Science partagée : 22er août

Voici le récapitulatif des articles les plus partagés sur Bluesky cette semaine. Ce fut une semaine frustrante, non pas parce qu'il est difficile de trouver des articles, mais au contraire. Il y en a beaucoup que j'aurais aimé lire attentivement et commenter. Mais il y en a aussi beaucoup d'intéressants qui n'ont pas été retenus. Rien que vendredi, j'ai reçu tellement de documents que je pourrais être occupé toute la semaine. Pour une raison ou une autre, je m'attendais à un été calme. Comme d'habitude, les articles payants sont signalés par un 💰 ; les autres sont en accès libre au moment de la consultation.

1. Une innovation génétique unique à l'origine de la terrestrialisation des plantes
Mbadinga Zamar, DL et al. · bioRxiv · 2 publications · 61 mentions J’aime · 37 partages sur Bluesky

L'évolution des innovations fonctionnelles qui ont permis aux plantes de coloniser la terre ferme il y a 450 millions d'années reste un mystère. Nous montrons ici que l'acquisition d'une seule famille d'enzymes a joué un rôle crucial dans l'évolution de deux de ces innovations : la cuticule, qui protège les plantes de la déshydratation et des rayons UV, et la symbiose mycorhizienne arbusculaire, qui favorise l'absorption d'eau et de nutriments.

2. Techniques et défis liés à l'étude de la diversité photosynthétique chez les plantes vasculaires submergées d'eau douce
Loew-Mendelson, E. et al. · Applications en sciences végétales · 2 publications · 29 mentions J’aime · 16 partages sur Bluesky

Bien que la diversité photosynthétique des plantes aquatiques rivalise avec celle des espèces terrestres, les conditions environnementales qui la sous-tendent diffèrent fondamentalement. Malgré ces différences, les plantes aquatiques et terrestres ont développé de manière convergente des mécanismes de concentration du carbone (MCC). Cependant, la caractérisation de ces mécanismes chez les plantes submergées est restée en retrait par rapport à celle des systèmes terrestres, en raison des contraintes méthodologiques propres au milieu aquatique. Nous présentons ici une synthèse des méthodes actuelles de détection des MCC chez les plantes aquatiques. Les méthodes physiologiques, notamment l'analyse des échanges gazeux et des isotopes, apportent des informations précieuses sur les plantes terrestres, mais se heurtent à des difficultés importantes dans les systèmes aquatiques.

3. Un métabolite bactérien modifie le métabolisme fongique, déclenchant la transition des hyphes en levures.
Bharathwaj, M. et al. · Current Biology · 1 publication · 40 mentions J’aime · 13 partages sur Bluesky

Les champignons alternent entre différentes morphologies cellulaires pour s'adapter à leur environnement et le coloniser. Chez Candida albicans, la colonisation commensale de l'homme et sa virulence dépendent d'une transition réversible entre des hyphes invasives et des cellules de levure disséminées. La transition levure-hyphes est bien comprise, mais la transition inverse, des hyphes vers les levures, est comparativement peu connue. En développant une technique d'imagerie permettant de visualiser et de quantifier cette transition hyphes-levures, nous montrons que la gladioline, un produit naturel bactérien, l'accélère.

4. L'exclusion des embruns salés foliaires et la tolérance tissulaire sous-tendent l'adaptation locale aux embruns océaniques.
Plunkert, ML et al. · American Journal of Botany · 1 publication · 33 mentions J’aime · 11 partages sur Bluesky

La survie aux embruns marins est cruciale pour les plantes des écosystèmes côtiers, pourtant les mécanismes de résilience de ces plantes restent mal compris. Nous avons étudié ces mécanismes d'adaptation en comparant cinq paires de latitudes d'accessions de mimules jaunes, adaptées localement aux habitats côtiers et continentaux… Nos résultats suggèrent que l'adaptation des plantes aux habitats côtiers implique souvent l'évolution de mécanismes multiples de survie face au stress induit par les embruns marins.

Société botanique d'Amérique @botsocamerica.bsky.social · sur Bluesky

L'exclusion des embruns salés foliaires et la tolérance tissulaire sous-tendent l'adaptation locale aux embruns océaniques.

