Science partagée : 15er août

Voici le récapitulatif des articles les plus partagés sur Bluesky cette semaine. J'ai reçu une alerte alarmante du gouvernement m'indiquant de ne pas faire de barbecues en raison des risques d'incendie ; l'article le plus partagé cette semaine tombe donc à pic. La publication légèrement tardive de cette semaine est également liée à la chaleur. J'ai du mal à la supporter, mais ce sera le cas pour beaucoup de gens dans les années à venir. Les articles payants sont signalés par un 💰 ; les autres sont accessibles gratuitement au moment de la consultation.

1. Plus rapides, plus vastes, plus dévastateurs : la propagation extrême des feux de forêt prépare le terrain à des changements dans l'écosystème forestier de l'ouest et de la région boréale de l'Amérique du Nord.
Coop, JD et al. Science Advances · 1 publication · 99 mentions J’aime · 49 partages sur Bluesky

Dans cette étude, nous mesurons les taux de croissance linéaire journaliers des feux et évaluons les relations entre la propagation du feu, la gravité des brûlures et les indicateurs de résilience des paysages après incendie, à partir de 3 499 feux survenus entre 2012 et 2023 dans des forêts dominées par les conifères au Canada et dans l’ouest des États-Unis. Nos résultats montrent que l’augmentation du taux de propagation linéaire s’accompagne d’une augmentation de la gravité du feu, de la proportion de la surface brûlée avec une forte intensité et de la distance aux sources de semences d’arbres survivants.

2. Mandarine: Une nouvelle famille de Vaisseaux spatiaux à partir de champignons lichénisés
Tagirdzhanova, G. et al. Actes de l'Académie nationale des sciences · 1 publication · 66 mentions J’aime · 44 partages sur Bluesky

Des données récentes suggèrent que les lichens pourraient être encore plus complexes qu'on ne le pensait, contenant de multiples constituants microbiens. Cependant, la façon dont les génomes du principal symbiote fongique (qui fournit la majeure partie de la biomasse des tissus lichénisés) ont été façonnés au cours de l'évolution reste largement inexplorée. Récemment, des éléments transposables géants appelés Starships ont été découverts dans de nombreux génomes de champignons filamenteux, mais leur présence chez les champignons lichénisés demeure inconnue. Dans ce rapport, nous décrivons un élément Starship du champignon lichénisé *Xanthoria parietina*. Cet élément, nommé Tangerine, contient plusieurs gènes présentant des signatures de transfert horizontal de gènes provenant de champignons non lichénisés, très probablement de levures noires de l'ordre des Chaetothyriales, souvent associées aux lichens.

3. L'activation spécifique au type cellulaire de l'immunité déclenchée par des effecteurs largement perçus limite l'invasion des pathogènes chez les plantes
Chhillar  et al. · Hôte de cellule et microbe · 2 publications · 70 mentions J’aime · 22 partages sur Bluesky

L'immunité déclenchée par les effecteurs (ETI) est essentielle à la défense des plantes, mais on ignore encore si tous les types cellulaires l'exécutent de manière similaire. Nous avons combiné l'activation immunitaire induite chimiquement avec la transcriptomique unicellulaire pour profiler les réponses ETI dans les principaux types cellulaires foliaires. ArabidopsisMalgré une perception uniforme de l'ETI, nous constatons des résultats transcriptionnels divergents : un ensemble central de gènes de défense est largement induit, tandis que des types cellulaires distincts activent des modules immunitaires spécialisés.

4. hémiparasite castilleja La présence est corrélée à une biodiversité végétale accrue au sein des communautés végétales montagnardes.
Argrett, JC et al. American Journal of Botany · 2 publications · 53 mentions J’aime · 21 partages sur Bluesky

Dans une étude de 2 ans menée au Rocky Mountain Biological Laboratory, nous avons sélectionné des parcelles appariées de présence et d'absence pour trois espèces de Castilleja hémiparasites sur sept sites d'étude afin d'explorer l'association de Castilleja avec les différences dans la structure des communautés végétales montagnardes.

Anny Chung (鍾彥儀) @yyachung.bsky.social · sur Bluesky

Nouvel article de Jordan Argrett, doctorant, sur le rôle de l'hémiparasite Castilleja dans la diversité des communautés végétales ! Il a étudié plus de 400 parcelles sur différents sites, espèces et saisons de croissance. Superbes illustrations réalisées à la main par un co-auteur du programme REU ! 🌍🌱🌿
bsapubs.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/...

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5. Facteurs de réponse à l'auxine : des facteurs de transcription aux effecteurs de l'auxine
Dipp‐Álvarez, M., Hernández‐García, J. · New Phytologist · 3 publications · 42 mentions J’aime · 20 partages sur Bluesky

Les voies de signalisation sont apparues et se sont considérablement diversifiées au cours de l'évolution. En utilisant les facteurs de réponse à l'auxine (ARF) comme modèle, nous examinons comment un système de signalisation végétale a évolué par cooptation de régulateurs transcriptionnels préexistants, un principe bien établi en biologie évolutive chez les organismes, tels que les animaux.

