Cartographie des zones de développement à l'apex de la racine à l'aide de l'algorithme de changement structurel multiple

Botanique

07 novembre 2016 - 1 min de lecture

Dans l'apex racine, la longueur de la cellule est fonction de sa position dans un fichier de cellule. Appliquer une approche mathématique utilisant un algorithme de changement structurel multiple (MSC), Pacheco-Escobedo et al. ont développé un modèle spatial pour identifier que la partie croissante de la racine d'Arabidopsis est composée de trois zones de développement distinctes : le domaine de prolifération (PD), le domaine de transition (TD) et la zone d'élongation (EZ).

Détermination de la frontière PD/TD dans la ligne CCS52A1:GUS en utilisant l'approche MSC ; L'expression de GUS marque le début de l'endoréduplication. (A–J) L'expression de CCS52A1:GUS dans les racines wt (7 DAS) se produit dans le TD et l'EZ. Les rectangles jaunes indiquent l'IC à 95 % de la position de la dernière cellule PD estimée par l'approche MSC. Barre d'échelle = 50 μm.

Le PD et le TD comprennent le méristème apical de la racine (RAM). L'approche MSC permet une détermination sans ambiguïté, rapide et automatisée des limites RAM/EZ et PD/TD. Cet outil accessible au public facilite le phénotypage des racines de différents fonds génétiques et des traitements expérimentaux.