De nouvelles recherches menées à travers l'Europe révèlent une variation significative des bactéries vivant sur Arabidopsis thaliana plantes. Cette étude à grande échelle a révélé que les conditions de sécheresse influencent fortement les bactéries qui colonisent les plantesLes résultats montrent des relations complexes entre le climat, la génétique végétale et les communautés microbiennes.
L’étude a identifié deux communautés bactériennes distinctes sur A. thaliana: l'une prévaut en Europe du Nord, l'autre en Europe du Sud. La gravité de la sécheresse s'est avérée être le meilleur indicateur de la communauté bactérienne hébergée par une plante. La génétique de la plante et la sécheresse ont toutes deux directement influencé la composition bactérienne, 10 % des bactéries principales étant affectées par la sécheresse et 20 % par des facteurs génétiques de l'hôte associés à la tolérance à la sécheresse.
Les chercheurs ont découvert les microbes en collectant A. thaliana Des échantillons provenant de 267 sites en Europe entre février et mai 2018 ont été prélevés. Ils ont séquencé la région V3-V4 de l'ARN ribosomique 16S pour identifier les espèces bactériennes présentes sur les plantes. L'extraction et le séquençage de l'ADN ont également été effectués pour analyser la génétique des plantes. Des techniques statistiques avancées, notamment la modélisation de forêts aléatoires et les modèles à effets mixtes, ont été utilisées pour analyser les relations entre les communautés bactériennes, la génétique des plantes et divers facteurs climatiques, en particulier les paramètres liés à la sécheresse.
Cette étude à l'échelle continentale s'appuie sur des recherches antérieures à plus petite échelle, offrant une vue complète des interactions entre plantes et microbes dans divers environnements. Les résultats soulignent le rôle important de la sécheresse dans la formation de ces interactions, suggérant que la disponibilité en eau affecte les microbes qui colonisent et prospèrent sur les plantes. La compréhension de ces relations pourrait avoir des implications importantes pour l'agriculture et la conservation à mesure que le changement climatique modifie les régimes de précipitations.
La sécheresse ne joue pas seulement un rôle sélectif majeur dans A. thaliana « Les populations de moustiques » sont également connues pour affecter la capacité des plantes à résister aux attaques des agents pathogènes. Une question importante sera de savoir si les différents microbiomes de fond des plantes plus susceptibles de connaître la sécheresse dans la nature aideront ou entraveront la défense contre les agents pathogènes.
Karasov, TL, Neumann, M., Leventhal, L. et al., 2024. Associations à l'échelle continentale des membres de la phyllosphère d'Arabidopsis thaliana avec le génotype de l'hôte et la sécheresse. Nature Microbiology. Disponible sur : https://doi.org/10.1038/s41564-024-01773-z (OA)
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