
in silico Plantes (isP) fournit une maison unique pour la recherche en modélisation végétale, publiant des recherches interdisciplinaires, pluridisciplinaires et transdisciplinaires à l'interface entre les mathématiques, l'informatique et la biologie végétale. La revue publie des travaux qui décrivent les réseaux de gènes végétaux, la synthèse des protéines, les voies métaboliques, la physiologie et la croissance en utilisant la modélisation mathématique et conceptuelle, l'analyse des systèmes, les simulations informatiques et la visualisation.
Les sujets des articles publiés par isP aujourd'hui incluent:
- l'introduction d'un nouvel outil relie des modèles de différentes langues et échelles pour créer des plantes, des champs ou des régions entières in silico;
- un examen de la façon dont le développement de cultures à haut rendement peut être accéléré en utilisant des modèles phénomiques, génomiques et systémiques en combinaisonet
- une évaluation de la capacité d'un modèle générique de répartition de la biomasse à prédire des schémas temporels précis de répartition de la biomasse et de l'azote.
La revue est gérée par le Annals of Botany Société , une organisation caritative éducative à but non lucratif créée pour promouvoir la phytologie dans le monde entier.
Vous pouvez également vous tenir au courant de tous les aspects de la modélisation des parcelles à partir d'isP et d'autres sources en suivant le blog Botany One produit par The Annals of Botany Entreprise. Vous pouvez également suivre in silico Plantes sur sa page Twitter.
Rencontrez les rédacteurs
Dr Graeme Hammer est professeur en sciences des cultures et directeur du Centre des sciences des cultures de l'Alliance du Queensland pour l'innovation agricole et alimentaire (QAAFI), qui est un institut de recherche de l'Université du Queensland, en Australie. Il mène des recherches sur la physiologie et la génétique de traits adaptatifs complexes dans les grandes cultures, en mettant l'accent sur la productivité de l'eau dans les céréales. Ses recherches sous-tendent le développement de modèles mathématiques de la croissance, du développement et du rendement des cultures qui permettent de simuler les conséquences de la manipulation génétique et de la gestion des cultures dans des environnements cibles spécifiques.
Dr Stephen Long, FRS, est professeur dans les départements de biologie végétale et des sciences des cultures à l'Université de l'Illinois et en sciences des cultures à l'Université de Lancaster. Il a développé une gamme de modèles mécanistes à différentes échelles reliant l'effet environnemental sur la photosynthèse à la productivité des plantes. Celles-ci ont également été utilisées pour identifier des cibles pour la sélection et la bio-ingénierie des augmentations durables de la productivité des cultures, réduites avec succès à la pratique.
Dr Amy Marshall-Colon est professeur adjoint au département de biologie végétale de l'Université de l'Illinois. Ses recherches explorent les mécanismes de régulation contrôlant l'absorption et l'assimilation de l'azote chez les plantes en utilisant une approche de biologie des systèmes. L'objectif principal de ses recherches est d'utiliser la modélisation prédictive des réseaux pour identifier les stratégies d'ingénierie les plus efficaces pour améliorer la productivité des cultures en réponse aux défis environnementaux imposés par le changement climatique mondial.
Dr Przemyslaw Prusinkiewicz, FRSC, est professeur au département d'informatique de l'Université de Calgary. Il y dirige le Laboratoire de modélisation et visualisation biologiques. Il est un pionnier de la modélisation informatique, de la simulation et de la visualisation du développement des plantes. Ses recherches actuelles portent sur le lien entre les processus au niveau moléculaire et la forme macroscopique des plantes. Il est le chef de projet du logiciel de modélisation de plantes Virtual Laboratory et L-studio, développé et distribué par son laboratoire.
Dr Xin-Guang Zhu est le chef du groupe de biologie des systèmes végétaux à l'Académie chinoise des sciences - Institut partenaire Max-Planck-Gesellschaft pour la biologie computationnelle. Il développe des modèles de systèmes multi-échelles, allant du métabolisme, des feuilles, de la canopée jusqu'aux niveaux de la plante entière, et des outils pour soutenir l'identification de nouvelles cibles de sélection ou d'ingénierie pour obtenir une efficacité photosynthétique plus élevée. Le laboratoire du Dr Zhu travaille également sur la reconstruction du processus évolutif et développemental de la photosynthèse C4 à partir d'un fond C3.
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