On sait que les microbes du sol peuvent aider les plantes à lutter contre les ravageurs. Maintenant recherche publiée dans New Phytologist montre que les plantes peuvent être utilisées pour créer des microbiomes anti-parasitaires. Ces collections de microbes peuvent être introduites dans de nouveaux sols, où elles peuvent protéger d'autres plantes. « Des stratégies écologiques sont nécessaires pour améliorer la durabilité de nos systèmes agricoles, et notre étude souligne que le sol est un élément clé », écrivent Ana Pineda et ses collègues dans leur article.
L'une des histoires de la dernière décennie a été de mieux comprendre comment les microbes du sol peuvent aider les plantes à se défendre contre les attaques d'agents pathogènes et d'herbivores. Pineda et ses collègues ont suivi la recherche, mais lorsque vous travaillez avec quelques souches microbiennes, les résultats peuvent être incohérents. "Une approche alternative consiste à se concentrer sur le microbiome complet", écrivent les auteurs. "Plusieurs auteurs ont fait valoir que l'introduction de communautés de sol plus complexes, plutôt que d'espèces / souches uniques, est nécessaire pour atteindre amélioration constante of protection des cultures, mais jusqu'à présent, les preuves de résistance contre les herbivores déclenchées par un tel microbiome ou par une seule souche microbienne fonctionnant dans une communauté microbienne complexe sont rares.
L'équipe a entrepris d'obtenir certaines de ces preuves en utilisant des plantes pour créer un microbiome bénéfique. L'expérience consistait à utiliser certaines plantes pour façonner un microbiome qui conférerait une protection à une autre plante lors du transfert du microbiome.
Ils ont utilisé un mélange de quatre espèces de graminées et de quatre espèces de plantes herbacées pour créer une communauté microbienne dans le sol qui avait bénéficié au chrysanthème lors d'expériences antérieures. En effet, l'équipe a utilisé les plantes pour cultiver les microbes pour elles. Ensuite, ils devaient trouver si ces microbes, et non les plantes, aidaient les chrysanthèmes à combattre les herbivores.
Pineda et ses collègues ont stérilisé du sol, puis introduit du sol avec les microbiomes préparés pour coloniser le nouveau sol. Ils avaient des chrysanthèmes dans le sol qui auraient maintenant dû bénéficier d'une protection accrue contre les attaques d'herbivores. Pour savoir si c'était le cas, ils ont introduit des thrips, Frankliniella occidentalis, et les tétranyques, Tetranychus urticae, pour attaquer les chrysanthèmes.
Les résultats ont été positifs mais mitigés.
« Le nombre de thrips sur les plants de chrysanthème a été fortement réduit par l'inoculation du sol. Moins de thrips ont été observés sur les plantes poussant dans un sol conditionné par la graminée AP et la herbacée RA, que sur les plantes poussant dans un sol stérilisé. Le groupe fonctionnel des plantes qui ont conditionné les inocula, cependant, n'a pas affecté le nombre de thrips sur le chrysanthème », écrivent Pineda et ses collègues.
Cependant, le sol n'a pas aidé les plantes à se défendre contre les tétranyques. De plus, les chrysanthèmes se sont également mis au travail en modifiant le microbiome, tout comme les plantes herbacées et les graminées utilisées pour créer les échantillons de test. Ils ont également constaté que les plantes herbacées étaient plus utiles pour créer des communautés bénéfiques que les graminées.
Malgré le mélange des résultats, l'équipe affirme que le travail montre la preuve de concept. Les prochaines étapes consisteront à voir comment obtenir des résultats plus prévisibles. "Un défi majeur est de savoir comment sélectionner des plantes de conditionnement qui créent des microbiomes de sol bénéfiques qui réduisent constamment les ravageurs et favorisent la croissance des plantes, dans le contexte de microbiomes de sol très diversifiés et variables", concluent Pineda et ses collègues. "Par conséquent, le" Saint Graal "dans la recherche sur la résistance des plantes induite par le microbiome est de trouver des espèces végétales qui modifient le microbiome du sol de manière prévisible et souhaitable."
