Partage de la science : 11 juillet

Voici une sélection des meilleurs articles que vous avez partagés cette semaine sur Bluesky. Les articles payants sont marqués d'un 💰 ; les autres sont accessibles gratuitement au moment de la consultation.

J'ai modifié le fonctionnement du système de collecte cette semaine. L'objectif est de réduire la taille du fichier envoyé par e-mail, car il était devenu assez volumineux. J'ai également ajouté des informations sur le système de notation des articles, vous permettant ainsi de voir le nombre de mentions « J'aime » ou de partages obtenus.

1. OpenEvo : une plateforme open source pour l’évolution et l’analyse automatisées
Cocioba, SS et al. bioRxiv · 1 publication · 105 mentions J’aime · 33 partages sur Bluesky

Nous présentons ici OpenEvo, une plateforme de turbidostat entièrement libre et économique pour la culture continue automatisée et les expériences d'évolution dirigée. Les outils existants sont coûteux, complexes ou ne disposent pas de matériel libre ; OpenEvo comble cette lacune avec une plateforme d'évolution complète et entièrement automatisée, accompagnée d'instructions de montage illustrées et détaillées pour les débutants, ainsi que de logiciels et de micrologiciels libres, pour un prix d'environ 300 $.

2. Distinguer le dessèchement des feuilles de la sénescence en conditions climatiques extrêmes ????
Bergström, M. et al. Les changements climatiques Nature · 1 publication · 53 mentions J’aime · 25 partages sur Bluesky

Ces dernières décennies, les températures mondiales ont rapidement augmenté, entraînant une multiplication des phénomènes extrêmes tels que les sécheresses, les vagues de chaleur et leur cooccurrence (les « sécheresses chaudes »). Ces événements ont provoqué une décoloration soudaine et généralisée des feuilles dans les forêts tempérées, comme observé lors de la vague de chaleur de 2021 dans le nord-ouest du Pacifique et des sécheresses chaudes généralisées de 2018 et 2022 en Europe. Le changement de couleur des feuilles étant généralement associé à la sénescence automnale, cette décoloration est souvent interprétée comme une sénescence prématurée ou induite par le stress. Cependant, toute décoloration précoce ne reflète pas nécessairement l'activation d'un programme de sénescence : les dommages thermiques et les défaillances hydrauliques liés aux sécheresses chaudes peuvent provoquer un dessèchement passif des feuilles.

Charlotte Grossiord @charlottegrossiord.bsky.social · sur Bluesky

Nous sommes ravis de partager notre nouvel article sur le brunissement des feuilles. 🔥 Le brunissement précoce des feuilles en période de chaleur et de sécheresse est souvent interprété comme une sénescence prématurée, mais il peut en réalité refléter des dommages causés par la chaleur. Il est essentiel de bien distinguer ces deux phénomènes. www.nature.com/articles/s41...
@wslresearch.bsky.social

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3. La production de sidérophores par le lichen Xanthoria parietina soutient son symbiote algal.
Happacher, I. et al. Communications Nature · 1 publication · 45 mentions J’aime · 20 partages sur Bluesky

Nous caractérisons ici le système d'acquisition du fer de Xanthoria parietina, un champignon lichénisé présent dans le monde entier et associé au photobionte microalgal Trebouxia decolorans.

4. Une expérience de résurrection révèle un potentiel d'adaptation réduit chez une mauvaise herbe agricole commune.
Évêque, SGD, Stinchcombe, Jr., Baucom, RS · Evolution Letters · 1 publication · 32 mentions J’aime · 11 partages sur Bluesky

L'évolution adaptative est cruciale pour la réponse des populations face à l'accélération des changements globaux d'origine anthropique. Bien que la théorie et certaines études empiriques suggèrent que les rythmes actuels de changement environnemental peuvent être suivis par des mutations évolutives tout aussi rapides, les décalages entre l'évolution attendue et l'évolution observée restent fréquents dans les systèmes naturels. À l'aide d'une approche de résurrection, nous démontrons que la structure des covariances génétiques entre les caractères liés à la pollinisation et au système de reproduction chez l'ipomée pourpre (Ipomoea purpurea) contraint de plus en plus les trajectoires évolutives.

Discuté sur Bluesky par @gbaucom.bsky.social.

