Face à la diversité époustouflante des êtres vivants, des compromis sont faits et les efforts de recherche concentrés sur quelques espèces sélectionnées – dites «organismes modèles' - dans l'espoir que les découvertes biologiques faites dans ceux-ci seront plus largement applicables à d'autres de leur espèce. En conséquence, nous avons des animaux modèles, tels que la mouche des fruits et le poisson zèbre, et des plantes modèles, telles que l'arabette et le riz. Nous avons aussi le modèle les systèmes, qui nous permettent de focaliser l'attention sur des processus particuliers ou des voies biochimiques plutôt que sur l'ensemble de l'organisme. Un bon exemple du monde végétal est la lignée cellulaire du tabac connue sous le nom de BY-2. Celle-ci a été établie à partir d'un cal induit sur un semis de la Nicotiana tabacum cultivar BY-2, et est utilisé comme système modèle pour les plantes supérieures en raison de son «homogénéité exceptionnellement élevée». Si vous avez consacré une grande partie de votre carrière à travailler avec ce système, vous savez probablement déjà qu'Ales Kovarik et al. ont récemment publié un papier intitulé « Une culture végétale (BY-2) largement utilisée dans les études moléculaires et cellulaires est génétiquement instable et très hétérogène ». Apparemment, et conformément à d'autres cultures à long terme, BY-2 existe "en tant que communauté de cellules avec différents caryotypes reflétés dans différents nombres de chromosomes, morphologies et distributions de répétitions satellites". Mauvaise nouvelle, en effet ! Heureusement, cependant, aucun problème de ce type avec Arabidopsis. Eh, qu'est-ce que tu dis, Skippy? Il y a!!?? Oh cher. Il y a quelque temps, Alison Anastasio et al. annoncé erreur d'identification généralisée parmi Arabidopsis adhésions. Sur les 5965 accessions qu'ils ont examinées, ils ont conclu que 286 méritaient une "attention particulière" car potentiellement mal identifiées. Les plus courageux d'entre vous peuvent lire le reste de l'article, mais c'est une 'nouvelle' effrayante pour ceux d'entre nous qui peuvent accepter aveuglément comme des truismes tous les 'traités sur le cresson de thale'. Eh bien, tout n'est peut-être pas perdu (pour ainsi dire) pour les utilisateurs de BY-2 et d'arabidopsis. Jeroen Nieuwland et al. ont annoncé 'Phytotracker', un système d'information de gestion de laboratoire 'spécifiquement pour organiser et suivre les plasmides, les graines et les plantes en croissance qui peuvent être utilisés dans des environnements de plate-forme mixtes'. Bien qu'il ait été développé dans un environnement de génétique moléculaire d'Arabidopsis, les auteurs disent qu'il peut être facilement adapté à «presque toutes les recherches en laboratoire sur les plantes» - même BY aussi, je suppose.
