Nom : Ray-grass vivace
Nom scientifique: Lolium Perenne L.
Connu pour: Être une herbe fourragère super délicieuse pour les ruminants au pâturage et appréciée comme gazon pour les sportifs dans les climats tempérés du monde
Record battu : Deux génomes en parallèle !
Le ray-grass n'est pas spectaculaire à première vue. Si vous vivez dans un climat tempéré, vous l'avez probablement déjà foulé sans même y prêter attention. Son importance réside dans sa valeur commerciale. Il fournit un fourrage de haute qualité pour les ruminants comme les vaches laitières, et les amateurs de viande apprécieront particulièrement la qualité supérieure de la viande produite grâce à un fourrage pluvial. De plus, les ventes de graminées à gazon, dont l'une des variétés de ray-grass vivace, arrivent au deuxième rang en termes de valeur commerciale après les semences de maïs aux États-Unis.
En 2016, non pas un mais deux brouillons du génome de l'ivraie vivace ont été générés (Byrne et al. 2015; Velmurugan et Mollison et al. 2016), suivant des stratégies assez similaires pour fournir des ressources indispensables à la sélection génomique de cette espèce végétale à pollinisation croisée. La préparation de ces brouillons de génome n'était pas une tâche anodine, puisque la taille du génome de l'ivraie est près de plus de la moitié de celle de l'énorme génome de l'orge (5100Mb : Consortium international de séquençage du génome de l'orge 2012). La taille estimée du génome était de 2068 76 Mb, et 54 % du génome était considéré comme répétitif. Les deux génomes provisoires couvrent désormais respectivement 40 % et XNUMX % de la taille estimée du génome du ray-grass anglais.
Bien que les deux équipes soient relativement petites, les progrès des technologies de séquençage et l'amélioration des outils bioinformatiques ont permis l'impensable il y a moins de dix ans. La plupart des domaines du codage génétique sont désormais bien couverts, et les deux génomes constituent une ressource précieuse pour comparer les génomes des lignées consanguines de cette espèce.
Cela ouvre également de nouvelles possibilités d’utiliser les deux génomes pour l’amélioration génétique de cette espèce de fourrage et de gazon à pollinisation croisée. Velmurugan et Mollison et al. (2016) fournir un ancrage du génome à la carte de densité génétique la plus élevée disponible de ray-grass vivace, et fournir également un accès facile au génome avec un navigateur de génome.
