Le genre Allium L., l'un des plus grands genres monocotylédones et qui comprend de nombreuses cultures économiquement importantes ayant une valeur nutritionnelle et médicinale, a fait l'objet d'études de classification ou de phylogénie pendant des siècles. Des études récentes ont suggéré que le genre peut être divisé en 15 sous-genres et 72 sections, qui ont ensuite été classés en trois lignées évolutives. Cependant, les relations phylogénétiques reconstruites par un ou deux loci ont montré un soutien plus faible, en particulier pour la troisième lignée évolutive, qui pourrait ne pas montrer très clairement les relations entre les espèces et pourrait entraver une étude adaptative et évolutive plus poussée.

Relations phylogénétiques, morphologies des fleurs et caractéristiques chromosomiques des espèces d'Allium recueillies dans cette étude. Source. Xié et al. 2020.

Deng-Feng Xie et ses collègues recueilli un total de 39 génomes complets de chloroplastes de Allium (couvrant 12 Allium sous-genres), et en les combinant avec 125 espèces de plastomes de 19 autres familles de monocotylédones, nous avons reconstruit la phylogénie du genre Allium, a estimé l'origine et le temps de divergence des trois lignées évolutives et a étudié l'évolution adaptative dans ce genre et les familles apparentées.

Leurs résultats ont détecté une relation phylogénétique bien étayée de Allium. Les PSG et les PSG avec des valeurs Ka/Ks élevées, ainsi que des morphologies diversifiées, des caractéristiques chromosomiques compliquées et des modes de reproduction uniques peuvent jouer un rôle important dans l'adaptation et l'évolution de Allium espèces. Il s'agit de la première étude qui a mené des analyses phylogénétiques et évolutives sur le genre Allium combiné avec le plastome et les données morphologiques et cytologiques. L'équipe espère que cette étude pourra contribuer à une analyse plus approfondie de Allium pour les autres chercheurs.