives entre ses tribus et sous-tribus sont controversées et les groupes eux-mêmes peuvent ne pas être entièrement monophylétiques. Un large éventail de gènes marqueurs individuels ont été utilisés pour déterminer la phylogénie de la sous-famille dans le passé, mais ceux-ci ont souvent produit des résultats contradictoires, qui peuvent être dus à une hybridation ou à un tri incomplet de la lignée.
Dans un article récent publié dans Annals of Botany, Jun Wen et ses collègues ont utilisé plus de 3300 gènes à copie unique (SCG) pour construire une phylogénie des Apioideae. Les SCG sont utiles car leur orthologie est facilement évaluée et ils ont une proportion plus élevée de sites informatifs que de nombreuses séquences codantes des mitochondries et des chloroplastes. Les chercheurs ont construit un arbre d'espèces basé sur la méthode coalescente. Ils ont ensuite utilisé l'arbre pour étudier l'évolution des types de fruits et la possible biogéographie des Apioideae.
Les analyses ont abouti à une phylogénie bien étayée dans laquelle les positions de plusieurs lignées majeures ont changé par rapport aux travaux antérieurs. Le schéma des fréquences de la topologie des arbres génétiques et des longueurs des branches suggère un tri incomplet de la lignée plutôt que l'hybridation comme cause des résultats contradictoires précédents. L'étude des types de fruits à la lumière de cette nouvelle phylogénie suggère que les fruits d'Apioideae se sont diversifiés dans deux directions, un groupe tendant vers la dispersion par l'eau et l'autre tendant vers la dispersion par le vent. Les fruits avec des côtes facilitant la dispersion des animaux semblent être dérivés de ceux qui sont dispersés par le vent.
En regardant la biogéographie de la sous-famille, la datation moléculaire indique le soulèvement du plateau Qinghai-Tibétain (QTP) et un changement climatique comme moteurs de la spéciation des Apioideae. "Dans l'ensemble, nos études indiquent que le QTP était susceptible d'être un centre d'origine et de différenciation des Apioideae", écrivent les auteurs, "et les taxons de [deux clades endémiques d'Asie de l'Est, Acrème et Physospermopsis] pourrait fournir des détails concernant l'importance de l'orogenèse QTP sur l'évolution des Apioideae.
L'un des auteurs a ce papier listé sur leur site ResearchGate.