6. Évolution rapide et divergence fonctionnelle de la télomérase de la mimule de Lewis (Mimulus lewisii).
Samo, N. et al. · bioRxiv · 1 publication · 44 mentions J’aime · 19 partages sur Bluesky

Les télomères sont des structures nucléoprotéiques qui protègent les extrémités des chromosomes et sont maintenus par la télomérase transcriptase inverse (TERT), une protéine qui utilise un ARN télomérase (TR) non codant comme matrice. Chez les mimules, *Mimulus lewisii* présente une duplication ancienne du gène TR, synthétisant un télomère hétérogène de séquence atypique d'un point de vue évolutif. Les mécanismes d'interaction entre TERT et les deux paralogues de TR lors du maintien des télomères restent inconnus, et les réponses à ces questions pourraient apporter un éclairage nouveau sur la fonction télomérique. Grâce à de nouveaux assemblages de génomes, nous avons découvert que TERT évolue rapidement dans les lignées partageant la duplication de TR. Nous avons étudié les conséquences fonctionnelles de cette évolution rapide, en utilisant d'abord le système triple hybride de la levure et en testant l'interaction physique entre les combinaisons TERT-TR conspécifiques et hétérospécifiques.

7. Évaluation de la génétique des populations de Quercus tardifolia et d'autres chênes rouges dans l'ouest du Texas
Koontz et al. · Revue internationale des sciences végétales · 4 publications · 35 mentions J’aime · 13 partages sur Bluesky

Nous décrivons ici nos recherches visant à délimiter les frontières des espèces dans un groupe de chênes rouges trouvés dans les monts Chisos et Davis de l'ouest du Texas, en nous concentrant sur Quercus tardifolia, le chêne à feuilles tardives, que l'on pensait disparu en 2011 avant son identification dans le parc national de Big Bend en 2022 et dans d'autres endroits par la suite.

Revue internationale des sciences végétales @ijpsjournal.bsky.social · sur Bluesky

AOP @ijpsjournal.bsky.social

🚨Recherche de premier cycle🚨

Conservation des tissus mous de fruits de Melastomataceae silicifiés enfouis par un volcanisme intraplaque dans la flore de Capella de l'Oligocène inférieur, dans l'est de l'Australie

Andrew C. Rozefelds et al

www.journals.uchicago.edu/doi/10.1086/...

#SciencesVégétales

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8. Avant que la distribution de l'auxine n'ait d'importance : Pré-structuration de l'axe de l'embryon d'Arabidopsis par phosphorylation d'AUX/IAA8 dépendante de MPK6
Bischoff, T. et al. bioRxiv · 2 publications · 30 mentions J’aime · 17 partages sur Bluesky

Dans la croissance et le développement des plantes, la molécule de signalisation auxine joue un rôle essentiel. De nombreux processus de structuration sont contrôlés par la signalisation auxinique au sein de la matière auto-organisée. Après la fécondation, un tel processus de structuration doit être initié pour la première fois au cours de la vie de la plante. Contrairement aux modèles précédents, nous montrons que la première réponse différentielle à l'auxine, qui distingue le développement embryonnaire du développement extra-embryonnaire dans les deux cellules filles du zygote, se produit indépendamment de tout gradient d'auxine détectable.

9. Les nutriments comme signaux qui organisent spatialement les interactions plantes-microbes ????
Chanson et al. · Opinion actuelle en biologie végétale · 1 publication · 30 mentions J’aime · 13 partages sur Bluesky

Nous présentons ici une synthèse des connaissances actuelles sur les réponses des plantes et des microbes aux nutriments et mettons en lumière les technologies émergentes qui permettent leur intégration. Nous introduisons ensuite un cadre théorique basé sur l'état cellulaire pour interpréter les interactions plante-microbe comme des propriétés émergentes de réponses cellulaires spatialement couplées, liées par l'environnement chimique local. Cette perspective offre les bases d'une compréhension plus mécaniste et prédictive des interactions plante-microbe.

Tatsuya Nobori @tatsuyanobori.bsky.social · sur Bluesky

Notre nouvelle revue est en ligne !

Les nutriments peuvent agir comme des signaux spatiaux qui organisent les interactions plante-microbe. Nous discutons des outils émergents et proposons un cadre d'analyse des états cellulaires reliant les états cellulaires végétaux et microbiens par le biais des paysages nutritifs locaux.

sciencedirect.com/science/arti...

