En cette période sans précédent d'extinction des plantes, de blogs générés par l'IA et de confusion quant à la fiabilité des informations en ligne, Botany One se lance dans une mission avec son premier numéro spécial consacré à la botanique numérique.

Nous publierons trois articles par semaine, consacrés à la botanique numérique, tout au long du mois de juin. En collaboration avec la communauté, nous avons commandé 12 articles à 8 auteurs, avec le soutien d'un rédacteur invité (moi-même), de deux rédacteurs et d'un producteur. Notre équipe a contacté une trentaine de personnes, notamment par le biais de conversations, de courriels et de sondages en ligne, afin de recueillir les avis de scientifiques, de spécialistes de la conservation, de gestionnaires de données, d'experts en numérisation, d'artistes et de personnes travaillant avec des collections.

À une époque où les blogs génériques générés par l'IA pullulent, nous souhaitions proposer une approche plus concrète : dialoguer avec de vraies personnes, suivre un travail réel et raconter des histoires avec contexte, attention et curiosité. Derrière chaque base de données, chaque spécimen scanné, chaque enregistrement nettoyé, chaque résultat de modélisation ou chaque carte, il y a des personnes qui prennent des décisions, résolvent des problèmes et s'efforcent de rendre le savoir plus utile.

Tous nos efforts convergent vers Kew. Symposium sur l'état des plantes et des champignons dans le mondeLa conférence, qui débutera le 29 juin à Kew et en ligne, réunira une communauté exceptionnelle afin d'analyser les données et de réorienter les efforts mondiaux pour sauver, conserver et soutenir les plantes et les champignons à travers le monde. Le symposium de 2026 portera sur ce que Kew appelle le Révolution numérique de la biodiversitéL’effort considérable déployé pour numériser les collections, débloquer les données et utiliser ces ressources pour répondre aux questions scientifiques, environnementales et sociétales est au cœur de notre démarche. Ce numéro est également lié au symposium des rédacteurs en chef de New Phytologist. Collections à travers le temps : héritage et innovation, qui se tiendra le vendredi 3 juillet 2026 à l'Université de Tartu, en Estonie.

Le État des plantes et des champignons du monde L'état des plantes et des champignons dans le monde est l'une des principales initiatives scientifiques mondiales de Kew. Il évalue nos connaissances sur la diversité des plantes et des champignons sur Terre, les menaces qui pèsent sur eux, ainsi que les politiques et les actions nécessaires pour les protéger. Les rapports précédents ont rassemblé des centaines de scientifiques de nombreux pays, démontrant l'importance de la collaboration pour comprendre, protéger et utiliser la biodiversité de manière responsable. Botany One suit l'état des plantes et des champignons dans le monde depuis plusieurs années (même depuis 1980). 2017, 2018, 2020), couvrant à la fois les preuves alarmantes concernant l'extinction des plantes et les histoires porteuses d'espoir sur la façon dont les plantes et les champignons peuvent contribuer à relever les défis mondiaux.

Notre problématique coïncide également avec celle de Kew. Numérisation des collections de Kew Ce projet, qui a représenté un effort incroyable pour numériser des millions de spécimens collectés à travers le monde au fil des siècles, souligne l'importance des collections. J'ai eu la chance de passer beaucoup de temps dans les herbiers de Kew et du monde entier, où ouvrir chaque armoire, chaque dossier ou chaque boîte est comme ouvrir un nouveau coffre aux trésors d'histoires.

Bien que les collections soient liées à colonialisme, L’élitisme et les privilèges méritent une réflexion approfondie. Il est essentiel de reconnaître l’origine de ces connaissances, de protéger les informations sensibles et de permettre… restitution et rapatriementet veillons à ne pas répéter les erreurs du passé, et bâtir une communauté botaniste inclusive à l'avenirLes collections scientifiques du monde entier révèlent des informations sur les plantes et les champignons, mais aussi sur les liens essentiels qui unissent l'humanité à notre monde et aux autres. Un spécimen n'est pas qu'une plante séchée ou un sachet rangé dans une vitrine. Il recèle des informations sur son lieu de croissance, son collecteur, son nom, la langue utilisée pour le décrire, les connaissances locales à son sujet, son parcours au sein des institutions et l'évolution de sa signification au fil du temps. La numérisation permet à un public plus large d'accéder à ces collections exceptionnelles, et c'est une avancée majeure. Cependant, la numérisation est aussi un travail de longue haleine : elle implique la mise en place de processus, la vérification des noms, la gestion des images, la prise en compte des incertitudes et la garantie d'une utilisation correcte et responsable des collections et de leurs données.