5. RBMP2 façonne des membranes spécialisées pour la libération de CO₂ dans le condensat pyrénoïde
Wu, H. et al. bioRxiv · 1 publication · 29 mentions J’aime · 8 partages sur Bluesky

Environ un tiers de la fixation mondiale du CO₂ se produit dans le pyrénoïde des algues, un condensat de l'enzyme fixatrice de CO₂ Rubisco, traversé par des membranes qui l'alimentent en CO₂. Chez l'algue modèle Chlamydomonas reinhardtii, le CO₂ est acheminé par une région réticulée centrale spécialisée de ces membranes. Nous décrivons ici la formation de cette région et identifions RBMP2 comme le premier facteur nécessaire à sa biogenèse.

6. Origines et diversification de la pollinisation par les colibris chez les Broméliacées
En avant, EA, Thompson, JB · Journal botanique de la Linnean Society · 1 publication · 23 mentions J’aime · 9 partages sur Bluesky

Nous avons constitué une base de données inédite recensant les pollinisateurs publiés pour 403 espèces de broméliacées, couvrant 70 % des genres et toutes les sous-familles, et analysé ces données dans un cadre phylogénétique. L'estimation des états ancestraux révèle une labilité importante, incluant de nombreuses transitions jusqu'alors inconnues. Nombre d'entre elles se produisent au cours de l'évolution récente, témoignant d'un renouvellement constant des pollinisateurs. Malgré une hétérogénéité marquée du taux de diversification de fond, la pollinisation par les colibris s'avère être un puissant moteur de diversification, un résultat qui, selon nos observations, restera probablement inchangé même en supposant une prévalence irréaliste de cette pollinisation chez les espèces non échantillonnées.

7. La conception informatique de domaines intégrés de novo permet un contrôle rationnel de la reconnaissance des effecteurs pathogènes dans les récepteurs immunitaires NLR des plantes.
Xi, Y. et al. bioRxiv · 1 publication · 13 mentions J’aime · 11 partages sur Bluesky

Nous décrivons ici un cadre programmable qui exploite les outils de conception de protéines d'IA générative, RFdiffusion et ProteinMPNN, pour concevoir des domaines intégrés de novo (ID) contre divers effecteurs pathogènes.

8. Les forêts tropicales sont confrontées à des risques croissants d'exposition à des seuils de température critiques. ????
van Tiel, N. et al. Actes de l'Académie nationale des sciences · 1 publication · 21 mentions J’aime · 8 partages sur Bluesky

Il est essentiel de comprendre à quel point les espèces d'arbres tropicaux sont proches des seuils de température critiques susceptibles d'entraver leur activité photosynthétique, dans un monde où les vagues de chaleur sont devenues plus intenses et plus fréquentes. À l'aide de données de télédétection de la température de surface et de cartes de répartition des espèces, nous avons étudié la variation spatio-temporelle des marges de sécurité thermique (MST, c'est-à-dire la différence entre T_crit, la température critique de photosynthèse, et la température maximale de la canopée) de 208 espèces d'arbres tropicaux en Amérique du Sud, en Asie du Sud-Est et en Afrique centrale, sur la période 2001-2020.

Charlotte Grossiord @charlottegrossiord.bsky.social · sur Bluesky

🌳À quel point les forêts tropicales sont-elles proches de leur limite photosynthétique ? Notre nouvelle étude souligne la vulnérabilité de ces écosystèmes face à un réchauffement accru et l’importance d’une représentation précise de la température de la canopée. www.pnas.org/doi/10.1073/... @wslresearch.bsky.social

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9. L'amélioration de l'hétérogénéité structurelle dans les paysages forestiers aménagés favorise la diversité gamma, mais pas la diversité bêta, dans les communautés végétales du sous-bois.
Bradler, Premier ministre et al. Journal of Applied Ecology · 1 publication · 18 mentions J’aime · 8 partages sur Bluesky

Bien que l'hétérogénéité de l'habitat soit reconnue pour favoriser la diversité spécifique locale, les effets de l'hétérogénéité structurale induite par la gestion sur les communautés végétales du sous-bois à différentes échelles spatiales restent mal compris, malgré leur rôle crucial pour la biodiversité forestière et le fonctionnement des écosystèmes. Afin d'analyser la réponse des communautés végétales du sous-bois à une augmentation de l'hétérogénéité structurale dans les forêts aménagées, nous avons établi 11 sites expérimentaux composés de deux paysages forestiers appariés : une parcelle témoin homogène non traitée et une parcelle expérimentale (ESBC, Amélioration de la Complexité Bêta Structurale). Dans les parcelles expérimentales, l'hétérogénéité structurale a été accrue par différentes combinaisons de manipulations locales, à l'échelle de la parcelle, de la lumière et du bois mort, induisant une plus grande hétérogénéité entre les parcelles à l'échelle du paysage.

