Nous savons actuellement peu de choses sur l'évolution de la couleur des fleurs lorsque plusieurs familles de pigments sont présentes. Ellis et Field ont examiné les modèles de transitions évolutives entre les fleurs pigmentées d'anthocyanes (rouge, rose, bleu et violet) et les fleurs jaunes dans la tribu des Antirrhineae.

Modèle pour l'espace d'état de la pigmentation et les transitions possibles.
Modèle de l'espace d'état de pigmentation et des transitions possibles. Les combinaisons d'allèles contrôlant les anthocyanes et les pigments jaunes peuvent donner naissance à quatre phénotypes. Le taux de transition du phénotype x au phénotype y à travers la phylogénie entre deux phénotypes est appelé qxy. Image d'Ellis et Field (2016).

Une analyse comparative phylogénétique indique une sélection pour la pigmentation jaune ou anthocyanique à différents moments. Néanmoins, ces transitions sont contraintes de passer par une étape intermédiaire non pigmentée. Ces résultats suggèrent une sélection fluctuante favorisant les fleurs avec un seul pigment par rapport à celles avec zéro ou deux pigments.