Les cartes de liaison génétique restent des outils très importants pour la découverte de gènes dans de nombreuses espèces végétales. Bien qu'il existe plusieurs cartes génétiques pour l'ivraie vivace, il a été difficile d'intégrer les données entre les études en raison de l'absence d'une séquence génomique de référence et de marqueurs génétiques communs.

Exemples de génotypes graphiques des chromosomes 2 et 3 (A) avant et (B) après correction des erreurs de génotype.
Exemples de représentations graphiques des génotypes des chromosomes 2 et 3 (A) avant et (B) après correction des erreurs de génotypage. L'axe des abscisses représente les génotypes des individus et l'axe des ordonnées les marqueurs, classés selon leur position sur la carte chromosomique. Le bleu indique l'allèle hérité du grand-parent paternel, le rose celui hérité du grand-parent maternel et le jaune l'état hétérozygote. Image : Velmurugan et al. (2016).

Velmurugan et al. ont développé une carte génétique dense basée sur les SNP d'une population de cartographie de référence de ray-grass en utilisant le génotypage par séquençage. Tous les marqueurs de la carte génétique sont ancrés à une ébauche de séquence génomique de l'un des grands-parents de la population F2 ; ainsi, les futures études génétiques utilisant la population seront comparables.