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10. Flavobacterium endophyte favorise le développement des poils absorbants et améliore la tolérance à la sécheresse via un module de régulation hormonale ERF–CEP5
Rahimi, A. et al. Nature Plants · 1 publication · 12 mentions J’aime · 13 partages sur Bluesky

Les poils absorbants (PA) sont des excroissances cellulaires des cellules épidermiques des racines des plantes, essentielles à l'absorption d'eau, à l'acquisition de nutriments et à la dynamique de la rhizosphère. Des gènes clés contrôlant le développement des PA ont été identifiés, mais les mécanismes de régulation de leur croissance en situation de stress hydrique restent largement méconnus. Nous montrons ici que l'endophyte bactérien de la racine Flavobacterium sp. 98 (Flavo98) module l'architecture du système racinaire avec une promotion prononcée de la formation de RH et de l'élongation cellulaire qui est maintenue dans des conditions de faible humidité.

11. Un rôle clé pour S-Nitrosylation dans la régulation immunitaire et le développement chez l'hépatique Marchantia polymorphe
Tabassum, N., Goodrich, J., Loake, GJ · Journal de botanique expérimentale · 1 publication · 18 mentions J’aime · 8 partages sur Bluesky

L'oxyde nitrique (NO) est une molécule de signalisation importante dans l'immunité des plantes à fleurs. Il s'accumule rapidement en réponse à la perception d'un pathogène. Outre sa réponse directe aux microbes, le NO contrôle diverses réponses de défense, principalement par S-nitrosylation. Ce processus est une modification redox-dépendante au cours de laquelle un groupe NO se fixe au thiol d'un résidu de cystéine, créant un S-nitrosothiol (SNO). Afin d'explorer plus largement le rôle de la S-nitrosylation, nous avons caractérisé le gène unique de la S-nitrosoglutathion réductase 1 (MpGSNOR1) chez la marchantie polymorphe (Marchantia polymorpha), une hépatique représentative d'une lignée très éloignée des plantes à fleurs.

12. Transformation et libération de la phytocytokine Zip1 du maïs
Koenig et al. (auteurs inconnus) · Physiologie végétale · 1 publication · 14 mentions J’aime · 9 partages sur Bluesky

Les phytocytokines sont des peptides endogènes qui modulent la réponse immunitaire des plantes, mais les mécanismes de leur maturation et de leur distribution spatiale restent mal compris. Nous montrons ici que le précurseur de la phytocytokine PROZIP1 chez le maïs est contrôlé par une voie protéolytique en deux étapes, spatialement distincte, qui découple mécaniquement l'activation du signal de son atténuation extracellulaire.

13. Les caractéristiques hydrauliques régissent les déplacements opposés d'aires de répartition des arbres de montagne sous l'effet du réchauffement climatique. ????
Zhang, X. et al. Les changements climatiques Nature · 1 publication · 22 mentions J’aime · 6 partages sur Bluesky

En intégrant des enregistrements dendrochronologiques à l'échelle hémisphérique de 45 espèces (121 743 individus), des observations globales des changements d'aire de répartition altitudinale de 102 espèces et des données sur les caractéristiques hydrauliques de 11 attributs fonctionnels, nous démontrons que les espèces sensibles au climat ont eu tendance à suivre rapidement le réchauffement vers des altitudes plus élevées, tandis que les taxons résistants à ces stress étaient prêts à s'étendre vers le bas. 

14. Une kinase de type récepteur de laitue reconnaît le motif heptapeptidique hautement conservé au sein des protéines microbiennes de type Nep1. ????
Bañales, I. et al. Actes de l'Académie nationale des sciences · 1 publication · 21 mentions J’aime · 6 partages sur Bluesky

Les plantes dépendent des récepteurs immunitaires de surface pour détecter les motifs microbiens et initier des réponses de défense efficaces. Bien que la famille des Astéracées soit l'un des groupes de plantes les plus importants et économiquement, on dispose de peu d'informations sur sa signalisation immunitaire déclenchée par ces motifs. La laitue cultivée (Lactuca sativa L.) reconnaît un peptide de 24 acides aminés (nlp24) issu de protéines de type Nep1 (peptide inducteur de nécrose et d'éthylène 1) (NLP) présentes chez les bactéries, les champignons et les oomycètes. Dans cette étude, nous avons caractérisé en détail les réponses immunitaires induites par nlp24 chez la laitue et identifié le récepteur LNR (LETTUCE nlp24 RECEPTOR) comme la kinase de type récepteur à répétitions riches en leucine qui assure sa reconnaissance.

15. Les extensions de petites sous-unités codées par le chloroplaste remodèlent le chlororibosome de Chlamydomonas
Valse, F. et al. Nature Plants · 1 publication · 14 mentions J’aime · 8 partages sur Bluesky

Les ribosomes chloroplastiques (chlororibosomes) synthétisent les protéines essentielles à l'appareil photosynthétique, mais leur diversité structurale en dehors des plantes à fleurs demeure largement inexplorée. Dans cette étude, nous combinons la cryo-tomographie électronique in situ et la cryo-microscopie électronique de particules uniques pour déterminer la structure du chlororibosome de l'algue verte unicellulaire Chlamydomonas reinhardtii.

