Génomes plastidiques et relations chez les Zingiberales
Génomes plastidiques et relations chez les Zingiberales

L'ordre des Zingibérales, un groupe d'angiospermes tropicales, comprend huit familles de monocotylédones tropicales et environ 2 500 espèces. Ces dernières auraient connu une radiation évolutive rapide et ancienne au Crétacé. Les Zingibérales présentent une grande diversité morphologique florale, et plusieurs de leurs membres sont importants sur les plans écologique et économique, comme le gingembre, la cardamome, le curcuma, le galanga, la banane et le plantain. Les relations phylogénétiques profondes entre les lignées primaires des Zingibérales se sont avérées difficiles à établir dans les études précédentes, ce qui représente une zone d'incertitude majeure dans l'arbre phylogénétique des monocotylédones. Bien que les Zingibérales constituent un clade diversifié de huit familles, les relations phylogénétiques profondes au sein de ces familles restent mal connues.

Un article récent dans Annals of Botany utilise le séquençage de nouvelle génération pour générer des ensembles complets de gènes de plastes et constate que les génomes de plastes fournissent un support solide pour de nombreuses relations, mais seulement un faible support pour l'inclusion de l'ordre des Heliconiaceae. La manipulation de diverses propriétés de la matrice de données affecte la topologie des arbres de manière imprévisible, ce qui suggère que les régions codantes complètes du plastome ne fournissent pas suffisamment d'informations sur les caractères pour résoudre ce rayonnement rapide et ancien.

Barrett, CF, Specht, CD, Leebens-Mack, J., Stevenson, DW, Zomlefer, WB et Davis, JI (2014) Résoudre les radiations anciennes : les ensembles de gènes de plastes complets peuvent-ils élucider les relations profondes entre les gingembres tropicaux (Zingiberales) ? . Annals of Botany, 113 (1), 119-133.