Nouvelle étude #AJB par @madisonplunkert.bsky.social, @pcdurant.bsky.social, @davidlowry.bsky.social et Katherine Egeler

doi.org/10.1002/ajb2...
#botanique #sciencesvégétales #mimule #Mimulus

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5. L'association des régulateurs morphogéniques BABY BOOM et GRF-GIF améliore l'efficacité de la transformation du maïs et favorise la régénération des feuilles
Chen, Z. et al. · New Phytologist · 1 publication · 22 mentions J’aime · 13 partages sur Bluesky

La transformation est un outil indispensable en génétique végétale et en génomique fonctionnelle. Bien que la transformation stable chez le maïs ne représente plus un obstacle majeur, le besoin de méthodes accessibles et efficaces pour les laboratoires de recherche demeure. Nous présentons ici le système GGB, une approche rapide et efficace optimisée pour la transformation d'embryons immatures chez B104 et d'autres lignées de maïs. Ce système combine deux régulateurs morphogénétiques distincts, la chimère GRF4-GIF1 du blé et le facteur de transcription BABY BOOM (BBM) du maïs (d'où le nom « GGB »), avec un protocole QuickCorn modifié. Il permet la régénération de plantules de maïs transformées en environ deux mois, avec une efficacité sept fois supérieure à celle obtenue avec chaque facteur morphogénétique utilisé seul.

New Phytologist @newphyt.bsky.social · sur Bluesky

L'association des régulateurs morphogéniques BABY BOOM et GRF-GIF améliore l'efficacité de la transformation du maïs et favorise la régénération des feuilles

???? nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/...
par Chen et al.

@WileyPlantSci #SciencesVégétales

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6. Identification de la carnivorie chez la plante à fleurs Saxifraga par des preuves multidisciplinaires
Zhang, XJ et al. · Communications Nature · 1 publication · 25 mentions J’aime · 9 partages sur Bluesky

La transformation de proie en prédateur est une innovation adaptative remarquable, commune à toutes les plantes carnivores, qui capturent et digèrent diverses proies animales pour en extraire des nutriments (azote, N). Nous rapportons ici un cas de carnivorie chez la plante alpine à fleurs Saxifraga candelabrum (Saxifragaceae ; Saxifragales). Des expériences de terrain et des études d’herbier révèlent que cette plante attire et capture activement des insectes grâce à ses poils glandulaires.

7. Le découplage stomatique lors des vagues de chaleur ne modifie pas le refroidissement ni la récupération des feuilles de Quercus ilex en conditions de sécheresse expérimentale de longue durée.
Gauthey, A. et al. · Physiologie des arbres · 1 publication · 18 mentions J’aime · 11 partages sur Bluesky

Nous avons étudié la physiologie foliaire et la température du couvert végétal dans un climat méditerranéen. Quercus ilex forêt exposée à plus de 20 ans d'exclusion expérimentale de la pluie, y compris lors d'une vague de chaleur intense (>40 °C). Globalement, Q.ilex On a observé un découplage stomatique en conditions de forte chaleur, mais ce mécanisme n'a permis qu'un refroidissement par évaporation limité et n'a pas empêché le dessèchement du couvert végétal. La sécheresse prolongée a principalement influencé la capacité de récupération plutôt que l'apparition du découplage lui-même.

Alice Gauthey @a-gthy.bsky.social · sur Bluesky

🌳🌡️ Notre nouvel article est paru ! Nous y démontrons que, lors de fortes chaleurs, un découplage stomatique s'est produit chez les chênes verts adultes ; cependant, ce mécanisme n'a permis qu'un refroidissement foliaire très limité 🍂

academic.oup.com/treephys/adv...

@charlottegrossiord.bsky.social
@mdekauwe.bsky.social
et bien d'autres

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8. Repenser le microbiome du noyau du sol
Lee, J. et al. New Phytologist · 2 publications · 14 mentions J’aime · 10 partages sur Bluesky

Le concept de microbiome central est issu de recherches sur les micro-organismes hôtes pour décrire les membres ou fonctions microbiens conservés au-delà de frontières spatiales, temporelles et biologiques clairement définies. Cependant, dans les recherches sur le microbiome des sols et des plantes, ce terme a progressivement évolué vers des sous-ensembles définis analytiquement et sélectionnés à l'aide de seuils ou de critères spécifiques à chaque étude. En synthétisant la littérature récente et des analyses intersites de sols de cultures bioénergétiques, nous montrons que la signification biologique originelle du microbiome central a été brouillée par des critères analytiques propres à chaque jeu de données.

New Phytologist @newphyt.bsky.social · sur Bluesky

✨ Pleins feux sur le papier ✨

(🧵 1/6) Repenser le microbiome du noyau du sol
nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/...

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9. Conception d'un domaine intégré Exo70 d'un NLR d'orge pour une meilleure résistance aux explosions
Saado, I. et al. La cellule végétale · 1 publication · 15 mentions J’aime · 10 partages sur Bluesky

Les récepteurs immunitaires intracellulaires protègent les plantes des invasions microbiennes en détectant et en répondant aux molécules effectrices d'origine pathogène, déclenchant souvent des réponses de mort cellulaire. Cependant, les effecteurs pathogènes peuvent évoluer pour échapper à la reconnaissance immunitaire, ce qui engendre des maladies dévastatrices menaçant l'agriculture mondiale. Nous montrons ici qu'un domaine Exo70 intégré du récepteur NLR (récepteur à répétitions riches en leucine et liaison aux nucléotides) intracellulaire RGH2 de l'orge peut interagir à la fois avec l'effecteur AVR-Pii du pathogène de la pyriculariose du riz et avec un variant étroitement apparenté responsable de la pyriculariose du blé.