10. EPOS1 est nécessaire à la formation normale de la gaine d'amidon des pyrénoïdes et à l'efficacité du CO.₂mécanisme de concentration dans Chlamydomonas reinhardtii ????
Adler, L. et al. New Phytologist · 2 publications · 7 mentions J’aime · 8 partages sur Bluesky

Les mécanismes de concentration du CO₂ à base de pyrénoïdes (pCCM) stimulent la photosynthèse en fournissant des concentrations élevées de CO₂ à la ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygénase. Les pyrénoïdes sont souvent entourés d'une gaine d'amidon qui, selon toute vraisemblance, améliore l'efficacité des pCCM, mais le mécanisme de formation de cette gaine reste mal connu. Dans cette étude, nous avons évalué le rôle de la protéine EPOS1, associée aux pyrénoïdes, dans la formation de la gaine d'amidon chez Chlamydomonas reinhardtii.

New Phytologist @newphyt.bsky.social · sur Bluesky

EPOS1 est nécessaire à l'assemblage normal de la gaine d'amidon des pyrénoïdes et à la fixation du CO2 chez Chlamydomonas.

Liat Adler, et al.

nph.onlinelibrary.wiley.com/share/UGKQVT...

#SciencesVégétales

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11. Éclairage sur la formation de la cuticule : le phytochrom B et les événements de signalisation en aval contrôlant le dépôt de cuticule dans les fruits de la tomate ????
Fernandes, LLG et al. Journal de botanique expérimentale · 1 publication · 11 mentions J’aime · 8 partages sur Bluesky

La cuticule est une barrière hydrophobe limitant la perte d'eau et la pénétration des pathogènes. Bien que la lumière influence sa formation, les mécanismes sous-jacents restent mal compris, notamment chez les fruits. Nous montrons ici que les fruits de plants de tomates cultivés sous un éclairage enrichi en infrarouge lointain présentent une cuticule plus épaisse et une surexpression des gènes de biosynthèse de la cutine et des cires.

12. S'adapter à la chaleur : dynamique à long terme et plasticité de la tolérance à la chaleur dans une communauté végétale tropicale ????
Hernández, GG et al. New Phytologist · 2 publications · 8 mentions J’aime · 7 partages sur Bluesky

L’augmentation des températures mondiales représente un défi immense pour les plantes, en particulier pour les espèces tropicales adaptées à des conditions thermiquement stables. Nous avons donc étudié la dynamique à long terme de la tolérance à la chaleur photosynthétique au sein d’une communauté tropicale de Zingiberales composée de 35 espèces dans une forêt tropicale humide des basses terres caribéennes du Costa Rica, à l’aide de recensements s’étalant sur 7 ans.

13. Les voisins modifient les interactions entre les plantes et le sol en remodelant les microbiomes racinaires. ????
Kuerban, M., Gomes, SIF, Bezemer, MC · Nature Plants · 1 publication · 15 mentions J’aime · 6 partages sur Bluesky

Les microbiomes du sol et les plantes voisines influencent fortement la croissance des plantes, façonnant ainsi la dynamique des communautés. Bien que ces processus aient été largement étudiés, ils sont rarement intégrés dans un cadre mécaniste. Par conséquent, leurs interactions mécanistes restent mal comprises. Nous abordons ici ces questions en utilisant une approche de rétroaction plante-sol avec six espèces de prairies cultivées seules ou avec cinq espèces voisines différentes dans un sol stérile et dans des sols ayant conservé des traces de plantes conspécifiques et hétérospécifiques.

14. Régénération des plantes : briser le silence de la totipotence par la reprogrammation d'une cellule précurseur stomatique ????
Torii, KU · Current Biology · 1 publication · 10 mentions J’aime · 7 partages sur Bluesky

Les plantes possèdent une capacité remarquable à reprogrammer leurs cellules somatiques en cellules souches. Une nouvelle étude révèle qu'un facteur de transcription, LEC2, en association avec SPEECHLESS, reprogramme directement un précurseur stomatique en une cellule fondatrice d'embryon somatique totipotente.

15. Organisation et évolution des gamétanges des plantes terrestres
Sorojsrisom et al. · Revue internationale des sciences végétales · 1 publication · 16 mentions J’aime · 5 partages sur Bluesky

Les gamétanges sont des organes essentiels du gamétophyte des plantes terrestres ; ils assurent la formation, le stockage et la dispersion des gamètes. De par leur importance biologique, la structure des gamétanges est généralement très conservée au sein des lignées, bien qu’elle présente des différences morphologiques marquées entre les principales lignées. La morphologie et le développement des gamétanges des plantes terrestres sont étudiés depuis plus de 150 ans, mais des questions importantes demeurent quant à leur origine évolutive, les homologies entre eux et la manière dont ils sont organisés par le génome.

