Image : Lothar Schermelleh, Wikimedia Commons (adapté de Schermelleh et al., Science 320 : 1332–1336).
Les séquences de gènes sont toutes très bien. Mais même les génies des gènes/gels les plus engagés admettront généralement que le travail acharné n'est pas le séquençage mais l'élaboration de ce que font tous ces gènes dans l'organisme intact. Un aspect tout aussi important de ce puzzle est de relier la fonction à la structure, qui à son tour s'appuie sur des techniques améliorées pour fournir la résolution structurelle nécessaire. Pour aider à ce dernier aspect, nous offrons des nouvelles de plusieurs développements en imagerie biologique. Jessica Fitzgibbon et ses collègues ont utilisé microscopie à éclairage structuré tridimensionnel (3D-SIM) pour obtenir des images de sous-diffraction de plasmodesmes (Physiologie végétale 153:1453–1463, 2010). Cette technique révolutionnaire donne effectivement une "super-résolution", qui aide à combler le fossé d'information entre la microscopie confocale et la microscopie électronique (EM). Au sujet de l'augmentation de la résolution, Ann McEvoy et al. vantent les vertus de la SMLM (microscopie optique à molécule unique), qui permet une résolution de 25 nm avec un microscope optique (http://www.biomedcentral.com/1741-7007/8/106), soit environ 10 fois plus que ce que vous pourriez normalement atteindre avec ce type de microscope. SMLM combine parfaitement la spécificité des sondes marquées avec la résolution de l'EM, mais avec l'avantage que SMLM peut être utilisé sur des cellules vivantes. Avant-avant-avant-dernière, et légèrement à côté de la fuite en avant pour atteindre la résolution EM au niveau du microscope optique, Romain Fernandez et al. (Nature Methods, doi:10.1038/nmeth.1472) présentent une technique d'imagerie de la croissance des plantes en quatre dimensions, c'est-à-dire en 3D mais avec une composante temporelle également. Démontrant son potentiel, ils ont analysé quantitativement Arabidopsis thaliana développement floral à une résolution au niveau cellulaire et a révélé des schémas de croissance différentiels de régions clés au cours des premiers stades de la morphogenèse florale. Lier les techniques de visualisation avec divers rapporteurs de la fonction des gènes aide à fournir ce lien vital entre le génotype et le phénotype. Avant l'avant-dernière, ajoutant une dimension temporelle importante à l'imagerie EM (connue pour ses vues statiques de matériel fixe, tentatives frustrantes de comprendre les processus dynamiques dans les tissus hydratés à la résolution EM), Juliette McGregor et Athene Donald montrent que certains processus végétaux extrêmement sensibles peuvent être vu au niveau EM (Journal de Microscopie 239: 135-141, 2010). Démontrant le potentiel de l'ESEM (microscope électronique à balayage environnemental), qui permet l'imagerie des tissus hydratés dans un faisceau d'électrons, le duo a réussi à démontrer que la fermeture de tradescantia les stomates peuvent être suivis en utilisant cette méthodologie. Enfin - et pour ceux qui aiment ce qui peut être réalisé lorsque la puissance du SEM (microscope électronique à balayage) est couplée à un logiciel de manipulation d'images - les superbes images de pollen capturées et "améliorées" par Martin Oeggerli valent toujours le coup d'œil (même si vous souffrez du rhume des foins !) (http://www.telegraph.co.uk/science/picture-galleries/7606811/Hayfever-sufferers-know-your-enemy-Scanning-Electron-Microscope-pictures-of-grains-of-pollen.html). En fin de compte, si vous vous êtes déjà demandé à quoi ressemble l'intérieur des aliments végétaux en utilisant l'IRM (imagerie par résonance magnétique), alors visitez http://insideinsides.blogspot.com/.
