La différenciation écologique est un mécanisme de spéciation important dans les complexes polyploïdes.

Caractérisation des niches écologiques via les valeurs indicatrices de Landolt des espèces accompagnatrices, Sonnleitner et al. ont constaté que les niches de quatre groupes (deux diploïdes, un tétraploïde, un hexaploïde) de Senecio carniolicus sl (Asteraceae) différaient en ce qui concerne la température, la lumière et les propriétés du sol, mais pas dans leur largeur. La différenciation de niche a été améliorée (déplacement de niche) là où les cytotypes coapparaissaient en sympatrie avec d'autres cytotypes. Le déplacement de niche stabilise potentiellement les zones de contact entre les cytotypes et nécessite donc d'être pris en compte dans la recherche sur la polyploïdie.