10. Intégration des techniques omiques unicellulaires pour résoudre la complexité spatio-temporelle de la symbiose mycorhizienne arbusculaire
Ferreras-Garrucho, G., Chancelier, T., Paszkowski, U. · Journal de botanique expérimentale · 1 publication · 17 mentions J’aime · 9 partages sur Bluesky

Dans cette revue, nous récapitulons les connaissances actuelles sur le contrôle spatio-temporel de la symbiose mycorhizienne arbusculaire (AMS), évaluons la pertinence des ensembles de données spatiales existants pour la recherche sur l'AMS et proposons de nouvelles perspectives pour les études futures.

Journal de botanique expérimentale @jxbotany.bsky.social · sur Bluesky

🧬🌱 AVIS 🌱🧬

Ferreras-Garrucho et al. explorent les récents progrès méthodologiques dans les technologies unicellulaires pour décrypter la dynamique spatio-temporelle de la symbiose mycorhizienne arbusculaire, en se concentrant sur les transcriptomes végétaux et fongiques spécifiques au type cellulaire.

🔗 doi.org/10.1093/jxb/...

#SciencesVégétales 🧪

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11. Prolifération mondiale des lycophytes pleuromiens opportunistes suite à la disparition des forêts de la fin du Trias
Peng, J. et al. · npj Paléoécosystèmes · 1 publication · 21 mentions J’aime · 7 partages sur Bluesky

Les crises environnementales et les extinctions massives terrestres sont généralement suivies de bouleversements écologiques, au cours desquels des plantes opportunistes colonisent rapidement les paysages dévastés, formant des communautés « pionnières » transitoires qui précèdent l'établissement d'écosystèmes forestiers complexes. Nous identifions ici un tel schéma à la suite de l'extinction massive de la fin du Trias, il y a environ 201 millions d'années. Nous documentons la dernière occurrence mondiale des lycophytes pleuroméennes dans les strates du Jurassique inférieur (Hettangien) de Suède et démontrons les liens biologiques entre la plante mère, *Lycostrobus scottii*, et ses méga- et microspores.

12. Voir l'invisible : l'imagerie hyperspectrale ouvre une nouvelle fenêtre sur l'espace de l'économie des racines
Rewald, B. · New Phytologist · 1 publication · 15 mentions J’aime · 8 partages sur Bluesky

Les radicelles – la « moitié cachée » des plantes – régulent l’absorption et le transport de l’eau et des nutriments, sous-tendent les stratégies d’utilisation des ressources par les plantes et influencent les processus communautaires et écosystémiques. Pourtant, malgré leur importance écologique, les racines restent considérablement moins étudiées que les feuilles et les parties aériennes, notamment en raison de difficultés méthodologiques.

13. Le séquençage du génome de Valeriana officinalis révèle des gènes candidats pour la biosynthèse de l'acide valérénique et le métabolisme des flavonoïdes.
de Oliveira, JAVS, Baez, M., Pucker, B. · bioRxiv · 1 publication · 14 mentions J’aime · 8 partages sur Bluesky

Valeriana officinalis est le nom scientifique de la valériane, une plante connue pour produire de l'acide valérénique, un composé aux propriétés anxiolytiques. Les troubles anxieux constituent un problème de santé publique majeur à l'échelle mondiale, affectant le quotidien. Face à la demande croissante de traitements naturels et non synthétiques contre l'anxiété, V. officinalis apparaît comme une ressource médicinale prometteuse, mais encore sous-exploitée. Le séquençage de son génome est une étape essentielle pour élucider les gènes de biosynthèse impliqués dans la production d'acide valérénique, facilitant ainsi les recherches futures sur sa synthèse. Nous présentons ici la première séquence du génome de la valériane, avec une taille d'assemblage de 3.3 Gbp et un N50 de 110.8 Mbp, ainsi que son annotation correspondante, complète à 96.6 %, offrant une ressource fondamentale pour l'étude des bases génétiques du métabolisme spécialisé de la valériane.

14. petits ARN régulateurs bactériens ????
Papenfort, K. · Nature Examens Microbiologie · 1 publication · 21 mentions J’aime · 5 partages sur Bluesky

Dans cette revue, je résume les fonctions régulatrices des petits ARN bactériens, je décris les mécanismes moléculaires qui régissent leur expression et leurs conséquences régulatrices, et j'aborde les nombreuses questions ouvertes passionnantes concernant la régulation génique médiée par les petits ARN chez les bactéries.

