
Dans les temps anciens - par exemple au 19ème siècle - la science était gravement entravée par le manque de technologie pour réaliser les expériences que ces messieurs (désolé mesdames...) des XXe et XXIe siècles, riches de visions et d'imagination. Aujourd'hui, nous disposons d'un arsenal inégalé de techniques et d'équipements pour tester nos hypothèses (c'est souvent notre imagination qui nous trahit…). Mais cela ne signifie pas que nous ne pouvons pas utiliser encore plus de méthodes et d'équipements nouveaux. Voici donc un aperçu des développements récents et des technologies révolutionnaires en biologie végétale.
Alors que les hormones (régulateurs de croissance des plantes?…) ne contrôlent pas tout la botanique, ce sont des acteurs majeurs dans la coordination de la croissance et du développement. Il serait donc utile de pouvoir voir où ils se trouvent en plante. Eh bien, Géraldine Brunoud et al. rapport un "nouveau capteur pour cartographier la réponse et la distribution de l'auxine à haute résolution spatio-temporelle". Entre autres choses, cette méthode "fournit une carte de la distribution relative de l'auxine à résolution cellulaire dans différents tissus". La méthode a été exploitée à bon escient dans démontrer que «le gravitropisme racinaire est régulé par un gradient d'auxine latéral transitoire contrôlé par un mécanisme de point de basculement». Marre de l'ennui des sous-cultures hebdomadaires de suspensions de cellules végétales ? Eh bien, ne vous inquiétez plus : Anne-Marie Boisson et al. rapport « une méthode simple et efficace pour la conservation à long terme des cultures de cellules végétales en suspension ».
Trop occupé à chercher votre prochain poste postdoctoral pour résoudre vous-même les structures des protéines ? Crowdsource il! C'est ainsi que le problème encore non résolu après plus de 10 ans d'étude du repliement d'une protéine a été abordé, par une armée d'assistants de laboratoire virtuels jouant au "jeu du repliement des protéines", Plie le – 'un jeu vidéo de réflexion en ligne sur le repliement des protéines'. D'accord alors ce travail a en fait été fait avec "une protéase rétrovirale du virus du singe Mason-Pfizer, qui provoque une maladie semblable au SIDA chez les singes", mais le principe est sûrement le même pour les protéines végétales. Envieux de la facilité avec laquelle vos collègues travaillent avec Nicotiana benthamiana peut effectuer Agrobacterium-transformation transitoire par infiltration foliaire ? Pas plus! Kenichi Tsuda et al. présenter un protocole pour un "efficace Agrobacterium-transformation transitoire d'Arabidopsis'. Je sais, et tu pensais qu'on pouvait TOUT faire avec Arabidopsis, déjà. Eh bien, on dirait que nous pouvons maintenant ! Et de nombreuses méthodologies et techniques de mesure à haute résolution sont présentées / examinées dans un numéro spécial de notre journal préféré sur les plantes [second-favori, sûrement ? – Ed.], et un éditorial utile vue d'ensemble est fourni par Asaph Aharoni et Federica Brandizzi. Une contribution qui a attiré mon attention était Ljudmilla Borisjuk et al. "Sondager le monde végétal par imagerie par résonance magnétique", qui montre l'ingéniosité du botaniste dans l'adoption et l'adaptation d'un technique plus généralement associée aux applications biomédicales.
Avant-dernier, Guido Grossmann et al. présenter le Puce racine – « une puce microfluidique intégrée pour la science végétale », qui vise à surmonter les problèmes reconnus d'étude du développement et de la physiologie des racines en croissance. Le RootChip intègre l'imagerie des cellules vivantes de la croissance et du métabolisme de Arabidopsis thaliana Les racines se développent rapidement en fonction des conditions environnementales et peuvent supporter plusieurs racines issues de plusieurs semis en parallèle. Tel que présenté, cela paraît impressionnant, mais ai-je tort de penser que les racines ont tendance à pousser dans l'obscurité, en pleine terre ? L'image accompagnant l'article montre des racines dans des tubes en plastique transparent, dans un laboratoire bien éclairé. Peut-être est-ce simplement à titre d'illustration, et les mesures significatives, etc., sont effectuées lorsque les racines sont dans leur état d'origine, obscurci.
Enfin, reconnaissant que la capacité de quantifier la géométrie des organes végétaux à l’échelle cellulaire peut fournir de nouvelles perspectives sur leur organisation structurelle, Andrew French et al. présenter un outil pour compter et mesurer les cellules voisines individuelles le long d'un fichier défini dans des images de microscope confocal à balayage laser. Entre autres utilisations, l'outil Cell-o-Tape peut être utilisé pour fournir une estimation de la position de transition dans la zone d'allongement d'un Arabidopsis racine – un emplacement apparemment « sensible » à la subjectivité de l'expérimentateur. Toute une liste – qui n'est en aucun cas exhaustive ! – mais, mon préféré est… Cell-o-Tape. Et je m'y tiens !
