Comprendre la génétique des populations et l'histoire évolutive des espèces menacées est nécessaire de toute urgence à une époque de perte accélérée de la biodiversité. Ces connaissances sont particulièrement importantes pour les régions à fort endémisme qui sont écologiquement vulnérables, comme le plateau Qinghai-Tibet (QTP).

Miao et al. ont étudié la variation génétique de 84 genévriers de six populations de Genévrier microsperma et une population de Genévrier erectopatens, deux genévriers endémiques étroits du QTP qui sont frères l'un de l'autre, en utilisant des données de séquençage d'ARN. Des analyses coalescentes ont été utilisées pour tester des scénarios de spéciation, de migration et démographiques. De plus, des gènes positivement sélectionnés et associés au climat ont été identifiés, et la charge génétique a été évaluée pour les deux espèces.

Genévrier microsperma et Genévrier erectopatens. Image Miao et al. 2021.

Les analyses de 149 052 polymorphismes mononucléotidiques ont montré que les deux espèces sont bien différenciées et monophylétiques. Ils ont divergé vers la fin du Pliocène, mais le flux génétique interspécifique s'est poursuivi jusqu'au dernier maximum glaciaire. La reconstruction démographique par Stairway Plot a détecté deux graves goulots d'étranglement pour J. microsperme mais un seul pour J. erectopatens. Les gènes sélectionnés positivement et les gènes associés au climat ont révélé l'adaptation à l'habitat des deux espèces. De plus, bien que J. microsperme avaient une répartition géographique beaucoup plus large que J. erectopatens, le premier possède une diversité génétique plus faible et une charge génétique plus élevée que le second.

Dans leur article, Miao et al. écrire. "Notre étude souligne l'importance de la spéciation et de la reconstruction de l'histoire démographique pour comprendre le schéma de distribution actuel et le niveau de diversité génétique des espèces menacées et pour aider à mettre en œuvre des stratégies de conservation et de gestion."

ARTICLE DE RECHERCHE

Miao, J., Farhat, P., Wang, W., Ruhsam, M., Milne, R., Yang, H., Tso, S., Li, J., Xu, J., Opgenoorth, L., Miehe, G., Mao, K., 2021. Histoire évolutive de deux espèces de conifères endémiques rares de l'est du plateau Qinghai-Tibet. Annals of Botany. https://doi.org/10.1093/aob/mcab114