Cette étude présente un nouveau modèle combinant deux maladies fongiques du blé, causées par Zymoseptoria tritici (septorie) et Puccinia triticina (rouille brune), avec un modèle de plante fonctionnelle-structurelle (FSP) du blé. La plupart des modèles épidémiologiques se concentrent sur un seul type d'agent pathogène, ignorant les interactions entre différents parasites fongiques en compétition sur le même hôte et l'impact des propriétés de la canopée sur eux.

Croissance d'une seule lésion de Z. tritici (A) et P. triticina (B) simulée avec le modèle 1.
Croissance d'une lésion unique de Z. tritici (A) et P. triticina (B) simulée avec le modèle 1. À gauche : pixels colonisés par la lésion après différents temps. À droite : dynamique de croissance de la lésion au cours du temps (exprimée en degrés-jours : °Cd).

Garin et al. ont simulé ces processus de l'échelle de la feuille à l'échelle de la canopée 3D pour explorer les interactions dynamiques complexes entre ces agents pathogènes et la plante dans diverses conditions. L'utilisation de la modélisation FSP aide à comprendre comment les propriétés de la canopée influencent le développement d'agents pathogènes concurrents.

Ce papier fait partie de la Annals of Botany Numéro spécial sur la modélisation fonctionnelle-structurelle de la croissance des plantes. Il sera en accès libre jusqu'en juin 2018, puis disponible uniquement aux abonnés jusqu'en avril 2019, date à laquelle il sera à nouveau en accès libre.