Pour raconter ces histoires, nous aborderons quatre phases des collections numériques : leur origine, la constitution de ces coffres aux trésors, les histoires cachées qu’elles renferment, et enfin leur mise à l’échelle – comment nous appliquons les connaissances que nous en tirons.

Nous commencerons par examiner comment les plantes deviennent des données – comment un spécimen, une note de terrain, une image, une observation ou une donnée locale intègre le monde scientifique. Nous aborderons ensuite le travail de numérisation proprement dit : le travail minutieux et pratique d’imagerie, de transcription, de création de bases de données, de vérification des noms, de mise en place de flux de travail et de sécurisation des collections. Nous entendrons des témoignages de personnes qui réfléchissent attentivement aux étapes complexes entre la collecte sur le terrain, l’enregistrement, l’étiquetage, la taxonomie, etc. métadonnées et les archives numériques sur lesquelles s'appuieront les futurs chercheurs et décideurs. Nous examinerons les techniques, les outils, les logiciels et les équipements qui rendent la numérisation possible, ainsi que les petites décisions qui peuvent faire qu'une collection numérique devienne véritablement utile ou simplement une archive en ligne désordonnée. Nos articles présenteront une multitude de bases de données mondiales, régionales, nationales et institutionnelles, et reconnaîtront l'immense valeur de… INaturalist observations (continuez à l'utiliser, tout le monde !). Nous explorerons également des outils numériques plus importants, notamment Wikidata, l'IA et la taxonomie accélérée, en se demandant comment de nouvelles approches peuvent aider les botanistes à relier des informations éparses sans perdre l'expertise et le jugement qui donnent du sens aux données.

De là, nous ouvrons un peu plus les vitrines pour explorer les histoires cachées que les collections peuvent révéler, de ethnobotanique et Collections de champignons et rôle des femmes en mycologie et botanique et l'histoire humaine contenue dans les spécimens. Une fois les collections numérisées, elles peuvent être recherchées, comparées, cartographiées et reliées entre elles d'une manière inédite. Notre numéro spécial proposera de nombreux entretiens passionnants. Comment les données des herbiers peuvent être révélatrices pour suivre et prédire l'évolution et la répartition des plantesIl ne s'agit pas simplement de vieux documents transformés en données modernes. Il s'agit d'histoires qui redeviennent visibles.

Enfin, nous élargissons notre champ d'action et nous demandons comment les collections numériques peuvent appuyer les décisions prises sur le terrain. Les données sont omniprésentes, dispersées sur le web, mais leur utilisation pertinente dépend toujours du contexte, du jugement et de la compréhension des réalités pratiques qui sous-tendent les priorités en matière de conservation. ensembles de données phénologiques mondiaux sur les plantes (construit à l'aide de l'apprentissage automatique pour traiter 70 millions d'images d'échantillons), en cours de développement Plantes pour la santé base de données et identification de Espèces évolutivement distinctes et menacées à l'échelle mondiale (EDGE) nous explorerons comment la botanique numérique peut aider à transformer des données éparses en priorités de conservation, notamment en ce qui concerne les espèces. conservation des plantes menacées au Mexique. 

N'oublions pas que nous ne parlons pas seulement d'herbiers. Vous découvrirez les banques de gènes, véritables trésors de cultures et de leurs espèces sauvages apparentées. Ces collections sont essentielles à la sécurité alimentaire, à la résilience des cultures et à l'avenir de l'agriculture. Nous explorerons également le rôle des collections de champignons, encore trop souvent négligées malgré leur importance capitale pour les écosystèmes, l'alimentation, les maladies, la médecine et la résilience climatique. Vous apprendrez aussi comment les collections numériques ont inspiré des artistes qui les partagent avec le grand public. La botanique numérique ne se résume pas aux bases de données et aux algorithmes ; elle fait aussi appel à l'imagination.