15. Que nous a appris la génomique des populations sur la dynamique de la sélection et de l'adaptation des plantes ?
Gaut, BS et al. Biologie moléculaire et évolution · 1 publication · 10 mentions J’aime · 8 partages sur Bluesky

La génomique des populations a transformé notre compréhension de la manière dont la sélection naturelle façonne les génomes végétaux. L'explosion des données de reséquençage de génomes entiers a permis d'estimer la diversité nucléotidique au sein des génomes, de clarifier les interactions entre la sélection, la recombinaison et la démographie, et d'étendre les conclusions au-delà des cultures et des espèces modèles à pratiquement tous les systèmes végétaux. Dans cet article, nous synthétisons les principaux enseignements et les défis persistants concernant l'action de la sélection naturelle sur les génomes végétaux.

16. Mycohétérotrophie partielle : une stratégie courante chez les plantes mycorhiziennes arbusculaires ?
Merckx, VSFT et al. New Phytologist · 1 publication · 9 mentions J’aime · 8 partages sur Bluesky

La grande majorité des plantes terrestres transfèrent une partie du carbone organique qu'elles produisent par photosynthèse aux champignons mycorhiziens arbusculaires (MA) présents dans leurs cellules racinaires ; ces champignons, en retour, aident les plantes à absorber les nutriments et l'eau du sol. Ce carbone peut ensuite être acquis auprès des champignons mycorhiziens par de rares plantes non photosynthétiques, dites « mycohétérotrophes », qui exploitent le même réseau fongique. Cependant, des découvertes récentes suggèrent que l'absorption de carbone à partir des champignons MA pourrait également exister chez certaines plantes vertes. Si tel est le cas, elles seraient alors qualifiées de mycohétérotrophes partielles (mixotrophes) plutôt que d'autotrophes pures. Nous discutons ici des preuves évolutives, écophysiologiques, morphologiques, génétiques et environnementales de l'existence et de la prévalence de ce caractère.

17. Bioacoustique végétale : décodage des émissions ultrasonores ????
Font Bordera, P. et al. · Journal de botanique expérimentale · 1 publication · 14 mentions J’aime · 6 partages sur Bluesky

Pendant des décennies, on a considéré que les interactions entre les plantes et leur environnement étaient principalement médiées par des stimuli chimiques et visuels. Cependant, des découvertes récentes ont révélé une dimension jusqu'alors inexplorée de la physiologie végétale : les émissions ultrasonores aériennes. Cet article passe en revue les recherches actuelles en bioacoustique végétale, en s'intéressant particulièrement à la génération d'ultrasons, à leurs caractéristiques et à leur spécificité face à différents stress.

18. La stratégie mycorhizienne des plantes non indigènes varie selon le biome et les perturbations.
Cazzaniga, SG et al. Nature Ecologie & Evolution · 1 publication · 9 mentions J’aime · 7 partages sur Bluesky

Il est crucial, pour la conservation et la gestion de la biodiversité, de prédire quelles espèces végétales non indigènes s'implanteront et où. La théorie suggère que la stratégie mycorhizienne des plantes non indigènes pourrait prédire leur succès d'implantation. Nous combinons ici un ensemble de données mondial de 440 788 relevés de végétation avec des données sur le statut d'espèce indigène et le type de mycorhizes afin d'évaluer la stratégie mycorhizienne des plantes non indigènes.

19. Sélection d'espèces indicatrices éclairée par la combinaison des associations d'espèces et des réponses environnementales
Rissanen, T. et al. Applications écologiques · 1 publication · 14 mentions J’aime · 5 partages sur Bluesky

La biodiversité évolue à un rythme sans précédent, soulignant la nécessité d'un suivi écologique efficace et à grande échelle. Or, le choix des espèces à suivre demeure un défi majeur. Les espèces indicatrices peuvent fournir des indicateurs économiques des grandes tendances de la biodiversité, mais il existe un manque crucial d'approches robustes et fondées sur les données pour les identifier au sein d'écosystèmes complexes et en rapide évolution, façonnés par le climat, la gestion des terres et leurs interactions. Nous proposons une approche basée sur la modélisation pour sélectionner des espèces indicatrices potentielles afin de suivre les communautés du sous-bois boréal, composante essentielle de la biodiversité forestière, mais souvent moins surveillées que les arbres. Nous nous concentrons sur les plantes vasculaires en raison de leurs associations avec de nombreux taxons. À l'aide de modèles de distribution d'espèces conjoints, nous étudions les relations entre espèces et entre espèces et environnement à travers la Finlande, en utilisant des données nationales sur la végétation du sous-bois couvrant près de 3 000 sites d'étude répartis sur différents types de sols et zones bioclimatiques, ainsi que des facteurs environnementaux clés représentant le climat, l'habitat et la gestion forestière.

Image de couverture: Zostera muelleri novazelandica by Lloyd Esler / iNaturalist CC BY-NC