16. Polyploïdie : une force macromutationnelle à l'origine des développements bioéconomiques
Peeters, MKR, Van de Peer, Y. · Actes de l'Académie nationale des sciences · 1 publication · 13 mentions J’aime · 8 partages sur Bluesky

La polyploïdisation, résultant du duplication du génome, est une macromutation qui remodèle les génomes, les phénotypes et les interactions écologiques. Elle engendre souvent de nouveaux phénotypes, notamment des modifications de la taille, de la physiologie, de la biochimie et une tolérance accrue au stress. Nous expliquons ici comment une exploitation stratégique de la polyploïdie peut contribuer de manière significative aux avancées de la bioéconomie moderne, soucieuse de réduire son empreinte écologique grâce à une production et une utilisation durables des ressources biologiques.

17. La microtomographie à rayons X à haute résolution révèle les relations entre les stomates et l'anatomie interne des feuilles de sorgho
Fischer, JM et al. Physiologie végétale · 1 publication · 16 mentions J’aime · 7 partages sur Bluesky

Les stomates sont des pores de l'épiderme foliaire qui régulent l'équilibre entre l'absorption de CO₂ pour la photosynthèse et les pertes d'eau dans l'atmosphère. La distribution des stomates influence donc l'efficience d'utilisation de l'eau et constitue une cible pour les techniques d'ingénierie visant à prévenir le stress hydrique. Cependant, la compréhension de la coordination entre l'anatomie interne de la feuille et le développement des stomates reste limitée, notamment en raison des difficultés techniques liées à l'évaluation de l'anatomie tridimensionnelle avec une résolution suffisante. Les graminées C4 sont peu étudiées, ce qui représente une lacune importante dans nos connaissances, compte tenu de la distribution linéaire de leurs stomates et de l'organisation unique de leur mésophylle. Dans cette étude, nous avons étudié du sorgho sauvage et une lignée transgénique à faible densité stomatique exprimant un facteur de structuration épidermique synthétique (EPFsyn).

18. Une insertion spécifique de 296 pb dans le DFR1 Le promoteur active la biosynthèse des anthocyanes médiée par l'éthylène lors de la sénescence automnale des feuilles chez Quercus aliena ????
Pei, Z. et al. · Journal de botanique expérimentale · 1 publication · 21 mentions J’aime · 5 partages sur Bluesky

Les arbres ornementaux à feuilles rouges sont généralement caractérisés par leur richesse en anthocyanes. Quercus aliena, une espèce de chêne indigène dominante en Chine, présente un feuillage d'automne remarquable, aux teintes jaunes à rouges. Cependant, la régulation moléculaire de la biosynthèse des anthocyanes lors de la sénescence foliaire demeure largement méconnue. Dans cette étude, nous avons identifié une insertion de 296 pb dans le promoteur de la dihydroflavonol 4-réductase (DFR1) chez le cultivar de Q. aliena à feuilles rouges 'Qiuyun', insertion significativement associée à une forte accumulation d'anthocyanes.

19. Détection de l'oxygène chez les plantes : de la signalisation dynamique de l'hypoxie aux rôles croissants de la voie de dégradation de la cystéine N
La Monaca, N. et al. Journal de botanique expérimentale · 1 publication · 15 mentions J’aime · 7 partages sur Bluesky

Des découvertes récentes ont fondamentalement transformé le paradigme de la détection de l'oxygène par les plantes. L'hypoxie n'est plus considérée uniquement comme la conséquence d'un stress environnemental, tel qu'une inondation, mais comme un signal physiologique dynamique et intrinsèque qui contrôle activement le développement normal de la plante.

20. La croissance lente comme stratégie de longévité des plantes
Binter, J. et al. Communications Nature · 1 publication · 9 mentions J’aime · 8 partages sur Bluesky

Les théories écologiques prévoient un compromis fondamental entre croissance rapide et longévité, avec des conséquences importantes sur la résilience des écosystèmes et le temps de résidence du carbone. L'étude des cernes des arbres a révélé une relation négative globalement constante entre le taux de croissance et la durée de vie. Cependant, les preuves à grande échelle de tels compromis chez d'autres espèces que les arbres restent rares, principalement en raison de limitations méthodologiques. Dans cette étude, nous exploitons les cernes de croissance annuels formés par épaississement secondaire chez les plantes herbacées vivaces pour tester si le compromis croissance-longévité représente un axe de stratégies végétales répandu chez différentes formes de vie.

Image de couverture : Un pompier en uniforme inspecte les dégâts causés par un incendie de forêt, la fumée s’élevant des arbres. IslandHopper X de Pexels.