L'heure de la confession : l'une des principales raisons pour lesquelles j'ai choisi d'étudier l'écologie il y a tant d'années était d'éviter ce qui, pour moi, était un double sommet d'incompréhensibilité : la biochimie et la génétique. J'aimais pouvoir voir ce qui se passait : la croissance d'une plante, la réaction d'une feuille à la sécheresse ou les réponses stomatiques à l'infection étaient toutes bonnes, mais quand les choses devenaient subcellulaires, le brouillard descendait et mon esprit errait. Alors, pitié de mes faibles chances de comprendre les articles de biologie moléculaire qui abondent actuellement dans la revue moyenne aujourd'hui ; parfois j'ai même du mal à déterminer si l'auteur parle d'un gène ou d'une protéine… et c'est là que repose mon reproche, car il n'y a aucune raison pour que je le fasse.

D'accord, les conventions varient un peu d'un journal à l'autre, mais à un niveau très basique, il semble généralement accepté qu'un nom de gène doit être donné dans italique type tandis que son produit protéique est donné en type normal ("romain"). Ainsi, l'expression accrue de la FLC gène produira des quantités accrues de la protéine FLC dans la cellule, une diminution de l'expression de la MAF2 gène entraînera des quantités inférieures de la protéine MAF2. Bien sûr, la distinction n'est pas nécessaire lorsque les mots «gène» et «protéine» sont présents, mais il est clair que vous ne voulez pas les répéter des dizaines de fois dans chaque paragraphe - utilisez donc simplement des italiques à la place (et pas besoin de tâtonner pour le bouton 'police italique' : 'Ctrl + I' fera l'affaire en une fraction de temps). Et il vaut la peine d'être conscient que si vous n'utilisez pas d'italiques dans votre article, quelqu'un d'autre peut le faire en votre nom : je ne connais aucune revue de haut niveau qui n'effectue pas une forme quelconque d'édition sur papiers acceptés, et si vous ne précisez pas ce qu'est un gène et ce qu'est une protéine, quelqu'un d'autre peut faire une supposition en votre nom - et ne pas nécessairement faire les choses correctement, comme l'illustre la phrase suivante qui est apparue il y a quelques années il y a dans un article sur Arabidopsis: « Après de très longues périodes de basse température, cependant, MAF2 les niveaux ont diminué et une accélération marquée de la floraison s'est produite.

Maintenant, je ne suis qu'un écologiste, mais je ne suis pas sûr que le niveau d'un gène puisse diminuer, n'est-ce pas ? Mais suis-je simplement pédant ? Dans cet exemple, ce que l'on entend est assez clair, et en termes d'effets globaux, le gène et la protéine sont presque synonymes - les niveaux d'expression du MAF2 diminution du gène, donc le niveau de la protéine MAF2 dans la cellule diminue, alors quel est le problème ? Pas grand-chose dans cet exemple simple, mais qu'en est-il d'un système plus complexe où l'expression du gène a augmenté mais un autre facteur a perturbé la production ultérieure de la protéine, ce qui l'a fait diminuer, peut-être avec plusieurs systèmes de gènes/protéines en interaction - votre lecteur pourrait-il suivre c'est si facile alors ?

La biologie moléculaire est une chose compliquée, donc quand il s'agit de clarté, chaque petit geste compte.