Les relations phylogénétiques dans la tribu Shoreeae écologiquement et économiquement importante présentent un problème de longue date dans la systématique des Dipterocarpaceae. Heckenhauer et coll. utiliser l'écrémage du génome basé sur le séquençage de nouvelle génération (NGS) pour obtenir des séquences complètes du génome des plastides de la tribu.
L'équipe a utilisé avec succès des analyses phylogénomiques de l'ensemble des génomes des plastes pour déduire les relations phylogénétiques entre les genres et les groupes de Shorea sensu Ashton. Discordance dans le placement de Parashore Une discordance a été observée entre les arbres phylogénétiques obtenus à partir d'analyses de plastomes et ceux issus d'ensembles de données d'ADN nucléaire précédemment disponibles. Cette discordance pourrait indiquer une hybridation ancienne ou un tri de lignée incomplet.
Dans leur commentaire, Olmstead et Dvorsky Depuis que nous construisons des arbres de relations évolutives à partir de séquences d'ADN chez les plantes, les auteurs ont pu se décharger de la responsabilité de la résolution des conflits sur les générations futures, ou du moins sur des études ultérieures, en suggérant qu'avec davantage de taxons et de données de séquences, les relations deviendraient claires. Que se passera-t-il lorsque nous arriverons au bout du chemin ? Dans cette étude, un excellent échantillonnage représentatif est évalué pour les séquences complètes du génome plastidial ET les données de représentation réduite du génome nucléaire dérivées de RADseq, soit près de 20 000 loci et plus de 100 000 SNP. Malgré l'ampleur des données, le conflit entre les arbres phylogénétiques chloroplastiques et nucléaires persiste. Les auteurs doivent spéculer sur les raisons de ce conflit.
Heckenhauer et ses collègues concluent : « Étant donné l’importance économique et écologique de la tribu Shoreeae, les études phylogénétiques moléculaires doivent désormais inciter à la recherche de caractères diagnostiques, une condition préalable nécessaire à toute révision systématique et taxonomique. »
