Colza (Brassica napus) est l'une des cultures oléagineuses les plus importantes au monde. Une carence en phosphore (P) diminue considérablement la hauteur de la plante et le nombre de branches de Brassica napus. Cependant, les bases génétiques contrôlant la hauteur des plantes et le nombre de branches chez B.napus sous carence en P restent largement méconnues. Liu et al. visant à extraire des gènes candidats pour la hauteur de la plante et le nombre de branches par étude d'association à l'échelle du génome (GWAS) et déterminer les haplotypes à faible tolérance au P.

Colza. Image: canva.

Un panel associatif de B.napus a été cultivé au champ avec un faible apport en P (P, 0 kg ha-1) et un apport suffisant en P (P, 40 kg ha-1) sur 2 ans et la hauteur de la plante et le nombre de branches ont été étudiés. Plus de cinq millions de polymorphismes mononucléotidiques (SNP) ont été utilisés pour effectuer une GWAS de la hauteur de la plante et du nombre de branches à deux sources de P contrastées.

Un total de 2127 SNP étaient fortement associés (P < 6·25 × 10-07) avec hauteur de plante et numéro de branche à deux alimentations P. Il y avait une corrélation significative entre la variation phénotypique et le nombre d'allèles favorables des locus associés sur les chromosomes A10 (chrA10_821671) et C08 (chrC08_27999846), ce qui contribuera à l'amélioration de la reproduction en agrégeant ces SNP. BnaA10g09290D et BnaC08g26640D ont été identifiés comme étant associés à chrA10_821671 et chrC08_27999846, respectivement. L'analyse des associations de gènes candidats et l'analyse des haplotypes ont montré que les lignées consanguines porteuses d'ATT à BnaA10g09290Hap1 et AAT à BnaC08g26640Hap1 avait une plus grande hauteur de plante que les lignées portant d'autres allèles d'haplotype à faible apport en P.

Ces locus SNP significatifs, les allèles et haplotypes favorables, et les accessions portant ces allèles et haplotypes souhaités seront utiles pour la sélection pour une faible tolérance au P B.napus cultivars.

ARTICLE DE RECHERCHE

Liu, H., Wang, J., Zhang, B., Yang, X., Hammond, JP, Ding, G., Wang, S., Cai, H., Wang, C., Xu, F., Shi , L., 2021. Une étude d'association à l'échelle du génome dissèque le contrôle génétique de la hauteur des plantes et du nombre de branches en réponse à un stress à faible teneur en phosphore chez Brassica napus. Annals of Botany. https://doi.org/10.1093/aob/mcab115

traduction espagnole par Lorena Marchant