Le Domaine indéterminé (IDD) sont une sous-classe spécifique aux plantes des facteurs de transcription C2H2 Zinc Finger. Certains de ces facteurs de transcription jouent un rôle dans divers aspects du métabolisme et du développement des plantes, mais la fonction de la plupart des gènes IDD est inconnue et l'évolution moléculaire de la sous-famille n'a pas été explorée en détail. Prochetto et Reinheimer extrait des séquences génomiques disponibles de plantes vertes (Viridiplantae) pour reconstruire la phylogénie, puis décrit les motifs/modèles d'expression des gènes IDD.

Image: canva.

Les auteurs ont identifié l'ensemble complet des gènes IDD de 16 génomes de Streptophyta. Ils ont découvert que IDD et son clade sœur STOP étaient issus d'une duplication à la base de Streptophyta. Une fois sur terre, les gènes IDD se sont largement dupliqués, donnant naissance à au moins dix lignées. Certaines de ces lignées ont été perdues dans les plantes non vasculaires et les gymnospermes existantes, mais toutes ont été conservées dans les angiospermes, se dupliquant profondément chez les dicotylédones et les monocotylédones et acquérant, en même temps, une hétérogénéité surprenante dans leurs régions C-terminales et leurs modes d'expression.

IDD étaient présents dans le dernier ancêtre commun de Streptophyta. Sur terre, IDD a largement dupliqué dix lignées d'origine. Plus tard, les IDD ont été recrutés par les angiospermes où ils se sont considérablement diversifiés en nombre; C-terminal et modèles d'expression accompagnant des aspects importants de l'évolution du corps végétal. Cette étude fournit un cadre solide des relations d'orthologie des facteurs de transcription IDD des plantes terrestres vertes, augmentant ainsi la précision de l'identification orthologue chez les espèces modèles et non modèles et facilitant l'identification de gènes agronomiquement importants liés au métabolisme et au développement des plantes.