16. Signalisation médiée par le cryptochrome dans le développement racinaire
Pérez Torres, M., Pédale, UV · New Phytologist · 1 publication · 12 mentions J’aime · 5 partages sur Bluesky

Par le biais de la signalisation à longue distance et de l'activité locale dans les tissus racinaires, les cryptochromes (CRY) influencent la croissance racinaire induite par l'auxine, la signalisation du saccharose à longue distance et la division cellulaire dans différentes conditions environnementales. Dans cet article, nous passons en revue les voies de signalisation systémiques et autonomes des racines médiées par les CRY, la modulation environnementale, la conservation interspécifique et discutons des questions en suspens concernant la croissance racinaire régulée par les CRY. Nous avons posé les questions suivantes : (1) La tolérance à la chaleur de la communauté des Zingibérales varie-t-elle d'une année à l'autre ? Si oui, cette variation interannuelle est-elle associée à des changements de température environnementale ? (2) Les espèces présentent-elles des différences de plasticité interannuelle, et cette différence modifie-t-elle leur classement relatif de tolérance à la chaleur au fil des ans ?

17. L'édition du génome renforce précisément la tolérance au sel Japon rendement du riz
Zhou, M. et al. Journal de biologie végétale intégrative · 1 publication · 12 mentions J’aime · 5 partages sur Bluesky

La modification génétique de trois gènes clés, la sous-unité gamma de la protéine G, la cytokinine oxydase et l'architecture végétale idéale 1, a amélioré la variété de riz japonica tolérante au sel Lansheng, augmentant ainsi le rendement tout en maintenant sa tolérance au sel et sa qualité d'origine.

18. Redéfinir l'intégrité des écosystèmes pour une biosphère de l'Anthropocène : un cadre de restauration basé sur les processus et les lignées
Svenning, J. · Écologie de la restauration · 1 publication · 17 mentions J’aime · 3 partages sur Bluesky

La restauration s'opère de plus en plus dans des paysages en pleine transformation, façonnés par les changements globaux d'origine humaine, où les états de référence historiques ne constituent plus des objectifs réalisables, ni même souhaitables. Pourtant, la restauration écologique et la gestion de la conservation reposent encore sur des définitions de l'intégrité des écosystèmes basées sur la composition et supposant des états de référence stables. De telles définitions sont de moins en moins adaptées pour guider la restauration dans une biosphère en mutation et dominée par l'homme. Je propose ici une redéfinition de l'intégrité des écosystèmes qui privilégie la persistance des processus écologiques clés et du patrimoine évolutif plutôt que la fidélité à la composition.

19. Résistance systémique acquise : rôle émergent des jasmonates dans la biogenèse, la translocation et le décodage distal des signaux locaux
Bennett, F. et al. New Phytologist · 1 publication · 11 mentions J’aime · 5 partages sur Bluesky

Des études récentes, utilisant l'imagerie de plantes entières et de rapporteurs confocaux, la signalisation électrique et la transcriptomique unicellulaire, ont révélé comment des types cellulaires spécifiques et l'organisation spatio-temporelle des réseaux de phytohormones contribuent à la signalisation immunitaire. Nous résumons ces résultats en les reliant aux connaissances antérieures afin de souligner l'importance collective des jasmonates, du calcium, des espèces réactives de l'oxygène et des signaux électriques en tant qu'initiateurs précoces, coordinateurs et, très probablement, propagateurs de la signalisation à longue distance lors de la SAR induite par l'ETI.

20. Hétérosis chez le blé : mécanismes, avantages et défis du développement hybride
Revell, I. et al. · Journal de botanique expérimentale · 1 publication · 8 mentions J’aime · 6 partages sur Bluesky

Cette revue, centrée sur le blé, détaille les connaissances actuelles sur le contrôle génétique de l'hétérosis et explore l'efficacité de différentes méthodes de production d'hybrides F1. Nous postulons que les mécanismes sous-jacents à l'hétérosis résultent probablement d'une combinaison de plusieurs, voire de l'ensemble des théories actuelles, et que la conversion de cultures pures comme le blé en systèmes de sélection hybride peut être optimisée grâce à un système génique complet, réduisant ainsi le besoin de systèmes de production hybride plus complexes.

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