Ce numéro met également à l'honneur les personnes qui contribuent aux collections. Non seulement les scientifiques et les conservateurs, mais aussi les bénévoles, les techniciens, les étudiants, les contributeurs communautaires, les citoyens scientifiques, les photographes, les personnes chargées du nettoyage des données, les développeurs de logiciels et celles qui montent les spécimens, transcrivent les étiquettes et ajoutent des observations via des plateformes comme iNaturalist. Ces contributions, souvent discrètes et parfois invisibles, participent pourtant à la construction de la connaissance mondiale de la biodiversité.

Bien qu'il reste beaucoup à faire, heureusement, de nombreuses personnes formidables œuvrent discrètement à travers le monde pour préserver, numériser, connecter et transformer le monde. Elles prennent soin de spécimens, préservent des semences, nettoient des données, conçoivent des processus, programment, créent des cartes, posent des questions essentielles, interrogent les communautés, forment d'autres personnes et transforment les connaissances dispersées en ressources utiles.

Nous devons agir avec efficacité, intelligence et collaboration. La botanique numérique ne vise pas à remplacer l'émerveillement que nous éprouvons pour les plantes et les champignons par des données. Au contraire, elle nous permet de partager cet émerveillement plus largement, de mieux répartir les connaissances et de prendre des décisions plus éclairées pour notre belle planète.

Donc "cher et tendre lecteur, J'espère que vous apprécierez ce formidable travail d'équipe de Botany One au cours du mois prochain, et n'hésitez pas à partager notre travail largement.

LIRE LA SUITE:

Dinnage R, Grady E, Neal N, et al.. 2025. PhenoVision : un cadre pour automatiser et fournir des données phénologiques végétales prêtes à la recherche à partir d’images de terrain. Méthodes en écologie et évolution 16: 1763-1780. https://doi.org/10.1111/2041-210x.70081

Fonseca-Kruel contre, Coimbra CEA, Estevão da Silva LA, et al.. 2025. Lier tradition et technologie : la numérisation de la collection ethnobotanique du jardin botanique de Rio de Janeiro. Plantes, gens, planète. https://doi.org/10.1002/ppp3.70105

Forêt F, Brown R, Buerki S, et al.. 2026. Risque élevé d'extinction pour l'ensemble de l'arbre de vie des plantes à fleurs. Science 392: 655-659. https://doi.org/10.1126/science.adz0773

Kreuzer C, Ridley GS, Smith NEC. 2026. La numérisation comme intermédiaire archivistique : quantification et qualification des réseaux de collecteurs mycologiques de Greta B. Stevenson. Plantes, gens, planète. https://doi.org/10.1002/ppp3.70173

Mabry ME, Caomhanach N, Abrahams RS, et al.. 2024. Construire une botanique inclusive : le rêve « radical ». Plantes, Humains, Planète. 6: 544-557. https://doi.org/10.1002/ppp3.10478

Parc DS, Feng X, Akiyama S, et al.. 2023. L'héritage colonial des herbiers. Comportement humain de nature 7: 1059-1068. https://doi.org/10.1038/s41562-023-01616-7

von Mering S, Leachman S, Santos J, Meudt HM. 2025. Wikidata pour les botanistes : avantages de la collaboration et du partage des données ouvertes liées. Annals of Botany 136: 491-511. https://doi.org/10.1093/aob/mcaf062

Moi blanc, Harris SA. 2026. Regarder en arrière pour mieux avancer : améliorer les métadonnées des collections scientifiques grâce à la collaboration interdisciplinaire. Plantes, Humains, Planète. https://doi.org/10.1002/ppp3.70200

Profil de l'auteur invité

Juniper Kiss est une botaniste globe-trotteuse et passionnée de données, rédactrice invitée pour Botany One et ancienne écrivaine, qui aime les jolis jardins, les solutions numériques, travailler avec les propriétaires fonciers, les ronces et les bananes.

Photo de couverture par Georg Andreas Helwing (Wikimedia Commons, Domaine public).